MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017046	CGC	2	6	474271	474276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495230
10002	NC_017046	GCC	2	6	474284	474289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495230
10003	NC_017046	TTC	2	6	474302	474307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495230
10004	NC_017046	TGC	2	6	474327	474332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495230
10005	NC_017046	GTC	2	6	474356	474361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495230
10006	NC_017046	CGC	2	6	474419	474424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495230
10007	NC_017046	CGT	2	6	474568	474573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495230
10008	NC_017046	TCG	2	6	474615	474620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495230
10009	NC_017046	GA	3	6	474663	474668	50 %	0 %	50 %	0 %	383495230
10010	NC_017046	GT	3	6	474683	474688	0 %	50 %	50 %	0 %	383495230
10011	NC_017046	CGAT	2	8	474717	474724	25 %	25 %	25 %	25 %	383495230
10012	NC_017046	AGTAG	2	10	474794	474803	40 %	20 %	40 %	0 %	383495230
10013	NC_017046	ACG	2	6	474810	474815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495230
10014	NC_017046	GCC	2	6	474824	474829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495230
10015	NC_017046	GCG	2	6	474843	474848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495230
10016	NC_017046	TGC	2	6	474861	474866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495230
10017	NC_017046	CCA	2	6	474916	474921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495230
10018	NC_017046	GGC	2	6	474974	474979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495230
10019	NC_017046	CA	3	6	474985	474990	50 %	0 %	0 %	50 %	383495230
10020	NC_017046	CCG	2	6	475026	475031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495230
10021	NC_017046	TTC	2	6	475173	475178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495230
10022	NC_017046	TTC	2	6	475283	475288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495230
10023	NC_017046	T	6	6	475335	475340	0 %	100 %	0 %	0 %	383495230
10024	NC_017046	AGA	2	6	475355	475360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495230
10025	NC_017046	GTT	2	6	475394	475399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383495230
10026	NC_017046	GC	3	6	475402	475407	0 %	0 %	50 %	50 %	383495230
10027	NC_017046	CGG	2	6	475504	475509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495230
10028	NC_017046	CA	3	6	475529	475534	50 %	0 %	0 %	50 %	383495230
10029	NC_017046	GCG	2	6	475541	475546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495230
10030	NC_017046	CTT	2	6	475555	475560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495230
10031	NC_017046	CCG	2	6	475564	475569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495230
10032	NC_017046	ATACCG	2	12	475578	475589	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383495230
10033	NC_017046	TGGAGG	2	12	475597	475608	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383495230
10034	NC_017046	CGA	2	6	475701	475706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495230
10035	NC_017046	AGTA	2	8	475857	475864	50 %	25 %	25 %	0 %	383495230
10036	NC_017046	GCG	2	6	475865	475870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495230
10037	NC_017046	TCG	2	6	475875	475880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495230
10038	NC_017046	CT	3	6	475896	475901	0 %	50 %	0 %	50 %	383495230
10039	NC_017046	AGGGT	2	10	475944	475953	20 %	20 %	60 %	0 %	383495230
10040	NC_017046	TTTA	2	8	475998	476005	25 %	75 %	0 %	0 %	383495231
10041	NC_017046	GGTA	2	8	476148	476155	25 %	25 %	50 %	0 %	383495231
10042	NC_017046	GCT	2	6	476166	476171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495231
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10045	NC_017046	CT	3	6	476258	476263	0 %	50 %	0 %	50 %	383495231
10046	NC_017046	CGG	2	6	476331	476336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495231
10047	NC_017046	GC	3	6	476346	476351	0 %	0 %	50 %	50 %	383495231
10048	NC_017046	GCC	2	6	476408	476413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495231
10049	NC_017046	CCG	2	6	476429	476434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495231
10050	NC_017046	ATC	2	6	476474	476479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495231
10051	NC_017046	CGATCG	2	12	476486	476497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383495231
10052	NC_017046	ATCGTC	2	12	476620	476631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383495231
10053	NC_017046	GTC	2	6	476644	476649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495231
10054	NC_017046	CCG	2	6	476682	476687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495231
10055	NC_017046	TAA	2	6	476773	476778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383495231
10056	NC_017046	GCT	2	6	476880	476885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495231
