MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017046	GCG	2	6	519788	519793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495269
11002	NC_017046	CAT	2	6	519826	519831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_017046	CGT	2	6	519836	519841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_017046	TTTC	2	8	519850	519857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11005	NC_017046	CGC	2	6	519894	519899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_017046	CTCG	2	8	519914	519921	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_017046	AGA	2	6	519956	519961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_017046	GCG	2	6	519970	519975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_017046	GGA	2	6	520047	520052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383495270
11010	NC_017046	TTC	2	6	520068	520073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495270
11011	NC_017046	CGCGG	2	10	520147	520156	0 %	0 %	60 %	40 %	383495270
11012	NC_017046	CGA	2	6	520206	520211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495270
11013	NC_017046	ATC	2	6	520234	520239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495270
11014	NC_017046	TCG	2	6	520283	520288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495270
11015	NC_017046	AGC	2	6	520335	520340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495270
11016	NC_017046	CA	3	6	520355	520360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11017	NC_017046	A	7	7	520374	520380	100 %	0 %	0 %	0 %	383495271
11018	NC_017046	GAT	2	6	520391	520396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495271
11019	NC_017046	GCT	2	6	520421	520426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495271
11020	NC_017046	CGG	2	6	520450	520455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495271
11021	NC_017046	ATG	2	6	520482	520487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495271
11022	NC_017046	CGG	2	6	520541	520546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495271
11023	NC_017046	GTG	2	6	520623	520628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495271
11024	NC_017046	T	6	6	520664	520669	0 %	100 %	0 %	0 %	383495271
11025	NC_017046	GAA	2	6	520694	520699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495271
11026	NC_017046	CGG	2	6	520711	520716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495271
11027	NC_017046	GC	3	6	520795	520800	0 %	0 %	50 %	50 %	383495271
11028	NC_017046	CGG	2	6	520822	520827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495271
11029	NC_017046	GTG	2	6	520842	520847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495271
11030	NC_017046	CT	3	6	520857	520862	0 %	50 %	0 %	50 %	383495271
11031	NC_017046	GCG	2	6	520891	520896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495271
11032	NC_017046	CTG	2	6	520899	520904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495271
11033	NC_017046	GCT	2	6	520905	520910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495271
11034	NC_017046	GC	3	6	520915	520920	0 %	0 %	50 %	50 %	383495271
11035	NC_017046	TGG	2	6	520931	520936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495271
11036	NC_017046	GTG	2	6	520941	520946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495271
11037	NC_017046	CGC	2	6	520955	520960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495271
11038	NC_017046	GCTGG	2	10	520965	520974	0 %	20 %	60 %	20 %	383495271
11039	NC_017046	GAAG	2	8	521012	521019	50 %	0 %	50 %	0 %	383495271
11040	NC_017046	AGC	2	6	521123	521128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495271
11041	NC_017046	GTG	2	6	521148	521153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495271
11042	NC_017046	CCG	3	9	521158	521166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495271
11043	NC_017046	CTG	2	6	521217	521222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495271
11044	NC_017046	GTTGGC	2	12	521280	521291	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383495271
11045	NC_017046	GC	3	6	521293	521298	0 %	0 %	50 %	50 %	383495271
11046	NC_017046	GAT	2	6	521370	521375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495271
11047	NC_017046	GCC	2	6	521442	521447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495271
11048	NC_017046	GCG	2	6	521458	521463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495271
11049	NC_017046	GTC	2	6	521532	521537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495271
11050	NC_017046	TTG	2	6	521557	521562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495271
11051	NC_017046	TTG	2	6	521584	521589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495271
11052	NC_017046	GCGCT	2	10	521686	521695	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11053	NC_017046	TCA	2	6	521730	521735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_017046	CGC	2	6	521745	521750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_017046	T	6	6	521762	521767	0 %	100 %	0 %	0 %	383495272
11056	NC_017046	GC	3	6	521813	521818	0 %	0 %	50 %	50 %	383495272
11057	NC_017046	CGC	2	6	521837	521842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495272
11058	NC_017046	CATT	2	8	521896	521903	25 %	50 %	0 %	25 %	383495272
11059	NC_017046	GGAA	2	8	522001	522008	50 %	0 %	50 %	0 %	383495272
11060	NC_017046	GCG	2	6	522103	522108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495272
11061	NC_017046	TTTC	2	8	522176	522183	0 %	75 %	0 %	25 %	383495272
11062	NC_017046	CGG	2	6	522189	522194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495272
11063	NC_017046	T	6	6	522269	522274	0 %	100 %	0 %	0 %	383495272
11064	NC_017046	CGG	2	6	522355	522360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495272
11065	NC_017046	GCA	2	6	522383	522388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495272
