MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
61501	NC_016912	ATC	2	6	2565476	2565481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61502	NC_016912	TAGT	2	8	2565576	2565583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61503	NC_016912	AGCA	2	8	2565603	2565610	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61504	NC_016912	GTAAAT	2	12	2565614	2565625	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61505	NC_016912	ATT	2	6	2565630	2565635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61506	NC_016912	AT	3	6	2565649	2565654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61507	NC_016912	AGA	2	6	2565671	2565676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61508	NC_016912	ATCAA	2	10	2565682	2565691	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61509	NC_016912	ATT	2	6	2565697	2565702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61510	NC_016912	ACA	2	6	2565705	2565710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61511	NC_016912	ATCA	2	8	2565793	2565800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61512	NC_016912	ATT	2	6	2565862	2565867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61513	NC_016912	TTA	2	6	2565952	2565957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61514	NC_016912	GAC	2	6	2566049	2566054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61515	NC_016912	CAT	2	6	2566061	2566066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61516	NC_016912	ATC	2	6	2566091	2566096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61517	NC_016912	ATTG	2	8	2566130	2566137	25 %	50 %	25 %	0 %	379015723
61518	NC_016912	TGT	2	6	2566147	2566152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015723
61519	NC_016912	ACG	2	6	2566188	2566193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015723
61520	NC_016912	GTTT	2	8	2566206	2566213	0 %	75 %	25 %	0 %	379015723
61521	NC_016912	GTC	2	6	2566221	2566226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015723
61522	NC_016912	TC	4	8	2566238	2566245	0 %	50 %	0 %	50 %	379015723
61523	NC_016912	TTG	2	6	2566281	2566286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015723
61524	NC_016912	TAAC	2	8	2566295	2566302	50 %	25 %	0 %	25 %	379015723
61525	NC_016912	ATC	2	6	2566305	2566310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61526	NC_016912	CTA	2	6	2566379	2566384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61527	NC_016912	GAT	2	6	2566406	2566411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015723
61528	NC_016912	CTTCAA	2	12	2566424	2566435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61529	NC_016912	TAA	3	9	2566460	2566468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015723
61530	NC_016912	CAT	3	9	2566502	2566510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61531	NC_016912	GTA	2	6	2566536	2566541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015723
61532	NC_016912	TCA	2	6	2566660	2566665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61533	NC_016912	CTA	2	6	2566667	2566672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61534	NC_016912	GTG	2	6	2566721	2566726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015723
61535	NC_016912	TTAAA	2	10	2566787	2566796	60 %	40 %	0 %	0 %	379015723
61536	NC_016912	ACT	2	6	2566816	2566821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61537	NC_016912	CAT	2	6	2566902	2566907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61538	NC_016912	ACA	2	6	2566926	2566931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015723
61539	NC_016912	TGC	2	6	2567067	2567072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015723
61540	NC_016912	CCAT	2	8	2567145	2567152	25 %	25 %	0 %	50 %	379015723
61541	NC_016912	ATC	2	6	2567214	2567219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61542	NC_016912	CGT	2	6	2567223	2567228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015723
61543	NC_016912	ATCC	2	8	2567281	2567288	25 %	25 %	0 %	50 %	379015723
61544	NC_016912	CAT	2	6	2567324	2567329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61545	NC_016912	T	6	6	2567339	2567344	0 %	100 %	0 %	0 %	379015723
61546	NC_016912	TG	3	6	2567395	2567400	0 %	50 %	50 %	0 %	379015723
61547	NC_016912	AGC	2	6	2567469	2567474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015723
61548	NC_016912	AT	3	6	2567476	2567481	50 %	50 %	0 %	0 %	379015723
61549	NC_016912	CAT	2	6	2567508	2567513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015723
61550	NC_016912	TTA	2	6	2567569	2567574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015723
61551	NC_016912	AT	3	6	2567606	2567611	50 %	50 %	0 %	0 %	379015723
61552	NC_016912	TAT	2	6	2567624	2567629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015723
61553	NC_016912	AAT	2	6	2567682	2567687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015723
61554	NC_016912	TAAC	2	8	2567726	2567733	50 %	25 %	0 %	25 %	379015723
61555	NC_016912	TGA	2	6	2567760	2567765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61556	NC_016912	TA	3	6	2567789	2567794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61557	NC_016912	CAT	2	6	2567795	2567800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61558	NC_016912	ACACT	2	10	2567855	2567864	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61559	NC_016912	ATTA	2	8	2567968	2567975	50 %	50 %	0 %	0 %	379015724
61560	NC_016912	TG	3	6	2568012	2568017	0 %	50 %	50 %	0 %	379015724
