MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_017325	GCCG	2	8	613681	613688	0 %	0 %	50 %	50 %	384535037
14502	NC_017325	GAT	2	6	613698	613703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535037
14503	NC_017325	AGG	2	6	613757	613762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535037
14504	NC_017325	CTTC	2	8	613781	613788	0 %	50 %	0 %	50 %	384535037
14505	NC_017325	GAT	2	6	613902	613907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535037
14506	NC_017325	CGA	2	6	613916	613921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535037
14507	NC_017325	GAT	2	6	613941	613946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535037
14508	NC_017325	GCC	2	6	613989	613994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14509	NC_017325	GAG	2	6	614002	614007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_017325	GCG	2	6	614015	614020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14511	NC_017325	TGG	2	6	614028	614033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_017325	TCG	2	6	614118	614123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14513	NC_017325	TCG	2	6	614140	614145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14514	NC_017325	CCG	2	6	614290	614295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535038
14515	NC_017325	GCC	2	6	614328	614333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535038
14516	NC_017325	GCG	2	6	614348	614353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535038
14517	NC_017325	CGCC	2	8	614415	614422	0 %	0 %	25 %	75 %	384535038
14518	NC_017325	CG	3	6	614499	614504	0 %	0 %	50 %	50 %	384535038
14519	NC_017325	CGG	2	6	614559	614564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535038
14520	NC_017325	GCC	2	6	614656	614661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535038
14521	NC_017325	GCC	2	6	614746	614751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535038
14522	NC_017325	CCTT	2	8	614822	614829	0 %	50 %	0 %	50 %	384535038
14523	NC_017325	GAT	2	6	614838	614843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_017325	CGG	2	6	614877	614882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_017325	GCG	2	6	614902	614907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_017325	TCA	2	6	615005	615010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535039
14527	NC_017325	GTT	2	6	615011	615016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384535039
14528	NC_017325	GCC	2	6	615038	615043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535039
14529	NC_017325	CTGG	2	8	615055	615062	0 %	25 %	50 %	25 %	384535039
14530	NC_017325	CAT	2	6	615067	615072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535039
14531	NC_017325	GTC	2	6	615125	615130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14532	NC_017325	CGG	2	6	615160	615165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535039
14533	NC_017325	GAC	2	6	615206	615211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14534	NC_017325	CTTC	2	8	615228	615235	0 %	50 %	0 %	50 %	384535039
14535	NC_017325	GCT	2	6	615265	615270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14536	NC_017325	TGCC	2	8	615271	615278	0 %	25 %	25 %	50 %	384535039
14537	NC_017325	TCC	2	6	615351	615356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384535039
14538	NC_017325	ATC	2	6	615386	615391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535039
14539	NC_017325	GCC	2	6	615426	615431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535039
14540	NC_017325	GCCAAG	2	12	615476	615487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14541	NC_017325	GGC	2	6	615517	615522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535039
14542	NC_017325	ACG	3	9	615525	615533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14543	NC_017325	CGA	2	6	615592	615597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14544	NC_017325	GCT	2	6	615634	615639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14545	NC_017325	CGT	2	6	615676	615681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14546	NC_017325	TTC	2	6	615692	615697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535039
14547	NC_017325	CAC	2	6	615706	615711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535039
14548	NC_017325	CGGC	2	8	615733	615740	0 %	0 %	50 %	50 %	384535039
14549	NC_017325	TCG	2	6	615744	615749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14550	NC_017325	GCC	3	9	615779	615787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535039
14551	NC_017325	AAG	2	6	615845	615850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535039
14552	NC_017325	CG	3	6	615858	615863	0 %	0 %	50 %	50 %	384535039
14553	NC_017325	TGG	2	6	615879	615884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535039
14554	NC_017325	TCA	2	6	615894	615899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535039
14555	NC_017325	CGG	2	6	615973	615978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535039
14556	NC_017325	GAG	2	6	616058	616063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535039
14557	NC_017325	CGA	2	6	616084	616089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535039
14558	NC_017325	ACTGA	2	10	616123	616132	40 %	20 %	20 %	20 %	384535039
14559	NC_017325	TGAAC	2	10	616359	616368	40 %	20 %	20 %	20 %	384535040
14560	NC_017325	GCCG	2	8	616378	616385	0 %	0 %	50 %	50 %	384535040
14561	NC_017325	CG	3	6	616388	616393	0 %	0 %	50 %	50 %	384535040
14562	NC_017325	GGC	2	6	616405	616410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535040
14563	NC_017325	GTC	2	6	616414	616419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535040
14564	NC_017325	TGA	2	6	616491	616496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535040
14565	NC_017325	CG	3	6	616524	616529	0 %	0 %	50 %	50 %	384535040
