MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta africana DSM 8902 chromosome

Total Repeats: 69899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017098	TCAGT	2	10	24	33	20 %	40 %	20 %	20 %	383789244
2	NC_017098	CTG	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
3	NC_017098	TGC	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
4	NC_017098	GCGCA	2	10	250	259	20 %	0 %	40 %	40 %	383789244
5	NC_017098	CAG	2	6	286	291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789244
6	NC_017098	AAC	3	9	415	423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789244
7	NC_017098	TGC	2	6	426	431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
8	NC_017098	ATC	2	6	571	576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789244
9	NC_017098	GAG	2	6	589	594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789244
10	NC_017098	CTG	2	6	673	678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
11	NC_017098	GAT	2	6	682	687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789244
12	NC_017098	GAA	2	6	721	726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789244
13	NC_017098	CCGG	2	8	786	793	0 %	0 %	50 %	50 %	383789244
14	NC_017098	AAG	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789244
15	NC_017098	ATCTG	2	10	947	956	20 %	40 %	20 %	20 %	383789244
16	NC_017098	ACC	2	6	967	972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789244
17	NC_017098	CAG	2	6	1060	1065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789244
18	NC_017098	AGCG	2	8	1121	1128	25 %	0 %	50 %	25 %	383789244
19	NC_017098	ACT	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789244
20	NC_017098	A	7	7	1170	1176	100 %	0 %	0 %	0 %	383789244
21	NC_017098	CTG	2	6	1181	1186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789244
22	NC_017098	CCA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789244
23	NC_017098	G	6	6	1270	1275	0 %	0 %	100 %	0 %	383789244
24	NC_017098	CAC	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789244
25	NC_017098	AGA	2	6	1307	1312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789244
26	NC_017098	ACCCG	2	10	1448	1457	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_017098	A	6	6	1508	1513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017098	TGC	2	6	1515	1520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017098	CAC	2	6	1526	1531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_017098	TA	3	6	1536	1541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017098	CTA	5	15	1573	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017098	TA	3	6	1596	1601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017098	AGA	2	6	1615	1620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017098	CAC	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789245
35	NC_017098	AAG	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789245
36	NC_017098	TCA	2	6	1696	1701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789245
37	NC_017098	TGC	3	9	1730	1738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789245
38	NC_017098	AAC	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789245
39	NC_017098	TGC	2	6	1812	1817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789245
40	NC_017098	CTA	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789245
41	NC_017098	TTC	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789245
42	NC_017098	GCCG	2	8	1875	1882	0 %	0 %	50 %	50 %	383789245
43	NC_017098	GAT	2	6	2005	2010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
44	NC_017098	ACT	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789245
45	NC_017098	GAT	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
46	NC_017098	GAT	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
47	NC_017098	CAG	2	6	2185	2190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789245
48	NC_017098	GCG	2	6	2261	2266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789245
49	NC_017098	GAG	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789245
50	NC_017098	CTG	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789245
51	NC_017098	TTG	2	6	2603	2608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789245
52	NC_017098	TGA	2	6	2734	2739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789245
53	NC_017098	TG	3	6	2814	2819	0 %	50 %	50 %	0 %	383789246
54	NC_017098	TTG	2	6	2822	2827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789246
55	NC_017098	CTG	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
56	NC_017098	TCA	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789246
57	NC_017098	GCA	2	6	2930	2935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789246
58	NC_017098	ATG	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789246
59	NC_017098	T	6	6	3139	3144	0 %	100 %	0 %	0 %	383789246
60	NC_017098	CTG	2	6	3250	3255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
61	NC_017098	ATC	2	6	3292	3297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789246
62	NC_017098	GCA	2	6	3321	3326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789246
63	NC_017098	CAG	2	6	3343	3348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789246
64	NC_017098	ACT	2	6	3481	3486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789246
65	NC_017098	GGAT	2	8	3530	3537	25 %	25 %	50 %	0 %	383789246
66	NC_017098	TGG	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789246
67	NC_017098	TGC	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
68	NC_017098	GAT	2	6	3649	3654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789246
69	NC_017098	CTG	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789246
70	NC_017098	GCG	2	6	3678	3683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789246
71	NC_017098	GAG	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789246
72	NC_017098	CTG	2	6	3851	3856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789247
73	NC_017098	GCA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
74	NC_017098	TGA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789247
75	NC_017098	TGG	3	9	3972	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789247
76	NC_017098	ATC	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789247
77	NC_017098	GCA	2	6	3997	4002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
78	NC_017098	GAA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789247
79	NC_017098	AGC	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
80	NC_017098	AGC	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789247
81	NC_017098	CCA	2	6	4353	4358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_017098	GCAG	2	8	4385	4392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017098	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017098	GTC	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789248
85	NC_017098	CGT	2	6	4539	4544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789248
86	NC_017098	GAA	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789248
87	NC_017098	CTGT	2	8	4563	4570	0 %	50 %	25 %	25 %	383789248
88	NC_017098	AAG	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789248
89	NC_017098	TATT	2	8	4676	4683	25 %	75 %	0 %	0 %	383789249
90	NC_017098	AC	3	6	4703	4708	50 %	0 %	0 %	50 %	383789249
91	NC_017098	GTA	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789249
92	NC_017098	ATT	2	6	4989	4994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789250
93	NC_017098	TTC	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789250
94	NC_017098	C	6	6	5027	5032	0 %	0 %	0 %	100 %	383789250
95	NC_017098	ATC	2	6	5083	5088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789250
96	NC_017098	ACAGG	2	10	5097	5106	40 %	0 %	40 %	20 %	383789250
97	NC_017098	CCGCA	2	10	5113	5122	20 %	0 %	20 %	60 %	383789250
98	NC_017098	TGC	2	6	5215	5220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
