MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7244	NC_017325	CA	3	6	303847	303852	50 %	0 %	0 %	50 %	384534750
7245	NC_017325	GAC	3	9	303893	303901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534750
7246	NC_017325	TAC	2	6	303990	303995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534750
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7248	NC_017325	CGA	2	6	304025	304030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534750
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7250	NC_017325	GAC	2	6	304143	304148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534750
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7253	NC_017325	CGA	2	6	304351	304356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534750
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7265	NC_017325	TCGA	2	8	304933	304940	25 %	25 %	25 %	25 %	384534751
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7268	NC_017325	CGG	2	6	305037	305042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534751
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7272	NC_017325	GGA	2	6	305256	305261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534751
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7275	NC_017325	CGGGA	2	10	305422	305431	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7276	NC_017325	A	6	6	305461	305466	100 %	0 %	0 %	0 %	384534752
7277	NC_017325	TCGC	2	8	305481	305488	0 %	25 %	25 %	50 %	384534752
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7282	NC_017325	GCCGA	2	10	305805	305814	20 %	0 %	40 %	40 %	384534752
7283	NC_017325	GC	3	6	305827	305832	0 %	0 %	50 %	50 %	384534752
7284	NC_017325	TGC	2	6	305833	305838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534752
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7316	NC_017325	TCGGT	2	10	307290	307299	0 %	40 %	40 %	20 %	384534753
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7322	NC_017325	GAG	2	6	307603	307608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7323	NC_017325	CAT	2	6	307681	307686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7330	NC_017325	TGA	2	6	307988	307993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534754
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7354	NC_017325	ATC	2	6	309590	309595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534757
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7357	NC_017325	ATG	2	6	309662	309667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534758
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7366	NC_017325	CGC	2	6	310056	310061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534758
7367	NC_017325	CGC	2	6	310069	310074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534758
7368	NC_017325	TGG	2	6	310158	310163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534758
7369	NC_017325	ATGC	2	8	310178	310185	25 %	25 %	25 %	25 %	384534759
7370	NC_017325	GCT	2	6	310191	310196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534759
7371	NC_017325	CGC	2	6	310215	310220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534759
7372	NC_017325	TGG	2	6	310310	310315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534759
7373	NC_017325	CTC	2	6	310347	310352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534759
7374	NC_017325	TGC	2	6	310382	310387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534759
7375	NC_017325	CGCGCA	2	12	310421	310432	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384534759
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7379	NC_017325	GGT	2	6	310605	310610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534759
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7381	NC_017325	CGG	2	6	310667	310672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534759
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7383	NC_017325	TGC	2	6	310742	310747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534759
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7385	NC_017325	GGC	2	6	310822	310827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534759
7386	NC_017325	GTCC	2	8	310854	310861	0 %	25 %	25 %	50 %	384534759
7387	NC_017325	CG	3	6	310890	310895	0 %	0 %	50 %	50 %	384534759
7388	NC_017325	TCA	2	6	310952	310957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534759
7389	NC_017325	CGA	2	6	311054	311059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534759
7390	NC_017325	CG	3	6	311081	311086	0 %	0 %	50 %	50 %	384534759
7391	NC_017325	CGG	2	6	311133	311138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534759
7392	NC_017325	TCG	2	6	311177	311182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534759
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7394	NC_017325	TCC	2	6	311228	311233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534759
7395	NC_017325	CGG	2	6	311246	311251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534759
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7397	NC_017325	GCC	3	9	311337	311345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534760
7398	NC_017325	GCC	2	6	311393	311398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534760
7399	NC_017325	GCGA	2	8	311415	311422	25 %	0 %	50 %	25 %	384534760
7400	NC_017325	CGC	2	6	311453	311458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534760
7401	NC_017325	GC	3	6	311457	311462	0 %	0 %	50 %	50 %	384534760
7402	NC_017325	CGA	2	6	311516	311521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534760
7403	NC_017325	GCC	3	9	311643	311651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534760
7404	NC_017325	GCC	2	6	311705	311710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534760
7405	NC_017325	GTC	2	6	311717	311722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534760
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7407	NC_017325	CAT	2	6	311771	311776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534760
7408	NC_017325	CGAGCG	2	12	311779	311790	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384534760
7409	NC_017325	CAT	2	6	311812	311817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534760
7410	NC_017325	CGGG	2	8	311890	311897	0 %	0 %	75 %	25 %	384534761
7411	NC_017325	CGC	2	6	311943	311948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534761
7412	NC_017325	AGC	2	6	311967	311972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534761
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7415	NC_017325	CGA	2	6	312082	312087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534761
7416	NC_017325	CCT	2	6	312093	312098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534761
