MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 38070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35002	NC_017053	ATGA	2	8	1639505	1639512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35003	NC_017053	ATT	2	6	1639516	1639521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494687
35004	NC_017053	AAT	2	6	1639547	1639552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494687
35005	NC_017053	TGA	2	6	1639558	1639563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494687
35006	NC_017053	GTC	2	6	1639581	1639586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494687
35007	NC_017053	TTA	2	6	1639632	1639637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494687
35008	NC_017053	CTT	2	6	1639645	1639650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494687
35009	NC_017053	TAA	2	6	1639685	1639690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494687
35010	NC_017053	CAT	2	6	1639693	1639698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494687
35011	NC_017053	TGT	2	6	1639770	1639775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494687
35012	NC_017053	T	7	7	1639848	1639854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35013	NC_017053	T	7	7	1639885	1639891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35014	NC_017053	AT	3	6	1639970	1639975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35015	NC_017053	TCA	2	6	1640045	1640050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35016	NC_017053	CAAA	2	8	1640057	1640064	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35017	NC_017053	A	7	7	1640062	1640068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35018	NC_017053	AGA	2	6	1640130	1640135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494688
35019	NC_017053	TTA	2	6	1640139	1640144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494688
35020	NC_017053	CCTG	2	8	1640352	1640359	0 %	25 %	25 %	50 %	383494688
35021	NC_017053	CAA	2	6	1640373	1640378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494688
35022	NC_017053	TAA	2	6	1640429	1640434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494688
35023	NC_017053	CCA	2	6	1640472	1640477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494688
35024	NC_017053	CTA	2	6	1640482	1640487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494688
35025	NC_017053	TCT	2	6	1640568	1640573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494688
35026	NC_017053	TCC	2	6	1640675	1640680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494688
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35028	NC_017053	CATC	2	8	1640728	1640735	25 %	25 %	0 %	50 %	383494688
35029	NC_017053	AAGA	2	8	1640740	1640747	75 %	0 %	25 %	0 %	383494688
35030	NC_017053	AAC	2	6	1640786	1640791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494688
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35033	NC_017053	AAAT	2	8	1640921	1640928	75 %	25 %	0 %	0 %	383494688
35034	NC_017053	CAT	2	6	1640932	1640937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494688
35035	NC_017053	CTT	2	6	1640965	1640970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494688
35036	NC_017053	TTAGCT	2	12	1640973	1640984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383494688
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35040	NC_017053	CAC	2	6	1641275	1641280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494689
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35042	NC_017053	CAT	2	6	1641323	1641328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494689
35043	NC_017053	TTG	2	6	1641354	1641359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494689
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35045	NC_017053	TTTC	2	8	1641409	1641416	0 %	75 %	0 %	25 %	383494689
35046	NC_017053	TAA	2	6	1641453	1641458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494689
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35051	NC_017053	CAA	2	6	1641731	1641736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494689
35052	NC_017053	T	7	7	1641820	1641826	0 %	100 %	0 %	0 %	383494689
35053	NC_017053	AAT	2	6	1641845	1641850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494689
35054	NC_017053	TCA	2	6	1641865	1641870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494689
35055	NC_017053	AAAAG	2	10	1641905	1641914	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35056	NC_017053	ATTT	2	8	1641940	1641947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35057	NC_017053	ATG	2	6	1641961	1641966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35058	NC_017053	T	7	7	1642067	1642073	0 %	100 %	0 %	0 %	383494690
35059	NC_017053	CAA	2	6	1642120	1642125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494690
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35061	NC_017053	GAA	2	6	1642207	1642212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494690
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35073	NC_017053	ATT	2	6	1642922	1642927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35074	NC_017053	TAC	2	6	1642930	1642935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35076	NC_017053	CAAG	2	8	1642972	1642979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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35086	NC_017053	TAT	2	6	1643361	1643366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35091	NC_017053	TGAT	2	8	1643539	1643546	25 %	50 %	25 %	0 %	383494693
35092	NC_017053	TAA	2	6	1643739	1643744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494693
35093	NC_017053	GTC	2	6	1643810	1643815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494693
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35101	NC_017053	CTG	2	6	1644180	1644185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494693
35102	NC_017053	TCT	2	6	1644227	1644232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494693
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35106	NC_017053	GCT	2	6	1644482	1644487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494693
35107	NC_017053	GTT	2	6	1644532	1644537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494693
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35109	NC_017053	ATT	2	6	1644598	1644603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494693
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35112	NC_017053	TTTG	2	8	1644752	1644759	0 %	75 %	25 %	0 %	383494693
35113	NC_017053	T	6	6	1644818	1644823	0 %	100 %	0 %	0 %	383494693
35114	NC_017053	TA	3	6	1644840	1644845	50 %	50 %	0 %	0 %	383494693
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35117	NC_017053	T	6	6	1644997	1645002	0 %	100 %	0 %	0 %	383494693
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35239	NC_017053	ATA	2	6	1651200	1651205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494698
35240	NC_017053	A	6	6	1651215	1651220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35241	NC_017053	CAA	2	6	1651229	1651234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35242	NC_017053	A	6	6	1651261	1651266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35243	NC_017053	AGG	2	6	1651301	1651306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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35246	NC_017053	CAA	2	6	1651438	1651443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35247	NC_017053	T	6	6	1651461	1651466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35248	NC_017053	TATAC	2	10	1651469	1651478	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35249	NC_017053	GGT	2	6	1651484	1651489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35250	NC_017053	TG	3	6	1651528	1651533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35251	NC_017053	ACA	2	6	1651568	1651573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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35253	NC_017053	TCTT	2	8	1651626	1651633	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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35260	NC_017053	TCA	2	6	1651976	1651981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494700
35261	NC_017053	GA	3	6	1652064	1652069	50 %	0 %	50 %	0 %	383494700
35262	NC_017053	TC	3	6	1652136	1652141	0 %	50 %	0 %	50 %	383494700
35263	NC_017053	TCA	2	6	1652151	1652156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494700
35264	NC_017053	AT	3	6	1652173	1652178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35265	NC_017053	A	7	7	1652289	1652295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35266	NC_017053	T	6	6	1652336	1652341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35349	NC_017053	TGATT	2	10	1656099	1656108	20 %	60 %	20 %	0 %	383494704
35350	NC_017053	TCA	2	6	1656156	1656161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494704
35351	NC_017053	AAGC	2	8	1656237	1656244	50 %	0 %	25 %	25 %	383494704
35352	NC_017053	CTT	2	6	1656327	1656332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494704
35353	NC_017053	ACTCA	2	10	1656400	1656409	40 %	20 %	0 %	40 %	383494704
35354	NC_017053	TGG	2	6	1656421	1656426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494704
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35472	NC_017053	T	9	9	1662462	1662470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35473	NC_017053	T	6	6	1662475	1662480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35474	NC_017053	TAGAC	2	10	1662509	1662518	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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35479	NC_017053	GAA	2	6	1662778	1662783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494710
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