MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Saprospira grandis str. Lewin chromosome

Total Repeats: 93812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016940	A	6	6	46	51	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016940	T	7	7	56	62	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016940	T	7	7	70	76	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016940	T	6	6	133	138	0 %	100 %	0 %	0 %	379728135
5	NC_016940	TAG	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
6	NC_016940	TAAA	2	8	222	229	75 %	25 %	0 %	0 %	379728135
7	NC_016940	AGG	2	6	237	242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379728135
8	NC_016940	CTT	2	6	328	333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728135
9	NC_016940	GGC	2	6	376	381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728135
10	NC_016940	GAA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
11	NC_016940	ACA	2	6	427	432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728135
12	NC_016940	A	6	6	434	439	100 %	0 %	0 %	0 %	379728135
13	NC_016940	ACA	2	6	496	501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728135
14	NC_016940	AGA	2	6	509	514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
15	NC_016940	A	6	6	596	601	100 %	0 %	0 %	0 %	379728135
16	NC_016940	CTG	2	6	678	683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728135
17	NC_016940	TGA	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
18	NC_016940	GGT	2	6	814	819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728135
19	NC_016940	ACT	2	6	897	902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728135
20	NC_016940	GAT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
21	NC_016940	AAG	2	6	950	955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
22	NC_016940	TTTC	2	8	973	980	0 %	75 %	0 %	25 %	379728135
23	NC_016940	ATC	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728135
24	NC_016940	CT	3	6	1094	1099	0 %	50 %	0 %	50 %	379728135
25	NC_016940	CAA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728135
26	NC_016940	ATG	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
27	NC_016940	GAT	2	6	1328	1333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728135
28	NC_016940	ACT	2	6	1380	1385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728135
29	NC_016940	CT	3	6	1451	1456	0 %	50 %	0 %	50 %	379728135
30	NC_016940	TAA	2	6	1480	1485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728135
31	NC_016940	GCC	2	6	1505	1510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728135
32	NC_016940	TGG	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728135
33	NC_016940	AGA	2	6	1614	1619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728135
34	NC_016940	GGC	2	6	1666	1671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016940	GCC	2	6	1688	1693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016940	T	6	6	1694	1699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016940	GCC	2	6	1748	1753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016940	GGC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016940	CGACC	2	10	1821	1830	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016940	A	8	8	1849	1856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016940	TATT	2	8	1899	1906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016940	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728136
43	NC_016940	CAT	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728136
44	NC_016940	TCCA	2	8	2036	2043	25 %	25 %	0 %	50 %	379728136
45	NC_016940	CA	3	6	2056	2061	50 %	0 %	0 %	50 %	379728136
46	NC_016940	CCT	2	6	2067	2072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728136
47	NC_016940	CGG	2	6	2091	2096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728136
48	NC_016940	TTC	2	6	2191	2196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728136
49	NC_016940	GGT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728136
50	NC_016940	CCA	2	6	2319	2324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728136
51	NC_016940	CTT	2	6	2473	2478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728136
52	NC_016940	CGT	2	6	2557	2562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728136
53	NC_016940	GGT	2	6	2563	2568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728136
54	NC_016940	AAT	2	6	2580	2585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728136
55	NC_016940	TC	3	6	2673	2678	0 %	50 %	0 %	50 %	379728136
56	NC_016940	GCC	2	6	2759	2764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728136
57	NC_016940	CTT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728136
58	NC_016940	A	6	6	2808	2813	100 %	0 %	0 %	0 %	379728136
59	NC_016940	GCC	2	6	3040	3045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728136
60	NC_016940	ATA	2	6	3046	3051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728136
61	NC_016940	TTA	2	6	3080	3085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728136
62	NC_016940	GCT	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728136
63	NC_016940	CTG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728136
64	NC_016940	CTC	2	6	3175	3180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728136
65	NC_016940	A	7	7	3232	3238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016940	GTTT	2	8	3248	3255	0 %	75 %	25 %	0 %	379728137
67	NC_016940	CT	3	6	3263	3268	0 %	50 %	0 %	50 %	379728137
68	NC_016940	T	9	9	3328	3336	0 %	100 %	0 %	0 %	379728137
69	NC_016940	AACA	2	8	3469	3476	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016940	ATT	3	9	3485	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016940	TGG	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728138
72	NC_016940	ATT	2	6	3549	3554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728138
73	NC_016940	ATT	2	6	3590	3595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728138
74	NC_016940	A	8	8	3621	3628	100 %	0 %	0 %	0 %	379728138
75	NC_016940	GTC	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728138
