MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56002	NC_016912	T	6	6	2333335	2333340	0 %	100 %	0 %	0 %	379015515
56003	NC_016912	TCA	2	6	2333394	2333399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015515
56004	NC_016912	CTA	2	6	2333415	2333420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015515
56005	NC_016912	GAT	2	6	2333436	2333441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015515
56006	NC_016912	TTC	2	6	2333455	2333460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015515
56007	NC_016912	TGT	2	6	2333504	2333509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015515
56008	NC_016912	AT	3	6	2333513	2333518	50 %	50 %	0 %	0 %	379015515
56009	NC_016912	T	6	6	2333536	2333541	0 %	100 %	0 %	0 %	379015515
56010	NC_016912	CGC	2	6	2333662	2333667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379015516
56011	NC_016912	TAC	2	6	2333683	2333688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015516
56012	NC_016912	TG	3	6	2333722	2333727	0 %	50 %	50 %	0 %	379015516
56013	NC_016912	TAA	2	6	2333768	2333773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015516
56014	NC_016912	TCA	2	6	2333872	2333877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015516
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56017	NC_016912	CAATC	2	10	2334148	2334157	40 %	20 %	0 %	40 %	379015516
56018	NC_016912	CTT	2	6	2334193	2334198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015516
56019	NC_016912	AT	3	6	2334217	2334222	50 %	50 %	0 %	0 %	379015516
56020	NC_016912	CTG	2	6	2334256	2334261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015516
56021	NC_016912	GCT	2	6	2334264	2334269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015516
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56034	NC_016912	A	6	6	2334841	2334846	100 %	0 %	0 %	0 %	379015516
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56115	NC_016912	T	6	6	2339091	2339096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56204	NC_016912	A	7	7	2342828	2342834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56205	NC_016912	TAA	2	6	2342960	2342965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015521
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56227	NC_016912	AT	3	6	2343787	2343792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56228	NC_016912	TAT	3	9	2343810	2343818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56231	NC_016912	T	6	6	2343939	2343944	0 %	100 %	0 %	0 %	379015522
56232	NC_016912	CTT	2	6	2344029	2344034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015522
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56236	NC_016912	GTA	2	6	2344196	2344201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015522
56237	NC_016912	CAAT	2	8	2344253	2344260	50 %	25 %	0 %	25 %	379015522
56238	NC_016912	CATG	2	8	2344290	2344297	25 %	25 %	25 %	25 %	379015522
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56240	NC_016912	ATC	2	6	2344340	2344345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015522
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56244	NC_016912	TTA	2	6	2344491	2344496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56356	NC_016912	CAA	2	6	2349531	2349536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015529
56357	NC_016912	TA	3	6	2349595	2349600	50 %	50 %	0 %	0 %	379015529
56358	NC_016912	T	6	6	2349718	2349723	0 %	100 %	0 %	0 %	379015529
56359	NC_016912	AAT	2	6	2349758	2349763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015529
56360	NC_016912	T	6	6	2349772	2349777	0 %	100 %	0 %	0 %	379015529
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56375	NC_016912	TAAT	2	8	2350206	2350213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56379	NC_016912	A	7	7	2350356	2350362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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56446	NC_016912	AAATGC	2	12	2353320	2353331	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379015534
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56455	NC_016912	CTT	3	9	2353763	2353771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015534
56456	NC_016912	TAA	2	6	2353784	2353789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015534
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56458	NC_016912	ATC	2	6	2353948	2353953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015534
56459	NC_016912	AT	3	6	2353977	2353982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56460	NC_016912	CTTATT	2	12	2353986	2353997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56461	NC_016912	TA	3	6	2354073	2354078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56462	NC_016912	TATT	2	8	2354091	2354098	25 %	75 %	0 %	0 %	379015535
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56464	NC_016912	T	6	6	2354115	2354120	0 %	100 %	0 %	0 %	379015535
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56466	NC_016912	AAT	2	6	2354167	2354172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015535
56467	NC_016912	TCA	2	6	2354228	2354233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015535
56468	NC_016912	TTGC	2	8	2354284	2354291	0 %	50 %	25 %	25 %	379015535
56469	NC_016912	TAAT	2	8	2354306	2354313	50 %	50 %	0 %	0 %	379015535
56470	NC_016912	TGT	2	6	2354341	2354346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015535
56471	NC_016912	CATT	2	8	2354375	2354382	25 %	50 %	0 %	25 %	379015535
56472	NC_016912	ACCA	2	8	2354439	2354446	50 %	0 %	0 %	50 %	379015535
56473	NC_016912	TTG	2	6	2354477	2354482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015535
56474	NC_016912	TGTT	2	8	2354484	2354491	0 %	75 %	25 %	0 %	379015535
56475	NC_016912	ACA	2	6	2354500	2354505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015535
56476	NC_016912	GTA	2	6	2354515	2354520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015535
56477	NC_016912	AAC	2	6	2354523	2354528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015535
56478	NC_016912	CTA	2	6	2354540	2354545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015535
56479	NC_016912	TAA	2	6	2354625	2354630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015535
56480	NC_016912	ATC	2	6	2354704	2354709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015535
56481	NC_016912	ATA	2	6	2354728	2354733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015535
56482	NC_016912	TAA	2	6	2354778	2354783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015535
56483	NC_016912	AAT	2	6	2354815	2354820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015535
56484	NC_016912	AAC	2	6	2354829	2354834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015535
56485	NC_016912	CCG	2	6	2354911	2354916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379015535
56486	NC_016912	A	6	6	2354930	2354935	100 %	0 %	0 %	0 %	379015535
56487	NC_016912	T	6	6	2354980	2354985	0 %	100 %	0 %	0 %	379015535
56488	NC_016912	ACA	2	6	2355031	2355036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015535
56489	NC_016912	CAA	2	6	2355065	2355070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015535
56490	NC_016912	ACCAA	2	10	2355115	2355124	60 %	0 %	0 %	40 %	379015535
56491	NC_016912	AT	3	6	2355133	2355138	50 %	50 %	0 %	0 %	379015535
56492	NC_016912	TCA	3	9	2355179	2355187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015535
56493	NC_016912	CAT	2	6	2355192	2355197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015535
56494	NC_016912	AAT	2	6	2355219	2355224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015535
56495	NC_016912	TAA	2	6	2355234	2355239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015535
56496	NC_016912	GCC	2	6	2355261	2355266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379015535
56497	NC_016912	CTTGT	2	10	2355311	2355320	0 %	60 %	20 %	20 %	379015535
56498	NC_016912	A	6	6	2355376	2355381	100 %	0 %	0 %	0 %	379015535
56499	NC_016912	TGT	2	6	2355384	2355389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015535
56500	NC_016912	ATA	2	6	2355430	2355435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015535

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