MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB02

Total Repeats: 38931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38502	NC_017323	TTC	2	6	1669714	1669719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534440
38503	NC_017323	GT	3	6	1669803	1669808	0 %	50 %	50 %	0 %	384534440
38504	NC_017323	CCA	2	6	1669868	1669873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534440
38505	NC_017323	GTC	2	6	1669894	1669899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534440
38506	NC_017323	TCA	2	6	1669940	1669945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534440
38507	NC_017323	CGT	2	6	1669977	1669982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534440
38508	NC_017323	CAT	2	6	1670049	1670054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534440
38509	NC_017323	CAA	2	6	1670103	1670108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534440
38510	NC_017323	TTC	2	6	1670110	1670115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534440
38511	NC_017323	TTC	2	6	1670177	1670182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534441
38512	NC_017323	AT	3	6	1670226	1670231	50 %	50 %	0 %	0 %	384534441
38513	NC_017323	CTTC	2	8	1670281	1670288	0 %	50 %	0 %	50 %	384534441
38514	NC_017323	CGT	2	6	1670296	1670301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534441
38515	NC_017323	TCT	2	6	1670337	1670342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534441
38516	NC_017323	ATT	2	6	1670375	1670380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384534441
38517	NC_017323	GCA	2	6	1670394	1670399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534441
38518	NC_017323	TGAT	2	8	1670421	1670428	25 %	50 %	25 %	0 %	384534441
38519	NC_017323	CG	3	6	1670451	1670456	0 %	0 %	50 %	50 %	384534442
38520	NC_017323	CT	3	6	1670523	1670528	0 %	50 %	0 %	50 %	384534442
38521	NC_017323	GCA	2	6	1670576	1670581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534442
38522	NC_017323	GAT	2	6	1670656	1670661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384534442
38523	NC_017323	GCGGGG	2	12	1670688	1670699	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	384534442
38524	NC_017323	GCG	2	6	1670700	1670705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534442
38525	NC_017323	TGT	2	6	1670710	1670715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534442
38526	NC_017323	AGC	2	6	1670731	1670736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534442
38527	NC_017323	TGC	2	6	1670834	1670839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534442
38528	NC_017323	GA	3	6	1670854	1670859	50 %	0 %	50 %	0 %	384534442
38529	NC_017323	ATTG	2	8	1670864	1670871	25 %	50 %	25 %	0 %	384534442
38530	NC_017323	GTG	2	6	1670903	1670908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534442
38531	NC_017323	TGT	2	6	1670922	1670927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384534442
38532	NC_017323	TCA	2	6	1670930	1670935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534442
38533	NC_017323	TCG	2	6	1670981	1670986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534442
38534	NC_017323	GATAGC	2	12	1671024	1671035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384534442
38535	NC_017323	AAG	2	6	1671047	1671052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534442
38536	NC_017323	TCAA	2	8	1671065	1671072	50 %	25 %	0 %	25 %	384534442
38537	NC_017323	TGAT	2	8	1671095	1671102	25 %	50 %	25 %	0 %	384534442
38538	NC_017323	GTG	2	6	1671113	1671118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534442
38539	NC_017323	TCA	2	6	1671144	1671149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534442
38540	NC_017323	CCG	2	6	1671251	1671256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534442
38541	NC_017323	GTC	2	6	1671304	1671309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534442
38542	NC_017323	TCA	3	9	1671323	1671331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534442
38543	NC_017323	ACA	2	6	1671332	1671337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384534442
38544	NC_017323	TCT	2	6	1671407	1671412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534442
38545	NC_017323	GTC	2	6	1671494	1671499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384534442
38546	NC_017323	AGA	2	6	1671512	1671517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534442
38547	NC_017323	GC	3	6	1671626	1671631	0 %	0 %	50 %	50 %	384534442
38548	NC_017323	GCG	2	6	1671865	1671870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534442
38549	NC_017323	CTT	2	6	1671960	1671965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534442
38550	NC_017323	GTCA	2	8	1672126	1672133	25 %	25 %	25 %	25 %	384534442
38551	NC_017323	CGG	2	6	1672149	1672154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534442
38552	NC_017323	CAG	2	6	1672324	1672329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534442
38553	NC_017323	TCTT	2	8	1672442	1672449	0 %	75 %	0 %	25 %	384534442
38554	NC_017323	GCG	2	6	1672502	1672507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38555	NC_017323	CTT	2	6	1672667	1672672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534443
38556	NC_017323	GATCTT	2	12	1672679	1672690	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384534443
38557	NC_017323	CTT	2	6	1672733	1672738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534443
38558	NC_017323	CG	3	6	1672807	1672812	0 %	0 %	50 %	50 %	384534443
38559	NC_017323	CTT	2	6	1672946	1672951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534443
38560	NC_017323	TTC	2	6	1673015	1673020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534443
38561	NC_017323	TGTCG	2	10	1673038	1673047	0 %	40 %	40 %	20 %	384534443
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38565	NC_017323	AGA	2	6	1673356	1673361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384534443
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38572	NC_017323	ACC	2	6	1673734	1673739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384534443
38573	NC_017323	CGA	2	6	1673777	1673782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534443
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38583	NC_017323	CAT	2	6	1674620	1674625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534446
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38585	NC_017323	TCA	2	6	1674741	1674746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534446
38586	NC_017323	CTTC	2	8	1674808	1674815	0 %	50 %	0 %	50 %	384534446
38587	NC_017323	TCT	2	6	1674871	1674876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384534446
38588	NC_017323	AATTT	2	10	1674987	1674996	40 %	60 %	0 %	0 %	384534446
38589	NC_017323	TCA	2	6	1675026	1675031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534446
38590	NC_017323	CATCCG	2	12	1675070	1675081	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384534447
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38594	NC_017323	CAT	3	9	1675321	1675329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38595	NC_017323	GAAG	2	8	1675335	1675342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38596	NC_017323	TTGC	2	8	1675370	1675377	0 %	50 %	25 %	25 %	384534448
38597	NC_017323	GCC	2	6	1675390	1675395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384534448
38598	NC_017323	GGT	2	6	1675472	1675477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384534448
38599	NC_017323	ACT	2	6	1675525	1675530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384534448
38600	NC_017323	ATCTT	2	10	1675581	1675590	20 %	60 %	0 %	20 %	384534448
38601	NC_017323	GGC	2	6	1675591	1675596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384534448
38602	NC_017323	GCA	2	6	1675647	1675652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384534448
38603	NC_017323	AAGGCA	2	12	1675680	1675691	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384534448
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38605	NC_017323	T	6	6	1675835	1675840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38606	NC_017323	CCA	2	6	1675857	1675862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38607	NC_017323	AAG	2	6	1675872	1675877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38608	NC_017323	G	6	6	1675886	1675891	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38609	NC_017323	ACG	2	6	1675973	1675978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38610	NC_017323	GCC	2	6	1676171	1676176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38611	NC_017323	ATG	2	6	1676215	1676220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38612	NC_017323	TCGG	2	8	1676375	1676382	0 %	25 %	50 %	25 %	384534449
38613	NC_017323	GAAG	2	8	1676488	1676495	50 %	0 %	50 %	0 %	384534449
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38615	NC_017323	GCTG	2	8	1676674	1676681	0 %	25 %	50 %	25 %	384534449
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.