MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_017325	GTT	3	9	1110011	1110019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26003	NC_017325	GCCG	3	12	1110056	1110067	0 %	0 %	50 %	50 %	384535536
26004	NC_017325	GCG	2	6	1110199	1110204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535536
26005	NC_017325	CGG	2	6	1110205	1110210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535536
26006	NC_017325	AAG	2	6	1110368	1110373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535536
26007	NC_017325	CAG	2	6	1110380	1110385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535536
26008	NC_017325	CGAGGC	2	12	1110519	1110530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384535537
26009	NC_017325	CGGC	2	8	1110602	1110609	0 %	0 %	50 %	50 %	384535537
26010	NC_017325	AAC	2	6	1110703	1110708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535537
26011	NC_017325	GAC	2	6	1110711	1110716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535537
26012	NC_017325	CGG	2	6	1110717	1110722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535537
26013	NC_017325	TGA	2	6	1110749	1110754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535537
26014	NC_017325	CAG	2	6	1110820	1110825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535537
26015	NC_017325	GAT	2	6	1110834	1110839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535537
26016	NC_017325	CGA	2	6	1110846	1110851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535537
26017	NC_017325	AAGC	2	8	1110858	1110865	50 %	0 %	25 %	25 %	384535537
26018	NC_017325	CAA	2	6	1110909	1110914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535537
26019	NC_017325	GTC	2	6	1110949	1110954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535537
26020	NC_017325	GTC	2	6	1111002	1111007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535537
26021	NC_017325	GCC	4	12	1111012	1111023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535537
26022	NC_017325	ATC	2	6	1111027	1111032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535537
26023	NC_017325	CAC	2	6	1111083	1111088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535537
26024	NC_017325	GCC	2	6	1111101	1111106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535537
26025	NC_017325	GC	3	6	1111138	1111143	0 %	0 %	50 %	50 %	384535537
26026	NC_017325	AAAG	2	8	1111165	1111172	75 %	0 %	25 %	0 %	384535537
26027	NC_017325	TGC	2	6	1111178	1111183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535537
26028	NC_017325	GGA	2	6	1111203	1111208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535537
26029	NC_017325	GCAGC	2	10	1111212	1111221	20 %	0 %	40 %	40 %	384535537
26030	NC_017325	CGG	2	6	1111238	1111243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535537
26031	NC_017325	GGC	2	6	1111311	1111316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535537
26032	NC_017325	CGA	2	6	1111329	1111334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535537
26033	NC_017325	GAC	2	6	1111393	1111398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535537
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26038	NC_017325	CAT	2	6	1111707	1111712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535537
26039	NC_017325	GTC	2	6	1111828	1111833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535537
26040	NC_017325	GC	3	6	1111916	1111921	0 %	0 %	50 %	50 %	384535537
26041	NC_017325	GTG	2	6	1111932	1111937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535537
26042	NC_017325	AAC	2	6	1111958	1111963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535537
26043	NC_017325	CAAG	2	8	1111986	1111993	50 %	0 %	25 %	25 %	384535537
26044	NC_017325	TCG	2	6	1112021	1112026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535537
26045	NC_017325	TGA	2	6	1112048	1112053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535537
26046	NC_017325	GGGC	2	8	1112075	1112082	0 %	0 %	75 %	25 %	384535537
26047	NC_017325	GCG	2	6	1112116	1112121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535537
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26049	NC_017325	CTT	2	6	1112147	1112152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535538
26050	NC_017325	CGG	2	6	1112154	1112159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535538
26051	NC_017325	CTG	2	6	1112274	1112279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535538
26052	NC_017325	GC	3	6	1112346	1112351	0 %	0 %	50 %	50 %	384535538
26053	NC_017325	ATC	2	6	1112353	1112358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535538
26054	NC_017325	GTT	2	6	1112360	1112365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535538
26055	NC_017325	GGC	3	9	1112478	1112486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535538
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26061	NC_017325	CG	3	6	1112691	1112696	0 %	0 %	50 %	50 %	384535538
26062	NC_017325	ATCG	2	8	1112697	1112704	25 %	25 %	25 %	25 %	384535538
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26066	NC_017325	ATC	2	6	1112847	1112852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535538
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26071	NC_017325	GCCG	2	8	1113101	1113108	0 %	0 %	50 %	50 %	384535538
26072	NC_017325	GCC	2	6	1113114	1113119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535538
26073	NC_017325	TGC	2	6	1113151	1113156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535538
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26081	NC_017325	GCCGGC	2	12	1113332	1113343	0 %	0 %	50 %	50 %	384535538
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26085	NC_017325	CG	3	6	1113653	1113658	0 %	0 %	50 %	50 %	384535539
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26089	NC_017325	GGCGC	2	10	1113838	1113847	0 %	0 %	60 %	40 %	384535539
26090	NC_017325	GAGT	2	8	1113994	1114001	25 %	25 %	50 %	0 %	384535539
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26098	NC_017325	TC	3	6	1114253	1114258	0 %	50 %	0 %	50 %	384535540
26099	NC_017325	CG	4	8	1114309	1114316	0 %	0 %	50 %	50 %	384535540
26100	NC_017325	GCG	3	9	1114314	1114322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535540
26101	NC_017325	CAA	2	6	1114324	1114329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535540
26102	NC_017325	TCG	2	6	1114362	1114367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535540
26103	NC_017325	CAGTC	2	10	1114394	1114403	20 %	20 %	20 %	40 %	384535540
26104	NC_017325	GCAAGG	2	12	1114407	1114418	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384535540
26105	NC_017325	CGA	2	6	1114437	1114442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535540
26106	NC_017325	CGA	2	6	1114452	1114457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535540
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26110	NC_017325	ACC	2	6	1114493	1114498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535540
