MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 58178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_017274	CTC	2	6	2496491	2496496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54502	NC_017274	CCA	2	6	2496592	2496597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54503	NC_017274	A	6	6	2496597	2496602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54504	NC_017274	TTC	3	9	2496606	2496614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54505	NC_017274	GTT	2	6	2496626	2496631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54506	NC_017274	GA	3	6	2496641	2496646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54507	NC_017274	CAA	2	6	2496668	2496673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54508	NC_017274	A	6	6	2496736	2496741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54509	NC_017274	TTC	2	6	2496776	2496781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54510	NC_017274	AGA	2	6	2496816	2496821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54511	NC_017274	TGA	2	6	2496835	2496840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54512	NC_017274	ACG	2	6	2496852	2496857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54513	NC_017274	GGT	2	6	2496919	2496924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54514	NC_017274	AGG	2	6	2496974	2496979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54515	NC_017274	GGTTG	2	10	2496995	2497004	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
54516	NC_017274	GAA	2	6	2497070	2497075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54517	NC_017274	CAA	2	6	2497146	2497151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54518	NC_017274	TCT	2	6	2497179	2497184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54519	NC_017274	AGGGT	2	10	2497235	2497244	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54520	NC_017274	ATT	2	6	2497311	2497316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54521	NC_017274	AT	4	8	2497333	2497340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54522	NC_017274	TA	3	6	2497341	2497346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54523	NC_017274	AAT	2	6	2497370	2497375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54524	NC_017274	ATATT	2	10	2497389	2497398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54525	NC_017274	A	7	7	2497443	2497449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54526	NC_017274	AGA	2	6	2497479	2497484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54527	NC_017274	TTA	2	6	2497536	2497541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54528	NC_017274	AAG	2	6	2497592	2497597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435057
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54530	NC_017274	ATAA	2	8	2497697	2497704	75 %	25 %	0 %	0 %	384435057
54531	NC_017274	TCA	2	6	2497751	2497756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435057
54532	NC_017274	CTT	3	9	2497792	2497800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435058
54533	NC_017274	TGA	2	6	2497864	2497869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435058
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54535	NC_017274	TTA	2	6	2497968	2497973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435058
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54537	NC_017274	ATTG	2	8	2497988	2497995	25 %	50 %	25 %	0 %	384435058
54538	NC_017274	TTGA	2	8	2498013	2498020	25 %	50 %	25 %	0 %	384435058
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54541	NC_017274	A	6	6	2498177	2498182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54542	NC_017274	ACTT	2	8	2498197	2498204	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54543	NC_017274	TTTA	2	8	2498234	2498241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54544	NC_017274	ATT	2	6	2498267	2498272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54545	NC_017274	CTC	2	6	2498325	2498330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435059
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54547	NC_017274	CTTAA	2	10	2498365	2498374	40 %	40 %	0 %	20 %	384435059
54548	NC_017274	CT	3	6	2498377	2498382	0 %	50 %	0 %	50 %	384435059
54549	NC_017274	CTC	2	6	2498418	2498423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435059
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54552	NC_017274	CTT	2	6	2498565	2498570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54553	NC_017274	ACT	2	6	2498670	2498675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54554	NC_017274	CTT	2	6	2498691	2498696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54555	NC_017274	TAA	2	6	2498708	2498713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54556	NC_017274	AAG	2	6	2498726	2498731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54557	NC_017274	TTG	2	6	2498795	2498800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54558	NC_017274	TAT	2	6	2498810	2498815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54559	NC_017274	ATT	2	6	2498841	2498846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54560	NC_017274	CTC	2	6	2498847	2498852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54561	NC_017274	GGTT	2	8	2498895	2498902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54562	NC_017274	AAT	2	6	2498903	2498908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54563	NC_017274	CAT	2	6	2498992	2498997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54564	NC_017274	TAA	2	6	2499011	2499016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54565	NC_017274	A	6	6	2499015	2499020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54566	NC_017274	ATTAA	2	10	2499098	2499107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54567	NC_017274	ATT	3	9	2499112	2499120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54568	NC_017274	ATT	2	6	2499224	2499229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54569	NC_017274	GTT	2	6	2499308	2499313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54570	NC_017274	GTT	2	6	2499344	2499349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54578	NC_017274	TAA	2	6	2499588	2499593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54579	NC_017274	CTA	2	6	2499625	2499630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54580	NC_017274	TCTT	2	8	2499653	2499660	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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54582	NC_017274	CTA	2	6	2499753	2499758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54583	NC_017274	AT	3	6	2499779	2499784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54584	NC_017274	GATAA	2	10	2499810	2499819	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54585	NC_017274	CTA	2	6	2499821	2499826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54586	NC_017274	GCCC	2	8	2499838	2499845	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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54589	NC_017274	TTTC	3	12	2499946	2499957	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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54596	NC_017274	CTT	3	9	2500064	2500072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435061
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54605	NC_017274	TAA	2	6	2500425	2500430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54606	NC_017274	GTAT	2	8	2500492	2500499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54607	NC_017274	TTAA	2	8	2500514	2500521	50 %	50 %	0 %	0 %	384435062
54608	NC_017274	GGGC	2	8	2500541	2500548	0 %	0 %	75 %	25 %	384435062
54609	NC_017274	TAA	2	6	2500570	2500575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435062
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54617	NC_017274	ATTAT	2	10	2501048	2501057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54618	NC_017274	ATCC	2	8	2501096	2501103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54619	NC_017274	AAGG	2	8	2501107	2501114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54620	NC_017274	TTA	2	6	2501146	2501151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54621	NC_017274	CTC	2	6	2501170	2501175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54622	NC_017274	AGGGGT	2	12	2501292	2501303	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384435063
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