MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_017325	ATG	2	6	718602	718607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535141
17003	NC_017325	CGT	2	6	718622	718627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535141
17004	NC_017325	GTC	2	6	718680	718685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535141
17005	NC_017325	CGA	2	6	718703	718708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535141
17006	NC_017325	CTCG	2	8	718742	718749	0 %	25 %	25 %	50 %	384535141
17007	NC_017325	GGA	3	9	718799	718807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535141
17008	NC_017325	CGG	2	6	718840	718845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535141
17009	NC_017325	G	6	6	718879	718884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_017325	TGG	2	6	718931	718936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535142
17011	NC_017325	GCC	2	6	718969	718974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535142
17012	NC_017325	GCG	2	6	718993	718998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17013	NC_017325	CGC	2	6	719039	719044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535142
17014	NC_017325	GCG	2	6	719209	719214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17015	NC_017325	GGCG	2	8	719246	719253	0 %	0 %	75 %	25 %	384535142
17016	NC_017325	CGG	2	6	719304	719309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17017	NC_017325	GAC	2	6	719316	719321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17018	NC_017325	GGC	2	6	719346	719351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17019	NC_017325	CGG	2	6	719357	719362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17020	NC_017325	CGAT	2	8	719363	719370	25 %	25 %	25 %	25 %	384535142
17021	NC_017325	CTG	2	6	719374	719379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17022	NC_017325	GC	3	6	719384	719389	0 %	0 %	50 %	50 %	384535142
17023	NC_017325	CGT	3	9	719445	719453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17024	NC_017325	TTC	2	6	719493	719498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535142
17025	NC_017325	GTC	2	6	719512	719517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17026	NC_017325	CAT	2	6	719538	719543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535142
17027	NC_017325	CGA	2	6	719553	719558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17028	NC_017325	GCG	2	6	719586	719591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17029	NC_017325	GA	3	6	719611	719616	50 %	0 %	50 %	0 %	384535142
17030	NC_017325	GGC	2	6	719697	719702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17031	NC_017325	GCC	2	6	719743	719748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535142
17032	NC_017325	TCA	2	6	719750	719755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535142
17033	NC_017325	GGCG	2	8	719784	719791	0 %	0 %	75 %	25 %	384535142
17034	NC_017325	ACA	2	6	719924	719929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535142
17035	NC_017325	GCG	2	6	719942	719947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17036	NC_017325	TTC	2	6	719965	719970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535142
17037	NC_017325	GCA	2	6	719979	719984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17038	NC_017325	GGC	2	6	719995	720000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17039	NC_017325	GCTGCG	2	12	720012	720023	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384535142
17040	NC_017325	TGC	2	6	720038	720043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17041	NC_017325	CTT	2	6	720163	720168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535142
17042	NC_017325	CTTC	2	8	720227	720234	0 %	50 %	0 %	50 %	384535142
17043	NC_017325	CG	3	6	720248	720253	0 %	0 %	50 %	50 %	384535142
17044	NC_017325	TGC	2	6	720254	720259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17045	NC_017325	GCG	2	6	720270	720275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17046	NC_017325	AGG	2	6	720296	720301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535142
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17048	NC_017325	GAA	2	6	720375	720380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535142
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17050	NC_017325	GTCG	2	8	720456	720463	0 %	25 %	50 %	25 %	384535142
17051	NC_017325	GC	3	6	720466	720471	0 %	0 %	50 %	50 %	384535142
17052	NC_017325	CGA	2	6	720531	720536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17053	NC_017325	CGG	2	6	720575	720580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535142
17054	NC_017325	GCT	2	6	720597	720602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17055	NC_017325	CAA	2	6	720606	720611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535142
17056	NC_017325	CCT	2	6	720618	720623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535142
17057	NC_017325	GTC	2	6	720645	720650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17058	NC_017325	CAT	2	6	720669	720674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535142
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17060	NC_017325	GCT	2	6	720717	720722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
17061	NC_017325	TCG	2	6	720770	720775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
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17063	NC_017325	CAT	2	6	720816	720821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535142
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17070	NC_017325	TCG	2	6	720998	721003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535142
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17087	NC_017325	GCCG	2	8	721722	721729	0 %	0 %	50 %	50 %	384535142
17088	NC_017325	TGCCG	2	10	721747	721756	0 %	20 %	40 %	40 %	384535142
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17090	NC_017325	GTT	2	6	721834	721839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535142
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17093	NC_017325	AGCG	2	8	721950	721957	25 %	0 %	50 %	25 %	384535143
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17099	NC_017325	CGG	2	6	722193	722198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535143
17100	NC_017325	GGA	2	6	722219	722224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535143
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17102	NC_017325	TCG	2	6	722266	722271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535143
17103	NC_017325	GATC	2	8	722305	722312	25 %	25 %	25 %	25 %	384535143
17104	NC_017325	CG	3	6	722317	722322	0 %	0 %	50 %	50 %	384535143
17105	NC_017325	GGCC	2	8	722335	722342	0 %	0 %	50 %	50 %	384535143
17106	NC_017325	TGA	2	6	722371	722376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535143
17107	NC_017325	CG	3	6	722410	722415	0 %	0 %	50 %	50 %	384535143
17108	NC_017325	CCGAG	2	10	722434	722443	20 %	0 %	40 %	40 %	384535143
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17111	NC_017325	CTG	2	6	722615	722620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535143
