MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_017325	CGT	2	6	807167	807172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535223
19002	NC_017325	GAA	2	6	807184	807189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535223
19003	NC_017325	GAT	2	6	807218	807223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535223
19004	NC_017325	GTC	2	6	807230	807235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535223
19005	NC_017325	CCG	2	6	807327	807332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19006	NC_017325	TC	3	6	807341	807346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19007	NC_017325	CGA	2	6	807373	807378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535224
19008	NC_017325	CTC	2	6	807437	807442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535224
19009	NC_017325	CGG	2	6	807460	807465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535224
19010	NC_017325	CGA	2	6	807506	807511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535224
19011	NC_017325	CCT	2	6	807547	807552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535224
19012	NC_017325	GACAT	2	10	807588	807597	40 %	20 %	20 %	20 %	384535224
19013	NC_017325	GAG	2	6	807599	807604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535224
19014	NC_017325	GTC	2	6	807665	807670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535224
19015	NC_017325	CGG	2	6	807676	807681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535224
19016	NC_017325	TGGG	2	8	807699	807706	0 %	25 %	75 %	0 %	384535224
19017	NC_017325	GCC	3	9	807750	807758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535224
19018	NC_017325	CGA	2	6	807760	807765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535224
19019	NC_017325	CACCGG	2	12	807785	807796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384535224
19020	NC_017325	CCA	2	6	807832	807837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535224
19021	NC_017325	CGA	2	6	807886	807891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535224
19022	NC_017325	G	6	6	807916	807921	0 %	0 %	100 %	0 %	384535224
19023	NC_017325	TTC	2	6	807926	807931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535224
19024	NC_017325	CAG	2	6	808052	808057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535224
19025	NC_017325	CAA	2	6	808060	808065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535224
19026	NC_017325	CTT	2	6	808198	808203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535225
19027	NC_017325	CGC	2	6	808244	808249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535225
19028	NC_017325	GAT	2	6	808256	808261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535225
19029	NC_017325	GCCAT	2	10	808281	808290	20 %	20 %	20 %	40 %	384535225
19030	NC_017325	GCC	2	6	808320	808325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535225
19031	NC_017325	TCT	2	6	808330	808335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535225
19032	NC_017325	GTC	2	6	808349	808354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535225
19033	NC_017325	TGTC	2	8	808357	808364	0 %	50 %	25 %	25 %	384535225
19034	NC_017325	CAT	2	6	808376	808381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535225
19035	NC_017325	CTT	2	6	808469	808474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19036	NC_017325	CT	3	6	808479	808484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19037	NC_017325	AGC	2	6	808495	808500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19038	NC_017325	CGA	2	6	808566	808571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535226
19039	NC_017325	TTC	2	6	808609	808614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535226
19040	NC_017325	GCG	2	6	808682	808687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535226
19041	NC_017325	GCC	2	6	808718	808723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535226
19042	NC_017325	GCG	2	6	808750	808755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535226
19043	NC_017325	CCGAG	2	10	808803	808812	20 %	0 %	40 %	40 %	384535226
19044	NC_017325	TCC	2	6	808859	808864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535226
19045	NC_017325	GAGGGA	2	12	808874	808885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535226
19046	NC_017325	GTC	2	6	808889	808894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535226
19047	NC_017325	GCT	2	6	808905	808910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535226
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19050	NC_017325	GAG	2	6	808942	808947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535226
19051	NC_017325	GGCC	3	12	809044	809055	0 %	0 %	50 %	50 %	384535227
19052	NC_017325	TCC	2	6	809110	809115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535227
19053	NC_017325	CGG	2	6	809135	809140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535227
19054	NC_017325	CAT	2	6	809141	809146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535227
19055	NC_017325	GCC	2	6	809337	809342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535227
19056	NC_017325	CTG	2	6	809360	809365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535227
19057	NC_017325	CGG	2	6	809367	809372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535227
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19059	NC_017325	AAG	2	6	809388	809393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535227