14566	NC_017325	ATG	2	6	616631	616636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535040
14567	NC_017325	GAT	2	6	616716	616721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535040
14568	NC_017325	GAA	2	6	616804	616809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384535040
14569	NC_017325	TGC	2	6	616914	616919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535040
14570	NC_017325	GCGAG	2	10	617074	617083	20 %	0 %	60 %	20 %	384535041
14571	NC_017325	CAC	2	6	617091	617096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384535041
14572	NC_017325	GC	3	6	617130	617135	0 %	0 %	50 %	50 %	384535041
14573	NC_017325	GCC	2	6	617294	617299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535041
14574	NC_017325	GAG	2	6	617300	617305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535041
14575	NC_017325	CGA	2	6	617356	617361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535041
14576	NC_017325	CTT	2	6	617390	617395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535041
14577	NC_017325	TGC	2	6	617396	617401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535041
14578	NC_017325	CAGG	2	8	617472	617479	25 %	0 %	50 %	25 %	384535041
14579	NC_017325	TCG	2	6	617497	617502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535041
14580	NC_017325	CAT	2	6	617513	617518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535041
14581	NC_017325	CCGG	2	8	617536	617543	0 %	0 %	50 %	50 %	384535041
14582	NC_017325	GCG	2	6	617599	617604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535041
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14586	NC_017325	CG	4	8	617802	617809	0 %	0 %	50 %	50 %	384535041
14587	NC_017325	GTA	2	6	617813	617818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535041
14588	NC_017325	GGCC	2	8	617824	617831	0 %	0 %	50 %	50 %	384535041
14589	NC_017325	TCA	2	6	617839	617844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535041
14590	NC_017325	CGT	2	6	617930	617935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535041
14591	NC_017325	CTG	2	6	617936	617941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535041
14592	NC_017325	CGC	2	6	617996	618001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535041
14593	NC_017325	CGG	2	6	618005	618010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535041
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14596	NC_017325	GCG	2	6	618063	618068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535041
14597	NC_017325	CGC	2	6	618071	618076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535041
14598	NC_017325	CAT	2	6	618092	618097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535041
14599	NC_017325	TCGA	2	8	618156	618163	25 %	25 %	25 %	25 %	384535042
14600	NC_017325	GTGA	2	8	618187	618194	25 %	25 %	50 %	0 %	384535042
14601	NC_017325	GA	3	6	618193	618198	50 %	0 %	50 %	0 %	384535042
14602	NC_017325	CGT	2	6	618213	618218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535042
14603	NC_017325	GATC	2	8	618246	618253	25 %	25 %	25 %	25 %	384535042
14604	NC_017325	TGC	2	6	618287	618292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535042
14605	NC_017325	CCGG	2	8	618339	618346	0 %	0 %	50 %	50 %	384535042
14606	NC_017325	GCCGC	2	10	618360	618369	0 %	0 %	40 %	60 %	384535042
14607	NC_017325	CTT	2	6	618489	618494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535042
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14610	NC_017325	CGC	2	6	618569	618574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535042
14611	NC_017325	CGG	2	6	618595	618600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535042
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14613	NC_017325	GGC	2	6	618642	618647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535042
14614	NC_017325	GCG	2	6	618684	618689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535042
14615	NC_017325	CTG	2	6	618837	618842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535043
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14618	NC_017325	ACG	2	6	618915	618920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535043
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14620	NC_017325	CGA	2	6	618949	618954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535043
14621	NC_017325	GCC	2	6	618981	618986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535043
14622	NC_017325	GCC	2	6	619035	619040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535043
14623	NC_017325	TCG	2	6	619147	619152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535043
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14625	NC_017325	GCC	2	6	619287	619292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535043
14626	NC_017325	GC	3	6	619302	619307	0 %	0 %	50 %	50 %	384535043
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14633	NC_017325	GC	4	8	619731	619738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14634	NC_017325	CGGAGG	2	12	619758	619769	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14635	NC_017325	C	8	8	619839	619846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14636	NC_017325	CGG	2	6	619923	619928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535044
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14640	NC_017325	GC	3	6	620104	620109	0 %	0 %	50 %	50 %	384535044
14641	NC_017325	TGG	3	9	620119	620127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384535044
14642	NC_017325	TCG	2	6	620226	620231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535044
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14646	NC_017325	CGG	2	6	620437	620442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535044
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14652	NC_017325	ATCG	2	8	620621	620628	25 %	25 %	25 %	25 %	384535044
