MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta africana DSM 8902 chromosome

Total Repeats: 69899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017098	GCT	2	6	228856	228861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789429
5002	NC_017098	GCT	3	9	228883	228891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789429
5003	NC_017098	GGT	2	6	228892	228897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789429
5004	NC_017098	CTG	2	6	228935	228940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789429
5005	NC_017098	GAC	2	6	229036	229041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789429
5006	NC_017098	CAG	2	6	229112	229117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789429
5007	NC_017098	GATC	2	8	229195	229202	25 %	25 %	25 %	25 %	383789429
5008	NC_017098	TGA	2	6	229224	229229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789429
5009	NC_017098	TG	4	8	229233	229240	0 %	50 %	50 %	0 %	383789429
5010	NC_017098	TGA	2	6	229278	229283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789429
5011	NC_017098	GCG	2	6	229346	229351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789429
5012	NC_017098	CAT	2	6	229354	229359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789429
5013	NC_017098	GCT	2	6	229372	229377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789429
5014	NC_017098	CGG	2	6	229543	229548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789429
5015	NC_017098	GCGCT	2	10	229616	229625	0 %	20 %	40 %	40 %	383789429
5016	NC_017098	ACG	2	6	229813	229818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789430
5017	NC_017098	GAT	2	6	229820	229825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789430
5018	NC_017098	CGC	2	6	229881	229886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789430
5019	NC_017098	GCT	2	6	229934	229939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789430
5020	NC_017098	GGC	2	6	229958	229963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789430
5021	NC_017098	TGAGCT	2	12	229982	229993	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383789430
5022	NC_017098	CGGG	2	8	230000	230007	0 %	0 %	75 %	25 %	383789430
5023	NC_017098	AT	3	6	230009	230014	50 %	50 %	0 %	0 %	383789430
5024	NC_017098	GCGG	2	8	230023	230030	0 %	0 %	75 %	25 %	383789430
5025	NC_017098	GACC	2	8	230060	230067	25 %	0 %	25 %	50 %	383789430
5026	NC_017098	CTG	2	6	230175	230180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789430
5027	NC_017098	ACC	2	6	230241	230246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789430
5028	NC_017098	G	7	7	230258	230264	0 %	0 %	100 %	0 %	383789430
5029	NC_017098	TACCG	2	10	230268	230277	20 %	20 %	20 %	40 %	383789430
5030	NC_017098	CCG	2	6	230326	230331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789430
5031	NC_017098	GCT	2	6	230333	230338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789430
5032	NC_017098	GCTCG	2	10	230386	230395	0 %	20 %	40 %	40 %	383789430
5033	NC_017098	AGC	2	6	230413	230418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789430
5034	NC_017098	GCA	2	6	230432	230437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789430
5035	NC_017098	GTTG	2	8	230663	230670	0 %	50 %	50 %	0 %	383789430
5036	NC_017098	CTG	2	6	230691	230696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789430
5037	NC_017098	GGTGT	2	10	230709	230718	0 %	40 %	60 %	0 %	383789430
5038	NC_017098	GCA	2	6	230868	230873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789430
5039	NC_017098	ACG	2	6	230897	230902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789430
5040	NC_017098	CGG	2	6	230979	230984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017098	GCG	2	6	231109	231114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789431
5042	NC_017098	GCG	2	6	231130	231135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789431
5043	NC_017098	GCT	2	6	231177	231182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789431
5044	NC_017098	TA	3	6	231290	231295	50 %	50 %	0 %	0 %	383789431
5045	NC_017098	TAT	2	6	231307	231312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383789431
5046	NC_017098	ATTT	2	8	231347	231354	25 %	75 %	0 %	0 %	383789431
5047	NC_017098	TTTC	2	8	231360	231367	0 %	75 %	0 %	25 %	383789431
5048	NC_017098	ACC	2	6	231382	231387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789431
5049	NC_017098	CGCA	2	8	231411	231418	25 %	0 %	25 %	50 %	383789431
5050	NC_017098	CAA	2	6	231423	231428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383789431
5051	NC_017098	GGA	2	6	231666	231671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789431
5052	NC_017098	GCA	2	6	231726	231731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789431
5053	NC_017098	GCA	2	6	231744	231749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789431
5054	NC_017098	GTT	2	6	231834	231839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789431
5055	NC_017098	GA	3	6	231848	231853	50 %	0 %	50 %	0 %	383789431
5056	NC_017098	TA	3	6	231854	231859	50 %	50 %	0 %	0 %	383789431
5057	NC_017098	TGG	2	6	231875	231880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789431
5058	NC_017098	CTG	2	6	231943	231948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789431
5059	NC_017098	GAG	2	6	231970	231975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789431
5060	NC_017098	AGG	2	6	232013	232018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789431
5061	NC_017098	CAG	2	6	232023	232028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789431
5062	NC_017098	CTA	2	6	232221	232226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789431
5063	NC_017098	GTT	2	6	232353	232358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789431
