MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 4591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017319	CGC	2	6	143565	143570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546158
3002	NC_017319	TCG	2	6	143647	143652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546158
3003	NC_017319	TCA	2	6	143657	143662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546158
3004	NC_017319	TCT	2	6	143671	143676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546158
3005	NC_017319	TGT	2	6	143693	143698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546158
3006	NC_017319	GGC	2	6	143738	143743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546158
3007	NC_017319	GCT	2	6	143756	143761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546158
3008	NC_017319	CCAG	2	8	143765	143772	25 %	0 %	25 %	50 %	384546158
3009	NC_017319	CTG	2	6	143790	143795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546158
3010	NC_017319	TCA	2	6	143958	143963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546159
3011	NC_017319	AGA	2	6	143977	143982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546159
3012	NC_017319	T	6	6	143987	143992	0 %	100 %	0 %	0 %	384546159
3013	NC_017319	CTT	3	9	144079	144087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546159
3014	NC_017319	A	7	7	144092	144098	100 %	0 %	0 %	0 %	384546159
3015	NC_017319	GGA	2	6	144127	144132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546159
3016	NC_017319	CTT	2	6	144138	144143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546159
3017	NC_017319	GCC	2	6	144264	144269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_017319	CTTA	2	8	144308	144315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_017319	TAA	2	6	144316	144321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017319	TTCAT	2	10	144398	144407	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3021	NC_017319	TCAA	2	8	144428	144435	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_017319	CGC	2	6	144625	144630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_017319	GCAG	2	8	144649	144656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3024	NC_017319	CCA	2	6	144681	144686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_017319	CAT	2	6	144696	144701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_017319	CAT	2	6	144718	144723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_017319	TCGT	2	8	144737	144744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_017319	CAC	3	9	144796	144804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_017319	GCA	3	9	144816	144824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_017319	GCCTGC	2	12	144839	144850	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_017319	TGC	2	6	144885	144890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017319	CA	3	6	144934	144939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_017319	CAG	2	6	144996	145001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_017319	ATG	2	6	145103	145108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017319	CAG	2	6	145196	145201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_017319	TCA	2	6	145243	145248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017319	CAG	2	6	145398	145403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546160
3038	NC_017319	CAGG	2	8	145415	145422	25 %	0 %	50 %	25 %	384546160
3039	NC_017319	CA	3	6	145531	145536	50 %	0 %	0 %	50 %	384546160
3040	NC_017319	GT	3	6	145626	145631	0 %	50 %	50 %	0 %	384546161
3041	NC_017319	CCG	2	6	145642	145647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546161
3042	NC_017319	TGA	2	6	145704	145709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546161
3043	NC_017319	AAC	2	6	145848	145853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546161
3044	NC_017319	TGA	2	6	145884	145889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546161
3045	NC_017319	TCTT	2	8	145914	145921	0 %	75 %	0 %	25 %	384546161
3046	NC_017319	ATG	3	9	145961	145969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546161
3047	NC_017319	CAG	2	6	146060	146065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546161
3048	NC_017319	ATT	2	6	146070	146075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546161
3049	NC_017319	T	6	6	146074	146079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_017319	GCG	2	6	146143	146148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_017319	GGT	2	6	146197	146202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546162
3052	NC_017319	GAA	2	6	146532	146537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017319	T	7	7	146540	146546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017319	AATAT	2	10	146561	146570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017319	ATG	2	6	146591	146596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546163
3056	NC_017319	GAC	2	6	146610	146615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546163
3057	NC_017319	TTA	2	6	146693	146698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546163
3058	NC_017319	TGA	2	6	146737	146742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546163
3059	NC_017319	C	6	6	146761	146766	0 %	0 %	0 %	100 %	384546163
3060	NC_017319	TAA	2	6	146835	146840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546163
3061	NC_017319	GTT	2	6	146844	146849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546163
3062	NC_017319	AT	3	6	146899	146904	50 %	50 %	0 %	0 %	384546163
3063	NC_017319	TTG	2	6	147028	147033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546163
3064	NC_017319	ATT	2	6	147050	147055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546163
3065	NC_017319	T	6	6	147091	147096	0 %	100 %	0 %	0 %	384546163
3066	NC_017319	ATTA	2	8	147127	147134	50 %	50 %	0 %	0 %	384546163
3067	NC_017319	AATT	2	8	147142	147149	50 %	50 %	0 %	0 %	384546163
3068	NC_017319	TTG	2	6	147167	147172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546163