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14659	NC_017325	AAGC	2	8	620913	620920	50 %	0 %	25 %	25 %	384535044
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14661	NC_017325	AAC	2	6	620986	620991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14662	NC_017325	CCCTG	2	10	621015	621024	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14663	NC_017325	GGCAG	2	10	621039	621048	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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14732	NC_017325	GC	3	6	623199	623204	0 %	0 %	50 %	50 %	384535045
14733	NC_017325	CGC	3	9	623202	623210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535045
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14740	NC_017325	GA	3	6	623458	623463	50 %	0 %	50 %	0 %	384535045
14741	NC_017325	GGC	2	6	623477	623482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535045
14742	NC_017325	CGCGAG	2	12	623511	623522	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384535045
14743	NC_017325	GAG	2	6	623535	623540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535045
14744	NC_017325	CGA	2	6	623573	623578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535045
14745	NC_017325	CG	3	6	623586	623591	0 %	0 %	50 %	50 %	384535045
14746	NC_017325	TGA	2	6	623593	623598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384535045
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14748	NC_017325	CG	3	6	623759	623764	0 %	0 %	50 %	50 %	384535045
14749	NC_017325	GCG	2	6	623768	623773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535045
14750	NC_017325	C	6	6	623815	623820	0 %	0 %	0 %	100 %	384535045
14751	NC_017325	CGA	2	6	623852	623857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535045
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14753	NC_017325	GC	3	6	623939	623944	0 %	0 %	50 %	50 %	384535045
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14755	NC_017325	GCT	2	6	623984	623989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535045
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14762	NC_017325	GCC	2	6	624206	624211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535045
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14764	NC_017325	GCT	2	6	624236	624241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535045
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14771	NC_017325	CCGC	2	8	624664	624671	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14772	NC_017325	TA	3	6	624759	624764	50 %	50 %	0 %	0 %	384535046
14773	NC_017325	GGC	2	6	624815	624820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535046
14774	NC_017325	GCC	2	6	624865	624870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384535046
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14797	NC_017325	CGA	2	6	625926	625931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535046
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14806	NC_017325	TCG	2	6	626157	626162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535046
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14813	NC_017325	GC	4	8	626420	626427	0 %	0 %	50 %	50 %	384535046
14814	NC_017325	TTC	2	6	626480	626485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384535046
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14840	NC_017325	CGA	2	6	627390	627395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535046
14841	NC_017325	GGC	2	6	627430	627435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535046
14842	NC_017325	TCG	2	6	627526	627531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14843	NC_017325	CGGC	2	8	627673	627680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14844	NC_017325	ATC	2	6	627725	627730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14845	NC_017325	TGA	2	6	627735	627740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14846	NC_017325	CA	3	6	627750	627755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14847	NC_017325	CGT	2	6	627803	627808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535047
14848	NC_017325	GC	4	8	627823	627830	0 %	0 %	50 %	50 %	384535047
14849	NC_017325	CG	3	6	627834	627839	0 %	0 %	50 %	50 %	384535047
14850	NC_017325	GCAG	2	8	627860	627867	25 %	0 %	50 %	25 %	384535047
14851	NC_017325	AGG	2	6	627902	627907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384535047
14852	NC_017325	TC	3	6	627922	627927	0 %	50 %	0 %	50 %	384535047
14853	NC_017325	GCG	2	6	627941	627946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535047
14854	NC_017325	TCG	2	6	628010	628015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535047
14855	NC_017325	CCT	2	6	628025	628030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14856	NC_017325	GAC	2	6	628076	628081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14857	NC_017325	AAG	3	9	628103	628111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14858	NC_017325	CAT	2	6	628138	628143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14859	NC_017325	CGA	2	6	628203	628208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384535048
14860	NC_017325	CGG	2	6	628233	628238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535048
14861	NC_017325	GCTC	2	8	628242	628249	0 %	25 %	25 %	50 %	384535048
14862	NC_017325	GCT	2	6	628251	628256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535048
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14985	NC_017325	TCG	2	6	633227	633232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384535052
14986	NC_017325	CGG	3	9	633245	633253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535052
14987	NC_017325	ATC	2	6	633289	633294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384535052
14988	NC_017325	CGG	2	6	633297	633302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384535052
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