MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017325	GAT	3	9	485168	485176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534918
11502	NC_017325	CAG	2	6	485180	485185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534918
11503	NC_017325	CCA	2	6	485194	485199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534918
11504	NC_017325	GAA	2	6	485231	485236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534918
11505	NC_017325	GGA	2	6	485245	485250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534918
11506	NC_017325	AAGG	2	8	485321	485328	50 %	0 %	50 %	0 %	384534918
11507	NC_017325	CAT	2	6	485360	485365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534918
11508	NC_017325	CGC	2	6	485369	485374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534918
11509	NC_017325	GAC	2	6	485381	485386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534918
11510	NC_017325	CG	3	6	485413	485418	0 %	0 %	50 %	50 %	384534918
11511	NC_017325	GC	3	6	485426	485431	0 %	0 %	50 %	50 %	384534918
11512	NC_017325	GAG	2	6	485453	485458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534918
11513	NC_017325	CGG	2	6	485467	485472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534918
11514	NC_017325	CGG	2	6	485488	485493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534918
11515	NC_017325	CGATCG	2	12	485494	485505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384534918
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11517	NC_017325	TCC	2	6	485532	485537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534918
11518	NC_017325	GCC	2	6	485547	485552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534918
11519	NC_017325	ATG	2	6	485562	485567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534918
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11521	NC_017325	TCC	2	6	485652	485657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534918
11522	NC_017325	GAA	2	6	485682	485687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534918
11523	NC_017325	CGA	2	6	485707	485712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534918
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11525	NC_017325	CGC	2	6	485811	485816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534918
11526	NC_017325	GAT	2	6	485852	485857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534918
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11528	NC_017325	GAC	2	6	485870	485875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534918
11529	NC_017325	CGG	2	6	485947	485952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534918
11530	NC_017325	GCG	2	6	485995	486000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534918
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11533	NC_017325	GAT	2	6	486153	486158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_017325	ATGC	2	8	486166	486173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11535	NC_017325	CGAT	2	8	486226	486233	25 %	25 %	25 %	25 %	384534919
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11539	NC_017325	GTG	3	9	486309	486317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534919
11540	NC_017325	CCGTT	2	10	486329	486338	0 %	40 %	20 %	40 %	384534919
11541	NC_017325	CGA	2	6	486383	486388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534919
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11543	NC_017325	GGA	2	6	486500	486505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534919
11544	NC_017325	TCGC	2	8	486516	486523	0 %	25 %	25 %	50 %	384534919
11545	NC_017325	CGC	2	6	486614	486619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534919
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11547	NC_017325	GGGC	2	8	486686	486693	0 %	0 %	75 %	25 %	384534919
11548	NC_017325	GCT	2	6	486748	486753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534919
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11550	NC_017325	GCG	2	6	486873	486878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534919
11551	NC_017325	CGC	2	6	486894	486899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534919
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11553	NC_017325	GGT	2	6	486923	486928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534919
11554	NC_017325	CG	3	6	486937	486942	0 %	0 %	50 %	50 %	384534919
11555	NC_017325	ATG	2	6	487023	487028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534919
11556	NC_017325	CGA	2	6	487064	487069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534919
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11558	NC_017325	TGC	2	6	487156	487161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534919
11559	NC_017325	GCG	2	6	487219	487224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534919
11560	NC_017325	CGG	2	6	487229	487234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534919
11561	NC_017325	CGG	2	6	487237	487242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534919
11562	NC_017325	CG	3	6	487288	487293	0 %	0 %	50 %	50 %	384534919
11563	NC_017325	GCCG	2	8	487481	487488	0 %	0 %	50 %	50 %	384534919
11564	NC_017325	CGC	2	6	487514	487519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534919
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11566	NC_017325	ACT	2	6	487581	487586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_017325	GCA	2	6	487629	487634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11569	NC_017325	CTG	2	6	487732	487737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534920
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11572	NC_017325	GCT	2	6	487862	487867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534920