10057	NC_017046	CTG	2	6	476977	476982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495232
10058	NC_017046	TGCC	2	8	476989	476996	0 %	25 %	25 %	50 %	383495232
10059	NC_017046	CGC	2	6	477015	477020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495232
10060	NC_017046	ATTC	2	8	477027	477034	25 %	50 %	0 %	25 %	383495232
10061	NC_017046	CGC	2	6	477057	477062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495232
10062	NC_017046	GCTC	2	8	477090	477097	0 %	25 %	25 %	50 %	383495232
10063	NC_017046	GGCG	2	8	477115	477122	0 %	0 %	75 %	25 %	383495232
10064	NC_017046	TTC	2	6	477131	477136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383495232
10065	NC_017046	ATG	2	6	477140	477145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495232
10066	NC_017046	CT	3	6	477155	477160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_017046	GTGATA	2	12	477246	477257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_017046	GCT	2	6	477291	477296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_017046	GCC	2	6	477345	477350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10070	NC_017046	TGCG	2	8	477672	477679	0 %	25 %	50 %	25 %	383495233
10071	NC_017046	GGC	2	6	477735	477740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495233
10072	NC_017046	GC	3	6	477765	477770	0 %	0 %	50 %	50 %	383495233
10073	NC_017046	TGGAAG	2	12	477805	477816	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383495233
10074	NC_017046	CTG	3	9	477825	477833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495233
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10083	NC_017046	ATG	2	6	478149	478154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495233
10084	NC_017046	CG	3	6	478158	478163	0 %	0 %	50 %	50 %	383495233
10085	NC_017046	CCAG	2	8	478231	478238	25 %	0 %	25 %	50 %	383495233
10086	NC_017046	GC	3	6	478332	478337	0 %	0 %	50 %	50 %	383495233
10087	NC_017046	GAA	3	9	478437	478445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495233
10088	NC_017046	GGT	2	6	478472	478477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495233
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10091	NC_017046	CAG	2	6	478515	478520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495233
10092	NC_017046	CAG	2	6	478524	478529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495233
10093	NC_017046	GGT	2	6	478532	478537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495233
10094	NC_017046	ACG	2	6	478570	478575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495233
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10097	NC_017046	GGC	2	6	478814	478819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_017046	TCA	3	9	478881	478889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495234
10099	NC_017046	GCA	2	6	478890	478895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495234
10100	NC_017046	CCA	2	6	478905	478910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495234
10101	NC_017046	GCGCC	2	10	478923	478932	0 %	0 %	40 %	60 %	383495234
10102	NC_017046	CGGT	2	8	478949	478956	0 %	25 %	50 %	25 %	383495234
10103	NC_017046	CGT	2	6	478981	478986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495234
10104	NC_017046	CGG	2	6	478993	478998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495234
10105	NC_017046	ATC	3	9	479003	479011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495234
10106	NC_017046	CAGCGC	2	12	479047	479058	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383495234
10107	NC_017046	CAT	2	6	479062	479067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495234
10108	NC_017046	CGACG	2	10	479131	479140	20 %	0 %	40 %	40 %	383495234
10109	NC_017046	CGG	2	6	479151	479156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495234
10110	NC_017046	CAGCGC	2	12	479371	479382	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	383495234
10111	NC_017046	CGC	2	6	479391	479396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495234
10112	NC_017046	AGC	2	6	479399	479404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495234
10113	NC_017046	CTG	2	6	479524	479529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495234
10114	NC_017046	CGCC	2	8	479601	479608	0 %	0 %	25 %	75 %	383495234
10115	NC_017046	GCC	2	6	479668	479673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495235
10116	NC_017046	GACAA	2	10	479701	479710	60 %	0 %	20 %	20 %	383495235
10117	NC_017046	CAT	2	6	479775	479780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495235
10118	NC_017046	CAG	2	6	479844	479849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495235
10119	NC_017046	CCA	2	6	479860	479865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495235
10120	NC_017046	CGG	2	6	480063	480068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495235
10121	NC_017046	TCA	2	6	480089	480094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495235
10122	NC_017046	ATAA	2	8	480123	480130	75 %	25 %	0 %	0 %	383495235
