MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_017046	GCG	2	6	542086	542091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495290
11503	NC_017046	GCA	2	6	542093	542098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495290
11504	NC_017046	ACG	2	6	542133	542138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495290
11505	NC_017046	GAT	2	6	542160	542165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495290
11506	NC_017046	CGC	2	6	542182	542187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495290
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11509	NC_017046	TTC	2	6	542277	542282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495290
11510	NC_017046	AG	3	6	542300	542305	50 %	0 %	50 %	0 %	383495290
11511	NC_017046	AG	5	10	542354	542363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_017046	TGA	2	6	542395	542400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495291
11513	NC_017046	CAG	2	6	542409	542414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495291
11514	NC_017046	A	6	6	542422	542427	100 %	0 %	0 %	0 %	383495291
11515	NC_017046	GC	3	6	542509	542514	0 %	0 %	50 %	50 %	383495291
11516	NC_017046	GCC	2	6	542521	542526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495291
11517	NC_017046	CTG	2	6	542547	542552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495291
11518	NC_017046	GCG	2	6	542604	542609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495291
11519	NC_017046	CGC	2	6	542610	542615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495291
11520	NC_017046	AGA	2	6	542635	542640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495291
11521	NC_017046	GCC	2	6	542669	542674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495291
11522	NC_017046	GCG	2	6	542808	542813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495292
11523	NC_017046	GTG	2	6	542948	542953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495292
11524	NC_017046	CGC	2	6	543033	543038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495292
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11527	NC_017046	GGC	2	6	543227	543232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495292
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11531	NC_017046	TTG	2	6	543394	543399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_017046	TCAG	2	8	543438	543445	25 %	25 %	25 %	25 %	383495293
11533	NC_017046	TGA	2	6	543467	543472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495293
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11535	NC_017046	TGA	2	6	543672	543677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495293
11536	NC_017046	CGTA	2	8	543825	543832	25 %	25 %	25 %	25 %	383495293
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11543	NC_017046	TGAT	2	8	544382	544389	25 %	50 %	25 %	0 %	383495293
11544	NC_017046	GAC	2	6	544507	544512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495293
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11552	NC_017046	TGC	3	9	544781	544789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495293
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11556	NC_017046	CGA	2	6	544902	544907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495293
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11563	NC_017046	AGCGCC	2	12	545365	545376	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11564	NC_017046	T	6	6	545385	545390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_017046	ATA	2	6	545391	545396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11567	NC_017046	TGG	2	6	545468	545473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_017046	A	6	6	545492	545497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_017046	TAT	2	6	545532	545537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495294
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11573	NC_017046	CTG	2	6	545770	545775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495294
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11584	NC_017046	GC	3	6	546141	546146	0 %	0 %	50 %	50 %	383495294
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11591	NC_017046	CAA	2	6	546372	546377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_017046	GGC	2	6	546393	546398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_017046	CTG	2	6	546424	546429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495295
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11601	NC_017046	GGAT	2	8	546605	546612	25 %	25 %	50 %	0 %	383495295
11602	NC_017046	CGC	2	6	546620	546625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495295
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11605	NC_017046	TCG	2	6	546764	546769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495295
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11609	NC_017046	CG	3	6	547043	547048	0 %	0 %	50 %	50 %	383495295
11610	NC_017046	GCC	2	6	547071	547076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495295
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11613	NC_017046	A	6	6	547279	547284	100 %	0 %	0 %	0 %	383495295
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11972	NC_017046	AG	3	6	563492	563497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11976	NC_017046	GTTGC	2	10	563691	563700	0 %	40 %	40 %	20 %	383495311
11977	NC_017046	TGC	2	6	563732	563737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495311
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11981	NC_017046	CCT	2	6	563973	563978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495311
11982	NC_017046	TTG	2	6	563995	564000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495311
11983	NC_017046	CTT	2	6	564012	564017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495311
11984	NC_017046	CG	3	6	564018	564023	0 %	0 %	50 %	50 %	383495311
11985	NC_017046	CAG	2	6	564037	564042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495311
11986	NC_017046	GC	3	6	564125	564130	0 %	0 %	50 %	50 %	383495311
11987	NC_017046	GCG	2	6	564143	564148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495311
11988	NC_017046	ATC	2	6	564149	564154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495311
11989	NC_017046	CTG	2	6	564307	564312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495311
11990	NC_017046	CT	3	6	564362	564367	0 %	50 %	0 %	50 %	383495311
11991	NC_017046	GC	3	6	564402	564407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11992	NC_017046	CCGGC	2	10	564441	564450	0 %	0 %	40 %	60 %	383495312
11993	NC_017046	CTA	2	6	564545	564550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495312
11994	NC_017046	GCG	2	6	564577	564582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495312
11995	NC_017046	TG	3	6	564684	564689	0 %	50 %	50 %	0 %	383495312
11996	NC_017046	GGC	2	6	564741	564746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495312
11997	NC_017046	GCGCC	2	10	564751	564760	0 %	0 %	40 %	60 %	383495312
11998	NC_017046	TCA	2	6	564794	564799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495312
11999	NC_017046	GC	3	6	564857	564862	0 %	0 %	50 %	50 %	383495312
12000	NC_017046	GAA	2	6	564864	564869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495312

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