MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 substr. PCC-N

Total Repeats: 66795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017052	TCA	2	6	267273	267278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490207
5002	NC_017052	CCG	2	6	267343	267348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490207
5003	NC_017052	TTC	2	6	267386	267391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490207
5004	NC_017052	ACT	2	6	267416	267421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490207
5005	NC_017052	CCG	2	6	267433	267438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490207
5006	NC_017052	GTT	2	6	267472	267477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490207
5007	NC_017052	TCA	2	6	267498	267503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490207
5008	NC_017052	CAC	2	6	267556	267561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490207
5009	NC_017052	G	7	7	267591	267597	0 %	0 %	100 %	0 %	383490207
5010	NC_017052	GGT	2	6	267638	267643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490207
5011	NC_017052	G	6	6	267650	267655	0 %	0 %	100 %	0 %	383490207
5012	NC_017052	TCC	2	6	267681	267686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490207
5013	NC_017052	CTG	2	6	267739	267744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490207
5014	NC_017052	GAG	2	6	267748	267753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490207
5015	NC_017052	TTC	2	6	267806	267811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490207
5016	NC_017052	GCC	2	6	267849	267854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490207
5017	NC_017052	TTC	2	6	267863	267868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490207
5018	NC_017052	GGA	2	6	267900	267905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490207
5019	NC_017052	TCC	2	6	267927	267932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490207
5020	NC_017052	TTC	2	6	267944	267949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490207
5021	NC_017052	CAA	2	6	268052	268057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490207
5022	NC_017052	GGC	2	6	268070	268075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490207
5023	NC_017052	TCA	2	6	268080	268085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490207
5024	NC_017052	GTT	2	6	268102	268107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490207
5025	NC_017052	T	6	6	268159	268164	0 %	100 %	0 %	0 %	383490207
5026	NC_017052	GCC	2	6	268185	268190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490207
5027	NC_017052	AGTTA	2	10	268479	268488	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017052	CAG	2	6	268516	268521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_017052	GTT	2	6	268528	268533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017052	TGAGC	2	10	268569	268578	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5031	NC_017052	GT	3	6	268603	268608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017052	CCG	2	6	268694	268699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_017052	GGC	2	6	268804	268809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490208
5034	NC_017052	GGA	2	6	268896	268901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490208
5035	NC_017052	T	6	6	268914	268919	0 %	100 %	0 %	0 %	383490208
5036	NC_017052	ATC	2	6	268982	268987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490208
5037	NC_017052	TAAAA	2	10	269018	269027	80 %	20 %	0 %	0 %	383490208
5038	NC_017052	TTG	2	6	269074	269079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490208
5039	NC_017052	GGA	2	6	269090	269095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490208
5040	NC_017052	GGC	2	6	269266	269271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490208
5041	NC_017052	AAT	2	6	269274	269279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490208
5042	NC_017052	ATTGT	2	10	269362	269371	20 %	60 %	20 %	0 %	383490208
5043	NC_017052	CAC	2	6	269422	269427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490208
5044	NC_017052	ATG	2	6	269447	269452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490208
5045	NC_017052	CGG	2	6	269460	269465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490208
5046	NC_017052	GGC	2	6	269488	269493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490208
5047	NC_017052	TGG	2	6	269504	269509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490208
5048	NC_017052	CCA	3	9	269592	269600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490208
5049	NC_017052	TGT	2	6	269639	269644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490208
5050	NC_017052	ACA	2	6	269699	269704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490208
5051	NC_017052	ATAA	2	8	269714	269721	75 %	25 %	0 %	0 %	383490208
5052	NC_017052	AAT	2	6	269771	269776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490209
5053	NC_017052	AGG	2	6	269913	269918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383490209
