MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017046	GGGC	2	8	163692	163699	0 %	0 %	75 %	25 %	383494962
3502	NC_017046	GC	3	6	163720	163725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_017046	ATA	2	6	163727	163732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_017046	CCG	2	6	163802	163807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_017046	CTA	2	6	163913	163918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_017046	A	7	7	163950	163956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017046	GAA	2	6	164065	164070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494963
3508	NC_017046	CTG	2	6	164273	164278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494963
3509	NC_017046	GAA	2	6	164299	164304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494963
3510	NC_017046	A	6	6	164387	164392	100 %	0 %	0 %	0 %	383494963
3511	NC_017046	TCG	2	6	164477	164482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494963
3512	NC_017046	ACG	2	6	164614	164619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494963
3513	NC_017046	CGG	2	6	164654	164659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3514	NC_017046	GGC	2	6	164713	164718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3515	NC_017046	GGC	3	9	164752	164760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3516	NC_017046	GGC	2	6	164779	164784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3517	NC_017046	AG	3	6	164802	164807	50 %	0 %	50 %	0 %	383494963
3518	NC_017046	CGG	2	6	164808	164813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3519	NC_017046	AGA	2	6	164823	164828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494963
3520	NC_017046	CGG	2	6	164892	164897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494963
3521	NC_017046	CG	3	6	164911	164916	0 %	0 %	50 %	50 %	383494963
3522	NC_017046	CAC	2	6	165045	165050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494963
3523	NC_017046	CTGG	2	8	165104	165111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3524	NC_017046	ATCCC	2	10	165132	165141	20 %	20 %	0 %	60 %	383494964
3525	NC_017046	TGA	2	6	165213	165218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494964
3526	NC_017046	GCCAGC	2	12	165257	165268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383494964
3527	NC_017046	GCA	2	6	165300	165305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494964
3528	NC_017046	T	6	6	165377	165382	0 %	100 %	0 %	0 %	383494964
3529	NC_017046	GAA	2	6	165489	165494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494964
3530	NC_017046	AGA	2	6	165590	165595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494964
3531	NC_017046	CGCTGC	2	12	165596	165607	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383494964
3532	NC_017046	AAT	2	6	165712	165717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494964
3533	NC_017046	AGA	2	6	165728	165733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494964
3534	NC_017046	GGC	2	6	165763	165768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494964
3535	NC_017046	GCA	2	6	165789	165794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494964
3536	NC_017046	GGC	2	6	165811	165816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494964
3537	NC_017046	AAT	2	6	165826	165831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494964
3538	NC_017046	AGCGC	2	10	165840	165849	20 %	0 %	40 %	40 %	383494964
3539	NC_017046	AGC	2	6	165906	165911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494964
3540	NC_017046	ATC	2	6	165947	165952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494964
3541	NC_017046	GCG	2	6	165963	165968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494964
3542	NC_017046	ATGA	2	8	166117	166124	50 %	25 %	25 %	0 %	383494964
3543	NC_017046	TGA	2	6	166136	166141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494964
3544	NC_017046	CTT	2	6	166161	166166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383494964
3545	NC_017046	GCG	2	6	166175	166180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494964
3546	NC_017046	TGA	2	6	166233	166238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494964
3547	NC_017046	TGCC	2	8	166562	166569	0 %	25 %	25 %	50 %	383494965
3548	NC_017046	CAC	2	6	166607	166612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494965
3549	NC_017046	ACC	2	6	166671	166676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494965
3550	NC_017046	ATC	2	6	166695	166700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494965
3551	NC_017046	TGC	2	6	166719	166724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494965
3552	NC_017046	TGG	2	6	166744	166749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494965
3553	NC_017046	GCC	2	6	166791	166796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494965
3554	NC_017046	ATG	3	9	166842	166850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494965
3555	NC_017046	GC	4	8	166870	166877	0 %	0 %	50 %	50 %	383494965
3556	NC_017046	GGAT	2	8	166908	166915	25 %	25 %	50 %	0 %	383494965
3557	NC_017046	GC	3	6	167002	167007	0 %	0 %	50 %	50 %	383494965
