MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS15252 chromosome

Total Repeats: 37427

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017040	GAA	2	6	230831	230836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479420
5002	NC_017040	AG	3	6	230953	230958	50 %	0 %	50 %	0 %	383479420
5003	NC_017040	TAT	2	6	231037	231042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479420
5004	NC_017040	TGA	2	6	231078	231083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479420
5005	NC_017040	ATTG	2	8	231274	231281	25 %	50 %	25 %	0 %	383479420
5006	NC_017040	GAT	2	6	231284	231289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479420
5007	NC_017040	G	6	6	231302	231307	0 %	0 %	100 %	0 %	383479420
5008	NC_017040	ACA	2	6	231450	231455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479420
5009	NC_017040	TGT	3	9	231457	231465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479420
5010	NC_017040	GA	4	8	231500	231507	50 %	0 %	50 %	0 %	383479420
5011	NC_017040	CAA	2	6	231563	231568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479421
5012	NC_017040	GAT	2	6	231616	231621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479421
5013	NC_017040	ACG	2	6	231656	231661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479421
5014	NC_017040	AGGCAA	2	12	231692	231703	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383479421
5015	NC_017040	A	6	6	231719	231724	100 %	0 %	0 %	0 %	383479421
5016	NC_017040	CAA	2	6	231733	231738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479421
5017	NC_017040	ACT	2	6	231778	231783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479421
5018	NC_017040	AGC	2	6	231806	231811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479421
5019	NC_017040	AGT	2	6	231871	231876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479421
5020	NC_017040	GAG	2	6	231877	231882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383479421
5021	NC_017040	AG	3	6	231913	231918	50 %	0 %	50 %	0 %	383479421
5022	NC_017040	CAG	2	6	232007	232012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479421
5023	NC_017040	ACT	2	6	232015	232020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479421
5024	NC_017040	AGC	2	6	232113	232118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479421
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5026	NC_017040	GCT	2	6	232240	232245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479421
5027	NC_017040	GTC	2	6	232271	232276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479421
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5029	NC_017040	GAA	2	6	232354	232359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479421
5030	NC_017040	A	6	6	232363	232368	100 %	0 %	0 %	0 %	383479421
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5032	NC_017040	ATT	2	6	232435	232440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479421
5033	NC_017040	CAG	2	6	232487	232492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479421
5034	NC_017040	TTG	2	6	232505	232510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479421
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5036	NC_017040	ACC	2	6	232599	232604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383479421
5037	NC_017040	CAG	2	6	232616	232621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479421
5038	NC_017040	CAT	2	6	232685	232690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479421
5039	NC_017040	TAT	2	6	232749	232754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479421
5040	NC_017040	ATG	2	6	232790	232795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479421
5041	NC_017040	TGAA	2	8	233006	233013	50 %	25 %	25 %	0 %	383479421
5042	NC_017040	TAA	2	6	233061	233066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479421
5043	NC_017040	TCA	2	6	233187	233192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479421
5044	NC_017040	AAGT	2	8	233222	233229	50 %	25 %	25 %	0 %	383479421
5045	NC_017040	AGCA	2	8	233247	233254	50 %	0 %	25 %	25 %	383479421
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5048	NC_017040	AGCTA	2	10	233385	233394	40 %	20 %	20 %	20 %	383479421
5049	NC_017040	CAGA	2	8	233419	233426	50 %	0 %	25 %	25 %	383479421
5050	NC_017040	TGG	2	6	233465	233470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479421
5051	NC_017040	A	6	6	233473	233478	100 %	0 %	0 %	0 %	383479421
5052	NC_017040	ATA	2	6	233549	233554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479421
5053	NC_017040	AAG	2	6	233600	233605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479421
5054	NC_017040	AGC	2	6	233610	233615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479421
5055	NC_017040	CTA	2	6	233645	233650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479421
5056	NC_017040	AGAT	2	8	233795	233802	50 %	25 %	25 %	0 %	383479421
5057	NC_017040	ACT	2	6	233803	233808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479421
5058	NC_017040	GAAAC	2	10	233833	233842	60 %	0 %	20 %	20 %	383479421
5059	NC_017040	GCT	2	6	233869	233874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479421
5060	NC_017040	TTG	2	6	233903	233908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479421
5061	NC_017040	TCT	2	6	234004	234009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479421
5062	NC_017040	TGA	2	6	234036	234041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479421
5063	NC_017040	A	6	6	234159	234164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017040	TAT	2	6	234194	234199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_017040	TC	3	6	234225	234230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_017040	TTG	2	6	234257	234262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_017040	A	7	7	234315	234321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_017040	A	6	6	234430	234435	100 %	0 %	0 %	0 %	383479422
5070	NC_017040	A	6	6	234502	234507	100 %	0 %	0 %	0 %	383479422
5071	NC_017040	GTT	2	6	234610	234615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479422
