MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 4591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017319	CAGAC	2	10	167759	167768	40 %	0 %	20 %	40 %	384546189
3502	NC_017319	GTG	2	6	167822	167827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546189
3503	NC_017319	TG	3	6	167976	167981	0 %	50 %	50 %	0 %	384546189
3504	NC_017319	CAG	2	6	168044	168049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546189
3505	NC_017319	GGTTCG	2	12	168073	168084	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384546189
3506	NC_017319	GAT	2	6	168164	168169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546189
3507	NC_017319	GCC	2	6	168196	168201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546189
3508	NC_017319	TCA	2	6	168261	168266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546189
3509	NC_017319	TCTG	2	8	168275	168282	0 %	50 %	25 %	25 %	384546189
3510	NC_017319	TAA	2	6	168306	168311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546189
3511	NC_017319	TTG	2	6	168359	168364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017319	T	7	7	168424	168430	0 %	100 %	0 %	0 %	384546190
3513	NC_017319	AT	3	6	168432	168437	50 %	50 %	0 %	0 %	384546190
3514	NC_017319	GGC	2	6	168538	168543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546190
3515	NC_017319	ATT	2	6	168680	168685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546190
3516	NC_017319	AGGA	2	8	168712	168719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017319	TTTC	2	8	168837	168844	0 %	75 %	0 %	25 %	384546191
3518	NC_017319	CAG	2	6	168876	168881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546191
3519	NC_017319	TGAC	2	8	169008	169015	25 %	25 %	25 %	25 %	384546191
3520	NC_017319	AGA	2	6	169028	169033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546191
3521	NC_017319	AAC	2	6	169136	169141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546191
3522	NC_017319	ACG	2	6	169144	169149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546191
3523	NC_017319	AGC	2	6	169256	169261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546191
3524	NC_017319	ATC	2	6	169267	169272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546191
3525	NC_017319	TTCCC	2	10	169404	169413	0 %	40 %	0 %	60 %	384546192
3526	NC_017319	GAT	2	6	169599	169604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546192
3527	NC_017319	ATC	2	6	169633	169638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546192
3528	NC_017319	TCA	2	6	169770	169775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546193
3529	NC_017319	CTGGT	2	10	169804	169813	0 %	40 %	40 %	20 %	384546193
3530	NC_017319	TCAG	2	8	169827	169834	25 %	25 %	25 %	25 %	384546193
3531	NC_017319	GCAT	2	8	169849	169856	25 %	25 %	25 %	25 %	384546193
3532	NC_017319	TCA	2	6	169866	169871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546193
3533	NC_017319	CAG	2	6	169913	169918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546193
3534	NC_017319	TTA	2	6	169920	169925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546193
3535	NC_017319	CAA	2	6	169954	169959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546193
3536	NC_017319	CTT	2	6	170072	170077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546193
3537	NC_017319	GTAT	2	8	170172	170179	25 %	50 %	25 %	0 %	384546193
3538	NC_017319	TGT	2	6	170291	170296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546193
3539	NC_017319	TCGT	2	8	170308	170315	0 %	50 %	25 %	25 %	384546193
3540	NC_017319	TTG	2	6	170340	170345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017319	GAAT	2	8	170432	170439	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017319	GTT	2	6	170571	170576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_017319	CGG	2	6	170770	170775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_017319	TGA	2	6	170826	170831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017319	GCA	2	6	170849	170854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_017319	CAA	2	6	170861	170866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_017319	ACA	2	6	170886	170891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_017319	GT	3	6	170904	170909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_017319	ATG	2	6	170934	170939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017319	TA	3	6	170980	170985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_017319	TGG	2	6	170995	171000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_017319	T	6	6	171062	171067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_017319	GAA	2	6	171096	171101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_017319	TA	4	8	171113	171120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017319	CTG	2	6	171164	171169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546194
3556	NC_017319	AGG	2	6	171188	171193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546194
3557	NC_017319	AAATGT	2	12	171195	171206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384546194
3558	NC_017319	A	6	6	171208	171213	100 %	0 %	0 %	0 %	384546194
3559	NC_017319	TGG	2	6	171303	171308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546194
3560	NC_017319	AG	3	6	171370	171375	50 %	0 %	50 %	0 %	384546194
3561	NC_017319	T	6	6	171415	171420	0 %	100 %	0 %	0 %	384546194
3562	NC_017319	GTA	2	6	171538	171543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546194
3563	NC_017319	A	6	6	171596	171601	100 %	0 %	0 %	0 %	384546194
3564	NC_017319	AGT	3	9	171742	171750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546194