3558	NC_017046	CAA	2	6	167153	167158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494965
3559	NC_017046	GAC	2	6	167165	167170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494965
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3561	NC_017046	CGCC	2	8	167221	167228	0 %	0 %	25 %	75 %	383494965
3562	NC_017046	GAA	2	6	167350	167355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494965
3563	NC_017046	GAT	2	6	167521	167526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494965
3564	NC_017046	CA	3	6	167550	167555	50 %	0 %	0 %	50 %	383494965
3565	NC_017046	ACC	2	6	167619	167624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494965
3566	NC_017046	TGA	2	6	167667	167672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494965
3567	NC_017046	TGAGC	2	10	167689	167698	20 %	20 %	40 %	20 %	383494965
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3570	NC_017046	GGCG	2	8	167825	167832	0 %	0 %	75 %	25 %	383494966
3571	NC_017046	ATG	2	6	167835	167840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494966
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3573	NC_017046	TGA	2	6	167920	167925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494966
3574	NC_017046	CGCAT	2	10	167951	167960	20 %	20 %	20 %	40 %	383494966
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3576	NC_017046	GAT	2	6	168098	168103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383494966
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3578	NC_017046	AAT	2	6	168307	168312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_017046	GA	3	6	168392	168397	50 %	0 %	50 %	0 %	383494967
3580	NC_017046	GC	4	8	168402	168409	0 %	0 %	50 %	50 %	383494967
3581	NC_017046	GC	3	6	168423	168428	0 %	0 %	50 %	50 %	383494967
3582	NC_017046	ATA	2	6	168572	168577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494967
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3584	NC_017046	ATA	2	6	168698	168703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383494967
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3588	NC_017046	GCG	2	6	168859	168864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494967
3589	NC_017046	GTTCA	2	10	168946	168955	20 %	40 %	20 %	20 %	383494967
3590	NC_017046	TTGG	2	8	168964	168971	0 %	50 %	50 %	0 %	383494967
3591	NC_017046	CAT	2	6	169014	169019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494967
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3593	NC_017046	CGG	2	6	169191	169196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494967
3594	NC_017046	GTCG	2	8	169236	169243	0 %	25 %	50 %	25 %	383494967
3595	NC_017046	GGC	2	6	169262	169267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383494967
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3597	NC_017046	CAC	2	6	169334	169339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_017046	GTTG	2	8	169373	169380	0 %	50 %	50 %	0 %	383494968
3599	NC_017046	TGG	2	6	169448	169453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383494968
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3601	NC_017046	C	6	6	169471	169476	0 %	0 %	0 %	100 %	383494968
3602	NC_017046	ATT	2	6	169506	169511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383494968
3603	NC_017046	T	7	7	169542	169548	0 %	100 %	0 %	0 %	383494968
3604	NC_017046	TCG	2	6	169590	169595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494968
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3606	NC_017046	CAG	2	6	169747	169752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494968
3607	NC_017046	GCC	2	6	169756	169761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383494968
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3610	NC_017046	ATGAC	2	10	169912	169921	40 %	20 %	20 %	20 %	383494968
3611	NC_017046	ATC	2	6	169990	169995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383494969
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3988	NC_017046	AGA	2	6	185857	185862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3989	NC_017046	TGC	2	6	185887	185892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3990	NC_017046	GCT	2	6	185947	185952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
3991	NC_017046	GAA	3	9	185972	185980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383494981
3992	NC_017046	TCC	2	6	186010	186015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383494981
3993	NC_017046	GCT	2	6	186056	186061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
3994	NC_017046	ACC	2	6	186077	186082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383494981
3995	NC_017046	CTG	2	6	186116	186121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
3996	NC_017046	ACA	2	6	186141	186146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383494981
3997	NC_017046	TGAT	2	8	186156	186163	25 %	50 %	25 %	0 %	383494981
3998	NC_017046	TGC	2	6	186193	186198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
3999	NC_017046	CTG	2	6	186218	186223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383494981
4000	NC_017046	ACG	2	6	186240	186245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383494981

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