MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 62925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45003	NC_017068	ATC	2	6	2146537	2146542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754902
45004	NC_017068	TCC	2	6	2146561	2146566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383754902
45005	NC_017068	GCC	2	6	2146572	2146577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383754902
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45064	NC_017068	TA	3	6	2149667	2149672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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45107	NC_017068	AGGC	2	8	2152385	2152392	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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45239	NC_017068	CGTT	2	8	2158356	2158363	0 %	50 %	25 %	25 %	383754916
45240	NC_017068	TGG	2	6	2158366	2158371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383754916
45241	NC_017068	TTC	2	6	2158388	2158393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383754916
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45268	NC_017068	GCT	2	6	2159837	2159842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
45269	NC_017068	TGC	2	6	2159854	2159859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
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45273	NC_017068	GTC	2	6	2159931	2159936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
45274	NC_017068	AATC	2	8	2159988	2159995	50 %	25 %	0 %	25 %	383754917
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45277	NC_017068	GCC	2	6	2160251	2160256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383754917
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45287	NC_017068	CATAGC	2	12	2160767	2160778	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383754917
45288	NC_017068	TGA	2	6	2160784	2160789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383754917
45289	NC_017068	GC	3	6	2160802	2160807	0 %	0 %	50 %	50 %	383754917
45290	NC_017068	CTT	2	6	2160858	2160863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383754917
45291	NC_017068	CAG	2	6	2160888	2160893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383754917
45292	NC_017068	GCT	2	6	2160956	2160961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
45293	NC_017068	GGC	2	6	2161014	2161019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383754917
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45295	NC_017068	ATAG	2	8	2161029	2161036	50 %	25 %	25 %	0 %	383754917
45296	NC_017068	CTG	2	6	2161044	2161049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
45297	NC_017068	CCA	3	9	2161061	2161069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383754917
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45299	NC_017068	CTT	2	6	2161173	2161178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383754917
45300	NC_017068	TCA	2	6	2161201	2161206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754917
45301	NC_017068	GCG	2	6	2161364	2161369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383754917
45302	NC_017068	AGGA	2	8	2161423	2161430	50 %	0 %	50 %	0 %	383754917
45303	NC_017068	CAT	2	6	2161517	2161522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754917
45304	NC_017068	TCA	2	6	2161550	2161555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754917
45305	NC_017068	CCG	2	6	2161561	2161566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383754917
45306	NC_017068	CCGC	2	8	2161610	2161617	0 %	0 %	25 %	75 %	383754917
45307	NC_017068	CCA	2	6	2161628	2161633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383754917
45308	NC_017068	CCG	2	6	2161661	2161666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383754917
45309	NC_017068	CTG	2	6	2161668	2161673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
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45311	NC_017068	CTG	2	6	2161836	2161841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
45312	NC_017068	CTG	2	6	2161916	2161921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
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45315	NC_017068	CTG	2	6	2161983	2161988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
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45319	NC_017068	ATC	2	6	2162328	2162333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754917
45320	NC_017068	ATT	2	6	2162343	2162348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383754917
45321	NC_017068	CGG	2	6	2162383	2162388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383754917
45322	NC_017068	CTGC	2	8	2162429	2162436	0 %	25 %	25 %	50 %	383754917
45323	NC_017068	TTG	2	6	2162449	2162454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383754917
45324	NC_017068	CCGG	2	8	2162510	2162517	0 %	0 %	50 %	50 %	383754917
45325	NC_017068	CAC	2	6	2162565	2162570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383754917
45326	NC_017068	CTG	2	6	2162640	2162645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754917
45327	NC_017068	ATC	2	6	2162673	2162678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754917
45328	NC_017068	TCA	2	6	2162722	2162727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754917
45329	NC_017068	TAT	2	6	2162956	2162961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45330	NC_017068	TTC	2	6	2163022	2163027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383754918
45331	NC_017068	ATC	2	6	2163042	2163047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754918
45332	NC_017068	GAT	2	6	2163117	2163122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383754918
45333	NC_017068	AGC	2	6	2163154	2163159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383754918