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5073	NC_017040	ATA	2	6	234747	234752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383479422
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5082	NC_017040	GTG	2	6	235102	235107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479423
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5086	NC_017040	TAT	2	6	235434	235439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017040	TCAA	2	8	235468	235475	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5088	NC_017040	TGA	2	6	235520	235525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5090	NC_017040	TAT	2	6	235619	235624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017040	CAA	2	6	235631	235636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_017040	A	7	7	235706	235712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017040	ACA	2	6	235800	235805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479424
5094	NC_017040	TAC	2	6	235818	235823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479424
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5096	NC_017040	TGGA	2	8	235878	235885	25 %	25 %	50 %	0 %	383479424
5097	NC_017040	GCAAGA	2	12	235886	235897	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383479424
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5099	NC_017040	CAT	2	6	235958	235963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479424
5100	NC_017040	AC	3	6	235966	235971	50 %	0 %	0 %	50 %	383479424
5101	NC_017040	TC	3	6	236007	236012	0 %	50 %	0 %	50 %	383479424
5102	NC_017040	CAA	2	6	236126	236131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479424
5103	NC_017040	CCAAT	2	10	236205	236214	40 %	20 %	0 %	40 %	383479424
5104	NC_017040	AGA	2	6	236228	236233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
5105	NC_017040	GAA	2	6	236310	236315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
5106	NC_017040	AGA	2	6	236324	236329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
5107	NC_017040	TGA	2	6	236387	236392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479424
5108	NC_017040	TGA	3	9	236398	236406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479424
5109	NC_017040	GAA	2	6	236421	236426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
5110	NC_017040	ACG	2	6	236434	236439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479424
5111	NC_017040	ATTG	2	8	236441	236448	25 %	50 %	25 %	0 %	383479424
5112	NC_017040	CAA	2	6	236464	236469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479424
5113	NC_017040	TTC	2	6	236481	236486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479424
5114	NC_017040	GAA	3	9	236613	236621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
5115	NC_017040	TGA	2	6	236633	236638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479424
5116	NC_017040	TGAC	2	8	236671	236678	25 %	25 %	25 %	25 %	383479424
5117	NC_017040	TTC	2	6	236700	236705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479424
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5119	NC_017040	TGA	2	6	236891	236896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479424
5120	NC_017040	CAAGA	2	10	236979	236988	60 %	0 %	20 %	20 %	383479424
5121	NC_017040	GAA	2	6	237015	237020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479424
5122	NC_017040	AAAC	2	8	237040	237047	75 %	0 %	0 %	25 %	383479424
5123	NC_017040	TTG	2	6	237103	237108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479424
5124	NC_017040	CTC	2	6	237151	237156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383479424
5125	NC_017040	TTC	2	6	237204	237209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479424
5126	NC_017040	TGG	2	6	237221	237226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479424
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5129	NC_017040	TGG	2	6	237308	237313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479424
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5142	NC_017040	TGG	2	6	237953	237958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_017040	AGA	2	6	237971	237976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_017040	AAG	2	6	237977	237982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_017040	ATTT	2	8	238005	238012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5147	NC_017040	TA	3	6	238032	238037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5231	NC_017040	GTA	2	6	241581	241586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479427
5232	NC_017040	CAG	2	6	241637	241642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479427
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5234	NC_017040	GCT	2	6	241843	241848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479427
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5237	NC_017040	AAT	2	6	242053	242058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5238	NC_017040	A	7	7	242147	242153	100 %	0 %	0 %	0 %	383479428
5239	NC_017040	TGA	2	6	242157	242162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479428
5240	NC_017040	AGC	2	6	242203	242208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479428
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5242	NC_017040	CAC	2	6	242522	242527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383479428
5243	NC_017040	AAG	2	6	242694	242699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479428
5244	NC_017040	A	6	6	242768	242773	100 %	0 %	0 %	0 %	383479428
5245	NC_017040	ATT	2	6	242776	242781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479428
5246	NC_017040	GAA	2	6	242786	242791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479428
5247	NC_017040	GCT	2	6	242872	242877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479428
5248	NC_017040	AGGT	2	8	242904	242911	25 %	25 %	50 %	0 %	383479428
5249	NC_017040	TCT	2	6	242914	242919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479428
5250	NC_017040	ATT	2	6	243094	243099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479428
