MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 4591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017319	TGA	2	6	194206	194211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546228
4002	NC_017319	CAGT	2	8	194239	194246	25 %	25 %	25 %	25 %	384546228
4003	NC_017319	TTG	2	6	194302	194307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546228
4004	NC_017319	GGT	2	6	194378	194383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546228
4005	NC_017319	A	6	6	194412	194417	100 %	0 %	0 %	0 %	384546228
4006	NC_017319	ATG	2	6	194556	194561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_017319	A	6	6	194593	194598	100 %	0 %	0 %	0 %	384546229
4008	NC_017319	TTCA	2	8	194706	194713	25 %	50 %	0 %	25 %	384546229
4009	NC_017319	TGGG	2	8	194743	194750	0 %	25 %	75 %	0 %	384546229
4010	NC_017319	TCG	2	6	194769	194774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546229
4011	NC_017319	CGA	2	6	194780	194785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546229
4012	NC_017319	AAT	2	6	194832	194837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546229
4013	NC_017319	TGA	2	6	194876	194881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546229
4014	NC_017319	A	6	6	195047	195052	100 %	0 %	0 %	0 %	384546229
4015	NC_017319	GCC	2	6	195055	195060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546229
4016	NC_017319	TCA	2	6	195066	195071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546229
4017	NC_017319	TGAT	2	8	195086	195093	25 %	50 %	25 %	0 %	384546229
4018	NC_017319	G	6	6	195124	195129	0 %	0 %	100 %	0 %	384546229
4019	NC_017319	GGA	2	6	195144	195149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546229
4020	NC_017319	TCAG	2	8	195168	195175	25 %	25 %	25 %	25 %	384546229
4021	NC_017319	T	7	7	195246	195252	0 %	100 %	0 %	0 %	384546229
4022	NC_017319	ATT	2	6	195277	195282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546229
4023	NC_017319	TGA	2	6	195290	195295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546229
4024	NC_017319	TCAG	2	8	195299	195306	25 %	25 %	25 %	25 %	384546229
4025	NC_017319	ATG	2	6	195335	195340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546229
4026	NC_017319	A	8	8	195341	195348	100 %	0 %	0 %	0 %	384546229
4027	NC_017319	CCA	2	6	195373	195378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546229
4028	NC_017319	ATGC	2	8	195383	195390	25 %	25 %	25 %	25 %	384546229
4029	NC_017319	TGG	2	6	195449	195454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546229
4030	NC_017319	GTT	2	6	195562	195567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_017319	GT	3	6	195604	195609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017319	GGA	2	6	195624	195629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_017319	ATTTA	2	10	195652	195661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_017319	T	6	6	195754	195759	0 %	100 %	0 %	0 %	384546230
4035	NC_017319	TGA	2	6	195785	195790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546230
4036	NC_017319	TGCC	2	8	195814	195821	0 %	25 %	25 %	50 %	384546230
4037	NC_017319	CAGC	2	8	195895	195902	25 %	0 %	25 %	50 %	384546230
4038	NC_017319	ACG	2	6	195964	195969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546230
4039	NC_017319	CAG	2	6	195991	195996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546230
4040	NC_017319	TGA	2	6	195999	196004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546230
4041	NC_017319	GCC	2	6	196027	196032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546230
4042	NC_017319	ATA	2	6	196078	196083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546230
4043	NC_017319	ACC	2	6	196106	196111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546230
4044	NC_017319	CTTCAT	2	12	196173	196184	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384546230
4045	NC_017319	TGC	2	6	196231	196236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546230
4046	NC_017319	CA	3	6	196292	196297	50 %	0 %	0 %	50 %	384546230
4047	NC_017319	GCG	2	6	196318	196323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546230
4048	NC_017319	CAG	2	6	196375	196380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546230
4049	NC_017319	GCA	2	6	196564	196569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546230
4050	NC_017319	T	7	7	196651	196657	0 %	100 %	0 %	0 %	384546231
4051	NC_017319	AGC	2	6	196659	196664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546231
4052	NC_017319	TGA	2	6	196669	196674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546231
4053	NC_017319	GAC	2	6	196721	196726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546231