5064	NC_017098	AGA	2	6	232394	232399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383789431
5065	NC_017098	GGT	2	6	232431	232436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789431
5066	NC_017098	GATT	2	8	232541	232548	25 %	50 %	25 %	0 %	383789431
5067	NC_017098	CAG	2	6	232579	232584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789431
5068	NC_017098	GCG	2	6	232593	232598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789431
5069	NC_017098	TGC	2	6	232731	232736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789431
5070	NC_017098	ATGC	2	8	232773	232780	25 %	25 %	25 %	25 %	383789431
5071	NC_017098	TGC	2	6	232803	232808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789431
5072	NC_017098	CGC	2	6	232846	232851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789431
5073	NC_017098	ATAA	2	8	232928	232935	75 %	25 %	0 %	0 %	383789431
5074	NC_017098	AT	3	6	232991	232996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017098	TGC	2	6	233030	233035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5076	NC_017098	CGC	2	6	233056	233061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789432
5077	NC_017098	CAG	2	6	233168	233173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5078	NC_017098	CAG	2	6	233210	233215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5079	NC_017098	GCT	2	6	233216	233221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5080	NC_017098	TTG	2	6	233244	233249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789432
5081	NC_017098	CCA	2	6	233293	233298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789432
5082	NC_017098	CTGG	2	8	233318	233325	0 %	25 %	50 %	25 %	383789432
5083	NC_017098	GCA	2	6	233410	233415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5084	NC_017098	GCT	2	6	233533	233538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5085	NC_017098	CAG	2	6	233639	233644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5086	NC_017098	GGC	2	6	233645	233650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789432
5087	NC_017098	TGC	2	6	233675	233680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5088	NC_017098	CAG	2	6	233744	233749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5089	NC_017098	ACC	2	6	233783	233788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383789432
5090	NC_017098	TCG	2	6	233823	233828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5091	NC_017098	GGC	2	6	233831	233836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789432
5092	NC_017098	GTG	2	6	233952	233957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789432
5093	NC_017098	GGT	2	6	233984	233989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789432
5094	NC_017098	CGT	2	6	234022	234027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5095	NC_017098	GC	3	6	234054	234059	0 %	0 %	50 %	50 %	383789432
5096	NC_017098	CCG	2	6	234069	234074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789432
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5100	NC_017098	GCT	2	6	234265	234270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789432
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5103	NC_017098	CGC	2	6	234382	234387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789432
5104	NC_017098	CTG	2	6	234419	234424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5105	NC_017098	GCT	2	6	234433	234438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789432
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5107	NC_017098	GGC	2	6	234473	234478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789432
5108	NC_017098	GGC	2	6	234518	234523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789432
5109	NC_017098	GCA	2	6	234594	234599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789432
5110	NC_017098	TCT	2	6	234639	234644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789432
5111	NC_017098	TTG	2	6	234736	234741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789433
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5114	NC_017098	CGC	2	6	235130	235135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789433
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5117	NC_017098	CGC	2	6	235376	235381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789433
5118	NC_017098	TTC	2	6	235426	235431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789433
5119	NC_017098	TGT	2	6	235454	235459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789433
5120	NC_017098	GCT	2	6	235460	235465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789433
5121	NC_017098	AAT	2	6	235521	235526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383789433
5122	NC_017098	G	6	6	235535	235540	0 %	0 %	100 %	0 %	383789433
5123	NC_017098	GGC	2	6	235647	235652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789433
5124	NC_017098	GC	3	6	235711	235716	0 %	0 %	50 %	50 %	383789433
5125	NC_017098	GAT	2	6	235851	235856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789433
5126	NC_017098	GAT	3	9	235890	235898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789433
5127	NC_017098	TCT	2	6	235934	235939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383789433
5128	NC_017098	TTGA	2	8	235952	235959	25 %	50 %	25 %	0 %	383789433
5129	NC_017098	AGTG	2	8	236050	236057	25 %	25 %	50 %	0 %	383789434
5130	NC_017098	GCG	2	6	236058	236063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789434
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5132	NC_017098	CAG	2	6	236098	236103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789434
5133	NC_017098	TGC	2	6	236145	236150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789434