10123	NC_017046	CGA	2	6	480179	480184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495235
10124	NC_017046	CAG	3	9	480249	480257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495235
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10130	NC_017046	CAT	2	6	480526	480531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383495236
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10132	NC_017046	CA	3	6	480622	480627	50 %	0 %	0 %	50 %	383495236
10133	NC_017046	CAG	2	6	480734	480739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495236
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10135	NC_017046	GTG	2	6	480752	480757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495236
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10137	NC_017046	CACCG	2	10	480782	480791	20 %	0 %	20 %	60 %	383495236
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10140	NC_017046	CGG	2	6	480874	480879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495236
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10145	NC_017046	CG	3	6	481130	481135	0 %	0 %	50 %	50 %	383495236
10146	NC_017046	TGC	2	6	481152	481157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495236
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10150	NC_017046	GCT	2	6	481255	481260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495236
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10153	NC_017046	CGT	2	6	481439	481444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495236
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10155	NC_017046	CAC	2	6	481517	481522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495236
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10181	NC_017046	AAAT	2	8	482727	482734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10182	NC_017046	GAT	2	6	482747	482752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10183	NC_017046	ACGAT	2	10	482779	482788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10184	NC_017046	ATCCAG	2	12	482883	482894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383495238
10185	NC_017046	GCA	2	6	482927	482932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495238
10186	NC_017046	ATGC	2	8	483009	483016	25 %	25 %	25 %	25 %	383495238
10187	NC_017046	GCA	2	6	483080	483085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495238
10188	NC_017046	CGGG	2	8	483097	483104	0 %	0 %	75 %	25 %	383495238
10189	NC_017046	CAG	2	6	483162	483167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495238
10190	NC_017046	GCTGGA	2	12	483185	483196	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383495238
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10194	NC_017046	CGA	2	6	483346	483351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495238
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10198	NC_017046	T	6	6	483601	483606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10205	NC_017046	GGCAGC	2	12	483880	483891	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383495239
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10222	NC_017046	CGC	2	6	484645	484650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495239
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10225	NC_017046	CTG	2	6	484753	484758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495239
10226	NC_017046	ATG	2	6	484801	484806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495240
10227	NC_017046	GGGC	2	8	484835	484842	0 %	0 %	75 %	25 %	383495240
10228	NC_017046	ACC	2	6	484843	484848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383495240
10229	NC_017046	CTG	2	6	484991	484996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495240
10230	NC_017046	CG	3	6	485001	485006	0 %	0 %	50 %	50 %	383495240
10231	NC_017046	GGCA	2	8	485009	485016	25 %	0 %	50 %	25 %	383495240
10232	NC_017046	GCA	2	6	485038	485043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495240
10233	NC_017046	CGC	2	6	485061	485066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495240
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10235	NC_017046	CGC	3	9	485214	485222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383495240
10236	NC_017046	GAC	2	6	485260	485265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383495240
10237	NC_017046	GGT	2	6	485275	485280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383495240
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10239	NC_017046	GAT	2	6	485356	485361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383495240
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10483	NC_017046	GAA	2	6	496037	496042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383495250
10484	NC_017046	CGT	2	6	496058	496063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383495250
10485	NC_017046	GCG	2	6	496138	496143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383495250
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