61561	NC_016912	TAA	2	6	2568078	2568083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015724
61562	NC_016912	T	6	6	2568146	2568151	0 %	100 %	0 %	0 %	379015724
61563	NC_016912	TTA	2	6	2568158	2568163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015724
61564	NC_016912	TCT	2	6	2568191	2568196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015724
61565	NC_016912	AT	3	6	2568209	2568214	50 %	50 %	0 %	0 %	379015724
61566	NC_016912	AC	3	6	2568225	2568230	50 %	0 %	0 %	50 %	379015724
61567	NC_016912	ATT	2	6	2568289	2568294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015724
61568	NC_016912	T	7	7	2568293	2568299	0 %	100 %	0 %	0 %	379015724
61569	NC_016912	ATC	2	6	2568313	2568318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015724
61570	NC_016912	TTC	2	6	2568322	2568327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015724
61571	NC_016912	TCA	2	6	2568347	2568352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015724
61572	NC_016912	ATA	2	6	2568362	2568367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015724
61573	NC_016912	TTCAT	2	10	2568374	2568383	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61574	NC_016912	ATTC	2	8	2568421	2568428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61575	NC_016912	TATT	2	8	2568432	2568439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61576	NC_016912	CTT	2	6	2568459	2568464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61577	NC_016912	ATT	2	6	2568558	2568563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61578	NC_016912	TTTTA	2	10	2568615	2568624	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61579	NC_016912	TGA	2	6	2568720	2568725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015725
61580	NC_016912	GAAT	2	8	2568767	2568774	50 %	25 %	25 %	0 %	379015725
61581	NC_016912	TCT	2	6	2568777	2568782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015725
61582	NC_016912	ATC	2	6	2568818	2568823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015725
61583	NC_016912	TA	3	6	2568836	2568841	50 %	50 %	0 %	0 %	379015725
61584	NC_016912	TC	3	6	2568866	2568871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61585	NC_016912	TA	3	6	2568880	2568885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61586	NC_016912	ATC	2	6	2568987	2568992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61587	NC_016912	CA	3	6	2569030	2569035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61588	NC_016912	AAC	2	6	2569045	2569050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61589	NC_016912	A	6	6	2569079	2569084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61590	NC_016912	CAATA	2	10	2569094	2569103	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61591	NC_016912	CTA	2	6	2569121	2569126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61592	NC_016912	TA	3	6	2569125	2569130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61593	NC_016912	ATTT	2	8	2569132	2569139	25 %	75 %	0 %	0 %	379015726
61594	NC_016912	TCA	2	6	2569174	2569179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015726
61595	NC_016912	TAA	2	6	2569195	2569200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015726
61596	NC_016912	AT	3	6	2569204	2569209	50 %	50 %	0 %	0 %	379015726
61597	NC_016912	CTG	2	6	2569244	2569249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015726
61598	NC_016912	ACT	2	6	2569369	2569374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015726
61599	NC_016912	TTC	2	6	2569461	2569466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015726
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61601	NC_016912	T	6	6	2569572	2569577	0 %	100 %	0 %	0 %	379015726
61602	NC_016912	TCT	3	9	2569579	2569587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015726
61603	NC_016912	ATAA	2	8	2569592	2569599	75 %	25 %	0 %	0 %	379015726
61604	NC_016912	GATTT	2	10	2569636	2569645	20 %	60 %	20 %	0 %	379015726
61605	NC_016912	CAT	2	6	2569721	2569726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015726
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61607	NC_016912	GTA	2	6	2570036	2570041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015726
61608	NC_016912	CCA	2	6	2570062	2570067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015726
61609	NC_016912	CTT	2	6	2570279	2570284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015726
61610	NC_016912	CAT	2	6	2570396	2570401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015726
61611	NC_016912	T	6	6	2570438	2570443	0 %	100 %	0 %	0 %	379015726
61612	NC_016912	T	6	6	2570448	2570453	0 %	100 %	0 %	0 %	379015726
61613	NC_016912	TTC	2	6	2570622	2570627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015726
61614	NC_016912	GCA	2	6	2570680	2570685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015726
61615	NC_016912	ATAA	2	8	2570695	2570702	75 %	25 %	0 %	0 %	379015726
61616	NC_016912	AAT	2	6	2570711	2570716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015726
61617	NC_016912	CTT	2	6	2570744	2570749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015726
61618	NC_016912	TATCTT	2	12	2570750	2570761	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379015726
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61620	NC_016912	ATG	2	6	2570806	2570811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015726
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61664	NC_016912	TATT	2	8	2572804	2572811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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