5134	NC_017098	CAG	2	6	236182	236187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789434
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5140	NC_017098	CGGT	2	8	236396	236403	0 %	25 %	50 %	25 %	383789434
5141	NC_017098	CCG	2	6	236429	236434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789434
5142	NC_017098	GAT	2	6	236455	236460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789434
5143	NC_017098	GTC	2	6	236496	236501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789434
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5153	NC_017098	GCG	2	6	236724	236729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789434
5154	NC_017098	GCT	2	6	236752	236757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789434
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5198	NC_017098	CGT	2	6	239218	239223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789437
5199	NC_017098	ATG	2	6	239369	239374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789437
5200	NC_017098	CGG	2	6	239388	239393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789437
5201	NC_017098	TCG	2	6	239397	239402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789437
5202	NC_017098	GGGCA	2	10	239405	239414	20 %	0 %	60 %	20 %	383789437
5203	NC_017098	CAG	2	6	239522	239527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789437
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5208	NC_017098	TCT	2	6	239680	239685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5224	NC_017098	GACCCT	2	12	240299	240310	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383789438
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5226	NC_017098	AGC	2	6	240457	240462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789438
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5228	NC_017098	GTGC	2	8	240507	240514	0 %	25 %	50 %	25 %	383789438
5229	NC_017098	CA	3	6	240562	240567	50 %	0 %	0 %	50 %	383789438
5230	NC_017098	GGT	2	6	240647	240652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789438
5231	NC_017098	CGT	2	6	240774	240779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789438
5232	NC_017098	GGA	2	6	240872	240877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789438
5233	NC_017098	CAGCG	2	10	240879	240888	20 %	0 %	40 %	40 %	383789438
5234	NC_017098	GCA	2	6	240893	240898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789438
5235	NC_017098	CAG	2	6	240929	240934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789438
5236	NC_017098	GGT	2	6	240944	240949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383789438
5237	NC_017098	ATG	2	6	241137	241142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789439
5238	NC_017098	GGC	2	6	241161	241166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789439
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5240	NC_017098	CGC	2	6	241277	241282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789439
5241	NC_017098	CTC	2	6	241311	241316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383789439
5242	NC_017098	TC	3	6	241440	241445	0 %	50 %	0 %	50 %	383789439
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5343	NC_017098	GCT	2	6	245842	245847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5344	NC_017098	CTG	2	6	245852	245857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5346	NC_017098	GAT	2	6	245920	245925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5355	NC_017098	T	6	6	246389	246394	0 %	100 %	0 %	0 %	383789444
5356	NC_017098	GGA	2	6	246400	246405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383789444
5357	NC_017098	GCA	2	6	246419	246424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789444
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5359	NC_017098	CCGCAG	2	12	246492	246503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383789444
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5361	NC_017098	CAG	2	6	246635	246640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789444
5362	NC_017098	ATG	2	6	246648	246653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789444
5363	NC_017098	CAT	2	6	246665	246670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789444
5364	NC_017098	CAT	2	6	246679	246684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383789444
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5367	NC_017098	GAC	2	6	246902	246907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383789444
5368	NC_017098	TCGA	2	8	246917	246924	25 %	25 %	25 %	25 %	383789444
5369	NC_017098	TCCT	2	8	246959	246966	0 %	50 %	0 %	50 %	383789444
5370	NC_017098	TAG	2	6	246996	247001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383789444
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5389	NC_017098	CTG	2	6	248089	248094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789445
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5482	NC_017098	GTT	2	6	252693	252698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383789447
5483	NC_017098	TC	3	6	252704	252709	0 %	50 %	0 %	50 %	383789447
5484	NC_017098	CCGG	2	8	252714	252721	0 %	0 %	50 %	50 %	383789447
5485	NC_017098	ATCT	2	8	252753	252760	25 %	50 %	0 %	25 %	383789447
5486	NC_017098	CGG	2	6	252827	252832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789447
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5490	NC_017098	CGG	2	6	252995	253000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383789447
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5494	NC_017098	GCC	2	6	253132	253137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383789447
5495	NC_017098	CTG	2	6	253185	253190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383789447
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