MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_016912	TCT	2	6	2211043	2211048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015396
53002	NC_016912	AAC	2	6	2211072	2211077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015396
53003	NC_016912	ATA	2	6	2211112	2211117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015396
53004	NC_016912	ATCA	2	8	2211174	2211181	50 %	25 %	0 %	25 %	379015396
53005	NC_016912	CAT	2	6	2211245	2211250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015396
53006	NC_016912	TCT	2	6	2211295	2211300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015396
53007	NC_016912	T	6	6	2211320	2211325	0 %	100 %	0 %	0 %	379015396
53008	NC_016912	CTG	2	6	2211357	2211362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015396
53009	NC_016912	CTT	2	6	2211383	2211388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015396
53010	NC_016912	T	6	6	2211407	2211412	0 %	100 %	0 %	0 %	379015396
53011	NC_016912	CTA	2	6	2211413	2211418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015396
53012	NC_016912	ATC	2	6	2211428	2211433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53013	NC_016912	T	6	6	2211447	2211452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53014	NC_016912	AGG	2	6	2211473	2211478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53015	NC_016912	CAA	2	6	2211509	2211514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015397
53016	NC_016912	ACAA	2	8	2211543	2211550	75 %	0 %	0 %	25 %	379015397
53017	NC_016912	CTG	2	6	2211564	2211569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015397
53018	NC_016912	TAA	2	6	2211619	2211624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015397
53019	NC_016912	TAT	2	6	2211670	2211675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015397
53020	NC_016912	CCAT	2	8	2211712	2211719	25 %	25 %	0 %	50 %	379015397
53021	NC_016912	AAC	2	6	2211793	2211798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015397
53022	NC_016912	ATT	2	6	2211905	2211910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015397
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53024	NC_016912	AATCA	2	10	2211966	2211975	60 %	20 %	0 %	20 %	379015397
53025	NC_016912	ATT	2	6	2211980	2211985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015398
53026	NC_016912	GAT	2	6	2212004	2212009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015398
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53028	NC_016912	AAT	2	6	2212117	2212122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015398
53029	NC_016912	CCA	2	6	2212246	2212251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015398
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53031	NC_016912	TCT	3	9	2212273	2212281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015398
53032	NC_016912	CTT	2	6	2212287	2212292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015398
53033	NC_016912	CGT	2	6	2212299	2212304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015398
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53038	NC_016912	T	7	7	2212513	2212519	0 %	100 %	0 %	0 %	379015399
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53040	NC_016912	CAA	2	6	2212601	2212606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015399
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53042	NC_016912	GT	3	6	2212695	2212700	0 %	50 %	50 %	0 %	379015399
53043	NC_016912	CA	3	6	2212736	2212741	50 %	0 %	0 %	50 %	379015399
53044	NC_016912	GTT	2	6	2212754	2212759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015399
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53050	NC_016912	AAT	2	6	2213157	2213162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015399
53051	NC_016912	AACGTC	2	12	2213163	2213174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379015399
53052	NC_016912	A	6	6	2213191	2213196	100 %	0 %	0 %	0 %	379015399
53053	NC_016912	TAA	2	6	2213197	2213202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015399
53054	NC_016912	ATC	2	6	2213220	2213225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015399
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53056	NC_016912	CAT	2	6	2213283	2213288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015399
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53058	NC_016912	CAA	2	6	2213357	2213362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015399
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53060	NC_016912	ATTT	2	8	2213451	2213458	25 %	75 %	0 %	0 %	379015399
53061	NC_016912	TAAA	2	8	2213486	2213493	75 %	25 %	0 %	0 %	379015399
53062	NC_016912	CTTT	2	8	2213534	2213541	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53063	NC_016912	CG	3	6	2213565	2213570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53064	NC_016912	TC	3	6	2213577	2213582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53065	NC_016912	A	7	7	2213583	2213589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53066	NC_016912	A	6	6	2213598	2213603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53067	NC_016912	CAT	2	6	2213614	2213619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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53069	NC_016912	TAA	2	6	2213703	2213708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015400
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53102	NC_016912	TGC	2	6	2215621	2215626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015402
53103	NC_016912	T	6	6	2215672	2215677	0 %	100 %	0 %	0 %	379015402
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53106	NC_016912	TAT	2	6	2215815	2215820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53107	NC_016912	TA	3	6	2215845	2215850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53108	NC_016912	TTA	2	6	2215890	2215895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53110	NC_016912	ATCA	2	8	2215964	2215971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53111	NC_016912	ATT	2	6	2216107	2216112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015403
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53115	NC_016912	GAG	2	6	2216207	2216212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015403
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53117	NC_016912	TAA	2	6	2216314	2216319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015403
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53119	NC_016912	ATG	2	6	2216403	2216408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015403
53120	NC_016912	ATT	2	6	2216459	2216464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015403
53121	NC_016912	ATG	2	6	2216468	2216473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015403
53122	NC_016912	TGC	2	6	2216527	2216532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015403
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53237	NC_016912	TAA	2	6	2220750	2220755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015407
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53239	NC_016912	TAA	2	6	2220771	2220776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015407
53240	NC_016912	T	6	6	2220780	2220785	0 %	100 %	0 %	0 %	379015407
53241	NC_016912	TCC	2	6	2220793	2220798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53242	NC_016912	ATCA	2	8	2220813	2220820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53243	NC_016912	TTAT	2	8	2220866	2220873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53244	NC_016912	T	6	6	2220873	2220878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53245	NC_016912	A	6	6	2220887	2220892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53246	NC_016912	A	7	7	2220930	2220936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53247	NC_016912	CGAT	2	8	2220980	2220987	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53248	NC_016912	TGC	2	6	2221041	2221046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015408