4054	NC_017319	TTA	2	6	196786	196791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546231
4055	NC_017319	GTG	2	6	196953	196958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546231
4056	NC_017319	TG	3	6	197107	197112	0 %	50 %	50 %	0 %	384546231
4057	NC_017319	CAG	2	6	197175	197180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546231
4058	NC_017319	GGTTCG	2	12	197204	197215	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384546231
4059	NC_017319	GAT	2	6	197295	197300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546231
4060	NC_017319	GCC	2	6	197327	197332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546231
4061	NC_017319	TCA	2	6	197392	197397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546231
4062	NC_017319	TCTG	2	8	197406	197413	0 %	50 %	25 %	25 %	384546231
4063	NC_017319	TAA	2	6	197437	197442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546231
4064	NC_017319	TTG	2	6	197490	197495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_017319	T	7	7	197555	197561	0 %	100 %	0 %	0 %	384546232
4066	NC_017319	AT	3	6	197563	197568	50 %	50 %	0 %	0 %	384546232
4067	NC_017319	CAGC	2	8	197629	197636	25 %	0 %	25 %	50 %	384546232
4068	NC_017319	GGC	2	6	197669	197674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546232
4069	NC_017319	AGGA	2	8	197702	197709	50 %	0 %	50 %	0 %	384546232
4070	NC_017319	ATT	2	6	197811	197816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546232
4071	NC_017319	AGGA	2	8	197843	197850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_017319	GTG	2	6	197896	197901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_017319	GCA	2	6	197925	197930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546233
4074	NC_017319	ATC	2	6	197936	197941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546233
4075	NC_017319	GCA	2	6	197952	197957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546233
4076	NC_017319	CGT	2	6	197965	197970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546233
4077	NC_017319	GGA	2	6	198006	198011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546233
4078	NC_017319	GAT	2	6	198025	198030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546233
4079	NC_017319	TGA	2	6	198034	198039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546233
4080	NC_017319	GCC	2	6	198069	198074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546234
4081	NC_017319	TTA	2	6	198097	198102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546234
4082	NC_017319	AAT	2	6	198108	198113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546234
4083	NC_017319	GT	4	8	198205	198212	0 %	50 %	50 %	0 %	384546234
4084	NC_017319	GCA	2	6	198217	198222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546234
4085	NC_017319	CGT	2	6	198224	198229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546234
4086	NC_017319	T	6	6	198296	198301	0 %	100 %	0 %	0 %	384546234
4087	NC_017319	AT	3	6	198309	198314	50 %	50 %	0 %	0 %	384546234
4088	NC_017319	TC	3	6	198535	198540	0 %	50 %	0 %	50 %	384546235
4089	NC_017319	GGT	2	6	198659	198664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546235
4090	NC_017319	ATT	2	6	198669	198674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546235
4091	NC_017319	CCT	2	6	198677	198682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_017319	ATG	2	6	198752	198757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546236
4093	NC_017319	ATT	2	6	198795	198800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546236
4094	NC_017319	GCA	2	6	198831	198836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546236
4095	NC_017319	GGCC	2	8	198850	198857	0 %	0 %	50 %	50 %	384546236
4096	NC_017319	AAC	2	6	198867	198872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546236
4097	NC_017319	GACCT	2	10	198992	199001	20 %	20 %	20 %	40 %	384546236
4098	NC_017319	ATG	2	6	199025	199030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546236
4099	NC_017319	G	7	7	199040	199046	0 %	0 %	100 %	0 %	384546236
4100	NC_017319	GACG	2	8	199122	199129	25 %	0 %	50 %	25 %	384546236
4101	NC_017319	AC	3	6	199212	199217	50 %	0 %	0 %	50 %	384546237
4102	NC_017319	GGT	2	6	199224	199229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546237
4103	NC_017319	GGC	2	6	199512	199517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546237
4104	NC_017319	AAC	2	6	199631	199636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546237
4105	NC_017319	CGCA	2	8	199648	199655	25 %	0 %	25 %	50 %	384546237
4106	NC_017319	GCA	2	6	199692	199697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546237
4107	NC_017319	CTG	2	6	199759	199764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546237
