MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS1882 chromosome

Total Repeats: 38070

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_017053	TTGCTG	2	12	1360210	1360221	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383494434
29003	NC_017053	TCGT	2	8	1360240	1360247	0 %	50 %	25 %	25 %	383494434
29004	NC_017053	CTT	3	9	1360335	1360343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494434
29005	NC_017053	CAG	2	6	1360366	1360371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494434
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29012	NC_017053	GGT	2	6	1360635	1360640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494434
29013	NC_017053	GGT	2	6	1360644	1360649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494434
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29019	NC_017053	TGGGC	2	10	1360817	1360826	0 %	20 %	60 %	20 %	383494435
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29049	NC_017053	AGT	2	6	1362252	1362257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29052	NC_017053	TGA	2	6	1362304	1362309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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29054	NC_017053	ATGA	2	8	1362442	1362449	50 %	25 %	25 %	0 %	383494437
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29109	NC_017053	TTC	2	6	1365201	1365206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29110	NC_017053	TTA	2	6	1365227	1365232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29118	NC_017053	CTA	2	6	1365475	1365480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494439
29119	NC_017053	TCA	2	6	1365514	1365519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494439
29120	NC_017053	CATA	2	8	1365592	1365599	50 %	25 %	0 %	25 %	383494439
29121	NC_017053	CAC	2	6	1365646	1365651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494439
29122	NC_017053	AAT	2	6	1365668	1365673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494439
29123	NC_017053	TTC	2	6	1365746	1365751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494439
29124	NC_017053	GTC	2	6	1365802	1365807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494439
29125	NC_017053	CAT	2	6	1365973	1365978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494439
29126	NC_017053	GTT	2	6	1366044	1366049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494439
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29128	NC_017053	CTA	2	6	1366119	1366124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494440
29129	NC_017053	ATC	2	6	1366210	1366215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494440
29130	NC_017053	ACG	2	6	1366249	1366254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494440
29131	NC_017053	CCAA	2	8	1366265	1366272	50 %	0 %	0 %	50 %	383494440
29132	NC_017053	ATA	2	6	1366292	1366297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494440
29133	NC_017053	AGT	2	6	1366333	1366338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494440
29134	NC_017053	CCT	2	6	1366451	1366456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494440
29135	NC_017053	CAC	2	6	1366471	1366476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494440
29136	NC_017053	TTC	2	6	1366486	1366491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494440
29137	NC_017053	T	6	6	1366518	1366523	0 %	100 %	0 %	0 %	383494440
29138	NC_017053	CAA	2	6	1366527	1366532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494440
29139	NC_017053	ATA	2	6	1366550	1366555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494440
29140	NC_017053	ATA	2	6	1366568	1366573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494440
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29142	NC_017053	GTT	2	6	1366637	1366642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494440
29143	NC_017053	AAT	2	6	1366712	1366717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494440
29144	NC_017053	TCA	2	6	1366733	1366738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494440
29145	NC_017053	TCTT	2	8	1366817	1366824	0 %	75 %	0 %	25 %	383494440
29146	NC_017053	ATT	2	6	1366912	1366917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494440
29147	NC_017053	T	6	6	1366942	1366947	0 %	100 %	0 %	0 %	383494440
29148	NC_017053	AAGA	2	8	1367008	1367015	75 %	0 %	25 %	0 %	383494441
29149	NC_017053	AAATC	2	10	1367051	1367060	60 %	20 %	0 %	20 %	383494441
29150	NC_017053	TCA	2	6	1367126	1367131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494441
29151	NC_017053	GAT	2	6	1367160	1367165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494441
29152	NC_017053	ATA	2	6	1367184	1367189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494441
29153	NC_017053	AGG	2	6	1367190	1367195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383494441
29154	NC_017053	CTG	2	6	1367216	1367221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494441
29155	NC_017053	ACC	2	6	1367241	1367246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494441
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29160	NC_017053	GCT	2	6	1367560	1367565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494441
29161	NC_017053	ATGG	2	8	1367602	1367609	25 %	25 %	50 %	0 %	383494441
29162	NC_017053	TTC	2	6	1367613	1367618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494441
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29165	NC_017053	CTT	2	6	1367774	1367779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494441
