MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_017325	GCCTTG	2	12	1025247	1025258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535452
24003	NC_017325	CCG	2	6	1025259	1025264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535452
24004	NC_017325	GT	3	6	1025287	1025292	0 %	50 %	50 %	0 %	384535452
24005	NC_017325	ATC	2	6	1025319	1025324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535452
24006	NC_017325	GCC	2	6	1025371	1025376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535452
24007	NC_017325	TCG	2	6	1025382	1025387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535452
24008	NC_017325	TCC	2	6	1025409	1025414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535452
24009	NC_017325	GAA	2	6	1025417	1025422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535452
24010	NC_017325	CGA	2	6	1025470	1025475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535452
24011	NC_017325	GCC	2	6	1025517	1025522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535452
24012	NC_017325	GA	3	6	1025538	1025543	50 %	0 %	50 %	0 %	384535452
24013	NC_017325	GTC	2	6	1025567	1025572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535452
24014	NC_017325	GCC	2	6	1025657	1025662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535452
24015	NC_017325	CAT	2	6	1025675	1025680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535452
24016	NC_017325	GAT	2	6	1025723	1025728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535452
24017	NC_017325	CG	3	6	1025749	1025754	0 %	0 %	50 %	50 %	384535452
24018	NC_017325	CGG	2	6	1025827	1025832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535452
24019	NC_017325	TGCG	2	8	1025950	1025957	0 %	25 %	50 %	25 %	384535452
24020	NC_017325	TCC	2	6	1025973	1025978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535452
24021	NC_017325	ACC	2	6	1026080	1026085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24022	NC_017325	GGC	2	6	1026192	1026197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535453
24023	NC_017325	GCC	2	6	1026231	1026236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535453
24024	NC_017325	TCG	2	6	1026238	1026243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535453
24025	NC_017325	GC	3	6	1026303	1026308	0 %	0 %	50 %	50 %	384535453
24026	NC_017325	C	6	6	1026332	1026337	0 %	0 %	0 %	100 %	384535453
24027	NC_017325	AGG	2	6	1026377	1026382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535453
24028	NC_017325	GCC	2	6	1026411	1026416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535453
24029	NC_017325	TTCGAT	2	12	1026489	1026500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384535453
24030	NC_017325	GGC	2	6	1026558	1026563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535453
24031	NC_017325	GCA	2	6	1026575	1026580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535453
24032	NC_017325	CTT	2	6	1026603	1026608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535453
24033	NC_017325	GGC	2	6	1026618	1026623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535453
24034	NC_017325	GC	3	6	1026640	1026645	0 %	0 %	50 %	50 %	384535453
24035	NC_017325	GCC	2	6	1026714	1026719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535453
24036	NC_017325	GTT	2	6	1026780	1026785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535453
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24038	NC_017325	GGA	2	6	1026924	1026929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535453
24039	NC_017325	GAT	2	6	1026966	1026971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535453
24040	NC_017325	CGG	2	6	1027010	1027015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535453
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24042	NC_017325	CGC	4	12	1027100	1027111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535453
24043	NC_017325	GAT	2	6	1027119	1027124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535453
24044	NC_017325	GAT	2	6	1027127	1027132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535453
24045	NC_017325	CGTCAG	2	12	1027170	1027181	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384535453
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24047	NC_017325	CGT	2	6	1027310	1027315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535453
24048	NC_017325	CGA	2	6	1027365	1027370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535453
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24050	NC_017325	GTC	2	6	1027501	1027506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535453
24051	NC_017325	CCG	2	6	1027510	1027515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535453
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24053	NC_017325	CGG	2	6	1027595	1027600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535453
24054	NC_017325	GCCG	2	8	1027647	1027654	0 %	0 %	50 %	50 %	384535453
24055	NC_017325	GA	3	6	1027722	1027727	50 %	0 %	50 %	0 %	384535454
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24057	NC_017325	GCA	2	6	1027820	1027825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535454
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24059	NC_017325	CAA	2	6	1027840	1027845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535454
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24064	NC_017325	TCG	2	6	1028170	1028175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535454
24065	NC_017325	GC	3	6	1028185	1028190	0 %	0 %	50 %	50 %	384535454
24066	NC_017325	TCGA	2	8	1028226	1028233	25 %	25 %	25 %	25 %	384535454
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24071	NC_017325	GCT	2	6	1028516	1028521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535454
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24073	NC_017325	GGC	2	6	1028624	1028629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24074	NC_017325	CCG	2	6	1028663	1028668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535455
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24079	NC_017325	TGA	2	6	1028851	1028856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535455
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24088	NC_017325	CGA	2	6	1029139	1029144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535455
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24091	NC_017325	TTCCT	2	10	1029251	1029260	0 %	60 %	0 %	40 %	384535455
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24101	NC_017325	ATG	2	6	1029582	1029587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535455
