MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 58178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_017274	TCA	2	6	2428361	2428366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384434991
53002	NC_017274	TCA	2	6	2428376	2428381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384434991
53003	NC_017274	ATA	2	6	2428400	2428405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53004	NC_017274	TA	3	6	2428404	2428409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53005	NC_017274	CATAAT	2	12	2428412	2428423	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53006	NC_017274	TGT	2	6	2428493	2428498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53007	NC_017274	CAC	2	6	2428511	2428516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53008	NC_017274	TCT	2	6	2428528	2428533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53009	NC_017274	TATGA	2	10	2428534	2428543	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53010	NC_017274	A	6	6	2428545	2428550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53011	NC_017274	TAC	2	6	2428582	2428587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53012	NC_017274	TAA	2	6	2428635	2428640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53013	NC_017274	ATA	2	6	2428655	2428660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53014	NC_017274	AAG	2	6	2428762	2428767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384434992
53015	NC_017274	CTC	2	6	2428789	2428794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384434992
53016	NC_017274	TCC	2	6	2428799	2428804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384434992
53017	NC_017274	GGAG	2	8	2428842	2428849	25 %	0 %	75 %	0 %	384434992
53018	NC_017274	CTT	2	6	2428878	2428883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384434992
53019	NC_017274	CCA	2	6	2428897	2428902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384434992
53020	NC_017274	CAA	2	6	2428936	2428941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384434992
53021	NC_017274	AAC	2	6	2428971	2428976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384434992
53022	NC_017274	GATG	2	8	2428980	2428987	25 %	25 %	50 %	0 %	384434992
53023	NC_017274	GA	3	6	2429055	2429060	50 %	0 %	50 %	0 %	384434992
53024	NC_017274	A	6	6	2429060	2429065	100 %	0 %	0 %	0 %	384434992
53025	NC_017274	TTC	2	6	2429100	2429105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53026	NC_017274	TAC	2	6	2429210	2429215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384434993
53027	NC_017274	AGG	2	6	2429319	2429324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384434993
53028	NC_017274	GTTAA	2	10	2429394	2429403	40 %	40 %	20 %	0 %	384434993
53029	NC_017274	AGGA	2	8	2429427	2429434	50 %	0 %	50 %	0 %	384434993
53030	NC_017274	GTG	2	6	2429482	2429487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384434993
53031	NC_017274	TTC	2	6	2429547	2429552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384434993
53032	NC_017274	CGA	2	6	2429584	2429589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384434993
53033	NC_017274	TTAA	2	8	2429611	2429618	50 %	50 %	0 %	0 %	384434993
53034	NC_017274	TTG	2	6	2429641	2429646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53035	NC_017274	TTA	2	6	2429694	2429699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53036	NC_017274	ATATT	2	10	2429704	2429713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53037	NC_017274	T	6	6	2429715	2429720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53038	NC_017274	GAA	2	6	2429736	2429741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53039	NC_017274	TGT	2	6	2429757	2429762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53040	NC_017274	AAGA	2	8	2429848	2429855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53041	NC_017274	CAA	2	6	2429886	2429891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53042	NC_017274	TTA	2	6	2429929	2429934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53043	NC_017274	GAG	2	6	2429943	2429948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53044	NC_017274	GAAG	2	8	2429950	2429957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53045	NC_017274	ATT	2	6	2430095	2430100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53046	NC_017274	TA	3	6	2430101	2430106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53047	NC_017274	AT	3	6	2430124	2430129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53048	NC_017274	AT	3	6	2430136	2430141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53049	NC_017274	TA	3	6	2430151	2430156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53050	NC_017274	ATT	2	6	2430218	2430223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53051	NC_017274	TTA	2	6	2430292	2430297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53052	NC_017274	TA	3	6	2430296	2430301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53053	NC_017274	TGAT	2	8	2430312	2430319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53054	NC_017274	A	6	6	2430362	2430367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53055	NC_017274	TCC	2	6	2430403	2430408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384434994
53056	NC_017274	T	6	6	2430419	2430424	0 %	100 %	0 %	0 %	384434994
53057	NC_017274	AAC	2	6	2430515	2430520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384434994
53058	NC_017274	GAG	2	6	2430521	2430526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384434994
53059	NC_017274	GA	3	6	2430528	2430533	50 %	0 %	50 %	0 %	384434994
53060	NC_017274	AAG	2	6	2430573	2430578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384434994
53061	NC_017274	ACCC	2	8	2430580	2430587	25 %	0 %	0 %	75 %	384434994
53062	NC_017274	GAA	2	6	2430689	2430694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384434994
