MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. 798 chromosome

Total Repeats: 103095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_017046	CAA	3	9	4871483	4871491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383499146
103002	NC_017046	T	6	6	4871555	4871560	0 %	100 %	0 %	0 %	383499146
103003	NC_017046	CCTG	2	8	4871596	4871603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103004	NC_017046	GGC	2	6	4871704	4871709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383499147
103005	NC_017046	CTG	2	6	4871724	4871729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499147
103006	NC_017046	CAT	2	6	4871760	4871765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499147
103007	NC_017046	ATC	2	6	4871875	4871880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499147
103008	NC_017046	TGG	2	6	4872027	4872032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383499147
103009	NC_017046	GAT	2	6	4872148	4872153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499147
103010	NC_017046	TTA	2	6	4872161	4872166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499147
103011	NC_017046	TTG	2	6	4872177	4872182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103012	NC_017046	ATAAA	2	10	4872218	4872227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103013	NC_017046	ATATT	2	10	4872228	4872237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103014	NC_017046	CTT	2	6	4872252	4872257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103015	NC_017046	TCTGT	2	10	4872258	4872267	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103016	NC_017046	GGC	2	6	4872277	4872282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103017	NC_017046	TAA	2	6	4872369	4872374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103018	NC_017046	AAG	2	6	4872385	4872390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103019	NC_017046	TGA	2	6	4872397	4872402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103020	NC_017046	T	6	6	4872426	4872431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103021	NC_017046	ATA	2	6	4872433	4872438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103022	NC_017046	TTA	2	6	4872440	4872445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103023	NC_017046	GGA	2	6	4872452	4872457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103024	NC_017046	TTTA	2	8	4872458	4872465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103025	NC_017046	TAA	2	6	4872486	4872491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103026	NC_017046	ACG	2	6	4872495	4872500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103027	NC_017046	TA	3	6	4872564	4872569	50 %	50 %	0 %	0 %	383499148
103028	NC_017046	CTG	2	6	4872630	4872635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499148
103029	NC_017046	TCA	2	6	4872811	4872816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499148
103030	NC_017046	ATA	2	6	4872849	4872854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383499148
103031	NC_017046	GGT	2	6	4872861	4872866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383499148
103032	NC_017046	A	6	6	4872876	4872881	100 %	0 %	0 %	0 %	383499148
103033	NC_017046	TCT	2	6	4872895	4872900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383499148
103034	NC_017046	GATT	2	8	4873027	4873034	25 %	50 %	25 %	0 %	383499148
103035	NC_017046	T	7	7	4873129	4873135	0 %	100 %	0 %	0 %	383499148
103036	NC_017046	CCG	2	6	4873162	4873167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383499148
103037	NC_017046	ATT	2	6	4873191	4873196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103038	NC_017046	CAA	2	6	4873281	4873286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103039	NC_017046	TGA	2	6	4873363	4873368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103040	NC_017046	AGCGA	2	10	4873440	4873449	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103041	NC_017046	GGA	2	6	4873464	4873469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103042	NC_017046	GA	3	6	4873477	4873482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103043	NC_017046	GGCG	2	8	4873498	4873505	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103044	NC_017046	CGC	2	6	4873525	4873530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103045	NC_017046	CTC	2	6	4873540	4873545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103046	NC_017046	CGG	2	6	4873547	4873552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103047	NC_017046	GAT	2	6	4873601	4873606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103048	NC_017046	TCA	2	6	4873643	4873648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103049	NC_017046	ATT	2	6	4873698	4873703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103050	NC_017046	AGC	2	6	4873809	4873814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103051	NC_017046	TGA	2	6	4873824	4873829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103052	NC_017046	AGC	2	6	4873856	4873861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103053	NC_017046	T	6	6	4873872	4873877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103054	NC_017046	T	6	6	4873916	4873921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103055	NC_017046	AGG	2	6	4874049	4874054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103056	NC_017046	CGC	2	6	4874161	4874166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383499149
103057	NC_017046	TGG	2	6	4874191	4874196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383499149
103058	NC_017046	GAT	2	6	4874198	4874203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499149
103059	NC_017046	ACG	2	6	4874243	4874248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499149
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103062	NC_017046	GCA	2	6	4874353	4874358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499149
103063	NC_017046	CG	3	6	4874360	4874365	0 %	0 %	50 %	50 %	383499149
103064	NC_017046	ACG	2	6	4874468	4874473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383499149
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103068	NC_017046	CAT	2	6	4874776	4874781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499149
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103070	NC_017046	CAA	2	6	4875006	4875011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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103073	NC_017046	AT	3	6	4875146	4875151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103079	NC_017046	TAAAT	2	10	4875291	4875300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103080	NC_017046	TAAA	2	8	4875306	4875313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103081	NC_017046	GCC	2	6	4875553	4875558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383499150
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103085	NC_017046	TAC	2	6	4875757	4875762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383499150
103086	NC_017046	TTA	2	6	4875787	4875792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383499150
103087	NC_017046	GCTGGC	2	12	4875867	4875878	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	383499150
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103089	NC_017046	TGA	2	6	4876005	4876010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383499150
103090	NC_017046	CG	4	8	4876030	4876037	0 %	0 %	50 %	50 %	383499150
103091	NC_017046	GGC	2	6	4876065	4876070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383499150
103092	NC_017046	ACA	2	6	4876098	4876103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383499150
103093	NC_017046	CTG	2	6	4876114	4876119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383499150
103094	NC_017046	A	8	8	4876166	4876173	100 %	0 %	0 %	0 %	383499150
103095	NC_017046	ATA	2	6	4876204	4876209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.