MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803

Total Repeats: 66818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017277	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017277	GTG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017277	GCG	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017277	TCT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017277	GGT	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017277	ATT	2	6	211	216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017277	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017277	CT	3	6	328	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017277	TG	4	8	385	392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017277	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017277	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017277	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017277	GA	3	6	721	726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017277	GTC	2	6	759	764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017277	T	6	6	786	791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017277	T	6	6	836	841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017277	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384435231
18	NC_017277	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435231
19	NC_017277	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435231
20	NC_017277	C	6	6	1162	1167	0 %	0 %	0 %	100 %	384435231
21	NC_017277	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435231
22	NC_017277	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435231
23	NC_017277	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	384435231
24	NC_017277	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384435231
25	NC_017277	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435231
26	NC_017277	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	384435231
27	NC_017277	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_017277	C	6	6	1507	1512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_017277	ATC	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017277	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435232
31	NC_017277	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435232
32	NC_017277	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	384435232
33	NC_017277	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435232
34	NC_017277	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	384435232
35	NC_017277	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435232
36	NC_017277	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435232
37	NC_017277	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435232
38	NC_017277	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435232
39	NC_017277	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435232
40	NC_017277	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	384435232
41	NC_017277	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017277	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	384435233
43	NC_017277	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384435233
44	NC_017277	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	384435233
45	NC_017277	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435233
46	NC_017277	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435233
47	NC_017277	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435233
48	NC_017277	T	8	8	2817	2824	0 %	100 %	0 %	0 %	384435233
49	NC_017277	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435233
50	NC_017277	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435233
51	NC_017277	TAT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017277	GCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017277	AC	3	6	2930	2935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017277	A	6	6	2940	2945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017277	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017277	AGC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017277	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435234
58	NC_017277	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	384435234
59	NC_017277	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435234
60	NC_017277	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435234
61	NC_017277	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435234
62	NC_017277	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435234
63	NC_017277	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435234
64	NC_017277	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	384435234
65	NC_017277	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435234
66	NC_017277	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435234
67	NC_017277	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435234
68	NC_017277	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435234
69	NC_017277	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435234
70	NC_017277	GTT	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017277	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017277	G	7	7	4391	4397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017277	TTG	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017277	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435235
75	NC_017277	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435235
76	NC_017277	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435235
77	NC_017277	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435235
78	NC_017277	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435235
79	NC_017277	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435235
80	NC_017277	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435235
81	NC_017277	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435235
82	NC_017277	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435235
83	NC_017277	CA	3	6	5066	5071	50 %	0 %	0 %	50 %	384435235
84	NC_017277	T	6	6	5078	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	384435235
85	NC_017277	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435235
86	NC_017277	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435235
87	NC_017277	C	6	6	5178	5183	0 %	0 %	0 %	100 %	384435235
88	NC_017277	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	384435235
89	NC_017277	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435235
90	NC_017277	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	384435235
91	NC_017277	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017277	CCA	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017277	GTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017277	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435236
95	NC_017277	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435236
96	NC_017277	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435236
97	NC_017277	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435236
98	NC_017277	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435236
99	NC_017277	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	384435236
100	NC_017277	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435236
101	NC_017277	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435236
102	NC_017277	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435236
103	NC_017277	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384435236
104	NC_017277	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435236
105	NC_017277	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435236
106	NC_017277	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435236
107	NC_017277	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435236
108	NC_017277	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435236
109	NC_017277	A	6	6	6800	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017277	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017277	ATT	2	6	6924	6929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017277	ATT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017277	A	6	6	7068	7073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017277	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435237
115	NC_017277	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	384435237
116	NC_017277	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435237
117	NC_017277	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435237
118	NC_017277	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435237
119	NC_017277	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435237
120	NC_017277	C	6	6	7394	7399	0 %	0 %	0 %	100 %	384435237
121	NC_017277	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435237
122	NC_017277	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435237
123	NC_017277	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435237
124	NC_017277	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435237
125	NC_017277	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435237
126	NC_017277	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435237
127	NC_017277	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384435237
128	NC_017277	TG	3	6	7658	7663	0 %	50 %	50 %	0 %	384435237
129	NC_017277	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435237
130	NC_017277	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384435237
131	NC_017277	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435237
132	NC_017277	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384435237
133	NC_017277	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435237
134	NC_017277	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435237
135	NC_017277	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384435237
136	NC_017277	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435237
137	NC_017277	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435237
138	NC_017277	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435237
139	NC_017277	TTCAAC	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435237
140	NC_017277	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384435237
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142	NC_017277	G	6	6	8364	8369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017277	TCT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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404	NC_017277	TAC	2	6	22287	22292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435247
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