MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC7

Total Repeats: 609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017077	CAA	2	6	5	10	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760672
2	NC_017077	ACC	2	6	55	60	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760672
3	NC_017077	GCT	2	6	73	78	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760672
4	NC_017077	A	6	6	97	102	100 %	0 %	0 %	0 %	383760672
5	NC_017077	TC	3	6	135	140	0 %	50 %	0 %	50 %	383760672
6	NC_017077	TAAA	2	8	170	177	75 %	25 %	0 %	0 %	383760672
7	NC_017077	A	7	7	360	366	100 %	0 %	0 %	0 %	383760672
8	NC_017077	TCC	2	6	390	395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760672
9	NC_017077	GT	3	6	482	487	0 %	50 %	50 %	0 %	383760672
10	NC_017077	TAA	2	6	528	533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760672
11	NC_017077	CAG	2	6	617	622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760672
12	NC_017077	CAAA	2	8	624	631	75 %	0 %	0 %	25 %	383760672
13	NC_017077	CAG	2	6	638	643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760672
14	NC_017077	AT	3	6	704	709	50 %	50 %	0 %	0 %	383760672
15	NC_017077	GCT	2	6	715	720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760672
16	NC_017077	AGG	2	6	779	784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760672
17	NC_017077	A	7	7	797	803	100 %	0 %	0 %	0 %	383760673
18	NC_017077	T	6	6	869	874	0 %	100 %	0 %	0 %	383760673
19	NC_017077	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760673
20	NC_017077	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	383760673
21	NC_017077	GTT	2	6	1002	1007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760673
22	NC_017077	GAA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760673
23	NC_017077	ATAC	2	8	1036	1043	50 %	25 %	0 %	25 %	383760673
24	NC_017077	GCA	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760673
25	NC_017077	GAT	2	6	1175	1180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760673
26	NC_017077	AAT	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017077	AGCA	2	8	1304	1311	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017077	TTGCT	2	10	1354	1363	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017077	GCT	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017077	GA	3	6	1442	1447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017077	GA	3	6	1463	1468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017077	GA	3	6	1496	1501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017077	GA	3	6	1517	1522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017077	GA	3	6	1548	1553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017077	GA	3	6	1568	1573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017077	ACAT	2	8	1591	1598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017077	GA	3	6	1631	1636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017077	ATT	2	6	1659	1664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017077	AGA	2	6	1715	1720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760674
40	NC_017077	AT	3	6	1727	1732	50 %	50 %	0 %	0 %	383760674
41	NC_017077	TTTA	2	8	1786	1793	25 %	75 %	0 %	0 %	383760674
42	NC_017077	TGCT	2	8	1794	1801	0 %	50 %	25 %	25 %	383760674
43	NC_017077	T	6	6	1853	1858	0 %	100 %	0 %	0 %	383760674
44	NC_017077	A	6	6	1888	1893	100 %	0 %	0 %	0 %	383760674
45	NC_017077	TGA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760674
46	NC_017077	TG	3	6	1960	1965	0 %	50 %	50 %	0 %	383760674
47	NC_017077	TAT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760674
48	NC_017077	TAA	3	9	2053	2061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760674
49	NC_017077	AT	3	6	2082	2087	50 %	50 %	0 %	0 %	383760674
50	NC_017077	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760674
51	NC_017077	TAA	2	6	2200	2205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760674
52	NC_017077	TAT	2	6	2206	2211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760674
53	NC_017077	AGA	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760674
54	NC_017077	GAA	2	6	2373	2378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760674
55	NC_017077	CTTTTT	2	12	2388	2399	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383760674
56	NC_017077	GTA	2	6	2409	2414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760674
57	NC_017077	GAG	2	6	2429	2434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760674
58	NC_017077	AGA	3	9	2440	2448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760674
59	NC_017077	A	6	6	2473	2478	100 %	0 %	0 %	0 %	383760674
60	NC_017077	TCTA	2	8	2491	2498	25 %	50 %	0 %	25 %	383760674
61	NC_017077	ACAG	2	8	2640	2647	50 %	0 %	25 %	25 %	383760674
62	NC_017077	GCA	2	6	2666	2671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760674
63	NC_017077	AGA	2	6	2695	2700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760674
64	NC_017077	TGC	2	6	2722	2727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760674
65	NC_017077	TGA	2	6	2755	2760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760674
66	NC_017077	AAT	2	6	2789	2794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760674
67	NC_017077	ATG	2	6	2846	2851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760674
68	NC_017077	AGA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760674
69	NC_017077	ATA	2	6	2932	2937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760674
70	NC_017077	ACA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017077	ACA	2	6	3032	3037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760675
72	NC_017077	A	6	6	3059	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	383760675
73	NC_017077	AAG	2	6	3140	3145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760675
74	NC_017077	GAG	2	6	3152	3157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760675
75	NC_017077	GCT	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760675
76	NC_017077	AGC	2	6	3220	3225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760675
77	NC_017077	TAT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760675
78	NC_017077	TAT	2	6	3277	3282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760675
79	NC_017077	CTAA	2	8	3318	3325	50 %	25 %	0 %	25 %	383760675
80	NC_017077	AGA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017077	AGGG	2	8	3353	3360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017077	T	6	6	3372	3377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017077	TACA	2	8	3389	3396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017077	GGA	2	6	3507	3512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017077	CAATA	2	10	3534	3543	60 %	20 %	0 %	20 %	383760676
86	NC_017077	TTATA	2	10	3621	3630	40 %	60 %	0 %	0 %	383760676
87	NC_017077	TA	3	6	3634	3639	50 %	50 %	0 %	0 %	383760676
88	NC_017077	AGA	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760676
89	NC_017077	AAG	2	6	3752	3757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760676
90	NC_017077	CTA	2	6	3823	3828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760677