5251	NC_017040	TTG	2	6	243143	243148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479428
5252	NC_017040	TTA	2	6	243173	243178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479428
5253	NC_017040	AGA	2	6	243184	243189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479428
5254	NC_017040	TCAG	2	8	243210	243217	25 %	25 %	25 %	25 %	383479428
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5256	NC_017040	ATG	2	6	243315	243320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479428
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5261	NC_017040	AAAG	2	8	243587	243594	75 %	0 %	25 %	0 %	383479428
5262	NC_017040	G	6	6	243703	243708	0 %	0 %	100 %	0 %	383479428
5263	NC_017040	GTT	2	6	243791	243796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383479428
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5265	NC_017040	TGGCGG	2	12	244033	244044	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	383479428
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5269	NC_017040	GCT	2	6	244074	244079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5270	NC_017040	TAA	2	6	244120	244125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5271	NC_017040	CAT	2	6	244173	244178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383479429
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5273	NC_017040	GTG	2	6	244405	244410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479429
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5281	NC_017040	CTT	2	6	244953	244958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479429
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5284	NC_017040	TAA	2	6	245087	245092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5303	NC_017040	T	6	6	246190	246195	0 %	100 %	0 %	0 %	383479431
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5319	NC_017040	TGG	2	6	246880	246885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383479431
5320	NC_017040	GAAA	2	8	247030	247037	75 %	0 %	25 %	0 %	383479431
5321	NC_017040	A	6	6	247056	247061	100 %	0 %	0 %	0 %	383479431
5322	NC_017040	T	7	7	247074	247080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5323	NC_017040	A	7	7	247107	247113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5329	NC_017040	TGA	2	6	247550	247555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479432
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5332	NC_017040	TTC	2	6	247645	247650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383479432
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5335	NC_017040	ATG	2	6	247833	247838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479432
5336	NC_017040	TGC	2	6	247865	247870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383479432
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5339	NC_017040	TA	3	6	248000	248005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5340	NC_017040	ACCA	2	8	248148	248155	50 %	0 %	0 %	50 %	383479433
5341	NC_017040	CTAG	2	8	248218	248225	25 %	25 %	25 %	25 %	383479433
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5346	NC_017040	ATTG	2	8	248761	248768	25 %	50 %	25 %	0 %	383479433
5347	NC_017040	TGA	2	6	248780	248785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479433
5348	NC_017040	TGATT	2	10	248817	248826	20 %	60 %	20 %	0 %	383479433
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5351	NC_017040	CG	3	6	248897	248902	0 %	0 %	50 %	50 %	383479433
5352	NC_017040	CGGT	2	8	248924	248931	0 %	25 %	50 %	25 %	383479433
5353	NC_017040	CAA	2	6	249025	249030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479433
5354	NC_017040	CAAG	2	8	249058	249065	50 %	0 %	25 %	25 %	383479433
5355	NC_017040	CCAAT	2	10	249074	249083	40 %	20 %	0 %	40 %	383479433
5356	NC_017040	TGA	2	6	249093	249098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479433
5357	NC_017040	CAG	2	6	249110	249115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479433
5358	NC_017040	TGA	2	6	249164	249169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479433
5359	NC_017040	CAG	2	6	249191	249196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479433
5360	NC_017040	TTA	2	6	249206	249211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479433
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5362	NC_017040	AAAG	2	8	249320	249327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5363	NC_017040	CAA	2	6	249382	249387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479434
5364	NC_017040	ATG	2	6	249392	249397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383479434
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5366	NC_017040	CA	3	6	249429	249434	50 %	0 %	0 %	50 %	383479434
5367	NC_017040	TAT	2	6	249469	249474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383479434
5368	NC_017040	AAG	2	6	249476	249481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479434
5369	NC_017040	GAG	2	6	249500	249505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383479434
5370	NC_017040	CAG	2	6	249553	249558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479434
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5372	NC_017040	AAC	3	9	249612	249620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383479434
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5491	NC_017040	TTA	2	6	255295	255300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_017040	A	6	6	255320	255325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5493	NC_017040	TCATT	2	10	255396	255405	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5497	NC_017040	GAC	2	6	255677	255682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479439
5498	NC_017040	ACTTAT	2	12	255786	255797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383479439
5499	NC_017040	GAA	2	6	255837	255842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383479439
5500	NC_017040	CAG	2	6	255856	255861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383479439

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