MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti SM11 chromosome

Total Repeats: 90598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017325	CGGA	2	8	186426	186433	25 %	0 %	50 %	25 %	384534633
4502	NC_017325	CGC	2	6	186456	186461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534633
4503	NC_017325	GCT	2	6	186478	186483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534633
4504	NC_017325	GGT	2	6	186484	186489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534633
4505	NC_017325	TGA	2	6	186510	186515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534633
4506	NC_017325	TCC	2	6	186564	186569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534633
4507	NC_017325	CTC	2	6	186623	186628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384534633
4508	NC_017325	TCA	2	6	186654	186659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534633
4509	NC_017325	TCG	2	6	186707	186712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534634
4510	NC_017325	GCT	2	6	186723	186728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534634
4511	NC_017325	GTGCCG	2	12	186734	186745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384534634
4512	NC_017325	CAC	2	6	186774	186779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534634
4513	NC_017325	CTT	2	6	186787	186792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534634
4514	NC_017325	CGG	2	6	186801	186806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534634
4515	NC_017325	CGACG	2	10	186825	186834	20 %	0 %	40 %	40 %	384534634
4516	NC_017325	GCC	2	6	186907	186912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534634
4517	NC_017325	GCA	2	6	186922	186927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534634
4518	NC_017325	GCCG	2	8	187014	187021	0 %	0 %	50 %	50 %	384534634
4519	NC_017325	GC	3	6	187056	187061	0 %	0 %	50 %	50 %	384534634
4520	NC_017325	AGCTG	2	10	187189	187198	20 %	20 %	40 %	20 %	384534634
4521	NC_017325	TCT	2	6	187317	187322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534635
4522	NC_017325	GAC	2	6	187354	187359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4523	NC_017325	GCT	2	6	187363	187368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4524	NC_017325	TCG	2	6	187374	187379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4525	NC_017325	CGT	2	6	187387	187392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4526	NC_017325	CGGC	2	8	187393	187400	0 %	0 %	50 %	50 %	384534635
4527	NC_017325	GCT	2	6	187414	187419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4528	NC_017325	CAC	2	6	187462	187467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534635
4529	NC_017325	TCG	2	6	187500	187505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4530	NC_017325	AGC	2	6	187536	187541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4531	NC_017325	TCT	2	6	187548	187553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534635
4532	NC_017325	GCC	2	6	187586	187591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534635
4533	NC_017325	CCG	2	6	187620	187625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534635
4534	NC_017325	CCGGC	2	10	187698	187707	0 %	0 %	40 %	60 %	384534635
4535	NC_017325	GCG	2	6	187749	187754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534635
4536	NC_017325	TGC	2	6	187773	187778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4537	NC_017325	GC	3	6	187887	187892	0 %	0 %	50 %	50 %	384534635
4538	NC_017325	GAT	2	6	187951	187956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534635
4539	NC_017325	GC	3	6	187961	187966	0 %	0 %	50 %	50 %	384534635
4540	NC_017325	ATT	2	6	187981	187986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384534635
4541	NC_017325	GCC	2	6	188030	188035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534635
4542	NC_017325	GCG	2	6	188084	188089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534635
4543	NC_017325	TGA	2	6	188100	188105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534635
4544	NC_017325	TAT	2	6	188126	188131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384534635
4545	NC_017325	CGC	2	6	188245	188250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534635
4546	NC_017325	GCT	2	6	188266	188271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4547	NC_017325	GTG	2	6	188288	188293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534635
4548	NC_017325	GAC	2	6	188302	188307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4549	NC_017325	GC	4	8	188320	188327	0 %	0 %	50 %	50 %	384534635
4550	NC_017325	AT	3	6	188338	188343	50 %	50 %	0 %	0 %	384534635
4551	NC_017325	GGC	2	6	188350	188355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534635
4552	NC_017325	CG	3	6	188421	188426	0 %	0 %	50 %	50 %	384534635
4553	NC_017325	ATG	2	6	188438	188443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534635
4554	NC_017325	GGC	2	6	188467	188472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534635
4555	NC_017325	CTG	3	9	188534	188542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4556	NC_017325	CTG	3	9	188555	188563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534635
4557	NC_017325	GGC	2	6	188578	188583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534635
4558	NC_017325	AGT	2	6	188604	188609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534635
4559	NC_017325	CCGGC	2	10	188686	188695	0 %	0 %	40 %	60 %	384534636
4560	NC_017325	CCG	2	6	188775	188780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534636
4561	NC_017325	CGC	2	6	188787	188792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534636
4562	NC_017325	GAT	2	6	188800	188805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534636
4563	NC_017325	CCG	2	6	188847	188852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534636
4564	NC_017325	GCC	2	6	188884	188889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534636
4565	NC_017325	CG	3	6	188925	188930	0 %	0 %	50 %	50 %	384534636
4566	NC_017325	CGT	2	6	188935	188940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534636
4567	NC_017325	GTC	2	6	188992	188997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534636
