MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421

Total Repeats: 62925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017068	CAGA	2	8	513007	513014	50 %	0 %	25 %	25 %	383753276
11002	NC_017068	GAT	2	6	513189	513194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753277
11003	NC_017068	GAA	3	9	513288	513296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753277
11004	NC_017068	GA	3	6	513298	513303	50 %	0 %	50 %	0 %	383753277
11005	NC_017068	CTG	2	6	513513	513518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_017068	CGC	2	6	513562	513567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11007	NC_017068	GCG	2	6	513572	513577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753278
11008	NC_017068	ATG	2	6	513603	513608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753278
11009	NC_017068	GCC	2	6	513655	513660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753278
11010	NC_017068	CAGG	2	8	513728	513735	25 %	0 %	50 %	25 %	383753278
11011	NC_017068	GAT	2	6	513753	513758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753278
11012	NC_017068	GAA	2	6	513799	513804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753278
11013	NC_017068	GAT	2	6	513807	513812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753278
11014	NC_017068	GAT	2	6	513885	513890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753278
11015	NC_017068	ACT	2	6	513900	513905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753278
11016	NC_017068	TGA	2	6	513935	513940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753278
11017	NC_017068	TG	4	8	513976	513983	0 %	50 %	50 %	0 %	383753278
11018	NC_017068	TTA	2	6	514045	514050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383753278
11019	NC_017068	GCA	2	6	514054	514059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753278
11020	NC_017068	AG	3	6	514131	514136	50 %	0 %	50 %	0 %	383753278
11021	NC_017068	AGC	2	6	514171	514176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753278
11022	NC_017068	CTGT	2	8	514239	514246	0 %	50 %	25 %	25 %	383753278
11023	NC_017068	GAA	2	6	514259	514264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753278
11024	NC_017068	AGG	2	6	514276	514281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753278
11025	NC_017068	GAA	2	6	514310	514315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753278
11026	NC_017068	CAG	2	6	514338	514343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753278
11027	NC_017068	TGAAG	2	10	514361	514370	40 %	20 %	40 %	0 %	383753278
11028	NC_017068	CAG	2	6	514404	514409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753278
11029	NC_017068	GAA	2	6	514634	514639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753278
11030	NC_017068	AGCTC	2	10	514663	514672	20 %	20 %	20 %	40 %	383753278
11031	NC_017068	GA	3	6	514754	514759	50 %	0 %	50 %	0 %	383753278
11032	NC_017068	GAA	2	6	514789	514794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753278
11033	NC_017068	CAG	2	6	514811	514816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753278
11034	NC_017068	GCG	2	6	514833	514838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_017068	TGC	2	6	514858	514863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_017068	T	6	6	514871	514876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_017068	GA	3	6	514950	514955	50 %	0 %	50 %	0 %	383753279
11038	NC_017068	TAT	2	6	515004	515009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383753279
11039	NC_017068	CAT	2	6	515086	515091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753279
11040	NC_017068	ATT	2	6	515150	515155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383753279
11041	NC_017068	GA	3	6	515167	515172	50 %	0 %	50 %	0 %	383753279
11042	NC_017068	TGC	2	6	515209	515214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753279
11043	NC_017068	CAGAA	2	10	515237	515246	60 %	0 %	20 %	20 %	383753279
11044	NC_017068	ATAA	2	8	515261	515268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_017068	AT	3	6	515272	515277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_017068	AGA	2	6	515282	515287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_017068	A	6	6	515311	515316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_017068	TATC	2	8	515338	515345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11049	NC_017068	CCGA	2	8	515354	515361	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11050	NC_017068	AT	3	6	515373	515378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_017068	AT	3	6	515387	515392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_017068	AGG	2	6	515413	515418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_017068	CAT	2	6	515434	515439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753280
11054	NC_017068	TTC	2	6	515453	515458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383753280
11055	NC_017068	AC	3	6	515490	515495	50 %	0 %	0 %	50 %	383753280
11056	NC_017068	TTG	2	6	515507	515512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383753280
11057	NC_017068	GAAT	2	8	515523	515530	50 %	25 %	25 %	0 %	383753280
11058	NC_017068	T	6	6	515588	515593	0 %	100 %	0 %	0 %	383753280
11059	NC_017068	CTG	2	6	515594	515599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753280
11060	NC_017068	TACA	2	8	515624	515631	50 %	25 %	0 %	25 %	383753280
11061	NC_017068	AGA	2	6	515657	515662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753280
11062	NC_017068	GGA	2	6	515669	515674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383753280
11063	NC_017068	CTGCTC	2	12	515731	515742	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383753280
11064	NC_017068	TGA	2	6	515850	515855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753280
11065	NC_017068	ATC	2	6	515927	515932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753280
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11071	NC_017068	GAA	2	6	516343	516348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753280
11072	NC_017068	GCT	2	6	516352	516357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753280
11073	NC_017068	AT	3	6	516403	516408	50 %	50 %	0 %	0 %	383753280
11074	NC_017068	GGA	2	6	516441	516446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_017068	AAG	2	6	516475	516480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753281
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11080	NC_017068	TGG	2	6	516719	516724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753281
