MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017325	GCC	2	6	123573	123578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534576
3002	NC_017325	GCC	2	6	123699	123704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534576
3003	NC_017325	TCT	2	6	123755	123760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534576
3004	NC_017325	CGC	2	6	123778	123783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534576
3005	NC_017325	GCC	2	6	123798	123803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534576
3006	NC_017325	GGC	2	6	123857	123862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534576
3007	NC_017325	GCC	2	6	123879	123884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534576
3008	NC_017325	TGC	2	6	123940	123945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534576
3009	NC_017325	CGA	2	6	124004	124009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534576
3010	NC_017325	GAT	2	6	124011	124016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534576
3011	NC_017325	TCG	2	6	124024	124029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534576
3012	NC_017325	GGC	2	6	124059	124064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534576
3013	NC_017325	CCT	2	6	124082	124087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534576
3014	NC_017325	CGT	2	6	124109	124114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534576
3015	NC_017325	GCCG	2	8	124130	124137	0 %	0 %	50 %	50 %	384534576
3016	NC_017325	CCG	3	9	124135	124143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534576
3017	NC_017325	CGG	2	6	124205	124210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534576
3018	NC_017325	GCA	2	6	124259	124264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534576
3019	NC_017325	TGA	2	6	124273	124278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534576
3020	NC_017325	GGC	2	6	124280	124285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534576
3021	NC_017325	AAG	2	6	124305	124310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534576
3022	NC_017325	CCGA	2	8	124338	124345	25 %	0 %	25 %	50 %	384534576
3023	NC_017325	TCG	2	6	124357	124362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534576
3024	NC_017325	GTCGA	2	10	124404	124413	20 %	20 %	40 %	20 %	384534576
3025	NC_017325	CA	3	6	124461	124466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_017325	GAAGG	2	10	124473	124482	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017325	GCC	2	6	124492	124497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_017325	GGGCG	2	10	124553	124562	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3029	NC_017325	CTT	2	6	124579	124584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_017325	CGC	2	6	124656	124661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_017325	GCA	2	6	124686	124691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017325	CTT	2	6	124701	124706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017325	GAG	2	6	124722	124727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017325	AAAC	2	8	124740	124747	75 %	0 %	0 %	25 %	384534577
3035	NC_017325	GACG	2	8	124798	124805	25 %	0 %	50 %	25 %	384534577
3036	NC_017325	GCT	2	6	124834	124839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3037	NC_017325	GCA	2	6	124849	124854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3038	NC_017325	CGG	2	6	124930	124935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534577
3039	NC_017325	GCA	2	6	124972	124977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3040	NC_017325	TCG	2	6	124986	124991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3041	NC_017325	TCG	2	6	124995	125000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3042	NC_017325	CCG	2	6	125028	125033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534577
3043	NC_017325	TCGG	2	8	125045	125052	0 %	25 %	50 %	25 %	384534577
3044	NC_017325	CAT	2	6	125056	125061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534577
3045	NC_017325	CGTC	2	8	125070	125077	0 %	25 %	25 %	50 %	384534577
3046	NC_017325	CCG	2	6	125111	125116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534577
3047	NC_017325	TGGGG	2	10	125140	125149	0 %	20 %	80 %	0 %	384534577
3048	NC_017325	TCG	2	6	125178	125183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3049	NC_017325	CG	3	6	125182	125187	0 %	0 %	50 %	50 %	384534577
3050	NC_017325	GCC	2	6	125197	125202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534577
3051	NC_017325	TTC	2	6	125315	125320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534577
3052	NC_017325	CGT	2	6	125362	125367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3053	NC_017325	CTC	2	6	125378	125383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534577
3054	NC_017325	CTT	2	6	125390	125395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534577
3055	NC_017325	ACCGC	2	10	125409	125418	20 %	0 %	20 %	60 %	384534577
3056	NC_017325	CGA	2	6	125446	125451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3057	NC_017325	ATCGA	2	10	125600	125609	40 %	20 %	20 %	20 %	384534577
3058	NC_017325	GTG	2	6	125618	125623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534577
