MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 58178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53502	NC_017274	TTC	2	6	2450212	2450217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435010
53503	NC_017274	ATT	2	6	2450248	2450253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435010
53504	NC_017274	TTA	2	6	2450262	2450267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435010
53505	NC_017274	ATT	2	6	2450273	2450278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435010
53506	NC_017274	A	6	6	2450290	2450295	100 %	0 %	0 %	0 %	384435010
53507	NC_017274	ATT	2	6	2450301	2450306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435010
53508	NC_017274	CAA	2	6	2450313	2450318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435010
53509	NC_017274	TGGA	2	8	2450330	2450337	25 %	25 %	50 %	0 %	384435010
53510	NC_017274	TA	3	6	2450380	2450385	50 %	50 %	0 %	0 %	384435010
53511	NC_017274	TTG	2	6	2450477	2450482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384435010
53512	NC_017274	TAA	2	6	2450483	2450488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435010
53513	NC_017274	ATT	2	6	2450545	2450550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53514	NC_017274	TA	3	6	2450552	2450557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53515	NC_017274	ATA	2	6	2450621	2450626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53516	NC_017274	GAG	2	6	2450636	2450641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53517	NC_017274	GAC	2	6	2450774	2450779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384435011
53518	NC_017274	AG	3	6	2450795	2450800	50 %	0 %	50 %	0 %	384435011
53519	NC_017274	GAA	2	6	2450843	2450848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435011
53520	NC_017274	ATT	3	9	2450879	2450887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435011
53521	NC_017274	TAA	2	6	2450947	2450952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435011
53522	NC_017274	GGAG	2	8	2451018	2451025	25 %	0 %	75 %	0 %	384435011
53523	NC_017274	TGA	3	9	2451031	2451039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435011
53524	NC_017274	TAG	2	6	2451093	2451098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435011
53525	NC_017274	ACA	2	6	2451113	2451118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435011
53526	NC_017274	TAGA	2	8	2451129	2451136	50 %	25 %	25 %	0 %	384435011
53527	NC_017274	AAT	2	6	2451145	2451150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435011
53528	NC_017274	CAT	2	6	2451164	2451169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435011
53529	NC_017274	TAC	2	6	2451243	2451248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435011
53530	NC_017274	CTT	2	6	2451249	2451254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435011
53531	NC_017274	ATTA	2	8	2451280	2451287	50 %	50 %	0 %	0 %	384435011
53532	NC_017274	TTA	2	6	2451290	2451295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435011
53533	NC_017274	TAA	2	6	2451397	2451402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435011
53534	NC_017274	CTT	2	6	2451427	2451432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435011
53535	NC_017274	TAA	2	6	2451441	2451446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435011
53536	NC_017274	AGA	2	6	2451524	2451529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435011
53537	NC_017274	TGA	2	6	2451637	2451642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435011
53538	NC_017274	TAA	2	6	2451729	2451734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435011
53539	NC_017274	GAG	2	6	2451824	2451829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384435011
53540	NC_017274	ATT	2	6	2451853	2451858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435011
53541	NC_017274	AAT	2	6	2451859	2451864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435011
53542	NC_017274	TAA	2	6	2451915	2451920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435011
53543	NC_017274	AGGA	2	8	2451936	2451943	50 %	0 %	50 %	0 %	384435011
53544	NC_017274	ATT	2	6	2452103	2452108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435011
53545	NC_017274	GGAG	2	8	2452118	2452125	25 %	0 %	75 %	0 %	384435011
53546	NC_017274	TAAT	2	8	2452131	2452138	50 %	50 %	0 %	0 %	384435011
53547	NC_017274	AGAT	2	8	2452140	2452147	50 %	25 %	25 %	0 %	384435011
53548	NC_017274	CT	3	6	2452164	2452169	0 %	50 %	0 %	50 %	384435011
53549	NC_017274	CTC	2	6	2452181	2452186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384435011
53550	NC_017274	TAT	2	6	2452256	2452261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435011
53551	NC_017274	GAT	2	6	2452273	2452278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435011
53552	NC_017274	GA	3	6	2452332	2452337	50 %	0 %	50 %	0 %	384435011
53553	NC_017274	GA	3	6	2452377	2452382	50 %	0 %	50 %	0 %	384435011
53554	NC_017274	GAA	2	6	2452390	2452395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435011
53555	NC_017274	A	6	6	2452394	2452399	100 %	0 %	0 %	0 %	384435011
