MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 4591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017319	TGT	2	6	23564	23569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384545998
502	NC_017319	CTT	2	6	23634	23639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384545998
503	NC_017319	TGG	2	6	23640	23645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384545998
504	NC_017319	CG	3	6	23651	23656	0 %	0 %	50 %	50 %	384545998
505	NC_017319	TC	3	6	23765	23770	0 %	50 %	0 %	50 %	384545998
506	NC_017319	TAA	2	6	23820	23825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384545998
507	NC_017319	GAA	2	6	23911	23916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017319	TTC	2	6	23919	23924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_017319	CCG	2	6	23948	23953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_017319	CAG	2	6	24047	24052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017319	TTC	2	6	24067	24072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_017319	TCA	2	6	24126	24131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017319	TGA	2	6	24172	24177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017319	CTG	2	6	24204	24209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017319	CTT	2	6	24223	24228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017319	TGTTT	2	10	24254	24263	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017319	T	6	6	24291	24296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017319	T	7	7	24343	24349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017319	CTTT	2	8	24351	24358	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_017319	AT	3	6	24378	24383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017319	CCCAG	2	10	24484	24493	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
522	NC_017319	AAT	2	6	24542	24547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017319	G	6	6	24560	24565	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017319	TGT	2	6	24597	24602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017319	ATT	2	6	24611	24616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017319	AAC	2	6	24632	24637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_017319	CA	3	6	24667	24672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_017319	GAA	2	6	24685	24690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017319	ATG	2	6	24692	24697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017319	GGGA	2	8	24703	24710	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017319	A	6	6	24870	24875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017319	CATC	2	8	24928	24935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
533	NC_017319	TGA	2	6	24954	24959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017319	GAA	2	6	24980	24985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017319	TTG	2	6	25031	25036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017319	AAGGT	2	10	25114	25123	40 %	20 %	40 %	0 %	384545999
537	NC_017319	GCTG	2	8	25234	25241	0 %	25 %	50 %	25 %	384545999
538	NC_017319	AGC	2	6	25309	25314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384545999
539	NC_017319	A	6	6	25341	25346	100 %	0 %	0 %	0 %	384545999
540	NC_017319	C	8	8	25391	25398	0 %	0 %	0 %	100 %	384545999
541	NC_017319	CAT	2	6	25401	25406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384545999
542	NC_017319	TGA	2	6	25446	25451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384545999
543	NC_017319	AGCGC	2	10	25514	25523	20 %	0 %	40 %	40 %	384546000
544	NC_017319	GAA	2	6	25592	25597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546000
545	NC_017319	TCA	2	6	25609	25614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546000
546	NC_017319	CGG	2	6	25653	25658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546000
547	NC_017319	CTCA	2	8	25729	25736	25 %	25 %	0 %	50 %	384546000
548	NC_017319	CAG	3	9	25857	25865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546000
549	NC_017319	ACG	2	6	25913	25918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546000
550	NC_017319	C	6	6	25938	25943	0 %	0 %	0 %	100 %	384546000
551	NC_017319	TCA	2	6	25950	25955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546000
552	NC_017319	TGA	2	6	25957	25962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546000
553	NC_017319	TCAG	2	8	25980	25987	25 %	25 %	25 %	25 %	384546000
554	NC_017319	GAA	2	6	25988	25993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546000
555	NC_017319	TTC	2	6	26003	26008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546000
556	NC_017319	GCA	2	6	26099	26104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546000
557	NC_017319	TCAAA	2	10	26152	26161	60 %	20 %	0 %	20 %	384546000
558	NC_017319	CAGA	2	8	26179	26186	50 %	0 %	25 %	25 %	384546000
559	NC_017319	TGG	2	6	26252	26257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017319	CGT	2	6	26283	26288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017319	ACA	2	6	26293	26298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017319	ACA	2	6	26316	26321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017319	GT	3	6	26334	26339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017319	ATG	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017319	AAC	2	6	26510	26515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546001
566	NC_017319	CCGT	2	8	26675	26682	0 %	25 %	25 %	50 %	384546002
567	NC_017319	GAA	2	6	26724	26729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546002
