MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_016912	CAAT	2	8	2252361	2252368	50 %	25 %	0 %	25 %	379015438
54002	NC_016912	TGA	2	6	2252381	2252386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015438
54003	NC_016912	AATTAC	2	12	2252402	2252413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379015438
54004	NC_016912	TGA	2	6	2252474	2252479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015438
54005	NC_016912	CAA	2	6	2252500	2252505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015438
54006	NC_016912	ATT	2	6	2252510	2252515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015438
54007	NC_016912	TAT	2	6	2252544	2252549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015438
54008	NC_016912	CAT	2	6	2252575	2252580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015438
54009	NC_016912	TA	3	6	2252664	2252669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54010	NC_016912	ATA	2	6	2252689	2252694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54011	NC_016912	CAT	2	6	2252702	2252707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54012	NC_016912	AAAC	2	8	2252792	2252799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54013	NC_016912	ATTC	2	8	2252815	2252822	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54014	NC_016912	AT	3	6	2252824	2252829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54015	NC_016912	TAA	2	6	2252848	2252853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54016	NC_016912	T	6	6	2252859	2252864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54017	NC_016912	ATA	2	6	2252893	2252898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54018	NC_016912	A	7	7	2252950	2252956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54019	NC_016912	TAA	2	6	2252993	2252998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54020	NC_016912	ATAAG	2	10	2253017	2253026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54021	NC_016912	ATT	2	6	2253059	2253064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015439
54022	NC_016912	TAT	2	6	2253067	2253072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015439
54023	NC_016912	TAA	2	6	2253076	2253081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015439
54024	NC_016912	AAT	2	6	2253082	2253087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015439
54025	NC_016912	AAG	2	6	2253105	2253110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015439
54026	NC_016912	ATACC	2	10	2253151	2253160	40 %	20 %	0 %	40 %	379015439
54027	NC_016912	TAGT	2	8	2253195	2253202	25 %	50 %	25 %	0 %	379015439
54028	NC_016912	CCA	2	6	2253210	2253215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015439
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54030	NC_016912	AT	3	6	2253360	2253365	50 %	50 %	0 %	0 %	379015439
54031	NC_016912	TAA	2	6	2253383	2253388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015439
54032	NC_016912	ACA	2	6	2253420	2253425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015439
54033	NC_016912	TGC	2	6	2253545	2253550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015439
54034	NC_016912	ACA	2	6	2253558	2253563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015439
54035	NC_016912	TTAA	2	8	2253567	2253574	50 %	50 %	0 %	0 %	379015439
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54040	NC_016912	TACC	2	8	2253877	2253884	25 %	25 %	0 %	50 %	379015439
54041	NC_016912	CCA	2	6	2253891	2253896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015439
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54043	NC_016912	AAT	2	6	2253944	2253949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015439
54044	NC_016912	TTAA	2	8	2253960	2253967	50 %	50 %	0 %	0 %	379015439
54045	NC_016912	AAATTC	2	12	2253977	2253988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379015439
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54047	NC_016912	AT	3	6	2254086	2254091	50 %	50 %	0 %	0 %	379015439
54048	NC_016912	CTCA	2	8	2254109	2254116	25 %	25 %	0 %	50 %	379015439
54049	NC_016912	AT	3	6	2254138	2254143	50 %	50 %	0 %	0 %	379015439
54050	NC_016912	CTG	2	6	2254165	2254170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015439
54051	NC_016912	TA	3	6	2254178	2254183	50 %	50 %	0 %	0 %	379015439
54052	NC_016912	TGT	2	6	2254211	2254216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015439
54053	NC_016912	TAAA	2	8	2254223	2254230	75 %	25 %	0 %	0 %	379015439
54054	NC_016912	TAAAAA	2	12	2254256	2254267	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379015439
54055	NC_016912	ACC	2	6	2254358	2254363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015439
54056	NC_016912	ATTTGA	2	12	2254374	2254385	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379015439
54057	NC_016912	CTT	2	6	2254426	2254431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54058	NC_016912	TGAT	2	8	2254442	2254449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54059	NC_016912	TAAA	2	8	2254452	2254459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54060	NC_016912	A	7	7	2254465	2254471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54061	NC_016912	ACT	2	6	2254547	2254552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54062	NC_016912	ATT	2	6	2254581	2254586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54063	NC_016912	A	6	6	2254600	2254605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54064	NC_016912	A	6	6	2254608	2254613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54065	NC_016912	TAA	2	6	2254677	2254682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54068	NC_016912	TAT	2	6	2254822	2254827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015440
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54070	NC_016912	ATTA	2	8	2254924	2254931	50 %	50 %	0 %	0 %	379015440
54071	NC_016912	TCA	2	6	2254977	2254982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015440
54072	NC_016912	ATC	2	6	2254991	2254996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015440
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54074	NC_016912	A	7	7	2255031	2255037	100 %	0 %	0 %	0 %	379015440
54075	NC_016912	AGG	2	6	2255041	2255046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015440
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54080	NC_016912	ATC	2	6	2255209	2255214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015441
54081	NC_016912	TTA	3	9	2255221	2255229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015441
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54083	NC_016912	ACC	2	6	2255250	2255255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54084	NC_016912	CATA	2	8	2255262	2255269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54085	NC_016912	CATA	2	8	2255293	2255300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54086	NC_016912	GTC	2	6	2255303	2255308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54087	NC_016912	GGT	2	6	2255324	2255329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54089	NC_016912	TTG	2	6	2255372	2255377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015442