45334	NC_017068	GAT	2	6	2163201	2163206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383754918
45335	NC_017068	TCA	2	6	2163242	2163247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754918
45336	NC_017068	TGA	4	12	2163311	2163322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383754918
45337	NC_017068	TGG	2	6	2163326	2163331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383754918
45338	NC_017068	ATC	2	6	2163334	2163339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754918
45339	NC_017068	AGAT	2	8	2163358	2163365	50 %	25 %	25 %	0 %	383754918
45340	NC_017068	GAT	2	6	2163513	2163518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383754918
45341	NC_017068	CAT	2	6	2163521	2163526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754918
45342	NC_017068	TCAG	2	8	2163583	2163590	25 %	25 %	25 %	25 %	383754918
45343	NC_017068	TGCC	2	8	2163597	2163604	0 %	25 %	25 %	50 %	383754918
45344	NC_017068	GCC	2	6	2163648	2163653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383754918
45345	NC_017068	CAGG	2	8	2163654	2163661	25 %	0 %	50 %	25 %	383754918
45346	NC_017068	GTT	2	6	2163807	2163812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383754918
45347	NC_017068	CGT	2	6	2163869	2163874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383754918
45348	NC_017068	CCA	2	6	2164070	2164075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383754918
45349	NC_017068	CGG	2	6	2164088	2164093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383754918
45350	NC_017068	CCA	2	6	2164109	2164114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383754918
45351	NC_017068	CCG	2	6	2164158	2164163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383754918
45352	NC_017068	ATG	2	6	2164183	2164188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383754918
45353	NC_017068	ATG	3	9	2164234	2164242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383754918
45354	NC_017068	ATC	2	6	2164262	2164267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754919
45355	NC_017068	CCTT	2	8	2164270	2164277	0 %	50 %	0 %	50 %	383754919
45356	NC_017068	ATT	2	6	2164291	2164296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383754919
45357	NC_017068	GCA	2	6	2164352	2164357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383754919
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45359	NC_017068	AGC	2	6	2164383	2164388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383754919
45360	NC_017068	ATG	3	9	2164498	2164506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383754919
45361	NC_017068	AGC	2	6	2164555	2164560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383754919
45362	NC_017068	GCC	2	6	2164581	2164586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383754919
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45364	NC_017068	CATTGA	2	12	2164631	2164642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383754919
45365	NC_017068	GAT	2	6	2164677	2164682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383754919
45366	NC_017068	CAC	2	6	2164683	2164688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383754919
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45380	NC_017068	GATGCG	2	12	2165183	2165194	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383754920
45381	NC_017068	AAT	2	6	2165345	2165350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383754920
45382	NC_017068	TTA	2	6	2165355	2165360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383754920
45383	NC_017068	CGGC	2	8	2165419	2165426	0 %	0 %	50 %	50 %	383754920
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45387	NC_017068	CCT	2	6	2165616	2165621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45388	NC_017068	GC	3	6	2165772	2165777	0 %	0 %	50 %	50 %	383754921
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45404	NC_017068	CT	3	6	2166447	2166452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45405	NC_017068	T	6	6	2166480	2166485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45406	NC_017068	GCC	2	6	2166490	2166495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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45422	NC_017068	CAATA	2	10	2167177	2167186	60 %	20 %	0 %	20 %	383754923
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45444	NC_017068	GAAC	2	8	2168292	2168299	50 %	0 %	25 %	25 %	383754923
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45450	NC_017068	GTT	2	6	2168539	2168544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383754923
45451	NC_017068	CGCAG	2	10	2168621	2168630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45452	NC_017068	TTAT	2	8	2168668	2168675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45453	NC_017068	CTTA	2	8	2168676	2168683	25 %	50 %	0 %	25 %	383754924
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45461	NC_017068	AGG	2	6	2168967	2168972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383754924
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45464	NC_017068	GCTGAA	2	12	2169052	2169063	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383754924
45465	NC_017068	CCT	2	6	2169120	2169125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383754924
45466	NC_017068	GCC	2	6	2169148	2169153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383754924
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45468	NC_017068	CAT	2	6	2169226	2169231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383754924
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45491	NC_017068	TGG	2	6	2170262	2170267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383754926
45492	NC_017068	CTT	2	6	2170274	2170279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383754926
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