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29169	NC_017053	CTG	2	6	1367852	1367857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494441
29170	NC_017053	CTT	2	6	1367906	1367911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494441
29171	NC_017053	CA	3	6	1368050	1368055	50 %	0 %	0 %	50 %	383494441
29172	NC_017053	GCT	2	6	1368127	1368132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494441
29173	NC_017053	GCA	2	6	1368274	1368279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494441
29174	NC_017053	CAC	2	6	1368302	1368307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494441
29175	NC_017053	T	7	7	1368323	1368329	0 %	100 %	0 %	0 %	383494441
29176	NC_017053	TCC	2	6	1368346	1368351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29177	NC_017053	TGC	2	6	1368400	1368405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494442
29178	NC_017053	TCA	2	6	1368477	1368482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494442
29179	NC_017053	GAC	2	6	1368499	1368504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494442
29180	NC_017053	T	6	6	1368508	1368513	0 %	100 %	0 %	0 %	383494442
29181	NC_017053	TCT	2	6	1368563	1368568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494442
29182	NC_017053	AAAG	2	8	1368658	1368665	75 %	0 %	25 %	0 %	383494442
29183	NC_017053	GTC	2	6	1368703	1368708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494442
29184	NC_017053	AC	3	6	1368720	1368725	50 %	0 %	0 %	50 %	383494442
29185	NC_017053	CAT	2	6	1368784	1368789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494442
29186	NC_017053	TCA	2	6	1368884	1368889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494443
29187	NC_017053	T	7	7	1368924	1368930	0 %	100 %	0 %	0 %	383494443
29188	NC_017053	TGG	2	6	1368954	1368959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494443
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29196	NC_017053	CTG	2	6	1369494	1369499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494444
29197	NC_017053	AAG	2	6	1369504	1369509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494444
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29200	NC_017053	CTT	2	6	1369653	1369658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494444
29201	NC_017053	GTT	2	6	1369886	1369891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383494444
29202	NC_017053	GA	3	6	1369892	1369897	50 %	0 %	50 %	0 %	383494444
29203	NC_017053	GCC	2	6	1369940	1369945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494444
29204	NC_017053	CCA	2	6	1369952	1369957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494444
29205	NC_017053	ATC	2	6	1369961	1369966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494444
29206	NC_017053	CAT	2	6	1370013	1370018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494444
29207	NC_017053	GAA	2	6	1370021	1370026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494444
29208	NC_017053	GCAG	2	8	1370029	1370036	25 %	0 %	50 %	25 %	383494444
29209	NC_017053	CCA	2	6	1370189	1370194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494444
29210	NC_017053	ATCG	2	8	1370220	1370227	25 %	25 %	25 %	25 %	383494444
29211	NC_017053	AATC	2	8	1370229	1370236	50 %	25 %	0 %	25 %	383494444
29212	NC_017053	T	6	6	1370323	1370328	0 %	100 %	0 %	0 %	383494444
29213	NC_017053	CAG	2	6	1370364	1370369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494444
29214	NC_017053	ACCAAT	2	12	1370413	1370424	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383494444
29215	NC_017053	ACT	2	6	1370501	1370506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494444
29216	NC_017053	CCA	2	6	1370594	1370599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494445
29217	NC_017053	CTT	2	6	1370621	1370626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494445
29218	NC_017053	T	6	6	1370678	1370683	0 %	100 %	0 %	0 %	383494445
29219	NC_017053	AGGA	2	8	1370685	1370692	50 %	0 %	50 %	0 %	383494445
29220	NC_017053	AGC	2	6	1370751	1370756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494445
29221	NC_017053	TTGC	2	8	1370816	1370823	0 %	50 %	25 %	25 %	383494445
29222	NC_017053	ACCA	2	8	1370841	1370848	50 %	0 %	0 %	50 %	383494445
29223	NC_017053	TAA	2	6	1370861	1370866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494445
29224	NC_017053	AAC	2	6	1371102	1371107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494445
29225	NC_017053	CAA	2	6	1371134	1371139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494445
29226	NC_017053	CTC	2	6	1371141	1371146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494445
29227	NC_017053	TGA	2	6	1371199	1371204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494445
29228	NC_017053	AT	3	6	1371245	1371250	50 %	50 %	0 %	0 %	383494445
29229	NC_017053	T	6	6	1371250	1371255	0 %	100 %	0 %	0 %	383494445
29230	NC_017053	CT	3	6	1371277	1371282	0 %	50 %	0 %	50 %	383494446
29231	NC_017053	TTC	2	6	1371347	1371352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494446
29232	NC_017053	CTA	2	6	1371411	1371416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494446
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29234	NC_017053	ACCA	2	8	1371514	1371521	50 %	0 %	0 %	50 %	383494446
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29498	NC_017053	T	7	7	1383231	1383237	0 %	100 %	0 %	0 %	383494458
29499	NC_017053	CCT	2	6	1383335	1383340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29500	NC_017053	TTA	2	6	1383349	1383354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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