53063	NC_017274	CCT	2	6	2430698	2430703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384434994
53064	NC_017274	CGA	2	6	2430814	2430819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384434994
53065	NC_017274	CG	3	6	2430822	2430827	0 %	0 %	50 %	50 %	384434994
53066	NC_017274	GAGG	2	8	2430920	2430927	25 %	0 %	75 %	0 %	384434994
53067	NC_017274	ATCT	2	8	2430947	2430954	25 %	50 %	0 %	25 %	384434994
53068	NC_017274	CCT	2	6	2430970	2430975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384434994
53069	NC_017274	CTC	2	6	2430992	2430997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384434994
53070	NC_017274	GTT	2	6	2431046	2431051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384434994
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53072	NC_017274	GTC	2	6	2431184	2431189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384434994
53073	NC_017274	GAT	2	6	2431207	2431212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384434994
53074	NC_017274	CTT	2	6	2431223	2431228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384434994
53075	NC_017274	CCT	2	6	2431300	2431305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384434994
53076	NC_017274	TTC	2	6	2431324	2431329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384434994
53077	NC_017274	TCCT	2	8	2431365	2431372	0 %	50 %	0 %	50 %	384434994
53078	NC_017274	CTC	2	6	2431430	2431435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384434994
53079	NC_017274	ATG	2	6	2431601	2431606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53080	NC_017274	AAT	2	6	2431620	2431625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53081	NC_017274	ATG	2	6	2431669	2431674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53082	NC_017274	AGT	2	6	2431744	2431749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53083	NC_017274	GAT	2	6	2431759	2431764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53084	NC_017274	ATT	2	6	2431841	2431846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53085	NC_017274	AGAA	2	8	2431875	2431882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53086	NC_017274	ATT	2	6	2431885	2431890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53087	NC_017274	CCA	2	6	2431924	2431929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53088	NC_017274	TGA	2	6	2431938	2431943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53089	NC_017274	TTTC	2	8	2431953	2431960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53090	NC_017274	ATC	2	6	2431994	2431999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53091	NC_017274	TCT	2	6	2432061	2432066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53092	NC_017274	AGA	2	6	2432085	2432090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53093	NC_017274	AGG	2	6	2432185	2432190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53094	NC_017274	AAAGG	2	10	2432296	2432305	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53095	NC_017274	TAA	2	6	2432385	2432390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53096	NC_017274	AGA	2	6	2432397	2432402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53097	NC_017274	AGT	2	6	2432404	2432409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53098	NC_017274	T	6	6	2432557	2432562	0 %	100 %	0 %	0 %	384434995
53099	NC_017274	ATA	2	6	2432596	2432601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384434995
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53101	NC_017274	TTA	2	6	2432694	2432699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384434995
53102	NC_017274	TTC	2	6	2432701	2432706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384434995
53103	NC_017274	TA	3	6	2432711	2432716	50 %	50 %	0 %	0 %	384434995
53104	NC_017274	AGC	2	6	2432764	2432769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384434995
53105	NC_017274	TAT	2	6	2432799	2432804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384434995
53106	NC_017274	TATG	2	8	2432830	2432837	25 %	50 %	25 %	0 %	384434995
53107	NC_017274	TTAG	2	8	2432852	2432859	25 %	50 %	25 %	0 %	384434995
53108	NC_017274	AT	4	8	2432867	2432874	50 %	50 %	0 %	0 %	384434995
53109	NC_017274	TA	3	6	2432909	2432914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53110	NC_017274	AG	5	10	2432924	2432933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53111	NC_017274	TAT	2	6	2432962	2432967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53112	NC_017274	TAA	2	6	2432970	2432975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53113	NC_017274	GGA	2	6	2433108	2433113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53114	NC_017274	AGG	2	6	2433137	2433142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53115	NC_017274	CGT	2	6	2433222	2433227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53116	NC_017274	TCC	2	6	2433252	2433257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53117	NC_017274	GAA	2	6	2433292	2433297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53118	NC_017274	GGA	3	9	2433346	2433354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53119	NC_017274	AAG	2	6	2433470	2433475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53120	NC_017274	GGATGT	2	12	2433493	2433504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53121	NC_017274	AGGA	2	8	2433578	2433585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53122	NC_017274	ATT	2	6	2433596	2433601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53123	NC_017274	GAG	2	6	2433613	2433618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53124	NC_017274	ATG	2	6	2433633	2433638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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53358	NC_017274	TAT	2	6	2442956	2442961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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