MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2002017 plasmid pSFxv_1

Total Repeats: 4591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017319	CTG	2	6	219084	219089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546264
4502	NC_017319	GCACT	2	10	219100	219109	20 %	20 %	20 %	40 %	384546264
4503	NC_017319	CGG	2	6	219123	219128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546264
4504	NC_017319	CGC	2	6	219175	219180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384546264
4505	NC_017319	CGT	2	6	219197	219202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546264
4506	NC_017319	AGTGG	2	10	219207	219216	20 %	20 %	60 %	0 %	384546264
4507	NC_017319	GAA	2	6	219288	219293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546264
4508	NC_017319	CGG	2	6	219296	219301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384546264
4509	NC_017319	AG	3	6	219330	219335	50 %	0 %	50 %	0 %	384546264
4510	NC_017319	GCA	2	6	219397	219402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384546264
4511	NC_017319	TCGC	2	8	219465	219472	0 %	25 %	25 %	50 %	384546264
4512	NC_017319	GAA	2	6	219557	219562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_017319	GGT	2	6	219575	219580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_017319	TTG	2	6	219734	219739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_017319	TCAT	2	8	219804	219811	25 %	50 %	0 %	25 %	384546265
4516	NC_017319	CTAT	2	8	219825	219832	25 %	50 %	0 %	25 %	384546265
4517	NC_017319	AAT	3	9	219875	219883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546265
4518	NC_017319	TC	3	6	219938	219943	0 %	50 %	0 %	50 %	384546266
4519	NC_017319	GAA	2	6	219994	219999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546266
4520	NC_017319	ACA	2	6	220012	220017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546266
4521	NC_017319	TA	3	6	220020	220025	50 %	50 %	0 %	0 %	384546266
4522	NC_017319	A	6	6	220027	220032	100 %	0 %	0 %	0 %	384546266
4523	NC_017319	AGA	2	6	220049	220054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384546266
4524	NC_017319	CTTC	2	8	220165	220172	0 %	50 %	0 %	50 %	384546266
4525	NC_017319	GTC	2	6	220250	220255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546266
4526	NC_017319	TAA	2	6	220268	220273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546266
4527	NC_017319	CTC	2	6	220275	220280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384546266
4528	NC_017319	CTT	2	6	220323	220328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384546266
4529	NC_017319	AT	3	6	220332	220337	50 %	50 %	0 %	0 %	384546266
4530	NC_017319	TA	3	6	220392	220397	50 %	50 %	0 %	0 %	384546266
4531	NC_017319	TATT	2	8	220412	220419	25 %	75 %	0 %	0 %	384546266
4532	NC_017319	TATC	2	8	220539	220546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4533	NC_017319	GGC	2	6	220621	220626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_017319	TTGA	2	8	220855	220862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017319	ATGAA	2	10	220883	220892	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_017319	TAT	2	6	220970	220975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384546267
4537	NC_017319	CAT	2	6	221015	221020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546267
4538	NC_017319	CAC	2	6	221021	221026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384546267
4539	NC_017319	CAAC	2	8	221033	221040	50 %	0 %	0 %	50 %	384546267
4540	NC_017319	AGT	2	6	221073	221078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384546267
4541	NC_017319	ATA	2	6	221193	221198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_017319	AAT	2	6	221199	221204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_017319	TAA	2	6	221212	221217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_017319	TAT	2	6	221237	221242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_017319	A	6	6	221243	221248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_017319	TAG	2	6	221274	221279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_017319	ATA	2	6	221549	221554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_017319	AGG	2	6	221655	221660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_017319	TGA	2	6	221703	221708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_017319	GTT	2	6	221726	221731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017319	TGAT	2	8	221749	221756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017319	GA	3	6	221768	221773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017319	AAG	2	6	221776	221781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_017319	AGGT	2	8	221838	221845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_017319	T	7	7	221890	221896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_017319	AATA	2	8	221913	221920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_017319	TAA	2	6	221924	221929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_017319	TTAA	2	8	221961	221968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017319	AAT	2	6	221969	221974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_017319	AAG	2	6	222004	222009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017319	A	6	6	222028	222033	100 %	0 %	0 %	0 %	384546268
4562	NC_017319	TAC	2	6	222093	222098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546268
4563	NC_017319	ACTA	2	8	222109	222116	50 %	25 %	0 %	25 %	384546268
4564	NC_017319	ACA	2	6	222134	222139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384546268
4565	NC_017319	CAAAA	2	10	222174	222183	80 %	0 %	0 %	20 %	384546268
4566	NC_017319	ATC	2	6	222194	222199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546268
4567	NC_017319	AAGG	2	8	222202	222209	50 %	0 %	50 %	0 %	384546268
4568	NC_017319	G	6	6	222208	222213	0 %	0 %	100 %	0 %	384546268
4569	NC_017319	ACTGG	2	10	222228	222237	20 %	20 %	40 %	20 %	384546268
4570	NC_017319	ACT	2	6	222319	222324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384546268
4571	NC_017319	AGCA	2	8	222339	222346	50 %	0 %	25 %	25 %	384546268
4572	NC_017319	GACC	2	8	222390	222397	25 %	0 %	25 %	50 %	384546268
4573	NC_017319	GGTT	2	8	222457	222464	0 %	50 %	50 %	0 %	384546268
4574	NC_017319	AAT	2	6	222469	222474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546268
4575	NC_017319	AG	3	6	222510	222515	50 %	0 %	50 %	0 %	384546268
4576	NC_017319	GGGA	2	8	222537	222544	25 %	0 %	75 %	0 %	384546268
4577	NC_017319	G	6	6	222565	222570	0 %	0 %	100 %	0 %	384546268
4578	NC_017319	A	6	6	222580	222585	100 %	0 %	0 %	0 %	384546268
4579	NC_017319	GTG	2	6	222599	222604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384546268
4580	NC_017319	A	6	6	222774	222779	100 %	0 %	0 %	0 %	384546268
4581	NC_017319	TGC	2	6	222798	222803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384546268
4582	NC_017319	TA	3	6	222841	222846	50 %	50 %	0 %	0 %	384546268
4583	NC_017319	TAA	2	6	222870	222875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384546268
4584	NC_017319	A	6	6	222874	222879	100 %	0 %	0 %	0 %	384546268
4585	NC_017319	AT	3	6	222911	222916	50 %	50 %	0 %	0 %	384546268
4586	NC_017319	AT	3	6	222948	222953	50 %	50 %	0 %	0 %	384546268
4587	NC_017319	T	6	6	222986	222991	0 %	100 %	0 %	0 %	384546268
4588	NC_017319	GCC	2	6	223035	223040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_017319	A	6	6	223183	223188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_017319	ATC	2	6	223261	223266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_017319	CTA	2	6	223318	223323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.