MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC4

Total Repeats: 1354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017069	AT	3	6	6	11	50 %	50 %	0 %	0 %	383755656
2	NC_017069	AT	3	6	50	55	50 %	50 %	0 %	0 %	383755656
3	NC_017069	GGAA	2	8	150	157	50 %	0 %	50 %	0 %	383755656
4	NC_017069	GAACG	2	10	213	222	40 %	0 %	40 %	20 %	383755656
5	NC_017069	C	6	6	264	269	0 %	0 %	0 %	100 %	383755656
6	NC_017069	CAA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755656
7	NC_017069	GCT	2	6	530	535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755656
8	NC_017069	TCA	2	6	642	647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755656
9	NC_017069	GCCA	2	8	701	708	25 %	0 %	25 %	50 %	383755656
10	NC_017069	GTC	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755656
11	NC_017069	TCGG	2	8	778	785	0 %	25 %	50 %	25 %	383755656
12	NC_017069	GGT	2	6	787	792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755656
13	NC_017069	CCAGC	2	10	900	909	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017069	AGCC	3	12	922	933	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017069	TGTC	2	8	957	964	0 %	50 %	25 %	25 %	383755657
16	NC_017069	AAC	2	6	1006	1011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755657
17	NC_017069	AAC	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017069	A	7	7	1124	1130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017069	ATTT	2	8	1147	1154	25 %	75 %	0 %	0 %	383755658
20	NC_017069	ACT	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755658
21	NC_017069	AGA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755658
22	NC_017069	TAG	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755658
23	NC_017069	CAG	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755658
24	NC_017069	TGA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755658
25	NC_017069	CTC	2	6	1420	1425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755658
26	NC_017069	CAAT	2	8	1481	1488	50 %	25 %	0 %	25 %	383755658
27	NC_017069	GGAA	2	8	1546	1553	50 %	0 %	50 %	0 %	383755658
28	NC_017069	A	6	6	1552	1557	100 %	0 %	0 %	0 %	383755658
29	NC_017069	TA	3	6	1569	1574	50 %	50 %	0 %	0 %	383755658
30	NC_017069	T	7	7	1617	1623	0 %	100 %	0 %	0 %	383755658
31	NC_017069	CCT	2	6	1671	1676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755659
32	NC_017069	CGT	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755659
33	NC_017069	GGAA	2	8	1915	1922	50 %	0 %	50 %	0 %	383755659
34	NC_017069	TAAC	2	8	2017	2024	50 %	25 %	0 %	25 %	383755659
35	NC_017069	T	6	6	2038	2043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017069	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017069	AGT	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755660
38	NC_017069	TGG	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755660
39	NC_017069	AGCC	2	8	2268	2275	25 %	0 %	25 %	50 %	383755660
40	NC_017069	TCA	2	6	2289	2294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755660
41	NC_017069	CT	3	6	2338	2343	0 %	50 %	0 %	50 %	383755660
42	NC_017069	T	6	6	2343	2348	0 %	100 %	0 %	0 %	383755660
43	NC_017069	CTGC	2	8	2397	2404	0 %	25 %	25 %	50 %	383755661
44	NC_017069	T	6	6	2471	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	383755661
45	NC_017069	T	6	6	2500	2505	0 %	100 %	0 %	0 %	383755661
46	NC_017069	AAC	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755661
47	NC_017069	CT	3	6	2562	2567	0 %	50 %	0 %	50 %	383755661
48	NC_017069	TGA	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755661
49	NC_017069	CATA	2	8	2620	2627	50 %	25 %	0 %	25 %	383755661
50	NC_017069	T	7	7	2636	2642	0 %	100 %	0 %	0 %	383755661
51	NC_017069	TGCGG	2	10	2702	2711	0 %	20 %	60 %	20 %	383755661
52	NC_017069	CCT	2	6	2854	2859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755661
53	NC_017069	CT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	0 %	50 %	383755661
54	NC_017069	GCT	3	9	2919	2927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755661
55	NC_017069	TGC	2	6	2930	2935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755661
56	NC_017069	TTC	2	6	3018	3023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755662
57	NC_017069	ATCA	2	8	3138	3145	50 %	25 %	0 %	25 %	383755662
58	NC_017069	CCT	2	6	3197	3202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017069	T	6	6	3220	3225	0 %	100 %	0 %	0 %	383755663
60	NC_017069	CCA	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755663
61	NC_017069	CCGT	2	8	3299	3306	0 %	25 %	25 %	50 %	383755663
62	NC_017069	AACAA	2	10	3361	3370	80 %	0 %	0 %	20 %	383755663
63	NC_017069	TCG	2	6	3413	3418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755663
64	NC_017069	T	6	6	3439	3444	0 %	100 %	0 %	0 %	383755663
65	NC_017069	CAT	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755663
66	NC_017069	AAACA	2	10	3534	3543	80 %	0 %	0 %	20 %	383755663
67	NC_017069	ATA	2	6	3548	3553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755663
68	NC_017069	TC	3	6	3554	3559	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017069	AT	4	8	3621	3628	50 %	50 %	0 %	0 %	383755664
70	NC_017069	TTCAC	2	10	3667	3676	20 %	40 %	0 %	40 %	383755664
71	NC_017069	GAA	2	6	3696	3701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755664
72	NC_017069	TTTG	2	8	3715	3722	0 %	75 %	25 %	0 %	383755664