24102	NC_017325	TCG	2	6	1029588	1029593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535455
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24104	NC_017325	TCG	2	6	1029720	1029725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535455
24105	NC_017325	GC	3	6	1029771	1029776	0 %	0 %	50 %	50 %	384535455
24106	NC_017325	GCG	3	9	1029957	1029965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535455
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24114	NC_017325	TCG	2	6	1030228	1030233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535455
24115	NC_017325	AGC	2	6	1030260	1030265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535455
24116	NC_017325	CGC	2	6	1030274	1030279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535456
24117	NC_017325	CCT	2	6	1030282	1030287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535456
24118	NC_017325	TCA	2	6	1030307	1030312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535456
24119	NC_017325	CGA	3	9	1030319	1030327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535456
24120	NC_017325	GCG	2	6	1030348	1030353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535456
24121	NC_017325	GAT	2	6	1030392	1030397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535456
24122	NC_017325	TTG	2	6	1030405	1030410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535456
24123	NC_017325	CGG	2	6	1030433	1030438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535456
24124	NC_017325	GGC	2	6	1030441	1030446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535456
24125	NC_017325	GCCGAG	2	12	1030452	1030463	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384535456
24126	NC_017325	AGC	2	6	1030522	1030527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535456
24127	NC_017325	GAT	2	6	1030560	1030565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535456
24128	NC_017325	CGC	2	6	1030580	1030585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535456
24129	NC_017325	CGC	2	6	1030593	1030598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535456
24130	NC_017325	CGA	2	6	1030601	1030606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535456
24131	NC_017325	CG	3	6	1030655	1030660	0 %	0 %	50 %	50 %	384535456
24132	NC_017325	TCGAG	2	10	1030661	1030670	20 %	20 %	40 %	20 %	384535456
24133	NC_017325	GCA	2	6	1030709	1030714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535456
24134	NC_017325	ACG	2	6	1030723	1030728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535456
24135	NC_017325	CAT	2	6	1030755	1030760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535456
24136	NC_017325	GAA	2	6	1030779	1030784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535456
24137	NC_017325	CGA	2	6	1030790	1030795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535456
24138	NC_017325	GCC	2	6	1030797	1030802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535456
24139	NC_017325	GCC	2	6	1030858	1030863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535456
24140	NC_017325	CGC	2	6	1030949	1030954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535456
24141	NC_017325	ACC	2	6	1030978	1030983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535456
24142	NC_017325	GAT	2	6	1031049	1031054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535456
24143	NC_017325	GCC	2	6	1031139	1031144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535457
24144	NC_017325	ACG	2	6	1031193	1031198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535457
24145	NC_017325	CCA	2	6	1031224	1031229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535457
24146	NC_017325	AGACGA	2	12	1031251	1031262	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384535457
24147	NC_017325	CGA	4	12	1031266	1031277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535457
24148	NC_017325	CGA	2	6	1031281	1031286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535457
24149	NC_017325	TGA	2	6	1031317	1031322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535457
24150	NC_017325	GCG	2	6	1031343	1031348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535457
24151	NC_017325	GC	3	6	1031351	1031356	0 %	0 %	50 %	50 %	384535457
24152	NC_017325	GAT	2	6	1031357	1031362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535457
24153	NC_017325	CGG	2	6	1031389	1031394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535457
24154	NC_017325	GAC	2	6	1031409	1031414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535457
24155	NC_017325	CG	4	8	1031432	1031439	0 %	0 %	50 %	50 %	384535457
24156	NC_017325	CAT	2	6	1031447	1031452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535457
24157	NC_017325	CACGAG	2	12	1031465	1031476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535457
24158	NC_017325	GAA	2	6	1031573	1031578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535457
24159	NC_017325	GAA	2	6	1031600	1031605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535457
24160	NC_017325	CGC	2	6	1031621	1031626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535457
24161	NC_017325	TGA	2	6	1031641	1031646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535457
24162	NC_017325	CAGG	2	8	1031653	1031660	25 %	0 %	50 %	25 %	384535457
24163	NC_017325	GAA	2	6	1031726	1031731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535457
24164	NC_017325	GCC	2	6	1031825	1031830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535457
24165	NC_017325	GCTC	2	8	1031848	1031855	0 %	25 %	25 %	50 %	384535457
24166	NC_017325	GCG	2	6	1031902	1031907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535457
24167	NC_017325	GGT	2	6	1031927	1031932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535457
24168	NC_017325	GCC	2	6	1031960	1031965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535457
24169	NC_017325	ATC	2	6	1031970	1031975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535457
24170	NC_017325	GCC	2	6	1032058	1032063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535457
24171	NC_017325	GCC	2	6	1032071	1032076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535457
24172	NC_017325	TCG	2	6	1032081	1032086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535457
24173	NC_017325	GGGTT	2	10	1032093	1032102	0 %	40 %	60 %	0 %	384535457
24174	NC_017325	CAT	2	6	1032194	1032199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535458