4108	NC_017319	GCC	2	6	199785	199790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546237
4109	NC_017319	AGC	2	6	199847	199852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546237
4110	NC_017319	CAT	2	6	199938	199943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546237
4111	NC_017319	CCGT	2	8	200031	200038	0 %	25 %	25 %	50 %	384546237
4112	NC_017319	ATG	2	6	200104	200109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546237
4113	NC_017319	GCT	2	6	200143	200148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546237
4114	NC_017319	TCGC	2	8	200154	200161	0 %	25 %	25 %	50 %	384546237
4115	NC_017319	CGT	2	6	200212	200217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546237
4116	NC_017319	GGAA	2	8	200226	200233	50 %	0 %	50 %	0 %	384546237
4117	NC_017319	TCG	2	6	200261	200266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546237
4118	NC_017319	CTG	2	6	200305	200310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546237
4119	NC_017319	G	6	6	200427	200432	0 %	0 %	100 %	0 %	384546237
4120	NC_017319	CCA	2	6	200447	200452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546237
4121	NC_017319	TCA	2	6	200453	200458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546237
4122	NC_017319	AG	3	6	200519	200524	50 %	0 %	50 %	0 %	384546238
4123	NC_017319	CTGG	2	8	200645	200652	0 %	25 %	50 %	25 %	384546238
4124	NC_017319	GGT	2	6	200807	200812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546238
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4211	NC_017319	AG	4	8	205356	205363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4212	NC_017319	CTTCCG	2	12	205396	205407	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4213	NC_017319	ATT	2	6	205428	205433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4214	NC_017319	AAT	2	6	205440	205445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4215	NC_017319	AATG	2	8	205471	205478	50 %	25 %	25 %	0 %	384546241
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4220	NC_017319	CTT	2	6	205746	205751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4221	NC_017319	T	6	6	205819	205824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4222	NC_017319	TG	3	6	205865	205870	0 %	50 %	50 %	0 %	384546242
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4237	NC_017319	CAG	2	6	206730	206735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546243
4238	NC_017319	GGTTCG	2	12	206759	206770	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384546243
4239	NC_017319	GAT	2	6	206850	206855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546243
4240	NC_017319	GCC	2	6	206882	206887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546243
4241	NC_017319	TCA	2	6	206947	206952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546243
4242	NC_017319	TCTG	2	8	206961	206968	0 %	50 %	25 %	25 %	384546243
4243	NC_017319	TAA	2	6	206992	206997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546243
4244	NC_017319	TTG	2	6	207045	207050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_017319	T	7	7	207110	207116	0 %	100 %	0 %	0 %	384546244
4246	NC_017319	AT	3	6	207118	207123	50 %	50 %	0 %	0 %	384546244
4247	NC_017319	CAGC	2	8	207184	207191	25 %	0 %	25 %	50 %	384546244
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4252	NC_017319	GAAT	2	8	207487	207494	50 %	25 %	25 %	0 %	384546245
4253	NC_017319	CCGGG	2	10	207512	207521	0 %	0 %	60 %	40 %	384546245
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4259	NC_017319	AAAAC	2	10	207708	207717	80 %	0 %	0 %	20 %	384546246
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4284	NC_017319	GTA	2	6	208732	208737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4287	NC_017319	TGAC	2	8	208850	208857	25 %	25 %	25 %	25 %	384546248
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4323	NC_017319	CCTGT	2	10	210529	210538	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4362	NC_017319	T	6	6	212264	212269	0 %	100 %	0 %	0 %	384546252
4363	NC_017319	GGCA	2	8	212280	212287	25 %	0 %	50 %	25 %	384546252
4364	NC_017319	CCGC	2	8	212423	212430	0 %	0 %	25 %	75 %	384546252
4365	NC_017319	AGGA	2	8	212435	212442	50 %	0 %	50 %	0 %	384546252
4366	NC_017319	GCGG	2	8	212478	212485	0 %	0 %	75 %	25 %	384546252
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4371	NC_017319	TAA	2	6	212719	212724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4373	NC_017319	CAA	2	6	212827	212832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4499	NC_017319	CTG	2	6	219039	219044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546264
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