3069	NC_017319	AT	3	6	147175	147180	50 %	50 %	0 %	0 %	384546163
3070	NC_017319	ATC	2	6	147268	147273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546163
3071	NC_017319	TAT	2	6	147280	147285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546163
3072	NC_017319	G	7	7	147400	147406	0 %	0 %	100 %	0 %	384546163
3073	NC_017319	TTA	2	6	147422	147427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546163
3074	NC_017319	TGA	2	6	147436	147441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546163
3075	NC_017319	A	6	6	147477	147482	100 %	0 %	0 %	0 %	384546163
3076	NC_017319	T	8	8	147598	147605	0 %	100 %	0 %	0 %	384546163
3077	NC_017319	AT	3	6	147640	147645	50 %	50 %	0 %	0 %	384546163
3078	NC_017319	TTA	2	6	147654	147659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546163
3079	NC_017319	ACTT	2	8	147697	147704	25 %	50 %	0 %	25 %	384546163
3080	NC_017319	ATG	2	6	147732	147737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546163
3081	NC_017319	TTTC	2	8	147743	147750	0 %	75 %	0 %	25 %	384546163
3082	NC_017319	GTTA	2	8	147754	147761	25 %	50 %	25 %	0 %	384546163
3083	NC_017319	AT	4	8	147813	147820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017319	ATA	2	6	147842	147847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_017319	TTC	2	6	147861	147866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_017319	AGAA	2	8	148049	148056	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017319	ATT	2	6	148095	148100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017319	TAT	2	6	148105	148110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017319	T	7	7	148133	148139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017319	AT	3	6	148177	148182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017319	AT	3	6	148231	148236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_017319	ATA	2	6	148294	148299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017319	T	7	7	148324	148330	0 %	100 %	0 %	0 %	384546164
3094	NC_017319	G	8	8	148353	148360	0 %	0 %	100 %	0 %	384546164
3095	NC_017319	A	6	6	148385	148390	100 %	0 %	0 %	0 %	384546164
3096	NC_017319	TGT	2	6	148416	148421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546164
3097	NC_017319	G	6	6	148441	148446	0 %	0 %	100 %	0 %	384546164
3098	NC_017319	CTC	2	6	148463	148468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546164
3099	NC_017319	ATT	2	6	148515	148520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546164
3100	NC_017319	ATGGA	2	10	148562	148571	40 %	20 %	40 %	0 %	384546164
3101	NC_017319	TA	3	6	148579	148584	50 %	50 %	0 %	0 %	384546164
3102	NC_017319	CTT	2	6	148586	148591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546164
3103	NC_017319	TGG	2	6	148659	148664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546164
3104	NC_017319	ATA	2	6	148673	148678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546164
3105	NC_017319	ATG	2	6	148679	148684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546164
3106	NC_017319	TGG	2	6	148704	148709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546164
3107	NC_017319	AATC	2	8	148740	148747	50 %	25 %	0 %	25 %	384546164
3108	NC_017319	TGG	2	6	148761	148766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546164
3109	NC_017319	GCG	2	6	148769	148774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546164
3110	NC_017319	TGG	2	6	148800	148805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546164
3111	NC_017319	TAA	2	6	148835	148840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546164
3112	NC_017319	ATT	2	6	148849	148854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546164
3113	NC_017319	TGG	2	6	148866	148871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546164
3114	NC_017319	TAGTGA	2	12	148881	148892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546164
3115	NC_017319	G	6	6	148894	148899	0 %	0 %	100 %	0 %	384546164
3116	NC_017319	CAA	2	6	148941	148946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546164
3117	NC_017319	GGT	2	6	148960	148965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546164
3118	NC_017319	AGC	2	6	149026	149031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546164
3119	NC_017319	CT	3	6	149032	149037	0 %	50 %	0 %	50 %	384546164
3120	NC_017319	TGC	2	6	149076	149081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546164
3121	NC_017319	GGTTAT	2	12	149086	149097	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384546164
3122	NC_017319	GGT	2	6	149107	149112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546164
3123	NC_017319	CTGT	2	8	149134	149141	0 %	50 %	25 %	25 %	384546164
3124	NC_017319	CAA	2	6	149145	149150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546164
3125	NC_017319	TGG	2	6	149172	149177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546164
3126	NC_017319	G	6	6	149183	149188	0 %	0 %	100 %	0 %	384546164
3127	NC_017319	AT	3	6	149229	149234	50 %	50 %	0 %	0 %	384546164
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3247	NC_017319	GA	3	6	155891	155896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_017319	GCT	2	6	155910	155915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3378	NC_017319	CCT	2	6	161755	161760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3379	NC_017319	TCC	3	9	161782	161790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3380	NC_017319	GAG	2	6	161878	161883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3381	NC_017319	GTAT	2	8	161913	161920	25 %	50 %	25 %	0 %	384546180
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3493	NC_017319	CG	3	6	167341	167346	0 %	0 %	50 %	50 %	384546188
3494	NC_017319	AT	3	6	167383	167388	50 %	50 %	0 %	0 %	384546188
3495	NC_017319	GTG	2	6	167456	167461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546188
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3497	NC_017319	AGC	2	6	167528	167533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546189
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