MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 5826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017078	CGT	2	6	147373	147378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760840
3002	NC_017078	AGG	2	6	147386	147391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760840
3003	NC_017078	TCT	2	6	147423	147428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760840
3004	NC_017078	GGC	2	6	147460	147465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760840
3005	NC_017078	TCAC	2	8	147475	147482	25 %	25 %	0 %	50 %	383760840
3006	NC_017078	ATT	2	6	147549	147554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760840
3007	NC_017078	CGC	2	6	147613	147618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760840
3008	NC_017078	GCT	2	6	147655	147660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760840
3009	NC_017078	GCT	3	9	147758	147766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760841
3010	NC_017078	CTG	2	6	147774	147779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760841
3011	NC_017078	GGTAT	2	10	147783	147792	20 %	40 %	40 %	0 %	383760841
3012	NC_017078	TCCT	2	8	147795	147802	0 %	50 %	0 %	50 %	383760841
3013	NC_017078	GGC	3	9	147863	147871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760841
3014	NC_017078	CAT	2	6	147963	147968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760841
3015	NC_017078	ATG	2	6	147975	147980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760841
3016	NC_017078	GGT	2	6	148047	148052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760841
3017	NC_017078	CAG	2	6	148071	148076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760841
3018	NC_017078	T	6	6	148085	148090	0 %	100 %	0 %	0 %	383760841
3019	NC_017078	A	7	7	148171	148177	100 %	0 %	0 %	0 %	383760841
3020	NC_017078	TCA	2	6	148180	148185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760841
3021	NC_017078	CAG	2	6	148198	148203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760841
3022	NC_017078	GTA	2	6	148248	148253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760841
3023	NC_017078	CAG	2	6	148291	148296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760841
3024	NC_017078	AT	3	6	148363	148368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017078	GTG	2	6	148493	148498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017078	A	6	6	148508	148513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017078	AT	3	6	148542	148547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017078	GAA	2	6	148559	148564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017078	GAA	2	6	148709	148714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017078	CTGCCC	2	12	148720	148731	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_017078	CTG	2	6	148778	148783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_017078	TATAA	2	10	148868	148877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_017078	AGG	2	6	148895	148900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017078	TGGT	2	8	148943	148950	0 %	50 %	50 %	0 %	383760842
3035	NC_017078	CAC	2	6	148953	148958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760842
3036	NC_017078	G	6	6	149016	149021	0 %	0 %	100 %	0 %	383760842
3037	NC_017078	GTA	2	6	149086	149091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760842
3038	NC_017078	TATG	2	8	149163	149170	25 %	50 %	25 %	0 %	383760842
3039	NC_017078	AAAG	2	8	149226	149233	75 %	0 %	25 %	0 %	383760842
3040	NC_017078	CAA	2	6	149250	149255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760842
3041	NC_017078	CAA	2	6	149259	149264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760842
3042	NC_017078	AGT	2	6	149280	149285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760842
3043	NC_017078	GTT	2	6	149325	149330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760842
3044	NC_017078	GAGCA	2	10	149383	149392	40 %	0 %	40 %	20 %	383760842
3045	NC_017078	ATC	2	6	149425	149430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760842
3046	NC_017078	AG	3	6	149508	149513	50 %	0 %	50 %	0 %	383760842
3047	NC_017078	CTA	2	6	149535	149540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760842
3048	NC_017078	CGAA	2	8	149610	149617	50 %	0 %	25 %	25 %	383760843
3049	NC_017078	AGCGT	2	10	149658	149667	20 %	20 %	40 %	20 %	383760843
3050	NC_017078	CAA	2	6	149695	149700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760843
3051	NC_017078	AAC	2	6	149713	149718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760843
3052	NC_017078	CGG	2	6	149928	149933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760843
3053	NC_017078	AT	3	6	149979	149984	50 %	50 %	0 %	0 %	383760843
3054	NC_017078	CAG	2	6	150029	150034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760843
3055	NC_017078	GAA	2	6	150035	150040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760843
3056	NC_017078	AAG	2	6	150160	150165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760843
3057	NC_017078	AAG	2	6	150173	150178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760843
3058	NC_017078	CAA	2	6	150343	150348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760843
3059	NC_017078	TCA	2	6	150355	150360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760843
3060	NC_017078	ACA	2	6	150362	150367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760843
3061	NC_017078	GGA	2	6	150406	150411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760843
3062	NC_017078	ATG	2	6	150428	150433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760843
3063	NC_017078	CAAAA	2	10	150462	150471	80 %	0 %	0 %	20 %	383760843
3064	NC_017078	GCT	2	6	150662	150667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760843
3065	NC_017078	CTA	2	6	150738	150743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017078	TTC	2	6	150789	150794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_017078	CAC	2	6	150844	150849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_017078	GAAG	2	8	150945	150952	50 %	0 %	50 %	0 %	383760844
3069	NC_017078	TTG	2	6	150991	150996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760844
3070	NC_017078	TAT	2	6	151004	151009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760844
