MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_017046	CGC	2	6	861335	861340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495579
18503	NC_017046	CAA	2	6	861468	861473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495579
18504	NC_017046	CGCC	2	8	861495	861502	0 %	0 %	25 %	75 %	383495579
18505	NC_017046	GC	3	6	861522	861527	0 %	0 %	50 %	50 %	383495579
18506	NC_017046	TTAACG	2	12	861534	861545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383495579
18507	NC_017046	CTG	2	6	861576	861581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495579
18508	NC_017046	TGC	2	6	861586	861591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495579
18509	NC_017046	GCG	3	9	861619	861627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495580
18510	NC_017046	GGCCG	2	10	861631	861640	0 %	0 %	60 %	40 %	383495580
18511	NC_017046	GCA	2	6	861669	861674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495580
18512	NC_017046	GCT	2	6	861690	861695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495580
18513	NC_017046	GCC	2	6	861710	861715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495580
18514	NC_017046	GT	3	6	861725	861730	0 %	50 %	50 %	0 %	383495580
18515	NC_017046	TGC	2	6	861818	861823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495580
18516	NC_017046	GGC	2	6	861843	861848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495580
18517	NC_017046	CCTGG	2	10	861906	861915	0 %	20 %	40 %	40 %	383495580
18518	NC_017046	GTG	2	6	861933	861938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495580
18519	NC_017046	CGG	2	6	861987	861992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495580
18520	NC_017046	GTG	2	6	861994	861999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495580
18521	NC_017046	ACC	2	6	862006	862011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495580
18522	NC_017046	GGCG	2	8	862124	862131	0 %	0 %	75 %	25 %	383495580
18523	NC_017046	TACTGA	2	12	862366	862377	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383495581
18524	NC_017046	CAG	2	6	862525	862530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495581
18525	NC_017046	CGA	2	6	862603	862608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495581
18526	NC_017046	CGG	2	6	862626	862631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495581
18527	NC_017046	GCAG	2	8	862663	862670	25 %	0 %	50 %	25 %	383495581
18528	NC_017046	GCGG	2	8	862691	862698	0 %	0 %	75 %	25 %	383495581
18529	NC_017046	CT	3	6	862712	862717	0 %	50 %	0 %	50 %	383495581
18530	NC_017046	AGC	2	6	862752	862757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495581
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18532	NC_017046	GGAT	2	8	862853	862860	25 %	25 %	50 %	0 %	383495581
18533	NC_017046	GCC	2	6	862876	862881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495581
18534	NC_017046	GC	3	6	862884	862889	0 %	0 %	50 %	50 %	383495581
18535	NC_017046	CGC	2	6	862916	862921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495581
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18537	NC_017046	GACAG	2	10	862984	862993	40 %	0 %	40 %	20 %	383495581
18538	NC_017046	CTT	2	6	863044	863049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_017046	CTG	2	6	863066	863071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18540	NC_017046	T	6	6	863072	863077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18541	NC_017046	AAT	2	6	863160	863165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18542	NC_017046	T	9	9	863185	863193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18543	NC_017046	GGC	2	6	863230	863235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18544	NC_017046	TA	3	6	863390	863395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18545	NC_017046	AAGG	2	8	863411	863418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18546	NC_017046	TCA	2	6	863441	863446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18547	NC_017046	A	6	6	863465	863470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_017046	CTG	2	6	863498	863503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18549	NC_017046	T	6	6	863589	863594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_017046	T	6	6	863604	863609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_017046	CGT	2	6	863740	863745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495582
18552	NC_017046	GGA	2	6	863760	863765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383495582
18553	NC_017046	GGC	2	6	863883	863888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495582
18554	NC_017046	CTA	2	6	863949	863954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495582
18555	NC_017046	ACT	2	6	863957	863962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495582
18556	NC_017046	GTG	3	9	864085	864093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495582
18557	NC_017046	ATG	2	6	864145	864150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495582
18558	NC_017046	GC	3	6	864183	864188	0 %	0 %	50 %	50 %	383495582
18559	NC_017046	GCG	2	6	864263	864268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495582
18560	NC_017046	GAC	2	6	864298	864303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495582
18561	NC_017046	TGA	2	6	864327	864332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495582
18562	NC_017046	CTAT	2	8	864401	864408	25 %	50 %	0 %	25 %	383495582
18563	NC_017046	CGC	2	6	864428	864433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495582
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18565	NC_017046	GCT	2	6	864513	864518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495582
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18570	NC_017046	CCG	2	6	864665	864670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495582
18571	NC_017046	CTG	2	6	864676	864681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495582
18572	NC_017046	TGA	2	6	864687	864692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495582
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18574	NC_017046	GAG	2	6	864814	864819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383495582
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18576	NC_017046	TGA	2	6	864891	864896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495582
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18579	NC_017046	GCT	2	6	864927	864932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495582
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18585	NC_017046	CTG	2	6	865189	865194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495582
18586	NC_017046	TGG	2	6	865226	865231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495582
18587	NC_017046	GC	3	6	865296	865301	0 %	0 %	50 %	50 %	383495582
18588	NC_017046	AGC	2	6	865397	865402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495582
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18590	NC_017046	GCA	2	6	865572	865577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495582
18591	NC_017046	ATG	2	6	865603	865608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495582
18592	NC_017046	GAA	2	6	865633	865638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495582
18593	NC_017046	GTT	2	6	865677	865682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495582
18594	NC_017046	AGTC	2	8	865773	865780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18595	NC_017046	GAA	2	6	865867	865872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_017046	CT	3	6	865909	865914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18597	NC_017046	A	8	8	865926	865933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_017046	TAT	2	6	865941	865946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_017046	CAT	2	6	866021	866026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18600	NC_017046	A	6	6	866034	866039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18601	NC_017046	GAC	2	6	866108	866113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18603	NC_017046	AATAA	2	10	866281	866290	80 %	20 %	0 %	0 %	383495583
18604	NC_017046	AGA	2	6	866373	866378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495583
18605	NC_017046	ATA	2	6	866432	866437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495583
18606	NC_017046	TAG	2	6	866445	866450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495583
18607	NC_017046	AGG	2	6	866451	866456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383495583
18608	NC_017046	GAGG	2	8	866536	866543	25 %	0 %	75 %	0 %	383495583
18609	NC_017046	AGTC	2	8	866549	866556	25 %	25 %	25 %	25 %	383495583
18610	NC_017046	GCA	2	6	866671	866676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495583
18611	NC_017046	GAA	2	6	866683	866688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495583
18612	NC_017046	ATA	2	6	866720	866725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495583
18613	NC_017046	ACT	2	6	866791	866796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495583
18614	NC_017046	ATA	2	6	866999	867004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495583
18615	NC_017046	GCC	2	6	867156	867161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495583
18616	NC_017046	ACC	2	6	867219	867224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495583
18617	NC_017046	GTAA	2	8	867244	867251	50 %	25 %	25 %	0 %	383495583
18618	NC_017046	TCC	2	6	867282	867287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495583
18619	NC_017046	AAC	2	6	867294	867299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495583
18620	NC_017046	CGG	2	6	867347	867352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495583
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18991	NC_017046	GATT	2	8	884626	884633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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