73	NC_017069	TCG	2	6	3760	3765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755664
74	NC_017069	TCG	2	6	3802	3807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755664
75	NC_017069	ACA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383755664
76	NC_017069	AAT	2	6	3826	3831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383755664
77	NC_017069	ATG	2	6	3911	3916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755665
78	NC_017069	T	6	6	4136	4141	0 %	100 %	0 %	0 %	383755665
79	NC_017069	CCT	2	6	4314	4319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017069	CAGA	2	8	4342	4349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017069	CAT	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017069	ATTTTT	2	12	4461	4472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017069	ATA	2	6	4512	4517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017069	ACC	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755666
85	NC_017069	ATT	2	6	4759	4764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383755666
86	NC_017069	T	7	7	4825	4831	0 %	100 %	0 %	0 %	383755667
87	NC_017069	TGT	2	6	4873	4878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755667
88	NC_017069	A	6	6	4912	4917	100 %	0 %	0 %	0 %	383755667
89	NC_017069	CTG	2	6	4940	4945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755667
90	NC_017069	TGT	2	6	5029	5034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755667
91	NC_017069	ACA	2	6	5057	5062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017069	T	6	6	5077	5082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017069	ATG	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017069	ATG	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017069	CTA	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755668
96	NC_017069	CGC	2	6	5369	5374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755668
97	NC_017069	TGA	2	6	5411	5416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755668
98	NC_017069	TCC	2	6	5539	5544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755668
99	NC_017069	CCG	2	6	5548	5553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383755668
100	NC_017069	T	6	6	5592	5597	0 %	100 %	0 %	0 %	383755668
101	NC_017069	GACG	2	8	5704	5711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017069	TAG	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755669
103	NC_017069	GTT	2	6	5827	5832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755669
104	NC_017069	GTG	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383755669
105	NC_017069	CCT	2	6	5921	5926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755670
106	NC_017069	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755670
107	NC_017069	GGC	2	6	5952	5957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755670
108	NC_017069	TCG	2	6	5963	5968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755670
109	NC_017069	T	6	6	5973	5978	0 %	100 %	0 %	0 %	383755670
110	NC_017069	TCT	2	6	5987	5992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755670
111	NC_017069	TTTTC	2	10	6029	6038	0 %	80 %	0 %	20 %	383755670
112	NC_017069	CTC	2	6	6102	6107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755670
113	NC_017069	TCGG	2	8	6118	6125	0 %	25 %	50 %	25 %	383755670
114	NC_017069	CCA	2	6	6138	6143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755670
115	NC_017069	TAAC	2	8	6199	6206	50 %	25 %	0 %	25 %	383755670
116	NC_017069	CGG	2	6	6227	6232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383755670
117	NC_017069	GGTT	2	8	6279	6286	0 %	50 %	50 %	0 %	383755670
118	NC_017069	GTTCT	2	10	6288	6297	0 %	60 %	20 %	20 %	383755670
119	NC_017069	CCTC	2	8	6323	6330	0 %	25 %	0 %	75 %	383755670
120	NC_017069	TGCGGG	2	12	6386	6397	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383755670
121	NC_017069	G	6	6	6406	6411	0 %	0 %	100 %	0 %	383755670
122	NC_017069	TCCTTT	2	12	6433	6444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755670
123	NC_017069	TG	3	6	6458	6463	0 %	50 %	50 %	0 %	383755670
124	NC_017069	CAT	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383755670
125	NC_017069	CGT	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755670
126	NC_017069	CCT	2	6	6578	6583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383755670
127	NC_017069	AT	3	6	6612	6617	50 %	50 %	0 %	0 %	383755670
128	NC_017069	GAA	2	6	6678	6683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383755670
129	NC_017069	CG	3	6	6692	6697	0 %	0 %	50 %	50 %	383755670
130	NC_017069	GAT	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755670
131	NC_017069	CAGG	2	8	6746	6753	25 %	0 %	50 %	25 %	383755670
132	NC_017069	ATG	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755670
133	NC_017069	CTTTT	2	10	6852	6861	0 %	80 %	0 %	20 %	383755671
134	NC_017069	TTG	2	6	6927	6932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383755671
135	NC_017069	ACAAG	2	10	6955	6964	60 %	0 %	20 %	20 %	383755671
136	NC_017069	TCTA	2	8	6993	7000	25 %	50 %	0 %	25 %	383755671
137	NC_017069	AGT	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383755672
138	NC_017069	CCA	2	6	7167	7172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383755672
139	NC_017069	CGA	2	6	7175	7180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755672
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