MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 58178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017274	CA	3	6	685483	685488	50 %	0 %	0 %	50 %	384433240
15002	NC_017274	AG	3	6	685510	685515	50 %	0 %	50 %	0 %	384433240
15003	NC_017274	TA	3	6	685525	685530	50 %	50 %	0 %	0 %	384433240
15004	NC_017274	GAA	2	6	685634	685639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_017274	CAA	2	6	685642	685647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_017274	T	6	6	685665	685670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_017274	GAG	2	6	685708	685713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_017274	ACT	2	6	685875	685880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_017274	TA	3	6	685927	685932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_017274	TGA	2	6	685954	685959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_017274	TGA	2	6	685970	685975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_017274	TAC	2	6	685980	685985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_017274	GTG	2	6	686028	686033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_017274	AGG	2	6	686084	686089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_017274	CT	3	6	686177	686182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15016	NC_017274	AAT	2	6	686191	686196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_017274	CT	3	6	686247	686252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15018	NC_017274	TTA	2	6	686273	686278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_017274	TTA	2	6	686305	686310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_017274	TAA	2	6	686353	686358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384433241
15021	NC_017274	TAT	2	6	686365	686370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384433241
15022	NC_017274	AGT	2	6	686371	686376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384433241
15023	NC_017274	AAGAG	2	10	686389	686398	60 %	0 %	40 %	0 %	384433241
15024	NC_017274	ATT	2	6	686453	686458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384433241
15025	NC_017274	TGT	2	6	686492	686497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384433241
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15028	NC_017274	GAG	2	6	686623	686628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384433242
15029	NC_017274	TCCC	2	8	686721	686728	0 %	25 %	0 %	75 %	384433242
15030	NC_017274	AAG	2	6	686821	686826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384433242
15031	NC_017274	TGA	2	6	686832	686837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384433242
15032	NC_017274	GAA	2	6	686861	686866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384433242
15033	NC_017274	AAT	2	6	686889	686894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384433242
15034	NC_017274	AAT	2	6	686922	686927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384433242
15035	NC_017274	ATT	2	6	686977	686982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384433242
15036	NC_017274	T	6	6	686989	686994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_017274	TTC	2	6	687133	687138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_017274	TCA	2	6	687144	687149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_017274	TAA	2	6	687241	687246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_017274	TAG	2	6	687344	687349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_017274	ATT	2	6	687351	687356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_017274	TA	3	6	687368	687373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_017274	TG	3	6	687456	687461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_017274	TAA	2	6	687490	687495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_017274	ACTG	2	8	687543	687550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15046	NC_017274	TTA	2	6	687574	687579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_017274	AAT	2	6	687675	687680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_017274	ACT	2	6	687709	687714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15049	NC_017274	TA	3	6	687852	687857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_017274	TGG	2	6	687881	687886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_017274	AG	3	6	687888	687893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_017274	ACT	2	6	687931	687936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_017274	GTAT	2	8	687981	687988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_017274	TAT	2	6	688002	688007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_017274	GAT	2	6	688014	688019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_017274	ATA	2	6	688098	688103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15057	NC_017274	CAC	2	6	688159	688164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15058	NC_017274	TA	3	6	688178	688183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_017274	GCCT	2	8	688272	688279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15060	NC_017274	GAG	2	6	688432	688437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15061	NC_017274	ATT	2	6	688540	688545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15062	NC_017274	AAG	2	6	688561	688566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_017274	AAG	2	6	688585	688590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_017274	ATG	2	6	688601	688606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_017274	ACA	2	6	688642	688647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_017274	AGG	2	6	688775	688780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_017274	ATAGT	2	10	688796	688805	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_017274	GGA	2	6	688825	688830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_017274	AGTT	2	8	688875	688882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15070	NC_017274	TAT	2	6	688936	688941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_017274	AAG	2	6	688979	688984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_017274	TTG	2	6	688989	688994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_017274	TTG	3	9	689007	689015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_017274	GTT	2	6	689033	689038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_017274	GAT	2	6	689060	689065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_017274	GAG	2	6	689074	689079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_017274	GAG	2	6	689141	689146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_017274	GTT	2	6	689207	689212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_017274	TAA	2	6	689227	689232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_017274	TAAG	2	8	689252	689259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_017274	TTA	2	6	689343	689348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_017274	CCT	2	6	689367	689372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15088	NC_017274	GTA	2	6	689586	689591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384433243
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15091	NC_017274	GGGT	2	8	689750	689757	0 %	25 %	75 %	0 %	384433243
15092	NC_017274	TA	3	6	689758	689763	50 %	50 %	0 %	0 %	384433243
15093	NC_017274	TAT	2	6	689989	689994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384433243
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15098	NC_017274	CTC	2	6	690257	690262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384433244
15099	NC_017274	TAAG	2	8	690275	690282	50 %	25 %	25 %	0 %	384433244
15100	NC_017274	GTA	2	6	690374	690379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384433244
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15102	NC_017274	ATC	2	6	690486	690491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384433244
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15104	NC_017274	TTA	2	6	690532	690537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384433245
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15107	NC_017274	TCA	2	6	690722	690727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384433245
15108	NC_017274	GCTTT	2	10	690733	690742	0 %	60 %	20 %	20 %	384433245
15109	NC_017274	AAT	2	6	690794	690799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384433245
15110	NC_017274	GTAA	2	8	690865	690872	50 %	25 %	25 %	0 %	384433245
15111	NC_017274	GTACA	2	10	690934	690943	40 %	20 %	20 %	20 %	384433245
15112	NC_017274	TA	3	6	690957	690962	50 %	50 %	0 %	0 %	384433245
15113	NC_017274	TAA	2	6	690991	690996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384433245
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15119	NC_017274	ATTG	2	8	691202	691209	25 %	50 %	25 %	0 %	384433245
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15121	NC_017274	TA	3	6	691267	691272	50 %	50 %	0 %	0 %	384433245
15122	NC_017274	ATA	2	6	691312	691317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384433245
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15125	NC_017274	TAAA	2	8	691400	691407	75 %	25 %	0 %	0 %	384433245
15126	NC_017274	AT	3	6	691488	691493	50 %	50 %	0 %	0 %	384433245
15127	NC_017274	TAA	2	6	691713	691718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_017274	ATT	2	6	691744	691749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15129	NC_017274	GTT	2	6	691789	691794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_017274	ATT	2	6	691814	691819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15131	NC_017274	CAT	2	6	691843	691848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_017274	TAT	2	6	692059	692064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_017274	TTCTTT	2	12	692083	692094	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15134	NC_017274	AT	3	6	692117	692122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15135	NC_017274	ATT	2	6	692229	692234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15136	NC_017274	AGTA	2	8	692260	692267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15137	NC_017274	ACG	2	6	692288	692293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15139	NC_017274	TTTAC	2	10	692411	692420	20 %	60 %	0 %	20 %	384433246
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15143	NC_017274	TGT	2	6	692670	692675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384433246
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15166	NC_017274	TTTAC	2	10	693864	693873	20 %	60 %	0 %	20 %	384433247
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15494	NC_017274	TAA	2	6	708363	708368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384433262
15495	NC_017274	TCTT	2	8	708413	708420	0 %	75 %	0 %	25 %	384433262
15496	NC_017274	CCA	2	6	708452	708457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384433262
15497	NC_017274	CGT	2	6	708519	708524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384433262
15498	NC_017274	TGG	2	6	708636	708641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384433262
15499	NC_017274	GCATTA	2	12	708665	708676	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384433262
15500	NC_017274	ATC	2	6	708766	708771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384433262

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