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53557	NC_017274	AAAT	2	8	2452635	2452642	75 %	25 %	0 %	0 %	384435011
53558	NC_017274	AGCT	2	8	2452665	2452672	25 %	25 %	25 %	25 %	384435011
53559	NC_017274	AAATT	2	10	2452673	2452682	60 %	40 %	0 %	0 %	384435011
53560	NC_017274	CTA	2	6	2452731	2452736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435011
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53564	NC_017274	TAA	2	6	2452847	2452852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435012
53565	NC_017274	AACTA	2	10	2452961	2452970	60 %	20 %	0 %	20 %	384435012
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53571	NC_017274	ATT	2	6	2453235	2453240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384435012
53572	NC_017274	GAA	2	6	2453327	2453332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435012
53573	NC_017274	TGC	2	6	2453408	2453413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384435012
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53576	NC_017274	A	6	6	2453577	2453582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53577	NC_017274	AG	3	6	2453681	2453686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53578	NC_017274	TAA	2	6	2453688	2453693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53579	NC_017274	TGG	2	6	2453702	2453707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53580	NC_017274	TAA	2	6	2453747	2453752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53581	NC_017274	GATA	2	8	2453758	2453765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53582	NC_017274	TTG	2	6	2453768	2453773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53583	NC_017274	CAG	2	6	2453808	2453813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53584	NC_017274	TA	3	6	2453875	2453880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53585	NC_017274	A	6	6	2453889	2453894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53586	NC_017274	GCTA	2	8	2453914	2453921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53587	NC_017274	ATG	2	6	2453952	2453957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53588	NC_017274	TTC	2	6	2453999	2454004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435013
53589	NC_017274	TTC	2	6	2454034	2454039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384435013
53590	NC_017274	AGA	2	6	2454052	2454057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384435013
53591	NC_017274	AGT	2	6	2454091	2454096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435013
53592	NC_017274	AGG	2	6	2454105	2454110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384435013
53593	NC_017274	TAA	2	6	2454116	2454121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435013
53594	NC_017274	ATA	2	6	2454247	2454252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435013
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53596	NC_017274	GGTT	2	8	2454319	2454326	0 %	50 %	50 %	0 %	384435013
53597	NC_017274	TGA	2	6	2454342	2454347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435013
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53599	NC_017274	TAC	2	6	2454466	2454471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435013
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53601	NC_017274	ATA	2	6	2454532	2454537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435014
53602	NC_017274	TAC	2	6	2454540	2454545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435014
53603	NC_017274	ACT	2	6	2454602	2454607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384435014
53604	NC_017274	TAG	2	6	2454629	2454634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435014
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53606	NC_017274	GTA	2	6	2454712	2454717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384435014
53607	NC_017274	ACGGT	2	10	2454740	2454749	20 %	20 %	40 %	20 %	384435014
53608	NC_017274	CAA	2	6	2454769	2454774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384435014
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53610	NC_017274	CATC	2	8	2454820	2454827	25 %	25 %	0 %	50 %	384435014
53611	NC_017274	AAT	2	6	2454891	2454896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384435014
53612	NC_017274	TTATA	2	10	2454930	2454939	40 %	60 %	0 %	0 %	384435014
53613	NC_017274	TC	3	6	2455027	2455032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53614	NC_017274	ATT	2	6	2455072	2455077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53615	NC_017274	ATT	2	6	2455102	2455107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53616	NC_017274	AATG	2	8	2455114	2455121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53617	NC_017274	AT	3	6	2455180	2455185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53618	NC_017274	TAT	2	6	2455202	2455207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53620	NC_017274	TTC	2	6	2455382	2455387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53978	NC_017274	TAA	2	6	2472191	2472196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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