3059	NC_017325	CGG	2	6	125626	125631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534577
3060	NC_017325	CGG	2	6	125644	125649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534577
3061	NC_017325	CAT	2	6	125659	125664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534577
3062	NC_017325	GC	3	6	125679	125684	0 %	0 %	50 %	50 %	384534577
3063	NC_017325	TCG	2	6	125688	125693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3064	NC_017325	TCT	2	6	125697	125702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534577
3065	NC_017325	ATC	3	9	125765	125773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534577
3066	NC_017325	AGC	2	6	125806	125811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534577
3067	NC_017325	GAT	2	6	125955	125960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534578
3068	NC_017325	GAGGC	2	10	126043	126052	20 %	0 %	60 %	20 %	384534578
3069	NC_017325	ACA	2	6	126113	126118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534578
3070	NC_017325	CAT	2	6	126150	126155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534578
3071	NC_017325	CGCT	2	8	126169	126176	0 %	25 %	25 %	50 %	384534578
3072	NC_017325	CGC	2	6	126183	126188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534578
3073	NC_017325	TGA	2	6	126230	126235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534578
3074	NC_017325	CGG	2	6	126273	126278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534578
3075	NC_017325	GC	4	8	126301	126308	0 %	0 %	50 %	50 %	384534578
3076	NC_017325	CGC	3	9	126306	126314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534578
3077	NC_017325	GTC	2	6	126328	126333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534578
3078	NC_017325	CGG	2	6	126350	126355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534578
3079	NC_017325	TCG	2	6	126405	126410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534578
3080	NC_017325	CATC	2	8	126480	126487	25 %	25 %	0 %	50 %	384534578
3081	NC_017325	GCC	3	9	126494	126502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534578
3082	NC_017325	TCA	2	6	126509	126514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534578
3083	NC_017325	GCC	2	6	126570	126575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534578
3084	NC_017325	TCG	2	6	126655	126660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534579
3085	NC_017325	GGCG	2	8	126728	126735	0 %	0 %	75 %	25 %	384534579
3086	NC_017325	GGC	2	6	126740	126745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534579
3087	NC_017325	GCT	2	6	126800	126805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534579
3088	NC_017325	GCC	2	6	126861	126866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534579
3089	NC_017325	ATC	2	6	126942	126947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534579
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3091	NC_017325	CGA	2	6	126995	127000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534579
3092	NC_017325	ATT	2	6	127033	127038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384534579
3093	NC_017325	GCG	2	6	127073	127078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534579
3094	NC_017325	GC	3	6	127122	127127	0 %	0 %	50 %	50 %	384534579
3095	NC_017325	GTC	2	6	127167	127172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534579
3096	NC_017325	CGG	2	6	127186	127191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534579
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3098	NC_017325	CAC	2	6	127316	127321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534580
3099	NC_017325	GCC	2	6	127329	127334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_017325	GCCG	2	8	127361	127368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_017325	CG	3	6	127367	127372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3102	NC_017325	CGC	2	6	127422	127427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534581
3103	NC_017325	TGA	2	6	127430	127435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534581
3104	NC_017325	CGG	2	6	127457	127462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534581
3105	NC_017325	GCG	2	6	127471	127476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534581
3106	NC_017325	GCC	2	6	127492	127497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534581
3107	NC_017325	CG	4	8	127502	127509	0 %	0 %	50 %	50 %	384534581
3108	NC_017325	CAT	3	9	127511	127519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534581
3109	NC_017325	GCC	2	6	127532	127537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534581
3110	NC_017325	GTG	2	6	127539	127544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534581
3111	NC_017325	CCG	2	6	127549	127554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534581
3112	NC_017325	GCC	2	6	127560	127565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534581
3113	NC_017325	CGC	2	6	127583	127588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534581
3114	NC_017325	TGA	2	6	127618	127623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534581
3115	NC_017325	CCGG	2	8	127707	127714	0 %	0 %	50 %	50 %	384534581
3116	NC_017325	TCG	2	6	127728	127733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534581