26111	NC_017325	GCG	2	6	1114528	1114533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535540
26112	NC_017325	CGG	2	6	1114617	1114622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535540
26113	NC_017325	GAC	2	6	1114733	1114738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535540
26114	NC_017325	TTCG	2	8	1114749	1114756	0 %	50 %	25 %	25 %	384535540
26115	NC_017325	ATC	2	6	1114757	1114762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535540
26116	NC_017325	ATC	2	6	1114847	1114852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535540
26117	NC_017325	GCC	2	6	1114871	1114876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535540
26118	NC_017325	CGAT	2	8	1114902	1114909	25 %	25 %	25 %	25 %	384535540
26119	NC_017325	GGC	2	6	1114933	1114938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535540
26120	NC_017325	CCGA	2	8	1114976	1114983	25 %	0 %	25 %	50 %	384535540
26121	NC_017325	CCGG	2	8	1115016	1115023	0 %	0 %	50 %	50 %	384535540
26122	NC_017325	CAT	2	6	1115026	1115031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535540
26123	NC_017325	GTC	2	6	1115078	1115083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535540
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26126	NC_017325	GGC	2	6	1115305	1115310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26127	NC_017325	GCC	2	6	1115317	1115322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26128	NC_017325	CCTTG	2	10	1115328	1115337	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26129	NC_017325	ACC	2	6	1115348	1115353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26130	NC_017325	GCA	2	6	1115377	1115382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535541
26131	NC_017325	GTAT	2	8	1115394	1115401	25 %	50 %	25 %	0 %	384535541
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26151	NC_017325	CGGC	2	8	1116343	1116350	0 %	0 %	50 %	50 %	384535543
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26197	NC_017325	GC	3	6	1118565	1118570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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26200	NC_017325	GCC	2	6	1118703	1118708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535548
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26228	NC_017325	CGG	2	6	1119650	1119655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535548
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26230	NC_017325	GGCC	2	8	1119710	1119717	0 %	0 %	50 %	50 %	384535548
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26232	NC_017325	TCG	2	6	1119739	1119744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535548
26233	NC_017325	ATT	2	6	1119792	1119797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384535548
26234	NC_017325	GGC	2	6	1119843	1119848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535548
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26335	NC_017325	GCGAC	2	10	1124193	1124202	20 %	0 %	40 %	40 %	384535552
26336	NC_017325	GAC	3	9	1124251	1124259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535552
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26343	NC_017325	GCG	2	6	1124523	1124528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535552
26344	NC_017325	GC	3	6	1124571	1124576	0 %	0 %	50 %	50 %	384535552
26345	NC_017325	TAC	2	6	1124594	1124599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535552
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26348	NC_017325	CAT	2	6	1124878	1124883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535553
26349	NC_017325	ATGT	2	8	1124903	1124910	25 %	50 %	25 %	0 %	384535554
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26463	NC_017325	CGAA	2	8	1129634	1129641	50 %	0 %	25 %	25 %	384535559
26464	NC_017325	GGC	2	6	1129779	1129784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535559
26465	NC_017325	GCCG	2	8	1129788	1129795	0 %	0 %	50 %	50 %	384535559
26466	NC_017325	TCC	2	6	1129811	1129816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26467	NC_017325	CGG	2	6	1129842	1129847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26468	NC_017325	CTTTTT	2	12	1129891	1129902	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26469	NC_017325	CGGG	2	8	1129903	1129910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26470	NC_017325	ATAC	2	8	1129982	1129989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26471	NC_017325	CG	3	6	1130042	1130047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26472	NC_017325	GA	3	6	1130090	1130095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26473	NC_017325	TCA	2	6	1130104	1130109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535560
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26475	NC_017325	CGT	2	6	1130192	1130197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535560
26476	NC_017325	GCTTC	2	10	1130292	1130301	0 %	40 %	20 %	40 %	384535560
26477	NC_017325	TCATCG	2	12	1130338	1130349	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384535560
26478	NC_017325	TCG	2	6	1130374	1130379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535560
26479	NC_017325	CG	3	6	1130438	1130443	0 %	0 %	50 %	50 %	384535560
26480	NC_017325	GTC	2	6	1130514	1130519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535560
26481	NC_017325	CG	3	6	1130524	1130529	0 %	0 %	50 %	50 %	384535560
26482	NC_017325	GAC	2	6	1130543	1130548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535560
26483	NC_017325	GCT	2	6	1130573	1130578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535560
26484	NC_017325	GCG	2	6	1130650	1130655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535560
26485	NC_017325	GAT	2	6	1130666	1130671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535560
26486	NC_017325	GC	3	6	1130703	1130708	0 %	0 %	50 %	50 %	384535560
26487	NC_017325	GCC	2	6	1130727	1130732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535560
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26490	NC_017325	TCGC	2	8	1130817	1130824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26491	NC_017325	GCCC	2	8	1130983	1130990	0 %	0 %	25 %	75 %	384535561
26492	NC_017325	ACG	2	6	1131040	1131045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535561
26493	NC_017325	GAGC	2	8	1131050	1131057	25 %	0 %	50 %	25 %	384535561
26494	NC_017325	CATG	2	8	1131059	1131066	25 %	25 %	25 %	25 %	384535561
26495	NC_017325	TTG	2	6	1131076	1131081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535561
26496	NC_017325	GTC	2	6	1131082	1131087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535561
26497	NC_017325	CCA	2	6	1131105	1131110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535561
26498	NC_017325	GC	3	6	1131159	1131164	0 %	0 %	50 %	50 %	384535561
26499	NC_017325	GTGC	2	8	1131177	1131184	0 %	25 %	50 %	25 %	384535561
26500	NC_017325	GCG	2	6	1131187	1131192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535561

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