568	NC_017319	TGT	2	6	26733	26738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384546002
569	NC_017319	GTG	3	9	26746	26754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546002
570	NC_017319	ATT	2	6	26761	26766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546002
571	NC_017319	ATTC	2	8	26818	26825	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
572	NC_017319	GAT	2	6	26827	26832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017319	TAA	2	6	26833	26838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017319	GC	3	6	26848	26853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_017319	TGCA	2	8	26885	26892	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
576	NC_017319	T	8	8	26910	26917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017319	TAA	2	6	26919	26924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017319	TAAG	2	8	26973	26980	50 %	25 %	25 %	0 %	384546003
579	NC_017319	T	6	6	27060	27065	0 %	100 %	0 %	0 %	384546003
580	NC_017319	CTG	2	6	27084	27089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546003
581	NC_017319	CG	3	6	27111	27116	0 %	0 %	50 %	50 %	384546003
582	NC_017319	CAG	2	6	27177	27182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546003
583	NC_017319	GT	3	6	27309	27314	0 %	50 %	50 %	0 %	384546003
584	NC_017319	AGT	2	6	27326	27331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546003
585	NC_017319	CTG	2	6	27368	27373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546003
586	NC_017319	AGA	2	6	27376	27381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546003
587	NC_017319	TCA	2	6	27416	27421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546003
588	NC_017319	ACT	2	6	27438	27443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546003
589	NC_017319	ACCGC	2	10	27470	27479	20 %	0 %	20 %	60 %	384546003
590	NC_017319	TTATG	2	10	27553	27562	20 %	60 %	20 %	0 %	384546003
591	NC_017319	GAC	2	6	27575	27580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546003
592	NC_017319	GAG	2	6	27614	27619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384546003
593	NC_017319	ACAAA	2	10	27631	27640	80 %	0 %	0 %	20 %	384546003
594	NC_017319	ATT	2	6	27662	27667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546003
595	NC_017319	TGC	2	6	27745	27750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546003
596	NC_017319	GCC	2	6	27775	27780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546003
597	NC_017319	TTCCA	2	10	27794	27803	20 %	40 %	0 %	40 %	384546003
598	NC_017319	ATT	2	6	27842	27847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546003
599	NC_017319	GGAT	2	8	27853	27860	25 %	25 %	50 %	0 %	384546003
600	NC_017319	GGT	2	6	27956	27961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546003
601	NC_017319	GA	3	6	28001	28006	50 %	0 %	50 %	0 %	384546003
602	NC_017319	GCG	2	6	28008	28013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546003
603	NC_017319	GTG	2	6	28062	28067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546003
604	NC_017319	GCA	2	6	28091	28096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546003
605	NC_017319	ACT	2	6	28146	28151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546003
606	NC_017319	ACCG	2	8	28169	28176	25 %	0 %	25 %	50 %	384546004
607	NC_017319	AAT	2	6	28210	28215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546004
608	NC_017319	GAA	2	6	28219	28224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546004
609	NC_017319	ACAG	2	8	28350	28357	50 %	0 %	25 %	25 %	384546004
610	NC_017319	ACA	2	6	28404	28409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546004
611	NC_017319	CGT	2	6	28468	28473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546004
612	NC_017319	GCA	2	6	28477	28482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546004
613	NC_017319	GAT	2	6	28522	28527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546004
614	NC_017319	ATA	2	6	28586	28591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546004
615	NC_017319	AG	3	6	28660	28665	50 %	0 %	50 %	0 %	384546004
616	NC_017319	AGC	2	6	28701	28706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546004
617	NC_017319	AT	3	6	28811	28816	50 %	50 %	0 %	0 %	384546004
618	NC_017319	TGA	2	6	28821	28826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546004
619	NC_017319	GAA	2	6	28833	28838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546004
620	NC_017319	TTA	2	6	28859	28864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546004
621	NC_017319	CTG	2	6	28865	28870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546004
622	NC_017319	TAT	2	6	28905	28910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546004
623	NC_017319	ACGT	2	8	29031	29038	25 %	25 %	25 %	25 %	384546004
624	NC_017319	TTA	2	6	29199	29204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017319	T	8	8	29208	29215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017319	TCT	2	6	29254	29259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_017319	ATG	2	6	29349	29354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546005
628	NC_017319	AAC	2	6	29365	29370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546005
629	NC_017319	CTGG	2	8	29508	29515	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
630	NC_017319	ATG	2	6	29597	29602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546006
631	NC_017319	ACG	2	6	29663	29668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546006
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633	NC_017319	GGTT	2	8	29768	29775	0 %	50 %	50 %	0 %	384546006
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