MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017046	TGAT	2	8	612838	612845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_017046	GGC	2	6	612858	612863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13003	NC_017046	CTTCA	2	10	613029	613038	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13004	NC_017046	GC	3	6	613112	613117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13005	NC_017046	CTT	2	6	613141	613146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_017046	TCC	2	6	613151	613156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13007	NC_017046	CAT	2	6	613185	613190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_017046	GTC	2	6	613201	613206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_017046	CAC	2	6	613264	613269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13010	NC_017046	TGA	2	6	613296	613301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_017046	GCTC	2	8	613333	613340	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13012	NC_017046	TC	3	6	613407	613412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13013	NC_017046	ACG	2	6	613496	613501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_017046	TCAT	2	8	613610	613617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13015	NC_017046	T	8	8	613649	613656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_017046	CGG	2	6	613701	613706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_017046	ATC	2	6	613718	613723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_017046	TGG	2	6	613746	613751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_017046	CTT	2	6	613768	613773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_017046	GTA	2	6	613796	613801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_017046	GCG	2	6	613817	613822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_017046	CT	3	6	613909	613914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13023	NC_017046	TGG	2	6	614057	614062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_017046	T	6	6	614158	614163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_017046	CTT	2	6	614185	614190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_017046	CGC	2	6	614240	614245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_017046	TGG	2	6	614257	614262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_017046	ATTA	2	8	614271	614278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_017046	ATT	2	6	614296	614301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495359
13030	NC_017046	CGCC	2	8	614394	614401	0 %	0 %	25 %	75 %	383495359
13031	NC_017046	TCT	2	6	614432	614437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495359
13032	NC_017046	TCA	2	6	614503	614508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495359
13033	NC_017046	CAG	2	6	614516	614521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495359
13034	NC_017046	TTA	2	6	614527	614532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495359
13035	NC_017046	TA	3	6	614573	614578	50 %	50 %	0 %	0 %	383495359
13036	NC_017046	TA	3	6	614592	614597	50 %	50 %	0 %	0 %	383495359
13037	NC_017046	GTT	2	6	614601	614606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495359
13038	NC_017046	GTA	2	6	614697	614702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495359
13039	NC_017046	TGCA	2	8	614745	614752	25 %	25 %	25 %	25 %	383495359
13040	NC_017046	TAA	2	6	614767	614772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495359
13041	NC_017046	TTGT	2	8	614793	614800	0 %	75 %	25 %	0 %	383495359
13042	NC_017046	TAT	2	6	614817	614822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495359
13043	NC_017046	TTC	2	6	614823	614828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495359
13044	NC_017046	GTTT	2	8	614839	614846	0 %	75 %	25 %	0 %	383495359
13045	NC_017046	TGA	2	6	614862	614867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495359
13046	NC_017046	ATG	2	6	614882	614887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495359
13047	NC_017046	A	6	6	614899	614904	100 %	0 %	0 %	0 %	383495359
13048	NC_017046	GTA	2	6	614917	614922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495359
13049	NC_017046	ATAA	2	8	614927	614934	75 %	25 %	0 %	0 %	383495359
13050	NC_017046	CAA	2	6	614972	614977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495359
13051	NC_017046	CTG	2	6	615022	615027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495359
13052	NC_017046	GCA	2	6	615061	615066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495359
13053	NC_017046	TGC	2	6	615107	615112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495359
13054	NC_017046	TAG	2	6	615141	615146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495359
13055	NC_017046	TAT	2	6	615147	615152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495359
13056	NC_017046	TTGTA	2	10	615252	615261	20 %	60 %	20 %	0 %	383495359
13057	NC_017046	CAG	2	6	615288	615293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495359
13058	NC_017046	ATTT	2	8	615341	615348	25 %	75 %	0 %	0 %	383495359
13059	NC_017046	GAT	2	6	615430	615435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495359
13060	NC_017046	T	6	6	615465	615470	0 %	100 %	0 %	0 %	383495359
13061	NC_017046	AT	3	6	615483	615488	50 %	50 %	0 %	0 %	383495359
13062	NC_017046	TA	3	6	615498	615503	50 %	50 %	0 %	0 %	383495359
13063	NC_017046	CAA	2	6	615545	615550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495359
13064	NC_017046	AGTT	2	8	615557	615564	25 %	50 %	25 %	0 %	383495359
13065	NC_017046	ATC	2	6	615610	615615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495359
13066	NC_017046	GAC	2	6	615631	615636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495359
13067	NC_017046	GCT	2	6	615688	615693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495359
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13070	NC_017046	TCT	2	6	615933	615938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495360
13071	NC_017046	T	8	8	615963	615970	0 %	100 %	0 %	0 %	383495360
13072	NC_017046	AT	3	6	615992	615997	50 %	50 %	0 %	0 %	383495360
13073	NC_017046	AAG	2	6	616054	616059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495360
13074	NC_017046	ATT	2	6	616078	616083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495360
13075	NC_017046	AAT	2	6	616102	616107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495360
13076	NC_017046	GCGGA	2	10	616168	616177	20 %	0 %	60 %	20 %	383495360
13077	NC_017046	AAG	2	6	616188	616193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495360
13078	NC_017046	TTCC	2	8	616197	616204	0 %	50 %	0 %	50 %	383495360
13079	NC_017046	GCC	2	6	616291	616296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495360
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13081	NC_017046	ATT	2	6	616697	616702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495360
13082	NC_017046	TGA	2	6	616731	616736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495360
13083	NC_017046	CTT	2	6	616809	616814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495360
13084	NC_017046	GGC	2	6	616933	616938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495361
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13086	NC_017046	CAT	2	6	617001	617006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495361
