MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017046	CGC	2	6	838427	838432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495557
18002	NC_017046	GTT	2	6	838440	838445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495557
18003	NC_017046	GCT	2	6	838448	838453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495557
18004	NC_017046	CGC	2	6	838469	838474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495557
18005	NC_017046	CTG	2	6	838491	838496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495557
18006	NC_017046	CGG	2	6	838556	838561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495557
18007	NC_017046	GTACG	2	10	838571	838580	20 %	20 %	40 %	20 %	383495557
18008	NC_017046	TCG	2	6	838582	838587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495557
18009	NC_017046	CG	3	6	838586	838591	0 %	0 %	50 %	50 %	383495557
18010	NC_017046	CAT	2	6	838643	838648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495557
18011	NC_017046	GC	4	8	838736	838743	0 %	0 %	50 %	50 %	383495557
18012	NC_017046	CG	3	6	838802	838807	0 %	0 %	50 %	50 %	383495558
18013	NC_017046	ACGG	2	8	838883	838890	25 %	0 %	50 %	25 %	383495558
18014	NC_017046	GCA	2	6	838900	838905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495558
18015	NC_017046	GCG	2	6	838906	838911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495558
18016	NC_017046	GTGC	2	8	838921	838928	0 %	25 %	50 %	25 %	383495558
18017	NC_017046	TTC	2	6	838946	838951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495558
18018	NC_017046	GC	3	6	838963	838968	0 %	0 %	50 %	50 %	383495558
18019	NC_017046	GGAA	2	8	838990	838997	50 %	0 %	50 %	0 %	383495558
18020	NC_017046	CGCCAG	2	12	839039	839050	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383495558
18021	NC_017046	AG	3	6	839049	839054	50 %	0 %	50 %	0 %	383495558
18022	NC_017046	GCT	2	6	839059	839064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495558
18023	NC_017046	CGC	2	6	839129	839134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495558
18024	NC_017046	CAC	2	6	839144	839149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495558
18025	NC_017046	GCCA	2	8	839151	839158	25 %	0 %	25 %	50 %	383495558
18026	NC_017046	CCA	2	6	839215	839220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495558
18027	NC_017046	GCT	2	6	839233	839238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495558
18028	NC_017046	ATGCGG	2	12	839315	839326	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383495558
18029	NC_017046	CGC	2	6	839342	839347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495558
18030	NC_017046	CGG	2	6	839395	839400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495558
18031	NC_017046	CG	4	8	839503	839510	0 %	0 %	50 %	50 %	383495558
18032	NC_017046	CA	3	6	839647	839652	50 %	0 %	0 %	50 %	383495558
18033	NC_017046	GCA	2	6	839677	839682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495558
18034	NC_017046	GCG	2	6	839734	839739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495558
18035	NC_017046	GAT	2	6	839785	839790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495558
18036	NC_017046	AAC	2	6	839813	839818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_017046	TGCCAG	2	12	839854	839865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383495559
18038	NC_017046	CGCGG	2	10	839963	839972	0 %	0 %	60 %	40 %	383495559
18039	NC_017046	TAAT	2	8	839983	839990	50 %	50 %	0 %	0 %	383495559
18040	NC_017046	ACG	2	6	840106	840111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495559
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18042	NC_017046	GCGA	2	8	840193	840200	25 %	0 %	50 %	25 %	383495559
18043	NC_017046	CGA	2	6	840205	840210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495559
18044	NC_017046	TCT	2	6	840265	840270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495559
18045	NC_017046	GC	3	6	840290	840295	0 %	0 %	50 %	50 %	383495559
18046	NC_017046	GCA	2	6	840314	840319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495559
18047	NC_017046	ACTCC	2	10	840327	840336	20 %	20 %	0 %	60 %	383495559
18048	NC_017046	GCG	2	6	840404	840409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495559
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18050	NC_017046	GTT	2	6	840540	840545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495559
18051	NC_017046	GCA	2	6	840716	840721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495559
18052	NC_017046	GAC	2	6	840756	840761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495559
18053	NC_017046	GCA	2	6	840776	840781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495559
18054	NC_017046	ACC	2	6	840816	840821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18055	NC_017046	TATGG	2	10	840858	840867	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_017046	TAA	2	6	840908	840913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18057	NC_017046	AC	3	6	840930	840935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18058	NC_017046	ATC	2	6	840975	840980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18059	NC_017046	A	7	7	841011	841017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_017046	ACGG	2	8	841043	841050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18061	NC_017046	T	6	6	841068	841073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18062	NC_017046	CGA	2	6	841109	841114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18063	NC_017046	AGCA	2	8	841164	841171	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18064	NC_017046	GCG	2	6	841207	841212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18065	NC_017046	AGCGT	2	10	841254	841263	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18066	NC_017046	CAG	2	6	841374	841379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18067	NC_017046	TTCA	2	8	841404	841411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18068	NC_017046	GGC	2	6	841440	841445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18069	NC_017046	GAT	2	6	841460	841465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_017046	GTAG	2	8	841476	841483	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_017046	AAT	2	6	841500	841505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18072	