91	NC_017077	GACC	2	8	3842	3849	25 %	0 %	25 %	50 %	383760677
92	NC_017077	TAC	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760677
93	NC_017077	GAA	2	6	3911	3916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760677
94	NC_017077	CAT	2	6	3938	3943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760677
95	NC_017077	GAA	2	6	3944	3949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760677
96	NC_017077	GAA	2	6	4007	4012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760677
97	NC_017077	ACCTT	2	10	4029	4038	20 %	40 %	0 %	40 %	383760677
98	NC_017077	TTC	2	6	4039	4044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760677
99	NC_017077	ACC	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760677
100	NC_017077	AGA	2	6	4126	4131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760677
101	NC_017077	TTG	2	6	4143	4148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760677
102	NC_017077	ATAG	2	8	4307	4314	50 %	25 %	25 %	0 %	383760677
103	NC_017077	GCA	2	6	4438	4443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760677
104	NC_017077	TATC	2	8	4517	4524	25 %	50 %	0 %	25 %	383760677
105	NC_017077	ATGGA	2	10	4530	4539	40 %	20 %	40 %	0 %	383760677
106	NC_017077	GCCA	2	8	4582	4589	25 %	0 %	25 %	50 %	383760677
107	NC_017077	ATA	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760677
108	NC_017077	AT	3	6	4659	4664	50 %	50 %	0 %	0 %	383760677
109	NC_017077	T	6	6	4719	4724	0 %	100 %	0 %	0 %	383760677
110	NC_017077	TC	3	6	4787	4792	0 %	50 %	0 %	50 %	383760677
111	NC_017077	AAT	2	6	4796	4801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760677
112	NC_017077	GCA	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760677
113	NC_017077	CTTG	2	8	4964	4971	0 %	50 %	25 %	25 %	383760677
114	NC_017077	A	6	6	5077	5082	100 %	0 %	0 %	0 %	383760677
115	NC_017077	AAG	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760677
116	NC_017077	TGG	3	9	5403	5411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760677
117	NC_017077	TGG	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760677
118	NC_017077	ACT	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760677
119	NC_017077	AGG	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760677
120	NC_017077	ATG	2	6	5670	5675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760677
121	NC_017077	GCT	2	6	5698	5703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760677
122	NC_017077	GGA	2	6	5719	5724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760677
123	NC_017077	TGC	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760677
124	NC_017077	GCA	2	6	5824	5829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760677
125	NC_017077	CCA	2	6	5877	5882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760677
126	NC_017077	CGGAGC	2	12	5886	5897	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383760677
127	NC_017077	CAAA	2	8	5964	5971	75 %	0 %	0 %	25 %	383760677
128	NC_017077	CTC	2	6	5986	5991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760677
129	NC_017077	GACCAT	2	12	5995	6006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383760677
130	NC_017077	ATTCC	2	10	6060	6069	20 %	40 %	0 %	40 %	383760677
131	NC_017077	CTATGC	2	12	6100	6111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383760677
132	NC_017077	GCAA	2	8	6120	6127	50 %	0 %	25 %	25 %	383760677
133	NC_017077	AGC	2	6	6217	6222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760677
134	NC_017077	ATG	2	6	6255	6260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760677
135	NC_017077	AGG	2	6	6336	6341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760677
136	NC_017077	CCA	2	6	6396	6401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760677
137	NC_017077	A	6	6	6438	6443	100 %	0 %	0 %	0 %	383760677
138	NC_017077	ACA	2	6	6486	6491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760677
139	NC_017077	AAT	2	6	6506	6511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760677
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399	NC_017077	ATC	2	6	19239	19244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760682
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452	NC_017077	GCA	2	6	21570	21575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760682
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464	NC_017077	GCA	2	6	22299	22304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760682
465	NC_017077	ACC	2	6	22377	22382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760682
466	NC_017077	CGC	2	6	22483	22488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760682
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469	NC_017077	CCT	2	6	22699	22704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760682
470	NC_017077	CAT	2	6	22711	22716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760682
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472	NC_017077	CAT	2	6	22786	22791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760682
473	NC_017077	GCT	2	6	22858	22863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760682
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475	NC_017077	CATCCA	2	12	22957	22968	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383760682
476	NC_017077	GGA	2	6	22982	22987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760682
477	NC_017077	CAT	2	6	22991	22996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760682
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480	NC_017077	CTG	2	6	23128	23133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760682
481	NC_017077	ATT	2	6	23243	23248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760682
482	NC_017077	CAG	2	6	23341	23346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760682
483	NC_017077	TGC	2	6	23374	23379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760682
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485	NC_017077	CCA	2	6	23422	23427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760682
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489	NC_017077	TTC	2	6	23550	23555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760682
490	NC_017077	ATT	2	6	23588	23593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760682
491	NC_017077	GCC	2	6	23805	23810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760682
492	NC_017077	ACC	2	6	23904	23909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
493	NC_017077	ATCT	2	8	23978	23985	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
494	NC_017077	GCC	2	6	24078	24083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760683
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497	NC_017077	T	7	7	24135	24141	0 %	100 %	0 %	0 %	383760683
498	NC_017077	T	6	6	24271	24276	0 %	100 %	0 %	0 %	383760683
499	NC_017077	GCT	2	6	24313	24318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760683
500	NC_017077	T	6	6	24331	24336	0 %	100 %	0 %	0 %	383760683

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