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19061	NC_017325	GGA	2	6	809421	809426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535227
19062	NC_017325	GC	3	6	809428	809433	0 %	0 %	50 %	50 %	384535227
19063	NC_017325	GTT	2	6	809438	809443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535227
19064	NC_017325	TCA	2	6	809447	809452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535227
19065	NC_017325	TAC	2	6	809485	809490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535228
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19068	NC_017325	ATCGTG	2	12	809626	809637	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384535228
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19085	NC_017325	GGC	2	6	810607	810612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535229
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19087	NC_017325	GAT	2	6	810757	810762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19088	NC_017325	GAC	2	6	810814	810819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19089	NC_017325	CG	3	6	810862	810867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19090	NC_017325	ATT	2	6	810898	810903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19091	NC_017325	ATT	2	6	810913	810918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19092	NC_017325	CTGGC	2	10	810932	810941	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19093	NC_017325	CG	3	6	810974	810979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19094	NC_017325	TGCA	2	8	811009	811016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19095	NC_017325	ACA	2	6	811061	811066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535230
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19097	NC_017325	ATC	2	6	811177	811182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535230
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19101	NC_017325	CG	4	8	811406	811413	0 %	0 %	50 %	50 %	384535230
19102	NC_017325	GAT	2	6	811431	811436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535230
19103	NC_017325	ATC	2	6	811441	811446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535230
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19108	NC_017325	ACGAGA	2	12	811772	811783	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384535230
19109	NC_017325	CTT	2	6	811909	811914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535230
19110	NC_017325	CGG	2	6	811929	811934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535230
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19112	NC_017325	GGA	2	6	812019	812024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535230
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19114	NC_017325	AGGCG	2	10	812070	812079	20 %	0 %	60 %	20 %	384535230
19115	NC_017325	CGT	2	6	812088	812093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535230
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19120	NC_017325	GCG	2	6	812203	812208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535230
19121	NC_017325	GTG	2	6	812218	812223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535230
19122	NC_017325	AGG	2	6	812228	812233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535230
19123	NC_017325	CGA	2	6	812241	812246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535230
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19127	NC_017325	AGG	2	6	812473	812478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19128	NC_017325	GTG	2	6	812518	812523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535231
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19207	NC_017325	CATC	2	8	816631	816638	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19208	NC_017325	CCGT	2	8	816666	816673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19209	NC_017325	AGG	2	6	816687	816692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19210	NC_017325	TGT	2	6	816862	816867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535236
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19221	NC_017325	GCT	3	9	817163	817171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535236
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19228	NC_017325	TGA	2	6	817492	817497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535236
19229	NC_017325	GCT	2	6	817517	817522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535236
19230	NC_017325	CGA	2	6	817531	817536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535236
19231	NC_017325	CGA	2	6	817561	817566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535236
19232	NC_017325	TCG	2	6	817621	817626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535236
19233	NC_017325	GCG	2	6	817691	817696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535236
19234	NC_017325	GCCG	2	8	817712	817719	0 %	0 %	50 %	50 %	384535236
19235	NC_017325	GCGG	2	8	817753	817760	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19236	NC_017325	CA	3	6	817768	817773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19237	NC_017325	GAT	2	6	817808	817813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535237
19238	NC_017325	GGC	2	6	818008	818013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535237