24175	NC_017325	GCC	2	6	1032325	1032330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535458
24176	NC_017325	TCG	2	6	1032332	1032337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24177	NC_017325	CAT	2	6	1032343	1032348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535458
24178	NC_017325	GCTTC	2	10	1032375	1032384	0 %	40 %	20 %	40 %	384535458
24179	NC_017325	GA	3	6	1032464	1032469	50 %	0 %	50 %	0 %	384535458
24180	NC_017325	CGCC	2	8	1032503	1032510	0 %	0 %	25 %	75 %	384535458
24181	NC_017325	CTCGAT	2	12	1032583	1032594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384535458
24182	NC_017325	CTT	2	6	1032601	1032606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535458
24183	NC_017325	GCA	3	9	1032669	1032677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24184	NC_017325	GCC	2	6	1032713	1032718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535458
24185	NC_017325	GCC	2	6	1032808	1032813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535458
24186	NC_017325	GTT	2	6	1032874	1032879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535458
24187	NC_017325	ATG	2	6	1032905	1032910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535458
24188	NC_017325	CTT	2	6	1032961	1032966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535458
24189	NC_017325	TGA	2	6	1032999	1033004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535458
24190	NC_017325	GGA	2	6	1033018	1033023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535458
24191	NC_017325	GC	3	6	1033036	1033041	0 %	0 %	50 %	50 %	384535458
24192	NC_017325	CGGT	2	8	1033088	1033095	0 %	25 %	50 %	25 %	384535458
24193	NC_017325	GTC	2	6	1033102	1033107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24194	NC_017325	ATC	2	6	1033175	1033180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535458
24195	NC_017325	GCC	2	6	1033198	1033203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535458
24196	NC_017325	GAT	2	6	1033213	1033218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535458
24197	NC_017325	AGC	3	9	1033235	1033243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24198	NC_017325	CGTCAG	2	12	1033264	1033275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24199	NC_017325	TTGA	2	8	1033307	1033314	25 %	50 %	25 %	0 %	384535458
24200	NC_017325	TCA	2	6	1033317	1033322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535458
24201	NC_017325	GC	3	6	1033329	1033334	0 %	0 %	50 %	50 %	384535458
24202	NC_017325	CGGACT	2	12	1033335	1033346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24203	NC_017325	GT	3	6	1033355	1033360	0 %	50 %	50 %	0 %	384535458
24204	NC_017325	TGA	2	6	1033374	1033379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535458
24205	NC_017325	CGT	2	6	1033380	1033385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24206	NC_017325	CGT	2	6	1033404	1033409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24207	NC_017325	GGC	2	6	1033447	1033452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535458
24208	NC_017325	CGG	2	6	1033455	1033460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535458
24209	NC_017325	GTC	2	6	1033502	1033507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24210	NC_017325	CGA	2	6	1033518	1033523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535458
24211	NC_017325	CCG	2	6	1033631	1033636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535458
24212	NC_017325	GGC	2	6	1033705	1033710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535458
24213	NC_017325	CTT	2	6	1033800	1033805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24214	NC_017325	CGTT	2	8	1033820	1033827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24215	NC_017325	GGT	2	6	1033875	1033880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24216	NC_017325	CCT	2	6	1033912	1033917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24217	NC_017325	CTCG	2	8	1034192	1034199	0 %	25 %	25 %	50 %	384535459
24218	NC_017325	GTC	2	6	1034250	1034255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535459
24219	NC_017325	GCG	2	6	1034311	1034316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535459
24220	NC_017325	GC	3	6	1034333	1034338	0 %	0 %	50 %	50 %	384535459
24221	NC_017325	CG	3	6	1034348	1034353	0 %	0 %	50 %	50 %	384535459
24222	NC_017325	CCGG	2	8	1034367	1034374	0 %	0 %	50 %	50 %	384535459
24223	NC_017325	AGC	2	6	1034436	1034441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535459
24224	NC_017325	GAT	2	6	1034555	1034560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535459
24225	NC_017325	GTCG	2	8	1034561	1034568	0 %	25 %	50 %	25 %	384535459
24226	NC_017325	GCC	2	6	1034585	1034590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535459
24227	NC_017325	GAT	2	6	1034618	1034623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535459
24228	NC_017325	TTG	2	6	1034628	1034633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535459
24229	NC_017325	GCC	2	6	1034654	1034659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535459
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24231	NC_017325	CCG	3	9	1034701	1034709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535459
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24332	NC_017325	CG	3	6	1038360	1038365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24333	NC_017325	CTC	2	6	1038374	1038379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24334	NC_017325	CTC	2	6	1038419	1038424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24335	NC_017325	GCC	2	6	1038607	1038612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535462
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24338	NC_017325	CGG	2	6	1038736	1038741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535462
24339	NC_017325	GAA	2	6	1038782	1038787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535462
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24341	NC_017325	GTA	2	6	1038887	1038892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535462
24342	NC_017325	GGCC	2	8	1038898	1038905	0 %	0 %	50 %	50 %	384535462
24343	NC_017325	GGC	2	6	1039013	1039018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535462
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24346	NC_017325	GCC	2	6	1039142	1039147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535462
24347	NC_017325	GCAT	2	8	1039164	1039171	25 %	25 %	25 %	25 %	384535462
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