13087	NC_017046	GTG	3	9	617017	617025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495361
13088	NC_017046	GC	3	6	617043	617048	0 %	0 %	50 %	50 %	383495361
13089	NC_017046	AC	3	6	617126	617131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13090	NC_017046	CGAT	2	8	617174	617181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13091	NC_017046	AAT	2	6	617279	617284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_017046	TTA	2	6	617317	617322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_017046	GTT	2	6	617330	617335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_017046	AGT	2	6	617364	617369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_017046	AC	3	6	617386	617391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13096	NC_017046	GTA	2	6	617453	617458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_017046	TTG	2	6	617469	617474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_017046	GC	3	6	617534	617539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13099	NC_017046	GCG	3	9	617579	617587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_017046	CTC	2	6	617657	617662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13101	NC_017046	ATT	2	6	617693	617698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_017046	GTC	2	6	617732	617737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_017046	TCA	2	6	617833	617838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_017046	A	7	7	617906	617912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_017046	TAA	2	6	617964	617969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_017046	ATA	2	6	617975	617980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_017046	GTT	2	6	617986	617991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_017046	ATT	2	6	618030	618035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_017046	GGGA	2	8	618215	618222	25 %	0 %	75 %	0 %	383495362
13110	NC_017046	CAA	2	6	618290	618295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383495362
13111	NC_017046	GTC	2	6	618309	618314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495362
13112	NC_017046	CTT	2	6	618317	618322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495362
13113	NC_017046	CGG	2	6	618348	618353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495362
13114	NC_017046	AG	3	6	618372	618377	50 %	0 %	50 %	0 %	383495362
13115	NC_017046	GCA	2	6	618398	618403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495362
13116	NC_017046	CAG	2	6	618424	618429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_017046	TGA	2	6	618595	618600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_017046	TCA	2	6	618631	618636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_017046	TCG	2	6	618674	618679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_017046	GCG	2	6	618709	618714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_017046	GC	3	6	618754	618759	0 %	0 %	50 %	50 %	383495363
13122	NC_017046	AGA	2	6	618821	618826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495363
13123	NC_017046	TCGC	2	8	618828	618835	0 %	25 %	25 %	50 %	383495363
13124	NC_017046	ATCACC	2	12	618855	618866	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383495363
13125	NC_017046	GCA	2	6	618868	618873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495363
13126	NC_017046	GCG	2	6	618894	618899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495363
13127	NC_017046	GTT	2	6	618915	618920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495363
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13130	NC_017046	CTG	2	6	619202	619207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495363
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13132	NC_017046	GCG	3	9	619252	619260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495363
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13138	NC_017046	ACC	2	6	619700	619705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13140	NC_017046	T	6	6	619753	619758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13141	NC_017046	TTAT	2	8	619763	619770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13142	NC_017046	AGA	2	6	619808	619813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495364
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13155	NC_017046	CTG	2	6	620548	620553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495364
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13173	NC_017046	TAT	2	6	621254	621259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13219	NC_017046	A	6	6	623431	623436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13220	NC_017046	GC	3	6	623530	623535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13221	NC_017046	CTTTT	2	10	623539	623548	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13222	NC_017046	T	7	7	623565	623571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13223	NC_017046	TAACGT	2	12	623578	623589	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13229	NC_017046	T	6	6	624119	624124	0 %	100 %	0 %	0 %	383495368
13230	NC_017046	GCT	2	6	624238	624243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495368
13231	NC_017046	CGG	2	6	624256	624261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495368
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13234	NC_017046	GC	3	6	624398	624403	0 %	0 %	50 %	50 %	383495368
13235	NC_017046	A	6	6	624411	624416	100 %	0 %	0 %	0 %	383495368
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13240	NC_017046	TGG	2	6	624567	624572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495368
13241	NC_017046	GTCGC	2	10	624599	624608	0 %	20 %	40 %	40 %	383495368
13242	NC_017046	GCG	2	6	624624	624629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495368
13243	NC_017046	TGG	2	6	624756	624761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495368
13244	NC_017046	CG	3	6	624872	624877	0 %	0 %	50 %	50 %	383495368
13245	NC_017046	CGT	2	6	624884	624889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495368
13246	NC_017046	CCG	2	6	624927	624932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495368
13247	NC_017046	TGC	2	6	625014	625019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495368
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13249	NC_017046	GC	3	6	625143	625148	0 %	0 %	50 %	50 %	383495369
13250	NC_017046	TGA	2	6	625172	625177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495369
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13288	NC_017046	CAA	2	6	626653	626658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13289	NC_017046	CGCTGG	2	12	626718	626729	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383495370
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13332	NC_017046	CGTT	2	8	628673	628680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13333	NC_017046	AGTA	2	8	628724	628731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13360	NC_017046	TTACC	2	10	630239	630248	20 %	40 %	0 %	40 %	383495371
13361	NC_017046	TGC	2	6	630298	630303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495371
13362	NC_017046	GCTG	2	8	630304	630311	0 %	25 %	50 %	25 %	383495371
13363	NC_017046	GAG	2	6	630312	630317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383495371
13364	NC_017046	CTG	2	6	630351	630356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495371
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