19239	NC_017325	CGA	2	6	818038	818043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535237
19240	NC_017325	CCCG	2	8	818063	818070	0 %	0 %	25 %	75 %	384535237
19241	NC_017325	CGA	2	6	818077	818082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535237
19242	NC_017325	GC	3	6	818091	818096	0 %	0 %	50 %	50 %	384535237
19243	NC_017325	CATG	2	8	818119	818126	25 %	25 %	25 %	25 %	384535237
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19355	NC_017325	CG	3	6	822092	822097	0 %	0 %	50 %	50 %	384535239
19356	NC_017325	GCC	2	6	822113	822118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535239
19357	NC_017325	GATCCT	2	12	822119	822130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384535239
19358	NC_017325	CGA	2	6	822131	822136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535239
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19360	NC_017325	TCA	2	6	822244	822249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535239
19361	NC_017325	CGA	2	6	822254	822259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535239
19362	NC_017325	ATC	2	6	822261	822266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535239
19363	NC_017325	CGG	2	6	822323	822328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535239
19364	NC_017325	GCC	2	6	822349	822354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535239
19365	NC_017325	GCGT	2	8	822391	822398	0 %	25 %	50 %	25 %	384535239
19366	NC_017325	CGA	2	6	822404	822409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535239
19367	NC_017325	TCG	2	6	822418	822423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535239
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19369	NC_017325	TTC	2	6	822709	822714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535240
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19383	NC_017325	CCTG	2	8	823137	823144	0 %	25 %	25 %	50 %	384535240
19384	NC_017325	CG	3	6	823157	823162	0 %	0 %	50 %	50 %	384535240
19385	NC_017325	CGGT	2	8	823166	823173	0 %	25 %	50 %	25 %	384535240
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19396	NC_017325	CTG	2	6	823789	823794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535241
19397	NC_017325	CCTT	2	8	823874	823881	0 %	50 %	0 %	50 %	384535241
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19402	NC_017325	GC	3	6	824201	824206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19403	NC_017325	GCG	2	6	824211	824216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19404	NC_017325	TCGG	2	8	824268	824275	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19405	NC_017325	GCC	2	6	824295	824300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19406	NC_017325	CGCT	2	8	824341	824348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19407	NC_017325	CGGG	2	8	824353	824360	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19408	NC_017325	TTTGG	2	10	824452	824461	0 %	60 %	40 %	0 %	384535242
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19426	NC_017325	GCT	2	6	825817	825822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535243
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19451	NC_017325	CAAG	2	8	826933	826940	50 %	0 %	25 %	25 %	384535243
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19474	NC_017325	CGA	2	6	827761	827766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535244
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19479	NC_017325	GAC	2	6	828014	828019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535244
19480	NC_017325	TC	3	6	828064	828069	0 %	50 %	0 %	50 %	384535244
19481	NC_017325	GCC	2	6	828071	828076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535244
19482	NC_017325	GTC	2	6	828095	828100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535244
19483	NC_017325	AGC	2	6	828141	828146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535244
19484	NC_017325	CG	3	6	828149	828154	0 %	0 %	50 %	50 %	384535244
19485	NC_017325	TCA	2	6	828174	828179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535244
19486	NC_017325	CGA	2	6	828225	828230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535244
19487	NC_017325	TCC	2	6	828243	828248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535244
19488	NC_017325	TCGA	2	8	828253	828260	25 %	25 %	25 %	25 %	384535244
19489	NC_017325	GGC	2	6	828298	828303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19490	NC_017325	GGA	2	6	828347	828352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19491	NC_017325	G	6	6	828375	828380	0 %	0 %	100 %	0 %	384535245
19492	NC_017325	CG	4	8	828415	828422	0 %	0 %	50 %	50 %	384535245
19493	NC_017325	CG	3	6	828424	828429	0 %	0 %	50 %	50 %	384535245
19494	NC_017325	AGC	2	6	828432	828437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535245
19495	NC_017325	CCG	2	6	828470	828475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535245
19496	NC_017325	CGGC	2	8	828553	828560	0 %	0 %	50 %	50 %	384535245
19497	NC_017325	CGG	2	6	828591	828596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535245
19498	NC_017325	GAC	4	12	828607	828618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535245
19499	NC_017325	AAG	2	6	828653	828658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535245
19500	NC_017325	GGGCG	2	10	828709	828718	0 %	0 %	80 %	20 %	384535245

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