MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB01

Total Repeats: 34177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_017324	CGA	2	6	1608303	1608308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34002	NC_017324	CCG	2	6	1608317	1608322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34003	NC_017324	GAA	2	6	1608340	1608345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34004	NC_017324	CAT	2	6	1608358	1608363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34005	NC_017324	AT	3	6	1608576	1608581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34006	NC_017324	TCA	2	6	1608584	1608589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34007	NC_017324	CAG	2	6	1608621	1608626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34008	NC_017324	CGG	2	6	1608642	1608647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34009	NC_017324	GTC	2	6	1608700	1608705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34010	NC_017324	TCCT	2	8	1608715	1608722	0 %	50 %	0 %	50 %	384532939
34011	NC_017324	CAG	2	6	1608731	1608736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34012	NC_017324	AGC	2	6	1608738	1608743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34013	NC_017324	GAA	2	6	1608754	1608759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384532939
34014	NC_017324	TGG	2	6	1608831	1608836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384532939
34015	NC_017324	CCG	2	6	1608862	1608867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532939
34016	NC_017324	CGC	2	6	1608904	1608909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532939
34017	NC_017324	CGG	2	6	1608952	1608957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34018	NC_017324	GCC	2	6	1609009	1609014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532939
34019	NC_017324	GGCA	2	8	1609059	1609066	25 %	0 %	50 %	25 %	384532939
34020	NC_017324	CTT	2	6	1609123	1609128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384532939
34021	NC_017324	GC	3	6	1609202	1609207	0 %	0 %	50 %	50 %	384532939
34022	NC_017324	GCC	2	6	1609222	1609227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532939
34023	NC_017324	ATC	2	6	1609244	1609249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384532939
34024	NC_017324	AGG	2	6	1609275	1609280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384532939
34025	NC_017324	CGG	2	6	1609302	1609307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34026	NC_017324	CGG	2	6	1609342	1609347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34027	NC_017324	CGG	2	6	1609356	1609361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34028	NC_017324	CGA	2	6	1609380	1609385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34029	NC_017324	GCC	3	9	1609426	1609434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532939
34030	NC_017324	GCG	2	6	1609439	1609444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34031	NC_017324	GAA	2	6	1609486	1609491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384532939
34032	NC_017324	TCG	2	6	1609562	1609567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34033	NC_017324	CACG	2	8	1609611	1609618	25 %	0 %	25 %	50 %	384532939
34034	NC_017324	CGG	2	6	1609645	1609650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34035	NC_017324	TGGC	2	8	1609663	1609670	0 %	25 %	50 %	25 %	384532939
34036	NC_017324	CGG	3	9	1609686	1609694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34037	NC_017324	AGT	2	6	1609731	1609736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384532939
34038	NC_017324	AGA	2	6	1609759	1609764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384532939
34039	NC_017324	TCC	2	6	1609790	1609795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384532939
34040	NC_017324	TCG	2	6	1609847	1609852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34041	NC_017324	GCC	3	9	1609897	1609905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532939
34042	NC_017324	GGC	2	6	1610023	1610028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34043	NC_017324	AGC	2	6	1610042	1610047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34044	NC_017324	GAT	2	6	1610077	1610082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384532939
34045	NC_017324	CGC	2	6	1610085	1610090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532939
34046	NC_017324	CGG	2	6	1610092	1610097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34047	NC_017324	GC	3	6	1610126	1610131	0 %	0 %	50 %	50 %	384532939
34048	NC_017324	GCA	2	6	1610169	1610174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34049	NC_017324	CGA	2	6	1610235	1610240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34050	NC_017324	GCC	2	6	1610257	1610262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532939
34051	NC_017324	GCG	2	6	1610280	1610285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34052	NC_017324	GTG	2	6	1610286	1610291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384532939
34053	NC_017324	CATCG	2	10	1610320	1610329	20 %	20 %	20 %	40 %	384532939
34054	NC_017324	GA	3	6	1610332	1610337	50 %	0 %	50 %	0 %	384532939
34055	NC_017324	CCG	2	6	1610378	1610383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532939
34056	NC_017324	GAC	2	6	1610386	1610391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34057	NC_017324	CAGG	2	8	1610415	1610422	25 %	0 %	50 %	25 %	384532939
34058	NC_017324	ATG	2	6	1610474	1610479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384532939
34059	NC_017324	GTC	2	6	1610485	1610490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532939
34060	NC_017324	CGG	2	6	1610628	1610633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34061	NC_017324	CG	3	6	1610634	1610639	0 %	0 %	50 %	50 %	384532939
34062	NC_017324	CGG	2	6	1610693	1610698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532939
34063	NC_017324	TCG	2	6	1610731	1610736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532940