3565	NC_017319	TGCTGA	2	12	171769	171780	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384546194
3566	NC_017319	AT	3	6	171858	171863	50 %	50 %	0 %	0 %	384546195
3567	NC_017319	CGTAAA	2	12	171919	171930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384546195
3568	NC_017319	CTC	2	6	171932	171937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546195
3569	NC_017319	A	6	6	171941	171946	100 %	0 %	0 %	0 %	384546195
3570	NC_017319	ATT	2	6	171952	171957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546195
3571	NC_017319	CAG	2	6	171958	171963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546195
3572	NC_017319	CAGCC	2	10	172015	172024	20 %	0 %	20 %	60 %	384546195
3573	NC_017319	A	6	6	172039	172044	100 %	0 %	0 %	0 %	384546195
3574	NC_017319	GGAA	2	8	172053	172060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_017319	CTG	2	6	172067	172072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_017319	TGC	2	6	172074	172079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_017319	GAT	2	6	172245	172250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546196
3578	NC_017319	CA	3	6	172287	172292	50 %	0 %	0 %	50 %	384546196
3579	NC_017319	CAG	2	6	172312	172317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546196
3580	NC_017319	AGC	2	6	172368	172373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546196
3581	NC_017319	AGGA	2	8	172406	172413	50 %	0 %	50 %	0 %	384546196
3582	NC_017319	CTG	2	6	172421	172426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546196
3583	NC_017319	GCC	2	6	172429	172434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546196
3584	NC_017319	GTT	2	6	172444	172449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546196
3585	NC_017319	TGC	2	6	172464	172469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546196
3586	NC_017319	CTC	2	6	172531	172536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546196
3587	NC_017319	AAG	2	6	172538	172543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546196
3588	NC_017319	A	6	6	172563	172568	100 %	0 %	0 %	0 %	384546196
3589	NC_017319	TGGA	2	8	172680	172687	25 %	25 %	50 %	0 %	384546197
3590	NC_017319	GCC	2	6	172690	172695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546197
3591	NC_017319	GTC	2	6	172699	172704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546197
3592	NC_017319	TGA	2	6	172709	172714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546197
3593	NC_017319	TCG	2	6	172772	172777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546197
3594	NC_017319	GCT	2	6	172787	172792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546197
3595	NC_017319	CTG	2	6	172888	172893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546197
3596	NC_017319	GAAA	2	8	172934	172941	75 %	0 %	25 %	0 %	384546197
3597	NC_017319	CTG	2	6	172976	172981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546197
3598	NC_017319	GA	4	8	172990	172997	50 %	0 %	50 %	0 %	384546197
3599	NC_017319	CTG	2	6	173021	173026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546197
3600	NC_017319	GCACT	2	10	173037	173046	20 %	20 %	20 %	40 %	384546197
3601	NC_017319	CGG	2	6	173060	173065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546197
3602	NC_017319	CGC	2	6	173112	173117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546197
3603	NC_017319	CGT	2	6	173134	173139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546197
3604	NC_017319	AGTGG	2	10	173144	173153	20 %	20 %	60 %	0 %	384546197
3605	NC_017319	GAA	2	6	173225	173230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546197
3606	NC_017319	CGG	2	6	173233	173238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546197
3607	NC_017319	AG	3	6	173267	173272	50 %	0 %	50 %	0 %	384546197
3608	NC_017319	CAA	2	6	173331	173336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546197
3609	NC_017319	ACGA	2	8	173361	173368	50 %	0 %	25 %	25 %	384546197
3610	NC_017319	ACA	2	6	173380	173385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546197
3611	NC_017319	ATAC	2	8	173497	173504	50 %	25 %	0 %	25 %	384546198
3612	NC_017319	AGAA	2	8	173596	173603	75 %	0 %	25 %	0 %	384546198
3613	NC_017319	TGT	2	6	173715	173720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546198
3614	NC_017319	CTG	2	6	173758	173763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546198
3615	NC_017319	GAT	2	6	173803	173808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546198
3616	NC_017319	ATGC	2	8	173820	173827	25 %	25 %	25 %	25 %	384546198
3617	NC_017319	ACTG	2	8	173841	173848	25 %	25 %	25 %	25 %	384546198
3618	NC_017319	GACCA	2	10	173862	173871	40 %	0 %	20 %	40 %	384546198
3619	NC_017319	ATG	2	6	173900	173905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546198
3620	NC_017319	GAT	2	6	174038	174043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546198
3621	NC_017319	ATC	2	6	174072	174077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546199
3622	NC_017319	GGGAA	2	10	174283	174292	40 %	0 %	60 %	0 %	384546199
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3624	NC_017319	GCT	2	6	174435	174440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546200
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3745	NC_017319	T	7	7	181248	181254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3746	NC_017319	TTA	2	6	181275	181280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3747	NC_017319	TAA	2	6	181281	181286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3748	NC_017319	A	6	6	181285	181290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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