5054	NC_017052	GCC	2	6	269969	269974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490209
5055	NC_017052	CAG	2	6	270013	270018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490209
5056	NC_017052	TTC	2	6	270091	270096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490209
5057	NC_017052	GGC	2	6	270121	270126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490209
5058	NC_017052	C	6	6	270139	270144	0 %	0 %	0 %	100 %	383490209
5059	NC_017052	CGG	2	6	270153	270158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490209
5060	NC_017052	CAG	2	6	270307	270312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490209
5061	NC_017052	CGGC	2	8	270324	270331	0 %	0 %	50 %	50 %	383490209
5062	NC_017052	TGG	2	6	270485	270490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490210
5063	NC_017052	TGGC	2	8	270609	270616	0 %	25 %	50 %	25 %	383490210
5064	NC_017052	A	8	8	270629	270636	100 %	0 %	0 %	0 %	383490210
5065	NC_017052	TGG	2	6	270658	270663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490210
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5069	NC_017052	GGC	2	6	270875	270880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490210
5070	NC_017052	CGC	3	9	270896	270904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490210
5071	NC_017052	TCA	2	6	270912	270917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490210
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5073	NC_017052	GTG	2	6	270939	270944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490210
5074	NC_017052	GCA	2	6	271084	271089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490210
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5080	NC_017052	A	6	6	271244	271249	100 %	0 %	0 %	0 %	383490210
5081	NC_017052	GGC	2	6	271350	271355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490210
5082	NC_017052	T	6	6	271494	271499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017052	TACT	2	8	271577	271584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_017052	CGA	2	6	271615	271620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490211
5085	NC_017052	AC	3	6	271625	271630	50 %	0 %	0 %	50 %	383490211
5086	NC_017052	GCAGTG	2	12	271733	271744	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383490211
5087	NC_017052	ATA	2	6	271772	271777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490211
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5089	NC_017052	TGT	2	6	271809	271814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383490211
5090	NC_017052	AGTT	2	8	271835	271842	25 %	50 %	25 %	0 %	383490211
5091	NC_017052	GAA	2	6	271859	271864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490211
5092	NC_017052	GT	3	6	271901	271906	0 %	50 %	50 %	0 %	383490211
5093	NC_017052	T	6	6	271906	271911	0 %	100 %	0 %	0 %	383490211
5094	NC_017052	ATT	2	6	271939	271944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490211
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5098	NC_017052	ACTTT	2	10	272254	272263	20 %	60 %	0 %	20 %	383490211
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5102	NC_017052	TTAA	2	8	272356	272363	50 %	50 %	0 %	0 %	383490211
5103	NC_017052	TCG	2	6	272382	272387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490211
5104	NC_017052	TCA	2	6	272388	272393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490211
5105	NC_017052	T	6	6	272394	272399	0 %	100 %	0 %	0 %	383490211
5106	NC_017052	T	6	6	272433	272438	0 %	100 %	0 %	0 %	383490211
5107	NC_017052	GGTTT	2	10	272439	272448	0 %	60 %	40 %	0 %	383490211
5108	NC_017052	TTCC	2	8	272463	272470	0 %	50 %	0 %	50 %	383490211
5109	NC_017052	CTT	2	6	272526	272531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383490211
5110	NC_017052	CTTT	2	8	272549	272556	0 %	75 %	0 %	25 %	383490211
5111	NC_017052	T	7	7	272559	272565	0 %	100 %	0 %	0 %	383490211
5112	NC_017052	CCAAGG	2	12	272583	272594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490211
5113	NC_017052	CGG	2	6	272648	272653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490211
5114	NC_017052	TAT	2	6	272685	272690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383490211
5115	NC_017052	AAGAA	2	10	272693	272702	80 %	0 %	20 %	0 %	383490211
5116	NC_017052	CAA	2	6	272710	272715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490211
5117	NC_017052	A	6	6	272733	272738	100 %	0 %	0 %	0 %	383490211
5118	NC_017052	GCT	3	9	272776	272784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490211
5119	NC_017052	TAA	2	6	272817	272822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383490211
5120	NC_017052	CGT	2	6	272860	272865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490211
5121	NC_017052	CAA	2	6	272875	272880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490211
5122	NC_017052	GAA	2	6	272887	272892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383490211
5123	NC_017052	TGA	2	6	272930	272935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490211