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11574	NC_017325	GGA	2	6	487898	487903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534920
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11583	NC_017325	GAT	2	6	488258	488263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534920
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11586	NC_017325	CGG	2	6	488351	488356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534920
11587	NC_017325	GCC	2	6	488427	488432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534920
11588	NC_017325	CGC	2	6	488459	488464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534920
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11590	NC_017325	A	6	6	488568	488573	100 %	0 %	0 %	0 %	384534921
11591	NC_017325	CGG	2	6	488594	488599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534921
11592	NC_017325	TCG	2	6	488653	488658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534921
11593	NC_017325	GC	3	6	488680	488685	0 %	0 %	50 %	50 %	384534921
11594	NC_017325	CGTCGG	2	12	488790	488801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_017325	CGG	2	6	488805	488810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_017325	AGC	2	6	488827	488832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534922
11597	NC_017325	GC	3	6	488835	488840	0 %	0 %	50 %	50 %	384534922
11598	NC_017325	CTT	2	6	488889	488894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534922
11599	NC_017325	CG	3	6	488914	488919	0 %	0 %	50 %	50 %	384534922
11600	NC_017325	AGG	2	6	488930	488935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534922
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11602	NC_017325	CGC	2	6	489009	489014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534922
11603	NC_017325	GA	3	6	489023	489028	50 %	0 %	50 %	0 %	384534922
11604	NC_017325	CCG	3	9	489060	489068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534922
11605	NC_017325	GTG	2	6	489079	489084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534922
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11607	NC_017325	ACG	2	6	489097	489102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534922
11608	NC_017325	CGC	2	6	489117	489122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534922
11609	NC_017325	CGT	2	6	489141	489146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534922
11610	NC_017325	CGG	2	6	489176	489181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534922
11611	NC_017325	ATC	2	6	489220	489225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534922
11612	NC_017325	ATC	2	6	489253	489258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534922
11613	NC_017325	CGGC	2	8	489264	489271	0 %	0 %	50 %	50 %	384534922
11614	NC_017325	GCC	2	6	489299	489304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534922
11615	NC_017325	GCCG	2	8	489335	489342	0 %	0 %	50 %	50 %	384534922
11616	NC_017325	CT	3	6	489356	489361	0 %	50 %	0 %	50 %	384534922
11617	NC_017325	GCC	2	6	489474	489479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534922
11618	NC_017325	CAG	2	6	489511	489516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534922
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11620	NC_017325	CCA	2	6	489585	489590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534922
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11625	NC_017325	CG	3	6	489704	489709	0 %	0 %	50 %	50 %	384534922
11626	NC_017325	TCG	2	6	489797	489802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534922
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11978	NC_017325	TCG	2	6	505803	505808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534936
11979	NC_017325	CGA	2	6	505810	505815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534936
11980	NC_017325	CGAT	2	8	505852	505859	25 %	25 %	25 %	25 %	384534936
11981	NC_017325	GCCGCT	2	12	505879	505890	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384534936
11982	NC_017325	GTCCG	2	10	505934	505943	0 %	20 %	40 %	40 %	384534936
11983	NC_017325	GCGA	2	8	505953	505960	25 %	0 %	50 %	25 %	384534936
11984	NC_017325	GAT	2	6	505973	505978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534936
11985	NC_017325	GAG	2	6	506037	506042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534936
11986	NC_017325	CGAT	2	8	506050	506057	25 %	25 %	25 %	25 %	384534936
11987	NC_017325	CCG	2	6	506058	506063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534936
11988	NC_017325	CTC	2	6	506147	506152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534936
11989	NC_017325	GTC	2	6	506177	506182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534936
11990	NC_017325	GC	3	6	506183	506188	0 %	0 %	50 %	50 %	384534936
11991	NC_017325	GTT	2	6	506192	506197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534936
11992	NC_017325	ACGG	2	8	506207	506214	25 %	0 %	50 %	25 %	384534936
11993	NC_017325	GCG	2	6	506290	506295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534936
11994	NC_017325	GGCG	2	8	506380	506387	0 %	0 %	75 %	25 %	384534936
11995	NC_017325	CCA	2	6	506395	506400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534936
11996	NC_017325	GCC	3	9	506420	506428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534936
11997	NC_017325	GCT	2	6	506468	506473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534936
11998	NC_017325	GATT	2	8	506513	506520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11999	NC_017325	TAT	2	6	506545	506550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12000	NC_017325	AGA	2	6	506618	506623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534937

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