3117	NC_017325	GCG	2	6	127735	127740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534581
3118	NC_017325	GAC	2	6	127820	127825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534581
3119	NC_017325	CCG	2	6	127886	127891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534581
3120	NC_017325	GAC	2	6	127928	127933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534581
3121	NC_017325	CAC	2	6	127988	127993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534581
3122	NC_017325	ATC	2	6	128004	128009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534581
3123	NC_017325	TCG	2	6	128026	128031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534581
3124	NC_017325	TAC	2	6	128049	128054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534581
3125	NC_017325	GGC	2	6	128102	128107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534581
3126	NC_017325	CTT	2	6	128126	128131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534581
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3130	NC_017325	CGA	2	6	128554	128559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534582
3131	NC_017325	CGG	2	6	128640	128645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534582
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3135	NC_017325	CGG	2	6	128710	128715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534582
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3137	NC_017325	GAT	2	6	128770	128775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534582
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3141	NC_017325	CGG	2	6	128920	128925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534582
3142	NC_017325	CTA	2	6	128953	128958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534582
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3144	NC_017325	CG	4	8	129046	129053	0 %	0 %	50 %	50 %	384534582
3145	NC_017325	CGA	2	6	129067	129072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534582
3146	NC_017325	GGA	2	6	129208	129213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_017325	TGC	2	6	129229	129234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534583
3148	NC_017325	TGC	2	6	129254	129259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534583
3149	NC_017325	GAC	2	6	129267	129272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534583
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3151	NC_017325	GCGG	2	8	129301	129308	0 %	0 %	75 %	25 %	384534583
3152	NC_017325	CGGC	2	8	129336	129343	0 %	0 %	50 %	50 %	384534583
3153	NC_017325	GC	3	6	129402	129407	0 %	0 %	50 %	50 %	384534583
3154	NC_017325	CGCTGC	2	12	129449	129460	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384534583
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3171	NC_017325	CGG	2	6	130169	130174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3172	NC_017325	GCA	2	6	130181	130186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3174	NC_017325	GCC	2	6	130213	130218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3175	NC_017325	AGGGC	2	10	130231	130240	20 %	0 %	60 %	20 %	384534584
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3202	NC_017325	G	6	6	131407	131412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3203	NC_017325	CG	3	6	131419	131424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3227	NC_017325	CGC	2	6	132444	132449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534586
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3230	NC_017325	AG	4	8	132497	132504	50 %	0 %	50 %	0 %	384534586
3231	NC_017325	AGC	2	6	132517	132522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534586
3232	NC_017325	CGT	2	6	132581	132586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534586
3233	NC_017325	CCG	2	6	132634	132639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534586
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3236	NC_017325	CCGG	2	8	132779	132786	0 %	0 %	50 %	50 %	384534586
3237	NC_017325	CG	3	6	132819	132824	0 %	0 %	50 %	50 %	384534586
3238	NC_017325	CTC	2	6	132825	132830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534586
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3241	NC_017325	CGC	2	6	132885	132890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534586
3242	NC_017325	GAT	2	6	132915	132920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534586
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3244	NC_017325	TCG	2	6	132961	132966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534586
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3247	NC_017325	GGCG	2	8	133198	133205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3248	NC_017325	GCG	2	6	133224	133229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3362	NC_017325	AGAC	2	8	138091	138098	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3363	NC_017325	GC	3	6	138197	138202	0 %	0 %	50 %	50 %	384534590
3364	NC_017325	CG	3	6	138214	138219	0 %	0 %	50 %	50 %	384534590
3365	NC_017325	TCGC	2	8	138269	138276	0 %	25 %	25 %	50 %	384534590
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3367	NC_017325	GCG	2	6	138302	138307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534590
