MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 37427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25005	NC_017040	TTA	2	6	1166458	1166463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480313
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25013	NC_017040	T	6	6	1166858	1166863	0 %	100 %	0 %	0 %	383480313
25014	NC_017040	AATT	2	8	1166885	1166892	50 %	50 %	0 %	0 %	383480313
25015	NC_017040	T	6	6	1166904	1166909	0 %	100 %	0 %	0 %	383480313
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25357	NC_017040	ATC	2	6	1184609	1184614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480330
25358	NC_017040	TCA	2	6	1184759	1184764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480330
25359	NC_017040	CTT	2	6	1184875	1184880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480330
25360	NC_017040	TCT	3	9	1184882	1184890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480330
25361	NC_017040	T	6	6	1184890	1184895	0 %	100 %	0 %	0 %	383480330
25362	NC_017040	GCT	2	6	1184939	1184944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480330
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25364	NC_017040	CTG	2	6	1185016	1185021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480330
25365	NC_017040	TTCT	2	8	1185025	1185032	0 %	75 %	0 %	25 %	383480330
25366	NC_017040	CTT	2	6	1185081	1185086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480330
25367	NC_017040	GATT	2	8	1185091	1185098	25 %	50 %	25 %	0 %	383480330
25368	NC_017040	CTGC	2	8	1185099	1185106	0 %	25 %	25 %	50 %	383480330
25369	NC_017040	GAT	2	6	1185261	1185266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480330
25370	NC_017040	GCT	2	6	1185275	1185280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480330
25371	NC_017040	TGCC	2	8	1185409	1185416	0 %	25 %	25 %	50 %	383480330
25372	NC_017040	AAT	2	6	1185421	1185426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480330
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25375	NC_017040	TGT	2	6	1185618	1185623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480331
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25377	NC_017040	GAT	2	6	1185707	1185712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480331
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25379	NC_017040	AAT	2	6	1185779	1185784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480331
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25383	NC_017040	ATCTT	2	10	1185937	1185946	20 %	60 %	0 %	20 %	383480331
25384	NC_017040	TTG	2	6	1185955	1185960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480331
25385	NC_017040	TTC	2	6	1185999	1186004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383480331
25386	NC_017040	TTG	2	6	1186005	1186010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480331
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25388	NC_017040	TGT	2	6	1186208	1186213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480331
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25394	NC_017040	CTG	2	6	1186596	1186601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480331
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25420	NC_017040	AGT	2	6	1187974	1187979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25421	NC_017040	ATT	2	6	1187983	1187988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25422	NC_017040	TGA	2	6	1188026	1188031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25423	NC_017040	T	6	6	1188036	1188041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25424	NC_017040	TCA	2	6	1188046	1188051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25425	NC_017040	GAA	2	6	1188052	1188057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25427	NC_017040	GTC	2	6	1188129	1188134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480333
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25440	NC_017040	TAGTCA	2	12	1188928	1188939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383480333
25441	NC_017040	GCT	2	6	1188973	1188978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480333
25442	NC_017040	GAAA	2	8	1189083	1189090	75 %	0 %	25 %	0 %	383480333
25443	NC_017040	ATT	2	6	1189260	1189265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383480333
25444	NC_017040	ATG	2	6	1189300	1189305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480333
25445	NC_017040	ATC	2	6	1189317	1189322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480333
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25452	NC_017040	T	6	6	1189535	1189540	0 %	100 %	0 %	0 %	383480333
25453	NC_017040	CCT	2	6	1189562	1189567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25454	NC_017040	A	6	6	1189568	1189573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25455	NC_017040	CCA	2	6	1189647	1189652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480334
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25458	NC_017040	TCA	2	6	1189831	1189836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480334
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25460	NC_017040	ATC	2	6	1189977	1189982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480334
25461	NC_017040	CCAT	2	8	1189995	1190002	25 %	25 %	0 %	50 %	383480334
25462	NC_017040	AAT	2	6	1190015	1190020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480334
25463	NC_017040	ACC	2	6	1190136	1190141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480334
25464	NC_017040	A	7	7	1190198	1190204	100 %	0 %	0 %	0 %	383480334
25465	NC_017040	TAA	2	6	1190266	1190271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480334
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25467	NC_017040	TAA	2	6	1190287	1190292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480334
25468	NC_017040	A	7	7	1190381	1190387	100 %	0 %	0 %	0 %	383480334
25469	NC_017040	TCA	2	6	1190415	1190420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480334
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25471	NC_017040	T	6	6	1190543	1190548	0 %	100 %	0 %	0 %	383480334
25472	NC_017040	TCC	2	6	1190565	1190570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383480335
25473	NC_017040	CGA	2	6	1190598	1190603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480335
25474	NC_017040	ACT	2	6	1190640	1190645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480335
25475	NC_017040	AC	3	6	1190722	1190727	50 %	0 %	0 %	50 %	383480335
25476	NC_017040	CAT	2	6	1190828	1190833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383480335
25477	NC_017040	AAT	2	6	1190838	1190843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480335
25478	NC_017040	TTG	2	6	1190867	1190872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480335
25479	NC_017040	TTGC	2	8	1190877	1190884	0 %	50 %	25 %	25 %	383480335
25480	NC_017040	CCA	2	6	1190890	1190895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480335
25481	NC_017040	AGC	2	6	1190897	1190902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383480335
25482	NC_017040	ATA	2	6	1190906	1190911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480335
25483	NC_017040	TAG	2	6	1190940	1190945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383480335
25484	NC_017040	TAGCC	2	10	1190958	1190967	20 %	20 %	20 %	40 %	383480335
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25486	NC_017040	CCAA	2	8	1191048	1191055	50 %	0 %	0 %	50 %	383480335
25487	NC_017040	ACC	2	6	1191114	1191119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383480335
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25489	NC_017040	ACTC	2	8	1191184	1191191	25 %	25 %	0 %	50 %	383480335
25490	NC_017040	AACC	2	8	1191316	1191323	50 %	0 %	0 %	50 %	383480335
25491	NC_017040	CTG	2	6	1191358	1191363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383480335
25492	NC_017040	AAT	2	6	1191364	1191369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480335
25493	NC_017040	AAAAGA	2	12	1191412	1191423	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383480335
25494	NC_017040	TAA	3	9	1191452	1191460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383480335
25495	NC_017040	TTG	2	6	1191501	1191506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383480335
25496	NC_017040	TTGTC	2	10	1191509	1191518	0 %	60 %	20 %	20 %	383480335
25497	NC_017040	TAT	2	6	1191576	1191581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25498	NC_017040	CAA	2	6	1191589	1191594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25499	NC_017040	TTG	2	6	1191645	1191650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25500	NC_017040	CTA	2	6	1191691	1191696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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