MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC9

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017072	ATT	2	6	10	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080714
2	NC_017072	GGA	2	6	75	80	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080714
3	NC_017072	AGAGCG	2	12	122	133	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383080714
4	NC_017072	CAA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080714
5	NC_017072	GGC	2	6	314	319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080714
6	NC_017072	AAAG	2	8	375	382	75 %	0 %	25 %	0 %	383080714
7	NC_017072	ACAAG	2	10	480	489	60 %	0 %	20 %	20 %	383080714
8	NC_017072	AAACG	2	10	568	577	60 %	0 %	20 %	20 %	383080714
9	NC_017072	AAGG	2	8	634	641	50 %	0 %	50 %	0 %	383080714
10	NC_017072	TGA	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080714
11	NC_017072	TGAAAG	2	12	794	805	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383080714
12	NC_017072	AGC	2	6	816	821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080714
13	NC_017072	CATA	2	8	849	856	50 %	25 %	0 %	25 %	383080714
14	NC_017072	TTA	2	6	866	871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080714
15	NC_017072	TGA	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080714
16	NC_017072	ACAA	2	8	956	963	75 %	0 %	0 %	25 %	383080714
17	NC_017072	AT	3	6	1017	1022	50 %	50 %	0 %	0 %	383080714
18	NC_017072	AT	3	6	1029	1034	50 %	50 %	0 %	0 %	383080714
19	NC_017072	AT	3	6	1037	1042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017072	TGG	2	6	1066	1071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017072	TGA	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017072	TGA	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017072	TG	3	6	1200	1205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017072	TGCT	3	12	1300	1311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017072	T	6	6	1414	1419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017072	ATA	2	6	1433	1438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017072	CTTT	2	8	1538	1545	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017072	TA	3	6	1806	1811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017072	AG	4	8	2029	2036	50 %	0 %	50 %	0 %	383080716
30	NC_017072	GCA	2	6	2132	2137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080716
31	NC_017072	CCA	2	6	2155	2160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080716
32	NC_017072	ATAC	2	8	2263	2270	50 %	25 %	0 %	25 %	383080717
33	NC_017072	GAAAC	2	10	2302	2311	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017072	AACTT	2	10	2324	2333	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017072	GT	3	6	2379	2384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017072	TAAT	2	8	2387	2394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017072	T	6	6	2441	2446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017072	TTTA	2	8	2499	2506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017072	GTA	2	6	2543	2548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017072	A	6	6	2548	2553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017072	AAC	2	6	2595	2600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.