3368	NC_017325	CCT	2	6	138310	138315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534590
3369	NC_017325	CGC	2	6	138355	138360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534590
3370	NC_017325	CCT	2	6	138373	138378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534590
3371	NC_017325	TCT	2	6	138385	138390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534590
3372	NC_017325	TGG	2	6	138399	138404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534590
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3376	NC_017325	CGG	2	6	138571	138576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534590
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3379	NC_017325	TGA	2	6	138678	138683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534590
3380	NC_017325	ATC	2	6	138716	138721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534590
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3382	NC_017325	TCG	2	6	138833	138838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534591
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3385	NC_017325	CGC	2	6	138975	138980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534591
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3390	NC_017325	CG	3	6	139250	139255	0 %	0 %	50 %	50 %	384534591
3391	NC_017325	CCG	2	6	139312	139317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534591
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3395	NC_017325	GCC	2	6	139409	139414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3396	NC_017325	GC	3	6	139499	139504	0 %	0 %	50 %	50 %	384534592
3397	NC_017325	CG	3	6	139505	139510	0 %	0 %	50 %	50 %	384534592
3398	NC_017325	GGGC	2	8	139523	139530	0 %	0 %	75 %	25 %	384534592
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3404	NC_017325	TCGA	2	8	139754	139761	25 %	25 %	25 %	25 %	384534592
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3423	NC_017325	TCC	2	6	140404	140409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3424	NC_017325	GAA	2	6	140416	140421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3425	NC_017325	ATG	2	6	140468	140473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534593
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3440	NC_017325	CAT	2	6	141488	141493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3443	NC_017325	GCCG	2	8	141635	141642	0 %	0 %	50 %	50 %	384534594
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3447	NC_017325	TGCCG	2	10	141799	141808	0 %	20 %	40 %	40 %	384534594
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3469	NC_017325	CGC	2	6	142775	142780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3470	NC_017325	GTGC	2	8	142795	142802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3471	NC_017325	TAA	2	6	142903	142908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384534595
3472	NC_017325	TCG	2	6	142941	142946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534595
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3474	NC_017325	GC	3	6	143079	143084	0 %	0 %	50 %	50 %	384534595
3475	NC_017325	GC	3	6	143097	143102	0 %	0 %	50 %	50 %	384534595
3476	NC_017325	AGC	2	6	143128	143133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534595
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3478	NC_017325	GC	3	6	143210	143215	0 %	0 %	50 %	50 %	384534595
3479	NC_017325	GC	3	6	143228	143233	0 %	0 %	50 %	50 %	384534595
3480	NC_017325	GGT	2	6	143243	143248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534595
3481	NC_017325	GC	3	6	143288	143293	0 %	0 %	50 %	50 %	384534595
3482	NC_017325	CGC	2	6	143312	143317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534595
3483	NC_017325	GAGC	2	8	143324	143331	25 %	0 %	50 %	25 %	384534595
3484	NC_017325	CCG	2	6	143409	143414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534595
3485	NC_017325	GCG	3	9	143427	143435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534595
3486	NC_017325	GAA	2	6	143443	143448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534595
3487	NC_017325	GCGCAG	2	12	143516	143527	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384534595
3488	NC_017325	TTC	2	6	143532	143537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534595
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3490	NC_017325	CGG	2	6	143569	143574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534595
3491	NC_017325	TGG	2	6	143589	143594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534595
3492	NC_017325	ACGA	2	8	143601	143608	50 %	0 %	25 %	25 %	384534595
3493	NC_017325	GCC	2	6	143618	143623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534595
3494	NC_017325	CCGC	2	8	143646	143653	0 %	0 %	25 %	75 %	384534595
3495	NC_017325	GGA	2	6	143666	143671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534595
3496	NC_017325	GGCC	2	8	143684	143691	0 %	0 %	50 %	50 %	384534595
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3498	NC_017325	CG	3	6	143779	143784	0 %	0 %	50 %	50 %	384534595
3499	NC_017325	GCC	2	6	143844	143849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534595
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