17112	NC_017325	GA	3	6	722643	722648	50 %	0 %	50 %	0 %	384535143
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17115	NC_017325	CG	3	6	722749	722754	0 %	0 %	50 %	50 %	384535143
17116	NC_017325	GCG	2	6	722756	722761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535143
17117	NC_017325	CAGC	2	8	722774	722781	25 %	0 %	25 %	50 %	384535143
17118	NC_017325	TCG	2	6	722784	722789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535143
17119	NC_017325	CTCG	2	8	722801	722808	0 %	25 %	25 %	50 %	384535143
17120	NC_017325	TCCGG	2	10	722824	722833	0 %	20 %	40 %	40 %	384535143
17121	NC_017325	CGA	2	6	722851	722856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535143
17122	NC_017325	GCC	2	6	722865	722870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535143
17123	NC_017325	GCA	2	6	722871	722876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535143
17124	NC_017325	TGC	2	6	723060	723065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535143
17125	NC_017325	CATA	2	8	723144	723151	50 %	25 %	0 %	25 %	384535143
17126	NC_017325	GATC	2	8	723184	723191	25 %	25 %	25 %	25 %	384535143
17127	NC_017325	CATG	2	8	723250	723257	25 %	25 %	25 %	25 %	384535143
17128	NC_017325	GGC	2	6	723263	723268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535143
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17130	NC_017325	GCATCG	2	12	723429	723440	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384535143
17131	NC_017325	GAC	2	6	723476	723481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535143
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17143	NC_017325	GCT	3	9	723894	723902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535143
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17148	NC_017325	GAT	2	6	724004	724009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535143
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17150	NC_017325	CG	3	6	724167	724172	0 %	0 %	50 %	50 %	384535143
17151	NC_017325	GTC	2	6	724193	724198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17152	NC_017325	TTC	2	6	724244	724249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17153	NC_017325	GC	3	6	724312	724317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17154	NC_017325	GGC	2	6	724439	724444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17155	NC_017325	TGC	2	6	724445	724450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17156	NC_017325	CTC	2	6	724481	724486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17157	NC_017325	GAG	2	6	724510	724515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17158	NC_017325	CAA	2	6	724518	724523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17159	NC_017325	CGG	2	6	724587	724592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535144
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17161	NC_017325	GC	3	6	724623	724628	0 %	0 %	50 %	50 %	384535144
17162	NC_017325	GGCC	2	8	724638	724645	0 %	0 %	50 %	50 %	384535144
17163	NC_017325	T	6	6	724650	724655	0 %	100 %	0 %	0 %	384535144
17164	NC_017325	CG	3	6	724691	724696	0 %	0 %	50 %	50 %	384535144
17165	NC_017325	TCG	2	6	724899	724904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535144
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17213	NC_017325	TCGG	2	8	727145	727152	0 %	25 %	50 %	25 %	384535144
17214	NC_017325	GCTTGC	2	12	727208	727219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17215	NC_017325	GCA	2	6	727308	727313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17216	NC_017325	CGA	2	6	727386	727391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17217	NC_017325	T	6	6	727392	727397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17218	NC_017325	TAAA	2	8	727407	727414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17219	NC_017325	GCA	2	6	727436	727441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17220	NC_017325	ATC	2	6	727463	727468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17221	NC_017325	A	6	6	727472	727477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17222	NC_017325	TGC	2	6	727507	727512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17223	NC_017325	GCC	2	6	727552	727557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535145
17224	NC_017325	TCC	2	6	727561	727566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535145
17225	NC_017325	TTG	2	6	727572	727577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535145
17226	NC_017325	CGT	3	9	727676	727684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535145
17227	NC_017325	CGA	2	6	727721	727726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535145
17228	NC_017325	CTGCCG	2	12	727908	727919	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384535145
17229	NC_017325	ATGCC	2	10	727939	727948	20 %	20 %	20 %	40 %	384535145
17230	NC_017325	GCT	2	6	727949	727954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535145
17231	NC_017325	GT	3	6	728035	728040	0 %	50 %	50 %	0 %	384535145
17232	NC_017325	ATC	2	6	728043	728048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535145
17233	NC_017325	GCAC	2	8	728185	728192	25 %	0 %	25 %	50 %	384535145
17234	NC_017325	TCGC	2	8	728232	728239	0 %	25 %	25 %	50 %	384535145
17235	NC_017325	GCG	3	9	728308	728316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535145
17236	NC_017325	CTG	2	6	728328	728333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535145
17237	NC_017325	CGA	2	6	728362	728367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535145
17238	NC_017325	TCG	2	6	728467	728472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535145
17239	NC_017325	TCA	2	6	728488	728493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535145
17240	NC_017325	GC	4	8	728530	728537	0 %	0 %	50 %	50 %	384535145
17241	NC_017325	CGC	2	6	728548	728553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535145
17242	NC_017325	CAGG	2	8	728590	728597	25 %	0 %	50 %	25 %	384535146
17243	NC_017325	CTG	2	6	728631	728636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535146
17244	NC_017325	TGC	2	6	728719	728724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535146
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17347	NC_017325	GTTTAC	2	12	732962	732973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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17350	NC_017325	CAA	2	6	733134	733139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384535152
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17352	NC_017325	TCG	2	6	733180	733185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535152
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17357	NC_017325	CGA	2	6	733382	733387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535152
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17359	NC_017325	TGA	2	6	733450	733455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535152
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17391	NC_017325	GCGA	2	8	735007	735014	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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