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11082	NC_017068	ATC	2	6	516835	516840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753281
11083	NC_017068	GCT	2	6	516843	516848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753281
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11086	NC_017068	CAGG	2	8	516908	516915	25 %	0 %	50 %	25 %	383753282
11087	NC_017068	TTCC	2	8	516922	516929	0 %	50 %	0 %	50 %	383753282
11088	NC_017068	CTG	2	6	516996	517001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753282
11089	NC_017068	GAT	2	6	517081	517086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753282
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11091	NC_017068	TTC	2	6	517205	517210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383753282
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11094	NC_017068	GTA	2	6	517517	517522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753282
11095	NC_017068	CTT	2	6	517540	517545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383753282
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11098	NC_017068	GCT	2	6	517841	517846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753282
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11101	NC_017068	GAC	2	6	518003	518008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753283
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11103	NC_017068	ATA	2	6	518102	518107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383753283
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11105	NC_017068	GAT	2	6	518239	518244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753283
11106	NC_017068	ATA	2	6	518489	518494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_017068	AGA	2	6	518513	518518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_017068	TCT	2	6	518532	518537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_017068	TGT	2	6	518565	518570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_017068	TG	3	6	518593	518598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_017068	GTG	2	6	518624	518629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_017068	T	6	6	518718	518723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_017068	CCT	2	6	518836	518841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11114	NC_017068	CA	3	6	518879	518884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11115	NC_017068	AAAG	2	8	518901	518908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_017068	ATG	2	6	518974	518979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_017068	GTCTTG	2	12	519004	519015	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11118	NC_017068	GGAA	2	8	519048	519055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_017068	T	6	6	519156	519161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_017068	GT	3	6	519163	519168	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_017068	TG	3	6	519182	519187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_017068	AGC	2	6	519192	519197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_017068	TGG	2	6	519250	519255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383753284
11124	NC_017068	CAG	2	6	519269	519274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753284
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11176	NC_017068	A	7	7	521930	521936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11180	NC_017068	GAAA	2	8	522155	522162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11211	NC_017068	TGA	2	6	523581	523586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753287
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11227	NC_017068	ATC	2	6	524805	524810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383753287
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11229	NC_017068	CCA	2	6	524912	524917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383753288
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11234	NC_017068	AATG	2	8	525165	525172	50 %	25 %	25 %	0 %	383753288
11235	NC_017068	ATTG	2	8	525173	525180	25 %	50 %	25 %	0 %	383753288
11236	NC_017068	ATT	2	6	525221	525226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383753289
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11240	NC_017068	CCT	2	6	525361	525366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383753289
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11242	NC_017068	CTG	2	6	525404	525409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753289
11243	NC_017068	TCC	2	6	525411	525416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383753289
11244	NC_017068	AGA	2	6	525421	525426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753289
11245	NC_017068	GAA	2	6	525502	525507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383753289
11246	NC_017068	GCG	2	6	525548	525553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383753290
11247	NC_017068	GCC	2	6	525559	525564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383753290
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11250	NC_017068	CTG	2	6	525739	525744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383753290
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11275	NC_017068	A	6	6	526950	526955	100 %	0 %	0 %	0 %	383753291
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11326	NC_017068	T	8	8	529642	529649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11327	NC_017068	AATA	2	8	529742	529749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11328	NC_017068	AT	3	6	529817	529822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11329	NC_017068	AGT	2	6	529865	529870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11335	NC_017068	TACGAT	2	12	530204	530215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383753293
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11350	NC_017068	ATG	2	6	530970	530975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383753293
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11353	NC_017068	TGCT	2	8	531184	531191	0 %	50 %	25 %	25 %	383753293
11354	NC_017068	AGC	2	6	531360	531365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383753293
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11356	NC_017068	GGTA	2	8	531431	531438	25 %	25 %	50 %	0 %	383753293
11357	NC_017068	AAC	2	6	531459	531464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383753293
11358	NC_017068	ATGG	2	8	531501	531508	25 %	25 %	50 %	0 %	383753293
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