MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017046	CCA	2	6	702246	702251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495440
15003	NC_017046	TGA	2	6	702281	702286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495440
15004	NC_017046	CG	3	6	702357	702362	0 %	0 %	50 %	50 %	383495440
15005	NC_017046	AGC	2	6	702391	702396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495440
15006	NC_017046	AAT	2	6	702401	702406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495440
15007	NC_017046	CGC	2	6	702473	702478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495440
15008	NC_017046	CCG	2	6	702503	702508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495440
15009	NC_017046	CG	3	6	702507	702512	0 %	0 %	50 %	50 %	383495440
15010	NC_017046	CTGC	2	8	702514	702521	0 %	25 %	25 %	50 %	383495440
15011	NC_017046	CAG	2	6	702522	702527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495440
15012	NC_017046	CTG	2	6	702540	702545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495440
15013	NC_017046	GCG	2	6	702587	702592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495440
15014	NC_017046	GTT	2	6	702627	702632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495440
15015	NC_017046	TAG	2	6	702679	702684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495440
15016	NC_017046	GGC	2	6	702717	702722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495440
15017	NC_017046	GTTT	2	8	702734	702741	0 %	75 %	25 %	0 %	383495440
15018	NC_017046	ATA	2	6	702822	702827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495440
15019	NC_017046	GCG	2	6	702828	702833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495440
15020	NC_017046	GC	3	6	702885	702890	0 %	0 %	50 %	50 %	383495440
15021	NC_017046	GTTT	2	8	702909	702916	0 %	75 %	25 %	0 %	383495440
15022	NC_017046	GC	3	6	702949	702954	0 %	0 %	50 %	50 %	383495440
15023	NC_017046	T	6	6	702957	702962	0 %	100 %	0 %	0 %	383495440
15024	NC_017046	GGC	2	6	702966	702971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495440
15025	NC_017046	TCG	3	9	702976	702984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495440
15026	NC_017046	CAT	2	6	703047	703052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495440
15027	NC_017046	GATA	2	8	703061	703068	50 %	25 %	25 %	0 %	383495440
15028	NC_017046	TTCG	2	8	703152	703159	0 %	50 %	25 %	25 %	383495440
15029	NC_017046	CAG	2	6	703227	703232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495440
15030	NC_017046	GCT	2	6	703322	703327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_017046	TCT	2	6	703331	703336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15032	NC_017046	TCAC	2	8	703350	703357	25 %	25 %	0 %	50 %	383495441
15033	NC_017046	TGGT	2	8	703369	703376	0 %	50 %	50 %	0 %	383495441
15034	NC_017046	GCC	2	6	703506	703511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495441
15035	NC_017046	GCG	2	6	703571	703576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495441
15036	NC_017046	CGG	3	9	703625	703633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495441
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15040	NC_017046	CGA	2	6	703898	703903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495442
15041	NC_017046	GCA	2	6	703943	703948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495442
15042	NC_017046	CG	4	8	703956	703963	0 %	0 %	50 %	50 %	383495442
15043	NC_017046	CAC	2	6	703971	703976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495442
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15047	NC_017046	AAT	2	6	704155	704160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_017046	A	6	6	704177	704182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_017046	CGG	2	6	704231	704236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15050	NC_017046	GTA	2	6	704245	704250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_017046	GCG	2	6	704262	704267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15052	NC_017046	ATC	2	6	704311	704316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_017046	A	6	6	704382	704387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_017046	GCG	2	6	704442	704447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_017046	A	6	6	704450	704455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_017046	TCA	2	6	704464	704469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495443
15057	NC_017046	GCC	2	6	704475	704480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495443
15058	NC_017046	GGC	2	6	704578	704583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495443
15059	NC_017046	CAG	2	6	704641	704646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495443
15060	NC_017046	GGC	2	6	704761	704766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495443
15061	NC_017046	GC	5	10	704899	704908	0 %	0 %	50 %	50 %	383495443
15062	NC_017046	T	7	7	705133	705139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_017046	T	6	6	705153	705158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_017046	GC	3	6	705188	705193	0 %	0 %	50 %	50 %	383495444
15065	NC_017046	CG	3	6	705301	705306	0 %	0 %	50 %	50 %	383495444
15066	NC_017046	ATT	2	6	705350	705355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495444
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15070	NC_017046	TGGC	2	8	705564	705571	0 %	25 %	50 %	25 %	383495444
15071	NC_017046	TAA	2	6	705636	705641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495444
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15073	NC_017046	TTA	2	6	705670	705675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495444
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15084	NC_017046	CTG	2	6	706256	706261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495444
15085	NC_017046	TCG	2	6	706296	706301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495445
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15093	NC_017046	GC	3	6	706720	706725	0 %	0 %	50 %	50 %	383495445
15094	NC_017046	GCG	2	6	706750	706755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495445
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15098	NC_017046	GC	3	6	707102	707107	0 %	0 %	50 %	50 %	383495446
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15109	NC_017046	GTC	2	6	707595	707600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495446
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15112	NC_017046	TCAT	2	8	707632	707639	25 %	50 %	0 %	25 %	383495446
15113	NC_017046	GCA	2	6	707669	707674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495446
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15486	NC_017046	CTT	2	6	724160	724165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495458
15487	NC_017046	GGCT	2	8	724231	724238	0 %	25 %	50 %	25 %	383495458
15488	NC_017046	GGCC	2	8	724258	724265	0 %	0 %	50 %	50 %	383495458
15489	NC_017046	GCG	3	9	724273	724281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495458
15490	NC_017046	TCAT	2	8	724324	724331	25 %	50 %	0 %	25 %	383495458
15491	NC_017046	CT	3	6	724351	724356	0 %	50 %	0 %	50 %	383495458
15492	NC_017046	ATA	2	6	724368	724373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495458
15493	NC_017046	CTGGC	2	10	724407	724416	0 %	20 %	40 %	40 %	383495458
15494	NC_017046	A	6	6	724420	724425	100 %	0 %	0 %	0 %	383495458
15495	NC_017046	GTT	2	6	724493	724498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495458
15496	NC_017046	A	6	6	724519	724524	100 %	0 %	0 %	0 %	383495458
15497	NC_017046	TCC	2	6	724558	724563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495458
15498	NC_017046	GCG	2	6	724598	724603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495458
15499	NC_017046	TCA	3	9	724684	724692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495458
15500	NC_017046	GCG	2	6	724760	724765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495458

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