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7418	NC_017325	CGC	2	6	312271	312276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534761
7419	NC_017325	TCA	2	6	312312	312317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534761
7420	NC_017325	CG	3	6	312384	312389	0 %	0 %	50 %	50 %	384534761
7421	NC_017325	GC	3	6	312434	312439	0 %	0 %	50 %	50 %	384534761
7422	NC_017325	GGC	2	6	312449	312454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534761
7423	NC_017325	GCC	2	6	312459	312464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534761
7424	NC_017325	CAG	2	6	312476	312481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534761
7425	NC_017325	CCG	2	6	312482	312487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534761
7426	NC_017325	CAG	2	6	312494	312499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534761
7427	NC_017325	TCG	2	6	312501	312506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534761
7428	NC_017325	TCTCG	2	10	312508	312517	0 %	40 %	20 %	40 %	384534761
7429	NC_017325	CCGG	2	8	312527	312534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7430	NC_017325	GAA	2	6	312545	312550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534762
7431	NC_017325	TGA	2	6	312585	312590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534762
7432	NC_017325	TCG	2	6	312618	312623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534762
7433	NC_017325	CGG	2	6	312625	312630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534762
7434	NC_017325	GGC	2	6	312632	312637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534762
7435	NC_017325	CTC	2	6	312653	312658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534762
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7437	NC_017325	GAG	2	6	312719	312724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534762
7438	NC_017325	ACG	2	6	312779	312784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534762
7439	NC_017325	GCA	2	6	312913	312918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534762
7440	NC_017325	CG	3	6	312930	312935	0 %	0 %	50 %	50 %	384534762
7441	NC_017325	ATG	2	6	313071	313076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534763
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7443	NC_017325	ATC	2	6	313158	313163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534763
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7450	NC_017325	GC	3	6	313544	313549	0 %	0 %	50 %	50 %	384534763
7451	NC_017325	CGT	2	6	313550	313555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534763
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7453	NC_017325	TGC	2	6	313612	313617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534763
7454	NC_017325	TCG	2	6	313639	313644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534763
7455	NC_017325	ATG	3	9	313668	313676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534763
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7457	NC_017325	CTG	2	6	313743	313748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534763
7458	NC_017325	CGC	2	6	313784	313789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7459	NC_017325	CGG	2	6	313796	313801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7460	NC_017325	AATG	2	8	313895	313902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7461	NC_017325	ACG	2	6	313923	313928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7462	NC_017325	ATG	2	6	313968	313973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7463	NC_017325	C	6	6	314015	314020	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7464	NC_017325	CAA	2	6	314065	314070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534764
7465	NC_017325	TCC	2	6	314141	314146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534764
7466	NC_017325	CGC	2	6	314176	314181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534764
7467	NC_017325	ACC	2	6	314198	314203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534764
7468	NC_017325	CTCGGC	2	12	314246	314257	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384534764
7469	NC_017325	GCC	2	6	314258	314263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534764
7470	NC_017325	AAG	2	6	314373	314378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534764
7471	NC_017325	CTTC	2	8	314424	314431	0 %	50 %	0 %	50 %	384534764
7472	NC_017325	GCG	3	9	314463	314471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534764
7473	NC_017325	CGT	2	6	314485	314490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534764
7474	NC_017325	TCGT	2	8	314495	314502	0 %	50 %	25 %	25 %	384534764
7475	NC_017325	AAG	2	6	314531	314536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534764
7476	NC_017325	GCA	2	6	314665	314670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534764
7477	NC_017325	TGC	2	6	314677	314682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534764
7478	NC_017325	CGC	2	6	314824	314829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534764
7479	NC_017325	CAC	2	6	314830	314835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534764
7480	NC_017325	GTC	2	6	314870	314875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534764
7481	NC_017325	GCC	2	6	314894	314899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534764
7482	NC_017325	CGGC	2	8	314907	314914	0 %	0 %	50 %	50 %	384534764
7483	NC_017325	GTCG	2	8	314917	314924	0 %	25 %	50 %	25 %	384534764
7484	NC_017325	AACATC	2	12	314927	314938	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384534764
7485	NC_017325	CGC	2	6	314986	314991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534764
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7487	NC_017325	GCC	2	6	315014	315019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534764
7488	NC_017325	CAA	2	6	315067	315072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534764
7489	NC_017325	TCGA	2	8	315083	315090	25 %	25 %	25 %	25 %	384534764
7490	NC_017325	TCG	2	6	315108	315113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534764
7491	NC_017325	GAG	2	6	315128	315133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534764
7492	NC_017325	CAG	3	9	315161	315169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534764
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7496	NC_017325	TCG	2	6	315330	315335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7498	NC_017325	TC	4	8	315412	315419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7499	NC_017325	AACC	2	8	315437	315444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7500	NC_017325	AGCA	2	8	315501	315508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

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