3071	NC_017078	CTG	2	6	151015	151020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760844
3072	NC_017078	GCT	2	6	151024	151029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760844
3073	NC_017078	CTC	2	6	151049	151054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760844
3074	NC_017078	GAA	2	6	151180	151185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760844
3075	NC_017078	AGC	2	6	151214	151219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760844
3076	NC_017078	GGC	2	6	151233	151238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760844
3077	NC_017078	TCA	2	6	151271	151276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760844
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3079	NC_017078	AAGG	2	8	151312	151319	50 %	0 %	50 %	0 %	383760844
3080	NC_017078	GCC	2	6	151337	151342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760844
3081	NC_017078	AAG	2	6	151501	151506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760844
3082	NC_017078	GCC	2	6	151562	151567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760844
3083	NC_017078	GGA	2	6	151704	151709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760844
3084	NC_017078	AT	3	6	151718	151723	50 %	50 %	0 %	0 %	383760844
3085	NC_017078	A	7	7	151889	151895	100 %	0 %	0 %	0 %	383760844
3086	NC_017078	T	7	7	151930	151936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017078	TGG	2	6	151959	151964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760845
3088	NC_017078	GAT	2	6	152014	152019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760845
3089	NC_017078	TGC	2	6	152127	152132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760845
3090	NC_017078	GGGC	2	8	152227	152234	0 %	0 %	75 %	25 %	383760845
3091	NC_017078	C	6	6	152255	152260	0 %	0 %	0 %	100 %	383760845
3092	NC_017078	AGC	2	6	152261	152266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760845
3093	NC_017078	AGC	2	6	152335	152340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760845
3094	NC_017078	GGC	2	6	152341	152346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760845
3095	NC_017078	ATA	2	6	152364	152369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760845
3096	NC_017078	AT	3	6	152462	152467	50 %	50 %	0 %	0 %	383760845
3097	NC_017078	TGAC	2	8	152480	152487	25 %	25 %	25 %	25 %	383760845
3098	NC_017078	TGA	3	9	152502	152510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760845
3099	NC_017078	CTG	2	6	152557	152562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760845
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3102	NC_017078	CGC	2	6	152781	152786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760845
3103	NC_017078	GCC	2	6	152788	152793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760845
3104	NC_017078	TTA	2	6	152861	152866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017078	ACC	2	6	152871	152876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_017078	TAT	2	6	152898	152903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017078	AT	3	6	152945	152950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_017078	ATA	2	6	153007	153012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017078	ATT	2	6	153036	153041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760846
3110	NC_017078	TGG	2	6	153093	153098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760846
3111	NC_017078	GTGG	2	8	153133	153140	0 %	25 %	75 %	0 %	383760846
3112	NC_017078	CTG	2	6	153278	153283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760846
3113	NC_017078	GCC	2	6	153313	153318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760846
3114	NC_017078	GCT	2	6	153326	153331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760846
3115	NC_017078	TGG	2	6	153358	153363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760846
3116	NC_017078	CCATGA	2	12	153420	153431	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383760846
3117	NC_017078	CCA	2	6	153432	153437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760846
3118	NC_017078	CTT	2	6	153464	153469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760846
3119	NC_017078	TGG	2	6	153473	153478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760846
3120	NC_017078	TCTG	2	8	153505	153512	0 %	50 %	25 %	25 %	383760846
3121	NC_017078	ATG	3	9	153515	153523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760846
3122	NC_017078	GGT	2	6	153535	153540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760846
3123	NC_017078	TCA	2	6	153567	153572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760846
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3240	NC_017078	A	7	7	160542	160548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3241	NC_017078	GGAT	2	8	160703	160710	25 %	25 %	50 %	0 %	383760856
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3359	NC_017078	AGGC	2	8	167326	167333	25 %	0 %	50 %	25 %	383760861
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3363	NC_017078	TGA	2	6	167423	167428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760861
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3365	NC_017078	A	6	6	167460	167465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3491	NC_017078	AGC	2	6	173228	173233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760869
3492	NC_017078	ATT	2	6	173236	173241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760869
3493	NC_017078	G	6	6	173298	173303	0 %	0 %	100 %	0 %	383760869
3494	NC_017078	GCA	2	6	173328	173333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760869
3495	NC_017078	CAT	2	6	173341	173346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760869
3496	NC_017078	CGG	2	6	173384	173389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760869
3497	NC_017078	TC	3	6	173450	173455	0 %	50 %	0 %	50 %	383760869
3498	NC_017078	CTGC	2	8	173565	173572	0 %	25 %	25 %	50 %	383760869
3499	NC_017078	AGC	2	6	173606	173611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760869
3500	NC_017078	ATG	2	6	173627	173632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760869

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