NC_017046	CTT	2	6	841547	841552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_017046	T	6	6	841597	841602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_017046	CAT	3	9	841604	841612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18077	NC_017046	CATT	2	8	841655	841662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18078	NC_017046	A	6	6	841685	841690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18079	NC_017046	CCG	2	6	841731	841736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18080	NC_017046	CTT	2	6	841737	841742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18081	NC_017046	CGG	2	6	841821	841826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_017046	CTG	2	6	841907	841912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_017046	AAAAT	2	10	841917	841926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_017046	TAT	2	6	841945	841950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_017046	CAT	2	6	841998	842003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18086	NC_017046	ATT	2	6	842020	842025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18087	NC_017046	TTA	3	9	842075	842083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_017046	TAA	2	6	842088	842093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_017046	GC	3	6	842115	842120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18090	NC_017046	ATA	2	6	842133	842138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_017046	ATT	2	6	842145	842150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495562
18092	NC_017046	CAGG	2	8	842215	842222	25 %	0 %	50 %	25 %	383495562
18093	NC_017046	ATG	2	6	842235	842240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495562
18094	NC_017046	CAG	2	6	842250	842255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495562
18095	NC_017046	TC	3	6	842261	842266	0 %	50 %	0 %	50 %	383495562
18096	NC_017046	GC	4	8	842372	842379	0 %	0 %	50 %	50 %	383495562
18097	NC_017046	GCT	2	6	842396	842401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495562
18098	NC_017046	GA	3	6	842410	842415	50 %	0 %	50 %	0 %	383495562
18099	NC_017046	CCG	2	6	842432	842437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495562
18100	NC_017046	GA	3	6	842536	842541	50 %	0 %	50 %	0 %	383495562
18101	NC_017046	CTG	3	9	842587	842595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495562
18102	NC_017046	T	6	6	842610	842615	0 %	100 %	0 %	0 %	383495562
18103	NC_017046	CGC	2	6	842633	842638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495562
18104	NC_017046	CGC	3	9	842644	842652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495562
18105	NC_017046	GAT	2	6	842687	842692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495562
18106	NC_017046	TAA	2	6	842699	842704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495562
18107	NC_017046	CGA	2	6	842741	842746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495562
18108	NC_017046	GTG	2	6	842784	842789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495562
18109	NC_017046	ACT	2	6	842815	842820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495562
18110	NC_017046	GGCG	2	8	842864	842871	0 %	0 %	75 %	25 %	383495562
18111	NC_017046	CGCT	2	8	842911	842918	0 %	25 %	25 %	50 %	383495562
18112	NC_017046	CAAC	2	8	842933	842940	50 %	0 %	0 %	50 %	383495562
18113	NC_017046	GCA	2	6	842948	842953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495562
18114	NC_017046	CCG	2	6	842957	842962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495562
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18116	NC_017046	GTT	2	6	843098	843103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495562
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18118	NC_017046	CAG	2	6	843180	843185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495562
18119	NC_017046	CTG	2	6	843252	843257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495562
18120	NC_017046	CAT	2	6	843290	843295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495562
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18122	NC_017046	TTA	2	6	843358	843363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495562
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18124	NC_017046	CGCC	2	8	843464	843471	0 %	0 %	25 %	75 %	383495562
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18243	NC_017046	CAT	2	6	849312	849317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495569
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18245	NC_017046	TCA	2	6	849453	849458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18247	NC_017046	GCC	2	6	849511	849516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18248	NC_017046	CTG	2	6	849521	849526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18250	NC_017046	ACT	2	6	849582	849587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495570
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18275	NC_017046	AG	3	6	851070	851075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18488	NC_017046	GC	3	6	861001	861006	0 %	0 %	50 %	50 %	383495579
18489	NC_017046	CAT	2	6	861039	861044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495579
18490	NC_017046	GTTG	2	8	861053	861060	0 %	50 %	50 %	0 %	383495579
18491	NC_017046	ATG	2	6	861061	861066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495579
18492	NC_017046	GGGGC	2	10	861095	861104	0 %	0 %	80 %	20 %	383495579
18493	NC_017046	CTG	2	6	861107	861112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495579
18494	NC_017046	G	6	6	861118	861123	0 %	0 %	100 %	0 %	383495579
18495	NC_017046	TGG	2	6	861139	861144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495579
18496	NC_017046	GCG	2	6	861172	861177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495579
18497	NC_017046	TGCTC	2	10	861184	861193	0 %	40 %	20 %	40 %	383495579
18498	NC_017046	CTG	2	6	861213	861218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495579
18499	NC_017046	GCC	2	6	861254	861259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495579
18500	NC_017046	CAGGCG	2	12	861264	861275	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383495579

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