MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57003	NC_016912	TAT	2	6	2375883	2375888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57004	NC_016912	ATC	2	6	2375975	2375980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015554
57005	NC_016912	GTC	2	6	2375981	2375986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015554
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57008	NC_016912	GAA	3	9	2376091	2376099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015554
57009	NC_016912	CCG	2	6	2376111	2376116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379015554
57010	NC_016912	A	7	7	2376120	2376126	100 %	0 %	0 %	0 %	379015554
57011	NC_016912	TA	3	6	2376131	2376136	50 %	50 %	0 %	0 %	379015554
57012	NC_016912	ATT	2	6	2376139	2376144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015554
57013	NC_016912	ATT	2	6	2376157	2376162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015554
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57016	NC_016912	A	6	6	2376244	2376249	100 %	0 %	0 %	0 %	379015554
57017	NC_016912	A	6	6	2376320	2376325	100 %	0 %	0 %	0 %	379015554
57018	NC_016912	TGA	2	6	2376327	2376332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015554
57019	NC_016912	ATT	2	6	2376334	2376339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015554
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57022	NC_016912	AACAA	2	10	2376380	2376389	80 %	0 %	0 %	20 %	379015554
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57028	NC_016912	TGA	2	6	2376646	2376651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57029	NC_016912	T	6	6	2376671	2376676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57030	NC_016912	TACA	2	8	2376697	2376704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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57032	NC_016912	TA	3	6	2376720	2376725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57033	NC_016912	TA	3	6	2376729	2376734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57034	NC_016912	ACTA	2	8	2376841	2376848	50 %	25 %	0 %	25 %	379015555
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57056	NC_016912	GAA	2	6	2377766	2377771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015555
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57103	NC_016912	AT	3	6	2379702	2379707	50 %	50 %	0 %	0 %	379015558
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57117	NC_016912	A	7	7	2380392	2380398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57118	NC_016912	TTA	2	6	2380407	2380412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57239	NC_016912	TAA	2	6	2385296	2385301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015561
57240	NC_016912	CT	3	6	2385359	2385364	0 %	50 %	0 %	50 %	379015561
57241	NC_016912	TGA	2	6	2385419	2385424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015561
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57243	NC_016912	ATGC	2	8	2385478	2385485	25 %	25 %	25 %	25 %	379015561
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57246	NC_016912	GCA	2	6	2385681	2385686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015561
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57251	NC_016912	GCAA	2	8	2385759	2385766	50 %	0 %	25 %	25 %	379015561
57252	NC_016912	CGC	2	6	2385808	2385813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379015561
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57258	NC_016912	T	7	7	2386041	2386047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57259	NC_016912	TAA	2	6	2386059	2386064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57260	NC_016912	ATTG	2	8	2386074	2386081	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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57262	NC_016912	TTAA	2	8	2386158	2386165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57263	NC_016912	T	6	6	2386168	2386173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57264	NC_016912	AAT	2	6	2386211	2386216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57265	NC_016912	TAAT	2	8	2386233	2386240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57266	NC_016912	TAA	2	6	2386260	2386265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57267	NC_016912	ACT	2	6	2386321	2386326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015562
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57307	NC_016912	ATA	2	6	2387845	2387850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57350	NC_016912	GCAATT	2	12	2389998	2390009	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379015564
57351	NC_016912	GTT	3	9	2390035	2390043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57352	NC_016912	TAC	2	6	2390055	2390060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57353	NC_016912	CA	3	6	2390104	2390109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57354	NC_016912	AC	3	6	2390131	2390136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57355	NC_016912	GT	3	6	2390167	2390172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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57357	NC_016912	ATA	2	6	2390215	2390220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57476	NC_016912	CGTA	2	8	2394447	2394454	25 %	25 %	25 %	25 %	379015569
57477	NC_016912	TGT	2	6	2394496	2394501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015569
57478	NC_016912	TTA	2	6	2394580	2394585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015569
57479	NC_016912	CTA	2	6	2394590	2394595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015569
57480	NC_016912	ATA	2	6	2394625	2394630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015569
57481	NC_016912	CAC	2	6	2394801	2394806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015569
57482	NC_016912	ATA	2	6	2394820	2394825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015569
57483	NC_016912	TC	3	6	2394931	2394936	0 %	50 %	0 %	50 %	379015569
57484	NC_016912	ATA	2	6	2394976	2394981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015569
57485	NC_016912	ACA	2	6	2395006	2395011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015569
57486	NC_016912	GTT	3	9	2395019	2395027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015569
57487	NC_016912	CTG	2	6	2395043	2395048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015569
57488	NC_016912	TAAT	2	8	2395088	2395095	50 %	50 %	0 %	0 %	379015569
57489	NC_016912	CAA	2	6	2395134	2395139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015569
57490	NC_016912	TTG	2	6	2395194	2395199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015569
57491	NC_016912	TCAATT	2	12	2395261	2395272	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379015569
57492	NC_016912	TTA	2	6	2395402	2395407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015569
57493	NC_016912	TCCT	2	8	2395455	2395462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57494	NC_016912	A	6	6	2395466	2395471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57495	NC_016912	ATAAA	2	10	2395489	2395498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57496	NC_016912	CAT	2	6	2395552	2395557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57497	NC_016912	TATG	2	8	2395623	2395630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57498	NC_016912	TTTG	2	8	2395650	2395657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57499	NC_016912	ATG	2	6	2395698	2395703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57500	NC_016912	TTA	2	6	2395704	2395709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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