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54091	NC_016912	TGTT	2	8	2255440	2255447	0 %	75 %	25 %	0 %	379015442
54092	NC_016912	A	6	6	2255502	2255507	100 %	0 %	0 %	0 %	379015442
54093	NC_016912	CAT	2	6	2255523	2255528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015442
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54105	NC_016912	TTAA	2	8	2256002	2256009	50 %	50 %	0 %	0 %	379015443
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54109	NC_016912	TAAA	2	8	2256111	2256118	75 %	25 %	0 %	0 %	379015443
54110	NC_016912	TGT	2	6	2256119	2256124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015443
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54112	NC_016912	AT	3	6	2256173	2256178	50 %	50 %	0 %	0 %	379015443
54113	NC_016912	CTC	2	6	2256182	2256187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54114	NC_016912	T	6	6	2256190	2256195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54115	NC_016912	T	6	6	2256256	2256261	0 %	100 %	0 %	0 %	379015444
54116	NC_016912	TAT	2	6	2256293	2256298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015444
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54119	NC_016912	ACTG	2	8	2256399	2256406	25 %	25 %	25 %	25 %	379015444
54120	NC_016912	ACT	2	6	2256487	2256492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015444
54121	NC_016912	TAA	2	6	2256501	2256506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015444
54122	NC_016912	CAA	2	6	2256569	2256574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015444
54123	NC_016912	TAA	2	6	2256623	2256628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015444
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54127	NC_016912	CGT	2	6	2256774	2256779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015444
54128	NC_016912	CATTA	2	10	2256822	2256831	40 %	40 %	0 %	20 %	379015444
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54140	NC_016912	ATA	2	6	2257186	2257191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54141	NC_016912	ATT	2	6	2257248	2257253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54143	NC_016912	ATT	2	6	2257298	2257303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54144	NC_016912	TTCA	2	8	2257310	2257317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54145	NC_016912	A	6	6	2257337	2257342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54148	NC_016912	A	7	7	2257498	2257504	100 %	0 %	0 %	0 %	379015445
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54152	NC_016912	CAA	2	6	2257604	2257609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015445
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54156	NC_016912	TAT	2	6	2257846	2257851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015445
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54159	NC_016912	T	7	7	2258019	2258025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54160	NC_016912	TAT	2	6	2258027	2258032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015446
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54200	NC_016912	TA	3	6	2259821	2259826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54201	NC_016912	AT	4	8	2259891	2259898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54202	NC_016912	TAA	2	6	2259921	2259926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54203	NC_016912	ATTT	2	8	2259940	2259947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54204	NC_016912	AGG	2	6	2259951	2259956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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54219	NC_016912	TAC	2	6	2260702	2260707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015447
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54221	NC_016912	TTG	2	6	2260788	2260793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015448
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54224	NC_016912	TCTT	2	8	2260905	2260912	0 %	75 %	0 %	25 %	379015448
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54226	NC_016912	A	6	6	2260968	2260973	100 %	0 %	0 %	0 %	379015448
54227	NC_016912	GTT	2	6	2261093	2261098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015448
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54229	NC_016912	CAA	2	6	2261184	2261189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015448
54230	NC_016912	TCTT	2	8	2261191	2261198	0 %	75 %	0 %	25 %	379015448
54231	NC_016912	TTTCAA	2	12	2261243	2261254	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379015448
54232	NC_016912	TGT	2	6	2261292	2261297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54233	NC_016912	CCAC	2	8	2261298	2261305	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54234	NC_016912	TTTTA	2	10	2261318	2261327	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54235	NC_016912	GAT	2	6	2261355	2261360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54236	NC_016912	CAT	2	6	2261361	2261366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54237	NC_016912	ACA	2	6	2261396	2261401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54238	NC_016912	AT	3	6	2261443	2261448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54239	NC_016912	T	6	6	2261486	2261491	0 %	100 %	0 %	0 %	379015449
54240	NC_016912	TAAA	2	8	2261505	2261512	75 %	25 %	0 %	0 %	379015449
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54345	NC_016912	TGT	2	6	2266196	2266201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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54351	NC_016912	TGT	2	6	2266310	2266315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54352	NC_016912	ATT	2	6	2266436	2266441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54353	NC_016912	TAA	2	6	2266489	2266494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015453
54354	NC_016912	TGAT	2	8	2266506	2266513	25 %	50 %	25 %	0 %	379015453
54355	NC_016912	AT	3	6	2266530	2266535	50 %	50 %	0 %	0 %	379015453
54356	NC_016912	AGC	2	6	2266616	2266621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015453
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54478	NC_016912	TTA	2	6	2272445	2272450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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54480	NC_016912	TAA	2	6	2272552	2272557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54481	NC_016912	TAA	2	6	2272580	2272585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54482	NC_016912	TC	3	6	2272635	2272640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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