5124	NC_017052	TGG	2	6	272936	272941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490211
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5131	NC_017052	CA	3	6	273420	273425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_017052	TCCT	2	8	273426	273433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5133	NC_017052	G	6	6	273462	273467	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_017052	A	6	6	273597	273602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5148	NC_017052	ATTT	2	8	274488	274495	25 %	75 %	0 %	0 %	383490213
5149	NC_017052	TTTA	2	8	274505	274512	25 %	75 %	0 %	0 %	383490213
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5247	NC_017052	GGT	2	6	280001	280006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490217
5248	NC_017052	GGC	2	6	280028	280033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490217
5249	NC_017052	TGG	2	6	280075	280080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490217
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5251	NC_017052	CGT	2	6	280167	280172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490218
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5255	NC_017052	GATT	2	8	280385	280392	25 %	50 %	25 %	0 %	383490218
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5298	NC_017052	ATGT	2	8	282826	282833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5299	NC_017052	TC	3	6	282859	282864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5322	NC_017052	CTGAT	2	10	284330	284339	20 %	40 %	20 %	20 %	383490222
5323	NC_017052	A	6	6	284341	284346	100 %	0 %	0 %	0 %	383490222
5324	NC_017052	GCG	2	6	284356	284361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383490222
5325	NC_017052	GTCA	2	8	284455	284462	25 %	25 %	25 %	25 %	383490222
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5331	NC_017052	ATC	2	6	284671	284676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490223
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5334	NC_017052	CCA	2	6	284923	284928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383490223
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5340	NC_017052	CAA	2	6	285225	285230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383490224
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5342	NC_017052	TAAG	2	8	285278	285285	50 %	25 %	25 %	0 %	383490224
5343	NC_017052	CAG	2	6	285378	285383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490224
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5351	NC_017052	AG	3	6	285790	285795	50 %	0 %	50 %	0 %	383490224
5352	NC_017052	GTC	2	6	285854	285859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490224
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5354	NC_017052	A	8	8	286079	286086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_017052	GGA	2	6	286118	286123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5356	NC_017052	TATT	2	8	286135	286142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5357	NC_017052	TTA	2	6	286144	286149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5358	NC_017052	GAT	2	6	286181	286186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383490225
5359	NC_017052	CGC	2	6	286202	286207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490225
5360	NC_017052	TTTTG	2	10	286283	286292	0 %	80 %	20 %	0 %	383490225
5361	NC_017052	T	6	6	286303	286308	0 %	100 %	0 %	0 %	383490225
5362	NC_017052	ACTA	2	8	286311	286318	50 %	25 %	0 %	25 %	383490225
5363	NC_017052	CAG	2	6	286325	286330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383490225
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5367	NC_017052	CCT	2	6	286601	286606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383490225
5368	NC_017052	GCC	2	6	286641	286646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490225
5369	NC_017052	CCG	3	9	286666	286674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490225
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5371	NC_017052	TGC	2	6	286906	286911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383490225
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5492	NC_017052	CCG	2	6	293263	293268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490230
5493	NC_017052	ACCC	2	8	293297	293304	25 %	0 %	0 %	75 %	383490230
5494	NC_017052	CCG	2	6	293307	293312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383490230
5495	NC_017052	TCA	2	6	293319	293324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490230
5496	NC_017052	GTG	2	6	293346	293351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383490230
5497	NC_017052	A	7	7	293435	293441	100 %	0 %	0 %	0 %	383490230
5498	NC_017052	CAAAT	2	10	293480	293489	60 %	20 %	0 %	20 %	383490231
5499	NC_017052	AC	3	6	293505	293510	50 %	0 %	0 %	50 %	383490231
5500	NC_017052	ATC	2	6	293539	293544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383490231

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