MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016912	A	6	6	547929	547934	100 %	0 %	0 %	0 %	379013844
13002	NC_016912	A	6	6	547969	547974	100 %	0 %	0 %	0 %	379013844
13003	NC_016912	GTC	2	6	547982	547987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013844
13004	NC_016912	ACTGCA	2	12	548008	548019	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
13005	NC_016912	TAG	2	6	548067	548072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013844
13006	NC_016912	CAC	2	6	548084	548089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013844
13007	NC_016912	AATC	2	8	548104	548111	50 %	25 %	0 %	25 %	379013844
13008	NC_016912	TAC	2	6	548112	548117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013844
13009	NC_016912	AAC	2	6	548133	548138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013844
13010	NC_016912	ATC	2	6	548148	548153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013844
13011	NC_016912	AAC	2	6	548223	548228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013844
13012	NC_016912	CAA	2	6	548284	548289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013844
13013	NC_016912	ACT	2	6	548362	548367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013844
13014	NC_016912	TTAAAA	2	12	548404	548415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013844
13015	NC_016912	GAT	2	6	548431	548436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013844
13016	NC_016912	TA	3	6	548525	548530	50 %	50 %	0 %	0 %	379013844
13017	NC_016912	ATT	2	6	548545	548550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013844
13018	NC_016912	ACA	2	6	548572	548577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013844
13019	NC_016912	ACA	3	9	548581	548589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013844
13020	NC_016912	CAA	2	6	548672	548677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013844
13021	NC_016912	GAA	2	6	548731	548736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013844
13022	NC_016912	TAA	2	6	548754	548759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013844
13023	NC_016912	A	6	6	548758	548763	100 %	0 %	0 %	0 %	379013844
13024	NC_016912	AAAC	2	8	548860	548867	75 %	0 %	0 %	25 %	379013844
13025	NC_016912	A	6	6	548910	548915	100 %	0 %	0 %	0 %	379013844
13026	NC_016912	TTAT	2	8	549011	549018	25 %	75 %	0 %	0 %	379013844
13027	NC_016912	ATA	2	6	549026	549031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013844
13028	NC_016912	AGC	2	6	549067	549072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013844
13029	NC_016912	CAT	2	6	549084	549089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013844
13030	NC_016912	CAA	2	6	549091	549096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013844
13031	NC_016912	ATA	2	6	549110	549115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013844
13032	NC_016912	TCA	2	6	549205	549210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013844
13033	NC_016912	TATG	2	8	549250	549257	25 %	50 %	25 %	0 %	379013844
13034	NC_016912	ACA	2	6	549361	549366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013844
13035	NC_016912	GAT	2	6	549472	549477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013844
13036	NC_016912	ACTA	2	8	549495	549502	50 %	25 %	0 %	25 %	379013844
13037	NC_016912	ACA	2	6	549527	549532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013844
13038	NC_016912	TAA	2	6	549600	549605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013844
13039	NC_016912	CTG	2	6	549767	549772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013844
13040	NC_016912	GAT	2	6	549805	549810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013844
13041	NC_016912	TGG	2	6	549822	549827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013844
13042	NC_016912	ATG	2	6	549854	549859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013844
13043	NC_016912	CTA	2	6	549879	549884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013844
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13048	NC_016912	GACTCA	2	12	550027	550038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
13049	NC_016912	GACTCA	2	12	550063	550074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
13050	NC_016912	GACTCA	2	12	550099	550110	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
13051	NC_016912	GATTCA	2	12	550117	550128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
13052	NC_016912	GATTCA	2	12	550153	550164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
13053	NC_016912	TCAGAC	2	12	550198	550209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
13054	NC_016912	GACTCA	2	12	550213	550224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
13055	NC_016912	GATTCA	2	12	550231	550242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
13056	NC_016912	TCAGAT	2	12	550252	550263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
13057	NC_016912	GACTCA	2	12	550267	550278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
13058	NC_016912	TCAGAT	2	12	550288	550299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
13059	NC_016912	TCAGAT	2	12	550324	550335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
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13061	NC_016912	GACTCA	2	12	550393	550404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
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13065	NC_016912	TCAGAT	2	12	550486	550497	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
13066	NC_016912	TCAGAT	2	12	550522	550533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
13067	NC_016912	GATTCA	2	12	550537	550548	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
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13072	NC_016912	ATT	2	6	550695	550700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013844
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13075	NC_016912	ATAA	2	8	550727	550734	75 %	25 %	0 %	0 %	379013844
13076	NC_016912	TTAAC	2	10	550740	550749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13078	NC_016912	A	6	6	550801	550806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_016912	AATTT	2	10	550825	550834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13081	NC_016912	T	6	6	550903	550908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_016912	ATG	2	6	550909	550914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_016912	TAAA	2	8	550917	550924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_016912	TTTA	2	8	550947	550954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_016912	AAT	2	6	550991	550996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_016912	TAT	2	6	551065	551070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_016912	TGA	2	6	551080	551085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_016912	TAAA	2	8	551159	551166	75 %	25 %	0 %	0 %	379013845
13089	NC_016912	TAG	2	6	551207	551212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013845
13090	NC_016912	ACA	2	6	551215	551220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013845
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13093	NC_016912	AATC	2	8	551308	551315	50 %	25 %	0 %	25 %	379013845