76	NC_016940	CCT	2	6	3731	3736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379728138
77	NC_016940	CAT	2	6	3746	3751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728138
78	NC_016940	GAAA	2	8	3817	3824	75 %	0 %	25 %	0 %	379728138
79	NC_016940	CTTT	2	8	3947	3954	0 %	75 %	0 %	25 %	379728138
80	NC_016940	GCC	2	6	3962	3967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728138
81	NC_016940	CGA	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728138
82	NC_016940	GAT	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728138
83	NC_016940	TGCC	2	8	4359	4366	0 %	25 %	25 %	50 %	379728138
84	NC_016940	ATG	2	6	4371	4376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379728138
85	NC_016940	CAA	2	6	4379	4384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379728138
86	NC_016940	TTC	2	6	4415	4420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728138
87	NC_016940	AGA	2	6	4426	4431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
88	NC_016940	GAA	2	6	4475	4480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
89	NC_016940	A	6	6	4538	4543	100 %	0 %	0 %	0 %	379728138
90	NC_016940	GAA	2	6	4559	4564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
91	NC_016940	ATTT	2	8	4591	4598	25 %	75 %	0 %	0 %	379728138
92	NC_016940	CGC	2	6	4625	4630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728138
93	NC_016940	AGA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
94	NC_016940	GAA	2	6	4769	4774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
95	NC_016940	GGT	2	6	4813	4818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379728138
96	NC_016940	GAA	2	6	4823	4828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
97	NC_016940	AGA	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728138
98	NC_016940	AAT	2	6	4848	4853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728138
99	NC_016940	T	7	7	4890	4896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016940	GCGG	2	8	4913	4920	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016940	CTG	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016940	TCG	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016940	TTCGGC	2	12	5041	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016940	TCA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016940	ATC	2	6	5102	5107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016940	CAT	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728139
107	NC_016940	A	6	6	5217	5222	100 %	0 %	0 %	0 %	379728139
108	NC_016940	ATT	2	6	5252	5257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
109	NC_016940	CCA	2	6	5319	5324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728139
110	NC_016940	ATT	2	6	5355	5360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
111	NC_016940	ATT	2	6	5410	5415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
112	NC_016940	CCG	2	6	5434	5439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728139
113	NC_016940	AAG	3	9	5532	5540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
114	NC_016940	GAAAT	2	10	5579	5588	60 %	20 %	20 %	0 %	379728139
115	NC_016940	AAG	2	6	5598	5603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
116	NC_016940	GCTTT	2	10	5662	5671	0 %	60 %	20 %	20 %	379728139
117	NC_016940	TTGCGC	2	12	5774	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728139
118	NC_016940	AAG	2	6	5802	5807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
119	NC_016940	AAG	2	6	5832	5837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
120	NC_016940	ATT	2	6	5876	5881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
121	NC_016940	AAG	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728139
122	NC_016940	T	6	6	5896	5901	0 %	100 %	0 %	0 %	379728139
123	NC_016940	ACT	2	6	5920	5925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728139
124	NC_016940	ATT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379728139
125	NC_016940	GCA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728139
126	NC_016940	TGC	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728139
127	NC_016940	TCA	2	6	6144	6149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379728139
128	NC_016940	CGG	3	9	6199	6207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728139
129	NC_016940	CTGG	2	8	6235	6242	0 %	25 %	50 %	25 %	379728139
130	NC_016940	AAT	2	6	6290	6295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379728139
131	NC_016940	CCT	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016940	CAA	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016940	CGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728140
134	NC_016940	CGA	2	6	6639	6644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379728140
135	NC_016940	CCG	2	6	6658	6663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379728140
136	NC_016940	TGC	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379728140
137	NC_016940	T	7	7	6715	6721	0 %	100 %	0 %	0 %	379728140
138	NC_016940	TGC	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016940	T	6	6	6785	6790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_016940	AT	3	6	11711	11716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_016940	GAA	2	6	17151	17156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379728154
404	NC_016940	CAC	2	6	17184	17189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379728154
405	NC_016940	TTC	2	6	17223	17228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379728154
406	NC_016940	CT	3	6	17252	17257	0 %	50 %	0 %	50 %	379728154
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423	NC_016940	TTG	2	6	17884	17889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_016940	GCG	2	6	17935	17940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379728155
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428	NC_016940	A	6	6	18069	18074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_016940	A	7	7	18104	18110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_016940	A	6	6	18959	18964	100 %	0 %	0 %	0 %	379728156
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