34064	NC_017324	CG	3	6	1610735	1610740	0 %	0 %	50 %	50 %	384532940
34065	NC_017324	CGA	2	6	1610873	1610878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532940
34066	NC_017324	CCA	2	6	1610894	1610899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384532940
34067	NC_017324	CGG	2	6	1610910	1610915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532940
34068	NC_017324	GTC	2	6	1611017	1611022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34069	NC_017324	CCGC	2	8	1611029	1611036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34070	NC_017324	GGC	2	6	1611041	1611046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34071	NC_017324	GAT	2	6	1611121	1611126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384532941
34072	NC_017324	GCC	2	6	1611142	1611147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532941
34073	NC_017324	T	6	6	1611151	1611156	0 %	100 %	0 %	0 %	384532941
34074	NC_017324	GGT	2	6	1611166	1611171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384532941
34075	NC_017324	GTGC	2	8	1611188	1611195	0 %	25 %	50 %	25 %	384532941
34076	NC_017324	CGGA	2	8	1611238	1611245	25 %	0 %	50 %	25 %	384532941
34077	NC_017324	GC	3	6	1611272	1611277	0 %	0 %	50 %	50 %	384532941
34078	NC_017324	CGA	2	6	1611363	1611368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532941
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34081	NC_017324	CCT	2	6	1611426	1611431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384532941
34082	NC_017324	GTC	2	6	1611548	1611553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532941
34083	NC_017324	TCG	2	6	1611558	1611563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532941
34084	NC_017324	GTT	2	6	1611604	1611609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384532941
34085	NC_017324	TCGA	2	8	1611626	1611633	25 %	25 %	25 %	25 %	384532941
34086	NC_017324	GGTT	2	8	1611748	1611755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34087	NC_017324	GAC	2	6	1611780	1611785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34088	NC_017324	CCA	2	6	1611832	1611837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34089	NC_017324	GC	3	6	1611839	1611844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34090	NC_017324	TGA	2	6	1611856	1611861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34091	NC_017324	GA	3	6	1611860	1611865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34092	NC_017324	TGC	2	6	1611871	1611876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34093	NC_017324	AG	3	6	1611890	1611895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34094	NC_017324	ACCGT	2	10	1611902	1611911	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34095	NC_017324	CTTT	2	8	1611949	1611956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34096	NC_017324	GCA	2	6	1612095	1612100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532942
34097	NC_017324	TGC	3	9	1612124	1612132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532942
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34099	NC_017324	GAA	2	6	1612176	1612181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384532942
34100	NC_017324	GCC	2	6	1612304	1612309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532942
34101	NC_017324	AAC	2	6	1612339	1612344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384532942
34102	NC_017324	CAA	2	6	1612374	1612379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384532942
34103	NC_017324	CCA	2	6	1612436	1612441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384532942
34104	NC_017324	GGC	2	6	1612459	1612464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532942
34105	NC_017324	CCG	2	6	1612497	1612502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532942
34106	NC_017324	TGAT	2	8	1612529	1612536	25 %	50 %	25 %	0 %	384532942
34107	NC_017324	AGC	2	6	1612541	1612546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532942
34108	NC_017324	AAT	2	6	1612578	1612583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384532942
34109	NC_017324	TGA	2	6	1612650	1612655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384532942
34110	NC_017324	CCG	2	6	1612657	1612662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384532942
34111	NC_017324	CTG	2	6	1612674	1612679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532942
34112	NC_017324	GA	3	6	1612682	1612687	50 %	0 %	50 %	0 %	384532942
34113	NC_017324	GCG	2	6	1612734	1612739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384532942
34114	NC_017324	TCG	2	6	1612796	1612801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532942
34115	NC_017324	AGC	2	6	1612815	1612820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532942
34116	NC_017324	TGC	2	6	1612843	1612848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384532942
34117	NC_017324	CGTC	2	8	1612860	1612867	0 %	25 %	25 %	50 %	384532942
34118	NC_017324	CGC	2	6	1613005	1613010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34119	NC_017324	ATC	2	6	1613011	1613016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34150	NC_017324	ACA	2	6	1615144	1615149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34151	NC_017324	CGT	2	6	1615204	1615209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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34155	NC_017324	CG	3	6	1615437	1615442	0 %	0 %	50 %	50 %	384532945
34156	NC_017324	CGA	2	6	1615455	1615460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532945
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34166	NC_017324	CGGT	2	8	1615802	1615809	0 %	25 %	50 %	25 %	384532945
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34171	NC_017324	GCCG	2	8	1616005	1616012	0 %	0 %	50 %	50 %	384532945
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34173	NC_017324	GCA	2	6	1616040	1616045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384532945
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.