4568	NC_017325	GCC	2	6	189048	189053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534636
4569	NC_017325	GGC	2	6	189079	189084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534636
4570	NC_017325	AGC	2	6	189098	189103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534636
4571	NC_017325	GA	3	6	189107	189112	50 %	0 %	50 %	0 %	384534636
4572	NC_017325	CG	3	6	189117	189122	0 %	0 %	50 %	50 %	384534636
4573	NC_017325	GAG	2	6	189155	189160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384534636
4574	NC_017325	GC	3	6	189178	189183	0 %	0 %	50 %	50 %	384534636
4575	NC_017325	TTG	2	6	189242	189247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534636
4576	NC_017325	CG	3	6	189276	189281	0 %	0 %	50 %	50 %	384534636
4577	NC_017325	GCC	2	6	189305	189310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534636
4578	NC_017325	GTT	2	6	189322	189327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534636
4579	NC_017325	AGCCG	2	10	189330	189339	20 %	0 %	40 %	40 %	384534636
4580	NC_017325	CGA	2	6	189360	189365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534636
4581	NC_017325	AGCCGA	2	12	189432	189443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534636
4582	NC_017325	CAG	2	6	189448	189453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534636
4583	NC_017325	A	6	6	189510	189515	100 %	0 %	0 %	0 %	384534636
4584	NC_017325	CGGC	2	8	189549	189556	0 %	0 %	50 %	50 %	384534636
4585	NC_017325	GCG	2	6	189557	189562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534636
4586	NC_017325	AAGCGG	2	12	189744	189755	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384534637
4587	NC_017325	GC	3	6	189776	189781	0 %	0 %	50 %	50 %	384534637
4588	NC_017325	CGC	3	9	189779	189787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534637
4589	NC_017325	CGTCG	2	10	189822	189831	0 %	20 %	40 %	40 %	384534637
4590	NC_017325	AGC	2	6	189841	189846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534637
4591	NC_017325	GTC	2	6	189849	189854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534637
4592	NC_017325	GGC	2	6	189873	189878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534637
4593	NC_017325	CGA	2	6	189884	189889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534637
4594	NC_017325	ATGA	2	8	189909	189916	50 %	25 %	25 %	0 %	384534637
4595	NC_017325	CGT	2	6	190032	190037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534637
4596	NC_017325	GA	3	6	190126	190131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017325	CGG	2	6	190192	190197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534638
4598	NC_017325	GGC	2	6	190325	190330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534638
4599	NC_017325	CGA	2	6	190331	190336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534638
4600	NC_017325	GA	3	6	190335	190340	50 %	0 %	50 %	0 %	384534638
4601	NC_017325	CAT	2	6	190469	190474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534638
4602	NC_017325	ATG	2	6	190482	190487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534638
4603	NC_017325	CCG	2	6	190537	190542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534638
4604	NC_017325	AGA	2	6	190564	190569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534638
4605	NC_017325	GGA	2	6	190595	190600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_017325	CG	3	6	190601	190606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_017325	GAT	2	6	190647	190652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_017325	GCG	2	6	190653	190658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_017325	GGGA	2	8	190700	190707	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_017325	TCA	2	6	190711	190716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534639
4611	NC_017325	CAT	3	9	190730	190738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534639
4612	NC_017325	CGA	2	6	190742	190747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534639
4613	NC_017325	GGCG	2	8	190793	190800	0 %	0 %	75 %	25 %	384534639
4614	NC_017325	TCG	2	6	190810	190815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534639
4615	NC_017325	GC	3	6	190836	190841	0 %	0 %	50 %	50 %	384534639
4616	NC_017325	TGC	2	6	190876	190881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534639
4617	NC_017325	TGA	2	6	190957	190962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534639
4618	NC_017325	CG	3	6	190998	191003	0 %	0 %	50 %	50 %	384534639
4619	NC_017325	CCCG	2	8	191099	191106	0 %	0 %	25 %	75 %	384534639
4620	NC_017325	CTG	2	6	191148	191153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534639
4621	NC_017325	GCA	2	6	191177	191182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534639
4622	NC_017325	GCT	2	6	191213	191218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534639
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4987	NC_017325	TCG	2	6	205238	205243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534651
4988	NC_017325	GGC	2	6	205285	205290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534651
4989	NC_017325	TGC	2	6	205295	205300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534651
4990	NC_017325	CGG	2	6	205355	205360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534651
4991	NC_017325	AGC	2	6	205361	205366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534651
4992	NC_017325	TGC	2	6	205451	205456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534651
4993	NC_017325	CGGC	2	8	205521	205528	0 %	0 %	50 %	50 %	384534651
4994	NC_017325	CCG	2	6	205535	205540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534651
4995	NC_017325	TCT	2	6	205565	205570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534651
4996	NC_017325	GGCC	2	8	205587	205594	0 %	0 %	50 %	50 %	384534651
4997	NC_017325	GCC	2	6	205651	205656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534651
4998	NC_017325	GAT	2	6	205657	205662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534651
4999	NC_017325	CG	3	6	205682	205687	0 %	0 %	50 %	50 %	384534651
5000	NC_017325	GC	3	6	205776	205781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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