13094	NC_016912	GCA	2	6	551334	551339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013845
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13098	NC_016912	AAAC	2	8	551539	551546	75 %	0 %	0 %	25 %	379013845
13099	NC_016912	AAG	2	6	551558	551563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013845
13100	NC_016912	CAAC	2	8	551608	551615	50 %	0 %	0 %	50 %	379013845
13101	NC_016912	ATG	2	6	551693	551698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013845
13102	NC_016912	TTG	2	6	551705	551710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013845
13103	NC_016912	AAT	2	6	551728	551733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013845
13104	NC_016912	AAT	2	6	551737	551742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013845
13105	NC_016912	AGC	2	6	551802	551807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013845
13106	NC_016912	CAT	2	6	551816	551821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013845
13107	NC_016912	ACA	2	6	551863	551868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013845
13108	NC_016912	ATT	2	6	551918	551923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013845
13109	NC_016912	TGA	2	6	551949	551954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013845
13110	NC_016912	ATT	2	6	551972	551977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013845
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13112	NC_016912	TAATT	2	10	552105	552114	40 %	60 %	0 %	0 %	379013845
13113	NC_016912	AATT	2	8	552165	552172	50 %	50 %	0 %	0 %	379013845
13114	NC_016912	TAC	2	6	552246	552251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013845
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13116	NC_016912	TGT	2	6	552288	552293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013845
13117	NC_016912	AAAC	2	8	552373	552380	75 %	0 %	0 %	25 %	379013845
13118	NC_016912	TAA	2	6	552456	552461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013845
13119	NC_016912	AAAT	2	8	552470	552477	75 %	25 %	0 %	0 %	379013845
13120	NC_016912	AT	3	6	552499	552504	50 %	50 %	0 %	0 %	379013845
13121	NC_016912	TAAA	2	8	552527	552534	75 %	25 %	0 %	0 %	379013845
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13123	NC_016912	TGT	2	6	552651	552656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013845
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13128	NC_016912	TAA	2	6	552840	552845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013845
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13141	NC_016912	ACAA	2	8	553593	553600	75 %	0 %	0 %	25 %	379013845
13142	NC_016912	AC	3	6	553685	553690	50 %	0 %	0 %	50 %	379013845
13143	NC_016912	TGA	2	6	553713	553718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013845
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13152	NC_016912	CTG	2	6	554339	554344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013845
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13180	NC_016912	ATAAA	2	10	555220	555229	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13187	NC_016912	ATG	2	6	555561	555566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013846
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13204	NC_016912	AAAAT	2	10	556137	556146	80 %	20 %	0 %	0 %	379013846
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13206	NC_016912	ATCAT	2	10	556221	556230	40 %	40 %	0 %	20 %	379013846
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13210	NC_016912	ATA	2	6	556638	556643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013846
13211	NC_016912	ACT	2	6	556703	556708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013846
13212	NC_016912	A	6	6	556750	556755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13213	NC_016912	ATC	2	6	556769	556774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13214	NC_016912	TA	3	6	556866	556871	50 %	50 %	0 %	0 %	379013847
13215	NC_016912	ACG	2	6	556903	556908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013847
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13220	NC_016912	TTA	2	6	557152	557157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013847
13221	NC_016912	GTAA	2	8	557209	557216	50 %	25 %	25 %	0 %	379013847
13222	NC_016912	T	6	6	557258	557263	0 %	100 %	0 %	0 %	379013847
13223	NC_016912	CATA	2	8	557281	557288	50 %	25 %	0 %	25 %	379013847
13224	NC_016912	TAAT	2	8	557326	557333	50 %	50 %	0 %	0 %	379013847
13225	NC_016912	TTG	2	6	557339	557344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013847
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13227	NC_016912	AAC	2	6	557456	557461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013847
13228	NC_016912	TGC	2	6	557502	557507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013847
13229	NC_016912	TA	3	6	557560	557565	50 %	50 %	0 %	0 %	379013847
13230	NC_016912	TG	3	6	557608	557613	0 %	50 %	50 %	0 %	379013847
13231	NC_016912	CTA	2	6	557629	557634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013847
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13233	NC_016912	GTT	2	6	557719	557724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013847
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13235	NC_016912	TTGT	2	8	557768	557775	0 %	75 %	25 %	0 %	379013847
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13358	NC_016912	A	6	6	563283	563288	100 %	0 %	0 %	0 %	379013854
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13483	NC_016912	TCA	2	6	567975	567980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013857
13484	NC_016912	TGA	2	6	568062	568067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013857
13485	NC_016912	ATG	2	6	568163	568168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013857
13486	NC_016912	TTA	2	6	568184	568189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013857
13487	NC_016912	TAT	2	6	568232	568237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013857
13488	NC_016912	TGCC	2	8	568386	568393	0 %	25 %	25 %	50 %	379013857
13489	NC_016912	AT	3	6	568427	568432	50 %	50 %	0 %	0 %	379013857
13490	NC_016912	GTG	2	6	568436	568441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013857
13491	NC_016912	ATT	2	6	568494	568499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013857
13492	NC_016912	GCA	2	6	568561	568566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013857
13493	NC_016912	AACC	2	8	568643	568650	50 %	0 %	0 %	50 %	379013858
13494	NC_016912	ACC	2	6	568666	568671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013858
13495	NC_016912	TG	3	6	568677	568682	0 %	50 %	50 %	0 %	379013858
13496	NC_016912	ATTT	2	8	568704	568711	25 %	75 %	0 %	0 %	379013858
13497	NC_016912	A	6	6	568712	568717	100 %	0 %	0 %	0 %	379013858
13498	NC_016912	AT	3	6	568787	568792	50 %	50 %	0 %	0 %	379013858
13499	NC_016912	AGA	2	6	568804	568809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013858
13500	NC_016912	TTA	2	6	568905	568910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013858

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