11066	NC_017046	GAAT	2	8	522447	522454	50 %	25 %	25 %	0 %	383495272
11067	NC_017046	GGC	2	6	522486	522491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495272
11068	NC_017046	CAC	2	6	522507	522512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495272
11069	NC_017046	CTT	2	6	522569	522574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495272
11070	NC_017046	T	6	6	522578	522583	0 %	100 %	0 %	0 %	383495272
11071	NC_017046	AAT	2	6	522592	522597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495272
11072	NC_017046	ATT	2	6	522606	522611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383495272
11073	NC_017046	CATA	2	8	522624	522631	50 %	25 %	0 %	25 %	383495272
11074	NC_017046	CGG	2	6	522794	522799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_017046	G	6	6	522798	522803	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_017046	CTG	2	6	522810	522815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_017046	TGA	2	6	522822	522827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_017046	TGAA	2	8	522838	522845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_017046	GGC	2	6	522888	522893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495273
11080	NC_017046	CTA	2	6	522965	522970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495273
11081	NC_017046	GCC	2	6	523023	523028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495273
11082	NC_017046	GCTG	2	8	523065	523072	0 %	25 %	50 %	25 %	383495273
11083	NC_017046	GTAC	2	8	523105	523112	25 %	25 %	25 %	25 %	383495273
11084	NC_017046	CG	3	6	523176	523181	0 %	0 %	50 %	50 %	383495273
11085	NC_017046	TCC	2	6	523184	523189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383495273
11086	NC_017046	ATA	2	6	523211	523216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495273
11087	NC_017046	TATT	2	8	523223	523230	25 %	75 %	0 %	0 %	383495273
11088	NC_017046	TAA	2	6	523254	523259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495273
11089	NC_017046	GGC	2	6	523261	523266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495273
11090	NC_017046	CGG	2	6	523304	523309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495273
11091	NC_017046	GGT	2	6	523327	523332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495273
11092	NC_017046	CGA	3	9	523334	523342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495273
11093	NC_017046	TCT	2	6	523378	523383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495273
11094	NC_017046	ACC	2	6	523492	523497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495274
11095	NC_017046	CAC	2	6	523572	523577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495274
11096	NC_017046	TGC	2	6	523595	523600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495274
11097	NC_017046	CCG	2	6	523624	523629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495274
11098	NC_017046	CGC	2	6	523638	523643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495274
11099	NC_017046	CGA	2	6	523709	523714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495274
11100	NC_017046	ATA	2	6	523753	523758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495274
11101	NC_017046	G	6	6	523796	523801	0 %	0 %	100 %	0 %	383495274
11102	NC_017046	CAGGT	2	10	523949	523958	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11103	NC_017046	GGAA	2	8	523961	523968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_017046	CCCA	2	8	524016	524023	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11105	NC_017046	CTG	2	6	524050	524055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11106	NC_017046	AAT	2	6	524228	524233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495275
11107	NC_017046	GCG	2	6	524236	524241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495275
11108	NC_017046	ACATCC	2	12	524292	524303	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383495275
11109	NC_017046	TCA	2	6	524346	524351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495275
11110	NC_017046	GC	3	6	524395	524400	0 %	0 %	50 %	50 %	383495275
11111	NC_017046	CAG	2	6	524474	524479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495275
11112	NC_017046	GATT	2	8	524530	524537	25 %	50 %	25 %	0 %	383495275
11113	NC_017046	TGT	2	6	524544	524549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495275
11114	NC_017046	GAT	2	6	524597	524602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495275
11115	NC_017046	CAGC	2	8	524638	524645	25 %	0 %	25 %	50 %	383495275
11116	NC_017046	AAGG	2	8	524666	524673	50 %	0 %	50 %	0 %	383495275
11117	NC_017046	GCT	2	6	524726	524731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495275
11118	NC_017046	CAG	2	6	524846	524851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495275
11119	NC_017046	CCG	2	6	524866	524871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495275
11120	NC_017046	AGCGG	2	10	524910	524919	20 %	0 %	60 %	20 %	383495275
11121	NC_017046	GAA	2	6	525025	525030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495275
11122	NC_017046	GCT	2	6	525050	525055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495275
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11124	NC_017046	ATC	2	6	525147	525152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495275
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11143	NC_017046	GGCT	2	8	526305	526312	0 %	25 %	50 %	25 %	383495278
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11232	NC_017046	AAGA	2	8	530192	530199	75 %	0 %	25 %	0 %	383495282
11233	NC_017046	ACGA	2	8	530209	530216	50 %	0 %	25 %	25 %	383495282
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11367	NC_017046	GCG	2	6	536256	536261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495285
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