99	NC_017098	GCT	2	6	5264	5269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
100	NC_017098	CG	3	6	5325	5330	0 %	0 %	50 %	50 %	383789250
101	NC_017098	TGG	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789250
102	NC_017098	T	6	6	5382	5387	0 %	100 %	0 %	0 %	383789250
103	NC_017098	CGC	2	6	5388	5393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789250
104	NC_017098	CA	3	6	5409	5414	50 %	0 %	0 %	50 %	383789250
105	NC_017098	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789250
106	NC_017098	CGC	2	6	5812	5817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789250
107	NC_017098	GCC	2	6	5849	5854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789250
108	NC_017098	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
109	NC_017098	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
110	NC_017098	GAG	2	6	5976	5981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789250
111	NC_017098	GGT	2	6	6004	6009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789250
112	NC_017098	CTG	2	6	6030	6035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
113	NC_017098	GTG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789250
114	NC_017098	GCT	3	9	6101	6109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
115	NC_017098	GAT	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789250
116	NC_017098	AAG	2	6	6240	6245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789250
117	NC_017098	GGC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789250
118	NC_017098	TGC	3	9	6280	6288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
119	NC_017098	GCT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
120	NC_017098	AAC	2	6	6324	6329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789250
121	NC_017098	TC	3	6	6377	6382	0 %	50 %	0 %	50 %	383789250
122	NC_017098	TCT	2	6	6397	6402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789250
123	NC_017098	ATT	2	6	6412	6417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789250
124	NC_017098	CTG	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
125	NC_017098	GCT	2	6	6482	6487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
126	NC_017098	TCAG	2	8	6499	6506	25 %	25 %	25 %	25 %	383789250
127	NC_017098	GCA	3	9	6514	6522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
128	NC_017098	CAC	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789250
129	NC_017098	TTC	3	9	6564	6572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789250
130	NC_017098	CTG	2	6	6597	6602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789250
131	NC_017098	ATT	2	6	6612	6617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789250
132	NC_017098	GTCG	2	8	6629	6636	0 %	25 %	50 %	25 %	383789250
133	NC_017098	GCA	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
134	NC_017098	TAC	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789250
135	NC_017098	GCA	2	6	6677	6682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789250
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137	NC_017098	GCA	2	6	6797	6802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789251
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149	NC_017098	CTGG	2	8	7238	7245	0 %	25 %	50 %	25 %	383789251
150	NC_017098	GGT	2	6	7258	7263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789251
151	NC_017098	GTC	2	6	7287	7292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789251
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161	NC_017098	GAG	2	6	7758	7763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017098	TA	3	6	7837	7842	50 %	50 %	0 %	0 %	383789252
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165	NC_017098	CGGTA	2	10	7989	7998	20 %	20 %	40 %	20 %	383789252
166	NC_017098	TGAA	2	8	8006	8013	50 %	25 %	25 %	0 %	383789252
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232	NC_017098	TGCAGA	2	12	11715	11726	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383789255
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247	NC_017098	TCCA	2	8	12446	12453	25 %	25 %	0 %	50 %	383789255
248	NC_017098	GAG	2	6	12463	12468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789255
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250	NC_017098	ACA	2	6	12548	12553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789255
251	NC_017098	TTC	2	6	12568	12573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789255
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254	NC_017098	TGAAC	2	10	12687	12696	40 %	20 %	20 %	20 %	383789255
255	NC_017098	AGC	3	9	12731	12739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789255
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258	NC_017098	TGC	2	6	12803	12808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789255
259	NC_017098	AAC	2	6	12819	12824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789255
260	NC_017098	ATG	2	6	12838	12843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789255
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262	NC_017098	ATT	2	6	12890	12895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789255
263	NC_017098	GC	3	6	12900	12905	0 %	0 %	50 %	50 %	383789255
264	NC_017098	TAC	2	6	12949	12954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789255
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266	NC_017098	TCAG	2	8	13091	13098	25 %	25 %	25 %	25 %	383789255
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269	NC_017098	GGT	2	6	13248	13253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789255
270	NC_017098	G	7	7	13302	13308	0 %	0 %	100 %	0 %	383789255
271	NC_017098	CTG	2	6	13399	13404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789255
272	NC_017098	ATC	2	6	13424	13429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789255
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275	NC_017098	ACA	2	6	13562	13567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789255
276	NC_017098	CTG	2	6	13573	13578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789255
277	NC_017098	TGCA	2	8	13598	13605	25 %	25 %	25 %	25 %	383789255
278	NC_017098	CGGCA	2	10	13615	13624	20 %	0 %	40 %	40 %	383789255
279	NC_017098	CTG	2	6	13718	13723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789255
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283	NC_017098	T	6	6	13923	13928	0 %	100 %	0 %	0 %	383789255
284	NC_017098	TGC	2	6	14041	14046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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351	NC_017098	CCACC	2	10	16217	16226	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
352	NC_017098	GCC	2	6	16234	16239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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383	NC_017098	GGA	2	6	17816	17821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_017098	AT	3	6	18120	18125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_017098	TC	3	6	18213	18218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
390	NC_017098	AAC	2	6	18244	18249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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392	NC_017098	TCC	2	6	18358	18363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789259
393	NC_017098	CTT	2	6	18408	18413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789259
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494	NC_017098	AAC	2	6	23137	23142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
495	NC_017098	ATA	2	6	23241	23246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_017098	CTC	2	6	23478	23483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
499	NC_017098	CAG	2	6	23505	23510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_017098	ATTCTG	2	12	23691	23702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

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