53249	NC_016912	ATCA	2	8	2221152	2221159	50 %	25 %	0 %	25 %	379015408
53250	NC_016912	TTG	2	6	2221199	2221204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015408
53251	NC_016912	TTG	2	6	2221233	2221238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015408
53252	NC_016912	TTG	2	6	2221308	2221313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015408
53253	NC_016912	AGC	2	6	2221392	2221397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015408
53254	NC_016912	CAT	2	6	2221496	2221501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015408
53255	NC_016912	TCGC	2	8	2221526	2221533	0 %	25 %	25 %	50 %	379015408
53256	NC_016912	CTA	2	6	2221586	2221591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015408
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53258	NC_016912	TTC	2	6	2221614	2221619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015408
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53260	NC_016912	AGC	2	6	2221626	2221631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015408
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53262	NC_016912	CAT	2	6	2221697	2221702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015408
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53264	NC_016912	ATT	2	6	2221791	2221796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015408
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53266	NC_016912	TCT	2	6	2221939	2221944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015408
53267	NC_016912	CAC	2	6	2221958	2221963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015408
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53269	NC_016912	GTT	2	6	2222122	2222127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015408
53270	NC_016912	TCAT	2	8	2222149	2222156	25 %	50 %	0 %	25 %	379015408
53271	NC_016912	CA	3	6	2222168	2222173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53272	NC_016912	AC	3	6	2222174	2222179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53273	NC_016912	ATT	2	6	2222187	2222192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53274	NC_016912	TAAAAA	2	12	2222217	2222228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53275	NC_016912	ATA	2	6	2222408	2222413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015409
53276	NC_016912	ATA	2	6	2222428	2222433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015409
53277	NC_016912	TGT	3	9	2222475	2222483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015409
53278	NC_016912	CAC	2	6	2222493	2222498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015409
53279	NC_016912	TAA	2	6	2222505	2222510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015409
53280	NC_016912	A	6	6	2222518	2222523	100 %	0 %	0 %	0 %	379015409
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53288	NC_016912	TTG	2	6	2222806	2222811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015409
53289	NC_016912	TC	3	6	2222956	2222961	0 %	50 %	0 %	50 %	379015409
53290	NC_016912	GCA	3	9	2222965	2222973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015409
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53299	NC_016912	TAT	2	6	2223267	2223272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015409
53300	NC_016912	CCTTT	2	10	2223287	2223296	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
53301	NC_016912	TAC	2	6	2223316	2223321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53302	NC_016912	AT	3	6	2223368	2223373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53303	NC_016912	CAA	2	6	2223476	2223481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53304	NC_016912	GGC	2	6	2223582	2223587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379015410
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53310	NC_016912	AGG	2	6	2223841	2223846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53311	NC_016912	ATT	2	6	2223869	2223874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015411
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53333	NC_016912	TGA	2	6	2224980	2224985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015412
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53338	NC_016912	GCA	2	6	2225299	2225304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015412
53339	NC_016912	AAC	2	6	2225420	2225425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015412
53340	NC_016912	ATA	2	6	2225459	2225464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015412
53341	NC_016912	ATTA	2	8	2225625	2225632	50 %	50 %	0 %	0 %	379015412
53342	NC_016912	CGG	2	6	2225712	2225717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379015412
53343	NC_016912	A	6	6	2225915	2225920	100 %	0 %	0 %	0 %	379015412
53344	NC_016912	GCA	2	6	2225932	2225937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015412
53345	NC_016912	CTT	2	6	2225964	2225969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015412
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53352	NC_016912	ATT	2	6	2226338	2226343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015413
53353	NC_016912	TTA	2	6	2226355	2226360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015413
53354	NC_016912	TAA	2	6	2226402	2226407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015413
53355	NC_016912	TGAT	2	8	2226435	2226442	25 %	50 %	25 %	0 %	379015413
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53357	NC_016912	ATT	2	6	2226457	2226462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015414
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53477	NC_016912	TA	3	6	2231399	2231404	50 %	50 %	0 %	0 %	379015420
53478	NC_016912	AGT	2	6	2231438	2231443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015420
53479	NC_016912	TTAA	2	8	2231454	2231461	50 %	50 %	0 %	0 %	379015420
53480	NC_016912	CTA	2	6	2231512	2231517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015420
53481	NC_016912	TACATT	2	12	2231585	2231596	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379015420
53482	NC_016912	TAA	2	6	2231618	2231623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015420
53483	NC_016912	TAA	2	6	2231727	2231732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015420
53484	NC_016912	TCCA	2	8	2231733	2231740	25 %	25 %	0 %	50 %	379015420
53485	NC_016912	GAA	2	6	2231835	2231840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015420
53486	NC_016912	ATC	2	6	2231852	2231857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015420
53487	NC_016912	AAT	2	6	2231859	2231864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015420
53488	NC_016912	TAAT	2	8	2231938	2231945	50 %	50 %	0 %	0 %	379015420
53489	NC_016912	AAT	2	6	2231992	2231997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015420
53490	NC_016912	ACT	2	6	2232011	2232016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015420
53491	NC_016912	TTC	2	6	2232023	2232028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015420
53492	NC_016912	CTT	2	6	2232035	2232040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015420
53493	NC_016912	TTTG	2	8	2232140	2232147	0 %	75 %	25 %	0 %	379015420
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53497	NC_016912	CTT	2	6	2232220	2232225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015420
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53499	NC_016912	GAC	2	6	2232238	2232243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015420
53500	NC_016912	GTAT	2	8	2232251	2232258	25 %	50 %	25 %	0 %	379015420

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